Chap 4 : ADN NOYAU GÉNOME Flashcards
Quel est l’aspect phénotypique des pneumocoques virulentes et par quoi est-il formé?
Un aspect huileux, un mucopolysaccharide.
Quel est l’aspect des bactéries pneumocoques non virulentes
Un aspect rugeux (R)
Quelle est l’interprétation des travaux de Griffith?
Les bactéries vivantes du départ sont R et on suppose qu’elles ont été transformées génétiquement par un élément des bactéries tueuses (un facteur transformant)
Pourquoi les travaux d’Avery/MacLeod/McCarty n’ont pas été reconnus ?
- La structure chimique de l’ADN semblait trop simple
- Les protéines font de meilleurs candidats
- Pensaient que le passage de S à R était des mutation et que les hérédités des bactéries était trop simple comparés à des organismes comme l’humain.
Les travaux de Hershey et Chase ont trouvé quelle différence entre l’ADN et les protéines bactériennes?
- ADN a pas de soufre 2. Protéines bactériennes ont pas de phosphate
De quoi est formée la particule phagique dans l’expérience de Hershey/Chase?
ADN et protéine
Conclusion des travaux de Hershey et Chase
L’information génétique du phage pénètrant la bactérie est de l’ADN et la capside protéique du phage sert d’emballage.
Qu’a découvert Chargaff?
Que les bases A C G T ne sont pas équimolaires dans l’ADN, que la concentration de A et T est environ égale, que celle de C et G aussi (rapport de 1), et que la concentration de pyrimidines et égale è celle des purines.
Quelles bases azotées s’assemblent entre elles?
A et T
G et C
Quelles liaisons sont entre les bases azotées
Pont H
Combien de pont H y a t il entre A et T
2
Combien de liaisons H il y a t’il entre C et G
3
Quelles conclusions sont tirées de la photo de R. Franklin ?
- Il y a 2 chaines dans la molécule d’ADN
- Elles sont en forme e double hélice
- Elles sont antiparallèles
Quelle est l’unité de base des acides nucléiques?
Les nucléotides
Quels sont les 2 types d’acides nucléiques
L’ADN et l’ARN
Que veux dire ADN?
acide désoxyribonucléique
Que veux dire ARN?
Acide ribonucléique
De quoi est formé un nucléotide?
- une base azotée
- un ribose ou désoxyribose
- un groupement phosphate
Sur quel carbone du ribose ou du désoxyribose est lié le groupement phosphate?
Le carbone 5
Quelle est la particularité du groupement phosphate
Confère le caractère et l’appellation acide des acides nucléiques.
Quels sont les 2 types de pentoses?
Ribose (ARN) Désoxyribose (ADN)
Quelle est la différence entre le ribose et le désoxyribose?
Le carbone 2 du désoxyribose n’a pas un OH mais un H.
Qu’est-ce qu’une base azotée?
Des hétérocycles avec 2 atomes d’azote dans chaque cyle.
Comment sont reliés 2 nucléotides?
Par une liaison phosphodiester entre le carbone 5’ d’un ose et le carbone 3’ de l’ose adjacent –> chaine de polynucléotide (brin d’adn)
Nomme les extrémités des brins d’ADN et ce qu’elle porte.
L’extrémité 5’P contient un groupement phosphate.
L’extrémité 3’OH a un OH libre
Quel est l’ordre de lecture de la chaine d’acide nucléique?
De 5’P vers 3’OH
Quelles sont les 3 caractéristiques des brins d’ADN?
- antiparallèles
- complémentaires (par liaison H)
- hélicoidales
a
a
Où est renfermé l’ADN nucléaire?
Le noyau.
Quelles sont les 3 structures importantes du noyau?
1 L’enveloppe nucléaire
2 Les pores nucléaires
3 le nucléole
Qu’arrive-t-il au nucléole, à l’enveloppe et aux pores nucléaires avant la division cellulaire?
Ils disparaissent
Quelles sont les 2 membranes de l’enveloppe nucléaire?
La membrane interne et externe
Décrire la membrane interne de l’enveloppe nucléaire?
Elle contient des protéines servant de sites de liaison à la chromatine et à la lamina nucléaire.
Décrire la membrane externe de l’enveloppe nucléaire.
Elle est en continuité avec la membrane du réticulum endoplasmique.
Comment s’appelle l’espace intermembranaire de l’enveloppe nucléaire?
L’espace périnucléaire.
Comment s’appelle le liquide dans lequel baignent les éléments nucléaires?
nucléoplasme
Qu’est-ce que la lamina nucléaire?
Un fin réseau de filaments de lamines qui borde la face interne de la membrane interne.
Comment s’effectuent les échanges entre noyau et cytoplasme ?
via les pores nucléaires
Comment est formée la lamina nucléaire?
Par polymérisation de lamines en filaments de lamines = réseau à maille carrée interrompu par les pores nucléaires
Quels sont les rôles de la lamina nucléaire?
- maintien forme du noyau 2. stabilisation des pores nucléaires 3. organisation et fonctionnement génome
Que forme la lamina nucléaire ?
le nucléosquelette
À quoi est associée la lamina nucléaire ?
Protéines transmembranaires (site de liaisons au chromosomes ds le nucléoplasme)
Qu’est-ce qui participe à l’assemblage et au désassemblage du noyau et avec quel mecanisme ?
Le réseau de filament de lamines, avec un mécanisme de phosphorylation/déphosphorylation
Combien il y a-t-il de lamines et quels sont leurs noms?
3 : lamines A B et C
Que fait une mutation des lamines A?
Vieillissement prématuré : syndrome de Hutchinson-Gilford ou progéria
Quelle est la composante la plus proéminante d’une cellule en interphase?
La nucléole
Quelles sont les 3 composantes du nucléole?
Les centres fibrillaires (CF), les composant fibrillaire dense (CFD) et le composant granulaire (CG)
Quelle est la fonction générale du nucléole?
Synthèse et assemblage du ribosome (sous-unitésè) .
Quelles sont les 3 fonctions du nucléole associées aux 3 composants ?
- Transcription de l’ARNr par les centres fibrillaires
- Maturation de l’ARNr par le composant fibrillaire dense
- Assemblage des sous-unités ribosomiques par le composant granulaire
Comment s’appellent les protéines des pores nucléaires?
Nucléoporines
Combien de nucléoporines sont dans les NPC?
30 protéines
Les fibrilles du côté nucléoplasmique des NPC forment quoi?
une structure en panier de basket
Par quoi est stabilisé chaque NPC
Des filaments de lamine
De quoi est constitué un NPC
Un anneau perfré par un transporteur central / canal, prolongé par des fibrilles cytosoliques et nucléaires
Le mode de transport des molécules à travers les NPC dépend de quoi?
De la taille des molécules
Quelles molécules font le transport passif à travers les NPC?
Les petites protéines et petites molécules hydrosolubles
Quelles molécules font le transport actif?
Les grosses molécules (+ de 40 kDa) et les ARNt et ARNm
Quelles molécules sont importées dans le noyau à partir du cytosol?
Histones, ADN et ARN polymérase, protéines d’épissage d’ARN
Quelles molécules sont exportées du noyau au cytosol?
Sous-unités des ribosomes assemblées dans le nucléole, protéines nucléaires
Quels sont les éléments nécessaires au transport actif nucléo-cytoplasmique?
- les molécules à importer doivent avoir des signaux de transport vers le noyau
- les molécules à exporter doivent avoir des signaux de transport vers le cytosol
- les molécules à transporter doivent s’associer à des récepteurs d’importation et d’exportation nucléaire
- Protéine Ran et hydrolyse GTP
- Les récepteurs de transport nucléaire doivent faire continuellement la navette entre le cytosol et le noyau
Comment se nomment les 2 types de récepteurs de transport nucléaire?
Importines et exportines
Quels sont les 2 signaux de localisation dans la protéine cargo qui déterminent sa destination finale?
- Le signal de localisation nucléaire (NLS)
2. Signal d’exportation nucléaire (NES)
Par quoi est reconnu le NLS?
Importines
Par quoi est reconnu les NES
Exportines
Où se situe Ran?
Cytosol et noyau
Qu’est-ce que la protéine Ran?
Une GTPase monomérique dont l’hydrolyse du GTP donne l’énergie nécessaire au transport des molécules à travers le NPC
Quelles sont les 2 protéines régulatrices de Ran?
Ran-GAP et Ran-GEF
Où se situent GAP et GEF?
GAP=cytosol, GEF = noyau
Qu’est-ce que GAP?
Protéine activant la GTPase, déclenche l’hydrplyse du gtp –> Convertit Ran-GTP en Ran-GDP
Qu’est-ce que GEF
Un facteur d’échange de guanine, convertit Ran-GDP en Ran-GTP
Quelles sont les étapes de l’importation des protéines cytosoliques?
- importines se lient au NLS
- complexe d’import est guidé vers NPC à l’aide des fibrilles cytosoliques
- protéine de cargaison est transportée dans le noyau
- importines retournes vers le cytosol par le NPC
Quelles sont les étapes d’exportation des protéines nucléaires?
- exportines se lient au NES
- complexe d’export passe à travers le NPC en interagissant avec les fibrilles du panier de basket
- dans le cytosol, la protéine cible se dissocie de l’exportine qui retourne au noyau
Comment se lient les différents types d’ARN aux exportines?
Les petits ARN se lient directement aux exportines et les snRNA et les grands ARN ont besoin de protéines adaptatrices spécifiques.
Génome :
Ensemble spécifique des gènes organisés dans un ou plusieurs chromosomes
Gène : 2 définitions
- Séquence ordonnée de nucléotides qui occupe une position précise sur un chromosome déterminé
- fragment d’ADN ou ARN (virus) qui porte le plan de fabrication d’une protéine.
Combien de protéines est associée à un gène?
1
Combien de gènes est associé à une protéine?
1 ou +
Chromosome =
macromolécule constituée d’une molécule d’ADN associée équitablement à des protéines histones et non histones, constituée de chromatine
Vrai ou Faux : le nombre et l’aspect général des chromosomes peuvent différer entre les individus d’une même espèce.
Faux
Qu’est-ce qu’une région polymorphe?
Régions dont la morphologie peut présenter des variations de taille liées à la présence de séquences répétées en nombre variable non codantes qui se trouvent aussi au niveau des centromères et des télomères
Quels sont les 2 formes de chromosomes?
Interphasique et Mitotique
Où sont les chromosomes interphasinque?
Périphérie de la membrane nucléaire interne, liés à des protéines membranaires associées à la lamina nucléaire dans le cytoplasme
Vrai ou faux : la chromatine d’un chromosome interphasique n’est pas compactée de manière uniforme?
Vrai
Quelles sont les 2 régions du chromosome interphasique et quelles sont leurs particularités?
Euchromatine : compactée, contient les gènes actifs
Hétérochromatine : moins compactése, contient des gènes inactifs
Qu’est-ce qu’un centromère ?
Zone de constriction du chromosome et zone de fixation sur les fibres du fuseau mitotique
Télomère =
Séquence répétitive d’ADN retrouvée à chacune des 2 extrémités des chromosomes
Vrai ou Faux : le nombre de répétitions télomériques diminue avec l’âge?
Vraii
Quelle est la fonction des télomère?
stabilisation et protection des extrémités chromosomiques (afin de les répliquer) si pathologique peut mener à des cancers
Que sont les origines de réplication?
Points de départ de la réplication de l’ADN
Décrire les bases azotées comprises dans les origines de réplications ?
Séquences d’ADN riches en A-T car elles ont 2 ponts H et sont plus faciles à ouvrir
Quelle est la dernière région du chromosome à se séparer durant l’anaphase?
Les centromères
Qu’est le centromère au niveau moléculaire?
Des séquences d’ADN en tendem répétées beaucoup de fois sans rôle de transcription
Combien de gènes sont nécessaires à la vie d’une cellule?
moins de 400
Combien de gènes l’humain a?
environ 30 000
Combien de paires de chromosomes à l’humain?
23 (46 total)
Quelle est la strucure de base de la chromatine?
Le nucléosome
Qu’est-ce que le nucléosome?
Un octamère d’histomes autour duquel s’entoure l’adn
Quelle est la composition des histones?
Riches en lysine et arginines (positives)
COmme se lient les histones à l’ADN
Liaisons électrostatiques: Les groupement phosphates (-) de l’ADN se lient au charges positives des lysines et arginines des histones
Que sont les queues d’histones et que peuvent-elles faire?
Une longue chaîne N-terminale qui sort du nucléosomes. Peuvent subir des modifications covalentes pouvant modifier la structure de la chromatine : acétylation, méthylation, phosphorylation
Que relie 2 nucléosomes successifs?
Un ADN linker de 200 pb
Que font les histones H1?
Elle empaquettent les nucléosomes en rangées régulières et répétitives sous forme de fibres de 30 nm de diamètre = premier niveau de compaction
Hétérochromatine =
forme d’ADN le plus condensé du chromosome en interphase
Localisation et formation de l’hétérochromatine
Localisée en périphérie du noyau et du nucléole. Concentré au centromère et télomère
% de l’ADN humain sous forme hétérochromatine?
10%
Vrai ou faux : des gènes en région d’hétérochromatine sont activés?
Faux
Euchromatine =
Forme décondensée et despriralisée de 10-12nm de diamètre de la chromatine
% d’euchromatine chez l’humain?
10%
80 % dans un stage intermédiaire mais plus proche de l’euchromatine que l’hétérochrimatine
QU’est-ce qu’un profil de modification d’histones
modifications permettant aux histones de lier des protéines spécifiques sur différents segments de la chromatine
QUe font les profils de modification des histones?
1) Compacter ou décondenser la chromatine
2) indique qu’un segment vient d’être répliqué
3) indiquer que les gènes sous-jacents doivent être exprimés
4) indiquer de l’ADN est endommagé
Comment les profils de modification des histones sont obtenus?
Ajout ou retrait de groupement : acétyle, méthyle ou phosphate
Comment sont modifiées les histones de l’euchromatine?
Les gènes actifs dans l’euchromatine sont hypo-méthylés et hyper-acetylées p/r à l’hétérochromatine
Comment sont modifiées les histones de l’hétérochromatine p/r à l’euchromatine?
Les gènes inactifs de l’hétérochromatine sont hyper-méthylés et hypo-acétylés p/r à l’euchromatine
À quoi sert la phosphorylation des histones et sur quel histone agit-elle?
1) Réponse aux dommages à l’ADN avec histone H2A X
2) remodelage de la chromatine et transcription active des gènes
Quelles sont les exceptions aux 23 paires de chromosomes?
Spermatozoide, ovule, globule rouge
Combien y’a-t’il de chromosomes non sexuels/autosomiques et de chromosomes sexuels?
22 paires autosomiques, 1 paire sexuelle
Quel chromosome détermine le sexe masculin?
Y
QU’est-ce que l’inactivation du chromosome X?
chez les femelles, les gènes d’un des 2 chromosomes X sont condensés et inactivé
