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Biologie Moléculaire > Chap 4 : ADN NOYAU GÉNOME > Flashcards

Chap 4 : ADN NOYAU GÉNOME Flashcards

1
Q

Quel est l’aspect phénotypique des pneumocoques virulentes et par quoi est-il formé?

A

Un aspect huileux, un mucopolysaccharide.

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Q

Quel est l’aspect des bactéries pneumocoques non virulentes

A

Un aspect rugeux (R)

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3
Q

Quelle est l’interprétation des travaux de Griffith?

A

Les bactéries vivantes du départ sont R et on suppose qu’elles ont été transformées génétiquement par un élément des bactéries tueuses (un facteur transformant)

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4
Q

Pourquoi les travaux d’Avery/MacLeod/McCarty n’ont pas été reconnus ?

A
  1. La structure chimique de l’ADN semblait trop simple
  2. Les protéines font de meilleurs candidats
  3. Pensaient que le passage de S à R était des mutation et que les hérédités des bactéries était trop simple comparés à des organismes comme l’humain.
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5
Q

Les travaux de Hershey et Chase ont trouvé quelle différence entre l’ADN et les protéines bactériennes?

A
  1. ADN a pas de soufre 2. Protéines bactériennes ont pas de phosphate
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6
Q

De quoi est formée la particule phagique dans l’expérience de Hershey/Chase?

A

ADN et protéine

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7
Q

Conclusion des travaux de Hershey et Chase

A

L’information génétique du phage pénètrant la bactérie est de l’ADN et la capside protéique du phage sert d’emballage.

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8
Q

Qu’a découvert Chargaff?

A

Que les bases A C G T ne sont pas équimolaires dans l’ADN, que la concentration de A et T est environ égale, que celle de C et G aussi (rapport de 1), et que la concentration de pyrimidines et égale è celle des purines.

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9
Q

Quelles bases azotées s’assemblent entre elles?

A

A et T

G et C

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10
Q

Quelles liaisons sont entre les bases azotées

A

Pont H

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11
Q

Combien de pont H y a t il entre A et T

A

2

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12
Q

Combien de liaisons H il y a t’il entre C et G

A

3

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13
Q

Quelles conclusions sont tirées de la photo de R. Franklin ?

A
  1. Il y a 2 chaines dans la molécule d’ADN
  2. Elles sont en forme e double hélice
  3. Elles sont antiparallèles
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14
Q

Quelle est l’unité de base des acides nucléiques?

A

Les nucléotides

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15
Q

Quels sont les 2 types d’acides nucléiques

A

L’ADN et l’ARN

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16
Q

Que veux dire ADN?

A

acide désoxyribonucléique

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17
Q

Que veux dire ARN?

A

Acide ribonucléique

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18
Q

De quoi est formé un nucléotide?

A
  1. une base azotée
  2. un ribose ou désoxyribose
  3. un groupement phosphate
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19
Q

Sur quel carbone du ribose ou du désoxyribose est lié le groupement phosphate?

A

Le carbone 5

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20
Q

Quelle est la particularité du groupement phosphate

A

Confère le caractère et l’appellation acide des acides nucléiques.

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21
Q

Quels sont les 2 types de pentoses?

A

Ribose (ARN) Désoxyribose (ADN)

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22
Q

Quelle est la différence entre le ribose et le désoxyribose?

A

Le carbone 2 du désoxyribose n’a pas un OH mais un H.

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23
Q

Qu’est-ce qu’une base azotée?

A

Des hétérocycles avec 2 atomes d’azote dans chaque cyle.

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24
Q

Comment sont reliés 2 nucléotides?

A

Par une liaison phosphodiester entre le carbone 5’ d’un ose et le carbone 3’ de l’ose adjacent –> chaine de polynucléotide (brin d’adn)

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25
Q

Nomme les extrémités des brins d’ADN et ce qu’elle porte.

A

L’extrémité 5’P contient un groupement phosphate.

L’extrémité 3’OH a un OH libre

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26
Q

Quel est l’ordre de lecture de la chaine d’acide nucléique?

A

De 5’P vers 3’OH

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27
Q

Quelles sont les 3 caractéristiques des brins d’ADN?

A
  1. antiparallèles
  2. complémentaires (par liaison H)
  3. hélicoidales
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28
Q

a

A

a

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29
Q

Où est renfermé l’ADN nucléaire?

A

Le noyau.

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30
Q

Quelles sont les 3 structures importantes du noyau?

A

1 L’enveloppe nucléaire
2 Les pores nucléaires
3 le nucléole

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31
Q

Qu’arrive-t-il au nucléole, à l’enveloppe et aux pores nucléaires avant la division cellulaire?

A

Ils disparaissent

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32
Q

Quelles sont les 2 membranes de l’enveloppe nucléaire?

A

La membrane interne et externe

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33
Q

Décrire la membrane interne de l’enveloppe nucléaire?

A

Elle contient des protéines servant de sites de liaison à la chromatine et à la lamina nucléaire.

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34
Q

Décrire la membrane externe de l’enveloppe nucléaire.

A

Elle est en continuité avec la membrane du réticulum endoplasmique.

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35
Q

Comment s’appelle l’espace intermembranaire de l’enveloppe nucléaire?

A

L’espace périnucléaire.

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36
Q

Comment s’appelle le liquide dans lequel baignent les éléments nucléaires?

A

nucléoplasme

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37
Q

Qu’est-ce que la lamina nucléaire?

A

Un fin réseau de filaments de lamines qui borde la face interne de la membrane interne.

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38
Q

Comment s’effectuent les échanges entre noyau et cytoplasme ?

A

via les pores nucléaires

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39
Q

Comment est formée la lamina nucléaire?

A

Par polymérisation de lamines en filaments de lamines = réseau à maille carrée interrompu par les pores nucléaires

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40
Q

Quels sont les rôles de la lamina nucléaire?

A
  1. maintien forme du noyau 2. stabilisation des pores nucléaires 3. organisation et fonctionnement génome
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41
Q

Que forme la lamina nucléaire ?

A

le nucléosquelette

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42
Q

À quoi est associée la lamina nucléaire ?

A

Protéines transmembranaires (site de liaisons au chromosomes ds le nucléoplasme)

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43
Q

Qu’est-ce qui participe à l’assemblage et au désassemblage du noyau et avec quel mecanisme ?

A

Le réseau de filament de lamines, avec un mécanisme de phosphorylation/déphosphorylation

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44
Q

Combien il y a-t-il de lamines et quels sont leurs noms?

A

3 : lamines A B et C

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45
Q

Que fait une mutation des lamines A?

A

Vieillissement prématuré : syndrome de Hutchinson-Gilford ou progéria

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46
Q

Quelle est la composante la plus proéminante d’une cellule en interphase?

A

La nucléole

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47
Q

Quelles sont les 3 composantes du nucléole?

A

Les centres fibrillaires (CF), les composant fibrillaire dense (CFD) et le composant granulaire (CG)

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48
Q

Quelle est la fonction générale du nucléole?

A

Synthèse et assemblage du ribosome (sous-unitésè) .

49
Q

Quelles sont les 3 fonctions du nucléole associées aux 3 composants ?

A
  1. Transcription de l’ARNr par les centres fibrillaires
  2. Maturation de l’ARNr par le composant fibrillaire dense
  3. Assemblage des sous-unités ribosomiques par le composant granulaire
50
Q

Comment s’appellent les protéines des pores nucléaires?

A

Nucléoporines

51
Q

Combien de nucléoporines sont dans les NPC?

A

30 protéines

52
Q

Les fibrilles du côté nucléoplasmique des NPC forment quoi?

A

une structure en panier de basket

53
Q

Par quoi est stabilisé chaque NPC

A

Des filaments de lamine

54
Q

De quoi est constitué un NPC

A

Un anneau perfré par un transporteur central / canal, prolongé par des fibrilles cytosoliques et nucléaires

55
Q

Le mode de transport des molécules à travers les NPC dépend de quoi?

A

De la taille des molécules

56
Q

Quelles molécules font le transport passif à travers les NPC?

A

Les petites protéines et petites molécules hydrosolubles

57
Q

Quelles molécules font le transport actif?

A

Les grosses molécules (+ de 40 kDa) et les ARNt et ARNm

58
Q

Quelles molécules sont importées dans le noyau à partir du cytosol?

A

Histones, ADN et ARN polymérase, protéines d’épissage d’ARN

59
Q

Quelles molécules sont exportées du noyau au cytosol?

A

Sous-unités des ribosomes assemblées dans le nucléole, protéines nucléaires

60
Q

Quels sont les éléments nécessaires au transport actif nucléo-cytoplasmique?

A
  1. les molécules à importer doivent avoir des signaux de transport vers le noyau
  2. les molécules à exporter doivent avoir des signaux de transport vers le cytosol
  3. les molécules à transporter doivent s’associer à des récepteurs d’importation et d’exportation nucléaire
  4. Protéine Ran et hydrolyse GTP
  5. Les récepteurs de transport nucléaire doivent faire continuellement la navette entre le cytosol et le noyau
61
Q

Comment se nomment les 2 types de récepteurs de transport nucléaire?

A

Importines et exportines

62
Q

Quels sont les 2 signaux de localisation dans la protéine cargo qui déterminent sa destination finale?

A
  1. Le signal de localisation nucléaire (NLS)

2. Signal d’exportation nucléaire (NES)

63
Q

Par quoi est reconnu le NLS?

A

Importines

64
Q

Par quoi est reconnu les NES

A

Exportines

65
Q

Où se situe Ran?

A

Cytosol et noyau

66
Q

Qu’est-ce que la protéine Ran?

A

Une GTPase monomérique dont l’hydrolyse du GTP donne l’énergie nécessaire au transport des molécules à travers le NPC

67
Q

Quelles sont les 2 protéines régulatrices de Ran?

A

Ran-GAP et Ran-GEF

68
Q

Où se situent GAP et GEF?

A

GAP=cytosol, GEF = noyau

69
Q

Qu’est-ce que GAP?

A

Protéine activant la GTPase, déclenche l’hydrplyse du gtp –> Convertit Ran-GTP en Ran-GDP

70
Q

Qu’est-ce que GEF

A

Un facteur d’échange de guanine, convertit Ran-GDP en Ran-GTP

71
Q

Quelles sont les étapes de l’importation des protéines cytosoliques?

A
  1. importines se lient au NLS
  2. complexe d’import est guidé vers NPC à l’aide des fibrilles cytosoliques
  3. protéine de cargaison est transportée dans le noyau
  4. importines retournes vers le cytosol par le NPC
72
Q

Quelles sont les étapes d’exportation des protéines nucléaires?

A
  1. exportines se lient au NES
  2. complexe d’export passe à travers le NPC en interagissant avec les fibrilles du panier de basket
  3. dans le cytosol, la protéine cible se dissocie de l’exportine qui retourne au noyau
73
Q

Comment se lient les différents types d’ARN aux exportines?

A

Les petits ARN se lient directement aux exportines et les snRNA et les grands ARN ont besoin de protéines adaptatrices spécifiques.

74
Q

Génome :

A

Ensemble spécifique des gènes organisés dans un ou plusieurs chromosomes

75
Q

Gène : 2 définitions

A
  1. Séquence ordonnée de nucléotides qui occupe une position précise sur un chromosome déterminé
  2. fragment d’ADN ou ARN (virus) qui porte le plan de fabrication d’une protéine.
76
Q

Combien de protéines est associée à un gène?

A

1

77
Q

Combien de gènes est associé à une protéine?

A

1 ou +

78
Q

Chromosome =

A

macromolécule constituée d’une molécule d’ADN associée équitablement à des protéines histones et non histones, constituée de chromatine

79
Q

Vrai ou Faux : le nombre et l’aspect général des chromosomes peuvent différer entre les individus d’une même espèce.

A

Faux

80
Q

Qu’est-ce qu’une région polymorphe?

A

Régions dont la morphologie peut présenter des variations de taille liées à la présence de séquences répétées en nombre variable non codantes qui se trouvent aussi au niveau des centromères et des télomères

81
Q

Quels sont les 2 formes de chromosomes?

A

Interphasique et Mitotique

82
Q

Où sont les chromosomes interphasinque?

A

Périphérie de la membrane nucléaire interne, liés à des protéines membranaires associées à la lamina nucléaire dans le cytoplasme

83
Q

Vrai ou faux : la chromatine d’un chromosome interphasique n’est pas compactée de manière uniforme?

A

Vrai

84
Q

Quelles sont les 2 régions du chromosome interphasique et quelles sont leurs particularités?

A

Euchromatine : compactée, contient les gènes actifs

Hétérochromatine : moins compactése, contient des gènes inactifs

85
Q

Qu’est-ce qu’un centromère ?

A

Zone de constriction du chromosome et zone de fixation sur les fibres du fuseau mitotique

86
Q

Télomère =

A

Séquence répétitive d’ADN retrouvée à chacune des 2 extrémités des chromosomes

87
Q

Vrai ou Faux : le nombre de répétitions télomériques diminue avec l’âge?

A

Vraii

88
Q

Quelle est la fonction des télomère?

A

stabilisation et protection des extrémités chromosomiques (afin de les répliquer) si pathologique peut mener à des cancers

89
Q

Que sont les origines de réplication?

A

Points de départ de la réplication de l’ADN

90
Q

Décrire les bases azotées comprises dans les origines de réplications ?

A

Séquences d’ADN riches en A-T car elles ont 2 ponts H et sont plus faciles à ouvrir

91
Q

Quelle est la dernière région du chromosome à se séparer durant l’anaphase?

A

Les centromères

92
Q

Qu’est le centromère au niveau moléculaire?

A

Des séquences d’ADN en tendem répétées beaucoup de fois sans rôle de transcription

93
Q

Combien de gènes sont nécessaires à la vie d’une cellule?

A

moins de 400

94
Q

Combien de gènes l’humain a?

A

environ 30 000

95
Q

Combien de paires de chromosomes à l’humain?

A

23 (46 total)

96
Q

Quelle est la strucure de base de la chromatine?

A

Le nucléosome

97
Q

Qu’est-ce que le nucléosome?

A

Un octamère d’histomes autour duquel s’entoure l’adn

98
Q

Quelle est la composition des histones?

A

Riches en lysine et arginines (positives)

99
Q

COmme se lient les histones à l’ADN

A

Liaisons électrostatiques: Les groupement phosphates (-) de l’ADN se lient au charges positives des lysines et arginines des histones

100
Q

Que sont les queues d’histones et que peuvent-elles faire?

A

Une longue chaîne N-terminale qui sort du nucléosomes. Peuvent subir des modifications covalentes pouvant modifier la structure de la chromatine : acétylation, méthylation, phosphorylation

101
Q

Que relie 2 nucléosomes successifs?

A

Un ADN linker de 200 pb

102
Q

Que font les histones H1?

A

Elle empaquettent les nucléosomes en rangées régulières et répétitives sous forme de fibres de 30 nm de diamètre = premier niveau de compaction

103
Q

Hétérochromatine =

A

forme d’ADN le plus condensé du chromosome en interphase

104
Q

Localisation et formation de l’hétérochromatine

A

Localisée en périphérie du noyau et du nucléole. Concentré au centromère et télomère

105
Q

% de l’ADN humain sous forme hétérochromatine?

A

10%

106
Q

Vrai ou faux : des gènes en région d’hétérochromatine sont activés?

A

Faux

107
Q

Euchromatine =

A

Forme décondensée et despriralisée de 10-12nm de diamètre de la chromatine

108
Q

% d’euchromatine chez l’humain?

A

10%

80 % dans un stage intermédiaire mais plus proche de l’euchromatine que l’hétérochrimatine

109
Q

QU’est-ce qu’un profil de modification d’histones

A

modifications permettant aux histones de lier des protéines spécifiques sur différents segments de la chromatine

110
Q

QUe font les profils de modification des histones?

A

1) Compacter ou décondenser la chromatine
2) indique qu’un segment vient d’être répliqué
3) indiquer que les gènes sous-jacents doivent être exprimés
4) indiquer de l’ADN est endommagé

111
Q

Comment les profils de modification des histones sont obtenus?

A

Ajout ou retrait de groupement : acétyle, méthyle ou phosphate

112
Q

Comment sont modifiées les histones de l’euchromatine?

A

Les gènes actifs dans l’euchromatine sont hypo-méthylés et hyper-acetylées p/r à l’hétérochromatine

113
Q

Comment sont modifiées les histones de l’hétérochromatine p/r à l’euchromatine?

A

Les gènes inactifs de l’hétérochromatine sont hyper-méthylés et hypo-acétylés p/r à l’euchromatine

114
Q

À quoi sert la phosphorylation des histones et sur quel histone agit-elle?

A

1) Réponse aux dommages à l’ADN avec histone H2A X

2) remodelage de la chromatine et transcription active des gènes

115
Q

Quelles sont les exceptions aux 23 paires de chromosomes?

A

Spermatozoide, ovule, globule rouge

116
Q

Combien y’a-t’il de chromosomes non sexuels/autosomiques et de chromosomes sexuels?

A

22 paires autosomiques, 1 paire sexuelle

117
Q

Quel chromosome détermine le sexe masculin?

A

Y

118
Q

QU’est-ce que l’inactivation du chromosome X?

A

chez les femelles, les gènes d’un des 2 chromosomes X sont condensés et inactivé

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