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Biologie Moléculaire > Chap 8 : transport intracellulaire > Flashcards

Chap 8 : transport intracellulaire Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un organite?

A

Compartiment différencié contenu dans les cellules eucaryotes ayant des fonctions précises

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Q

Faces des organites à une membrane:

A

face cytosolique (extérieure) et face luminale (intérieure)

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3
Q

Quels sont les organites à 2 membranes?

A

Noyau et mitochondries

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4
Q

Quels sont les 2 espaces des organites à 2 membranes?

A

espaces intermembranaires et interne (nucléoplasme ou matrice)

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5
Q

Citer les organites?

A

endosomes, peroxysomes, lysosomes, mitochondries, appareil de Golgi, réticulum endoplasmique, noyau

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6
Q

Fonctions cytosol :

A

Voies métaboliques, synthèse des protéines

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7
Q

Fonction noyau :

A

réplication ADN, synthèse Arn

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8
Q

Fonction mitochondrie:

A

oxydation de nutriments, synthses atp

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9
Q

fonction réticulum endoplasmique

A

synthèse membranes/lipides/protéines pour d’autres organites et la MP. pour le RE lisse seulement : séquestration/absorption/libération du Ca2+

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10
Q

Caractéristiques cytosol

A

gel aqueux où baignent les organites

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11
Q

caractéristiques noyau:

A

entourés d’une enveloppe nucléaire qui communique avec le cytosol via pores nucléaires

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12
Q

caractéristiques mitochondries :

A

membrane interne et externe et ADN mt

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13
Q

caractéristiques RE

A

membrane de RE = continuité de la membrane nucléaire externe

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14
Q

Fonction appareil de Golgi

A

modification, tri et empaquetage des protéines et lipides du RE et les distribue vers d’autres organites

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15
Q

caractéristiques appareil de Golgi

A

près du noyau

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16
Q

fonctions lysosomes

A

dégradation intracellulaires des protéines, macromolécules, organites usés et particules absorbés par la cellule par endocytose

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17
Q

caractéristiques lysosomes

A

enzymes digestives, pH acide

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18
Q

fonctions endosomes

A

trie du matériel absorbé par endocytose : recyclage vers la membrane plasmique ou dégradation dans le lysosome

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19
Q

caractéristiques endosomes

A

pH acide, endosomes précoces ou tardifs

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20
Q

fonctions peroxysomes

A

oxydation molécules toxiques et dégradation des lipides

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21
Q

caractéristiques peroxysomes

A

contient divers enzymes d’oxydation

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22
Q

Qu’est-ce que le système endomembranaire?

A

ensemble des organites limités par 1 membrane

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23
Q

Quels organites n’appartiennent pas au système endomembranaire?

A

Mitochondries, noyau, peroxysomes

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24
Q

Quels organites font partie du système endomembranaire?

A

enveloppe nucléaire, RE lisse et rugueux, appareil de Golgi, endosomes, lysosomes, ensemble de vésicules de transport qui relient ces compartiments entre eux à la membrane plasmique et le milieu extracellulaire

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25
Q

Vrai ou Faux: les organites recoivent les protéines par des pores

A

faux, seulement le noyau

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26
Q

Où se fait le transport transmembranaire (par translocation)

A

mitochondrie, peroxysomes, trnasport du cytosol au RER

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27
Q

où se fait le transport vésiculaire?

A

entre les compartiments endomembranaires

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28
Q

quels sont les 3 mécanismes de transports des protéines dans les organites

A

1) transport par les pores nucléaires (à partir du cytosol)
2) transport à travers les membranes par les protéines de translocation (à partir du cytosol)
3) transport par vesicules utilisant le bourgeonnement et la fusion membranaire ( à partir du RE ou d’un organite endomembranaire à un autre)

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29
Q

Comment s’appellent les vésicules dont la surface cytosolique est couverte d’un matau protéique distinctif?

A

Vésicules recouvertes

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30
Q

Quelles sont les fonctions du manteau des vésicules recouvertes?

A

1) donne forme au bourgeon

2) facilite capture des molécules et permet la séléction des molécules à transporter

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31
Q

Pourquoi la vésicule retire son manteau après le bourgeonnement?

A

Pour que sa membrane interagit directement avec la membrane qu’il veut fusionner

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32
Q

De quoi sont recouvertes les vésicules?

A

Clathrine en réseau en forme de panier à la surface cytosolique de la membrane

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33
Q

Les vésicules de transport sont des bourgeons de quels organites selon la voie?

A

Voie endocytaire : membrane plasmique

Voie exocytaire : appareil de golgi

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34
Q

Nommer les 3 protéines impliquées dans la formation et le relargage des vésicules recouvertes de clathrine.

A

1) récepteurs de chargement
2) adaptines
3) dynamine

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35
Q

que sont des récepteurs de chargement?

A

des récepteurs transmembranaires associés à la membrane de départ qui capturent les molécules luminales ou membranaires à transporter par la vésicules

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36
Q

que sont les adaptines?

A

protéines de manteau à clathrines qui facilitent la capture du cargo en piègeant les récepterus de chargements et en fixant le manteau de clathrine à la vésicule

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37
Q

c’est quoi la dynamine?

A

protéines cytosoliques GTPase qui sont recrutées par les clathrines et se polymérisent pour former un anneau autour du col de chaque puits recouvert.

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38
Q

Mécanisme de relargage de vésicule de transport

A
  1. hydrolyse du GTP –> resserrement de l’anneau autour du puits
  2. fusion des feuillets non cytosoliques luminaux ou extracellulaires
  3. détachement du puit de la membrane = vésicule recouvert
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39
Q

Comment est-ce que la vésicule de transport va jusqu’à sa cible?

A

transport actif par des protéines motrices le long du cytosquelette

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40
Q

Nommer les protéines de reconnaissances des vésicules de transport et par quelles protéines elles sont reconnues

A
  1. protéines Rab (vésicule) reconnues par les protéines d’attache (cible)
  2. protéines v-SNARE (vésicules) reconnues par t-SNARE (cible)
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41
Q

Mécanisme d’arrimage d’une vésicule à la cible:

A
  1. rab se lie à protéine d’attache

2. v-SNARE se lie à t-SNARE : verrouillage de vésicule sur cible

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42
Q

V ou F: le processus d’arrimage d’une vesicule sur sa cellule cible nécessite de l’énergie

A

faux

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43
Q

Que font les protéines SNARE lors de la fusion vésiculaire?

A

rapprochent les 2 membranes en s’enroulant l’une autour de l’autre

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44
Q

Que font les protéines Rab lors de la fusion vésiculaire?

A

catalysent la fusion des membranes en accélérant le processus de reconnaissance des SNARE. Après la fusion, Rab-GTP hydrolyse son GTP et retourne dans le cytosol sous forme de Rab-GDP
Actives : liées au GTP d’une membrane
Inactives : liées au GDP dans le cytosol.

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45
Q

quelle protéine active la GTPase du Rab?

A

GAP

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46
Q

De quoi sont formés les signaux de tri et où dirigent-ils les protéines synthétisées?

A

Séquence de 15 à 60 AA hydrophobes ou chargés. Protéines du cytosol vers l’organite

47
Q

V ou F : les protéines qui n’ont pas une séquence signal restent dans le cytosol.

A

Vrai

48
Q

Le RE sert de point d’entrée pour les protéines allant : (3 destinations)

A
  1. au RE
  2. surface cellulaire : MP
  3. à d’autres organites : AdeG, endosomes, lysosomes
49
Q

Quelles sont les 2 sortes de protéines transférées du cytosol au RE :

A
  1. protéines hydrosolubles : transloquées à travers la BCL du RE –> sécrétées hors de la cellule ou dans la lumière d’un autre organite
  2. protéines transmembranaires : partiellement transloquée à travers de la BCL du RE –> résident dans la BCL des : RE, organites, MP
50
Q

Comment les protéines pénètrent-elles la lumière du RE en même temps qu’elles sont synthétisées?

A

Les protéines commencent à rentrer dans la lumière du RE avant que la chaine polypeptidique termine de synthétiser grâce aux ribosomes liées à la membrane du RE dans la région du RER

51
Q

Comment sont fixés les ribosomes à la membrane du RE?

A

Par le polypeptide qui s’insère dans la membrane

52
Q

que dirige le ribosome vers la membrane du RE?

A

la séquence signal du RE présente dans la séquence du polypeptide en formation

53
Q

Quelles sont les 2 molécules qui guident la séquence signal du RE vers la membrane du RE?

A
  1. particule de reconnaissance du signal SRP (ds cytosol, se lie à la séquence signal)
  2. récepteurs de SRP (ds la membrane du RE, reconnaît SRP)
54
Q

La séquence signal du RE est situé où sur le polypeptide et est formé de quoi?

A

8 AA hydrophobes à l’extrémité N-terminale du polypeptide.

55
Q

Vrai ou faux : l’adressage d’une protéine transmembranaire est le même mécanisme que pour une protéine soluble.

A

Vrai

56
Q

Vrai ou faux : la translocation d’une protéine transmembranaire est la même que pour une protéine soluble

A

Faux

57
Q

Quelles sont les 2 séquences d’AA hydrophobes des protéines transmembranaires?

A
  1. séquence de départ de transfert redémarrant la translocation
  2. séquence d’arrêt de transfert arrêtant la translocation
58
Q

Mécanisme de translocation d’une protéine à 1 segment transmembranaire:

A
  1. séquence de départ de transfert : ouverture du canal de translocation et fixation dans le canal
  2. polypeptide entre dans la lumière du RE
  3. séquence d’arrêt de transfert = hélice alpha traverse la membrane, fixation dans le canal–>arrêt de transfert et éjection du polypeptide sur le côté de la membrane
  4. séquene de départ de transfert n-terminale clivée par une peptidase de signal
59
Q

Quelles sont les différences entre la séquence de départ de transfert d’une protéine à plusieurs segments vs une protéine à 1 segment ?

A

elle n’est pas sur l’extrémité N-terminale, elle n’est jamais clivée par une peptidase de signal, il n’y en a pas juste 1, mais plusieurs = autent que nécessaires pour avoir le nb de segments

60
Q

Que sont les ponts disulfures?

A

Une modification post-traductionnelle catalysée par enzyme du RE (PDI) formée dans le RE par oxydation des groupements SH de la chaine latérale des cystéines

61
Q

Que font les ponts disulfures?

A
  1. stabilisent la structure des protéines sécrétes/incorporées dans la MP
  2. Renforcent la conformation des protéines = résistance vs variations pH et protéases
62
Q

Qu’est-ce qu’est la glycosylation?

A

Protéines transformées en glycoprotéines par fixation covalente de courtes chaines d’oligosaccharides

63
Q

Rôles de la glycolisation

A
  1. protection vs dégradation
  2. rétention dans RE pour repliement correct
  3. guider protéines vers d’autres organites = signal de transport
  4. interaction intra-/extracellulaire = reconnaissance entre cellules
64
Q

n

A

n

65
Q

k

A

m

66
Q

m

A

,

67
Q

Comment s’appellent les sacs aplatis de l’appareil de Golgi?

A

Citernes

68
Q

Combien de citernes sont dans un empilement de l’AdeG?

A

3 à 20 citernes

69
Q

Nommer les 2 portes (entrées et sorties) de l’AdeG et leur orientation

A 
cis = entrée : près du noyau
trans = sortie : vers la MP
70
Q

Comment les protéines traversent-elles les citernes de l’AdeG?

A

des vésicules bourgeonnent d’une citerne et fusionnent avec la suivante puis ressort de l’autre…

71
Q

Quels sont les 2 modifications de maturation post-traductionnelles des protéines passant dans l’AdeG?

A
  1. glycosylation ou déglycosylation

2. remodelage de motifs glycosylés

72
Q

Comment l’AdeG trie?

A

tri des protéines qui rentrent ou sortent

73
Q

Quelles sont les 2 voies de transport vésiculaire?

A

exocytose et endocytose

74
Q

Quelles sont les modifications des protéines et lipides faites pendant l’exocytose?

A
  1. glycosylation (protéines et lipides)

2. ponts disulfures (protéines)

75
Q

Quelle voie permet l’ingestion et la digestion de molécules extracellulaire?

A

endocytose

76
Q

Définition exocytose?

A

processus par lequel une vésicule fusionne avec la MP pour sécréter des molécules dans l’espace extracellulaire

77
Q

2 types de voie d’exocytose:

A
  • constitutive

- régulée

78
Q

Quelles protéines sont sécrétées par la voie d’exocytose constitutive ?

A

1) adhérant à la face externe de MP
2) incorporées dans la matrice extracellulaire
3) diffusent dans le liquide extracellulaire pour nourrir ou signaler autre cellules

79
Q

Vrai ou faux : la voie exocytaire constitutive est sélective

A

faux

80
Q

quelle voie d’exocytose donne à la MP des protéines et des lipides pour lui permettre de croitre avant la division?

A

constitutive

81
Q

Quelles types de cellules font de l’exocytose régulée?

A

cellules spécialisées en sécrétion d’‘hormones, mucus, enzymes digestives ou neurotransmetteurs

82
Q

Quelle sont les particularités de la voie exocytose régulée?

A

Molécules stockées dans vésicules de sécrétions s’accumulent près de la MP (après la sortie du réseau trans Golgi où elles sont triées et empaquetées) et sont libérées suite à un signal extracellulaire

83
Q

Quelle est la fonction de l’agglutination sélective des protéines de la voie d’exocytose régulée?

A

empaquetage des protéines à une concentration plus élevées que les protéines non agglutinées = libération rapide de +++ de protéine en réponse au signal

84
Q

exemple de protéines sécrétées par voie d’exocytose régulée?

A

insuline par cellules beta du pancréas

85
Q

Définition endocytose

A

mécanisme de formation de vésicules à partir de la MP et par lequel la cellule incorpore du matériel qui sera livré aux lysosomes pour être digéré et transféré dans le cytosol pour être réutilisé par la cellule

86
Q

3 types d’endocytose:

A

phagocytose, pinocytose, endocytose dépendante d’un récepteur

87
Q

Phagocytose:

A

ingestion de microorganismes ou débris cellulaire par le phagosomes

88
Q

phagolysosome =

A

phagosome fusionné au lysosome afin de digérer les macromolécules

89
Q

Nommer 3 phagocytes

A
  1. macrophages
  2. neutrophiles
  3. cellules dendritiques
90
Q

Fonctions phagocytose :

A

nettoyage et défense organisme

91
Q

Mécanisme phagocytose:

A

phagocyte fait la projection de pseudopodes qui fusionnent à leur extrémités = phagosome

92
Q

Définition pinocytose :

A

ingestion rapide et non-spécifique de liquide et molécules via petites vésicules

93
Q

V ou F: la pinocytose est spécifique à certaines molécules solubles dans le liquide extracellulaire

A

faux : non-spécifique

94
Q

V ou F : la perte de fluide liée à l’exocytose est balancée par la prise de fluide de la pinocytose

A

Vrai

95
Q

Mécanisme pinocytose:

A

puits recouverts de clathrine détachent de la MP et retirent le manteauet fusionnent avec un endosome

96
Q

Définition de l’endocytose dépendante d’un récepteur

A

internalisation de macromolécules spécifiques (ligands) associées à un récepteur

97
Q

Quel est le mécanisme général de l’endocytose dépendante d’un récepteur?

A

ligands se lient à des récepteurs sur la face extraceluulaire de la MP et pénètre la cellule sous forme de complexe récepteur-ligand dans des vésicules recouvertes de clathrines

98
Q

Efficacité d’internalisation de l’endocytose vs la pinocytose et conséquence de cette efficacité

A

plus de 1000x plus importante que la pinocytose, les molécules extracellulaire de faibles quantités sont donc captées au maximum

99
Q

V ou F : l’endocytose dépendante d’un récepteur est un mécanisme de concentration

A

Vrai

100
Q

Exemple d’endocytose dépendante d’un récepteur:

A

endocytose dépendante du récepteur à LDL : LDL-R

101
Q

Fonction endosomes:

A

tri des molécules sur la voie de l’endocytose

102
Q

Citer les 2 types d’endosomes et leur localisation

A

précoces : près de la MP

tardifs : près du noyau

103
Q

Décrire le pH des endosomes et le technique de maintient du pH

A

Acide (5-6) maintenu par une pompe H+ couplé à de l’ATP qui pompe les H+ du cytosol vers la lumière de l’endosome

104
Q

Fonction du pH acide des endosomes

A

processus de tri obligeant les récepteurs à larguer leur chargement

105
Q

Qu’arrive-t-il aux éléments endocytés suite au tri dans les endosomes?

A
  1. recyclage vers la MP
  2. dégradation = lysosome
  3. transcytose : vers un domaine différent de la membrane plasmique
106
Q

V ou F : Les molécules dissociées à leurs récepteurs dans les endosomes peuvent intégrer la MP pour être recyclées.

A

Faux : les molécules dissociées de leurs récepteurs sont tous dégradées dans les lysosomes

107
Q

Définition lysosomes :

A

sacs entourés d’une membrane contenant plusieurs enzymes hydrolytiques (40)

108
Q

Les lysosomes sont responsables de la digestion des matériels extracellulaire et intracellulaire de quelles types d’organites:

A
  1. endosomes (vésicules chlatrines)
  2. phagosomes (bactéries ou virus)
  3. autophagosome (organites)
109
Q

n

A

n

110
Q

n

A

les enzymes ont une activité optimale à un pH de 5

111
Q

m

A

m

112
Q

Comment les produits entrent les lysosomes

A

via des protéines de transport dans le lysosome

113
Q

m

A

m

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