Cancergenetik Flashcards
Hvilken type gener er oftest involveret i arvelige cancer? hvorfor?
tumor supressor gener
- arver mutation på 1 allel (1.hit)
- mutation opstår på 2. allel (2.hit)
Hvad er somatiske mutationer?
- tilfældigt opstået mutationer
- sker kun i sygdomscellerne - her kræftceller (andre celler har vildtype)
- miljøfaktorer
Hvad er germline mutationer?
- monogen, polygen, kompleks mutation
- sker i alle celler
- arveligt
Hvordan aktiveres onkogen?
- kræver kun mutation i enkelt allel
- konstitutivt aktiv
- mere transkription, øget vækst
Hvad inddeles tumor supressor gener i?
care-takers
- DNA repeair
- BRCA gener
gate-keepers
- TP53
Hvad sker der med tumor supressor gener når cancer opstår?
begge alleler slukkes og giver vækstfordel for cancer.
- mutation
- deletion
- DNA- methylering
Hvad betyder tab af heterozygosity?
får 1 muteret og 1 rask fra forældre = heterozygot
ved tab af den raske inaktiveres tumot supressor = vækstfordel
Hvad betyder det at det er sekvenser af genetiske begivenheder der giver kræft?
- ophobning af mutation i både onkogener og tumor supressor
- typisk aneuploide (flere kromosomsæt 3n, 4n)
Hvad er NGS metoden? steps?
Next Generation Sequencing
- DNA oprensning
- fragmentering
- ligering af adaptor
- PCR
- bridge amplifikation
- Sekeventering
- data allignes
i solide tumor ses ofte den samme somatiske punktmutation i et bestemt gen. hvilken gentype er det?
onkogen
Hvad kan bedst forklare at der ses mange kromosomale forandringer i en tumor?
at én driver mutation inaktiver et caretaker-gen, som dermed ikke kan tage sig af det, hvis der skulle ske kromosomale forandringer.