biyokimya hifa

Question 1

peptit bağının yarı ömrü kaç senedir

Answer 1

20

Question 2

enzim ne işe yarar?

Answer 2

çabuk yıkılması gereken hormon gibi proteinlerin peptit bağ yıkımını hızlandırırlar

Question 3

peptit bağ yıkımı hızı hangi 3 yolla arttırılabilir?

Answer 3

1-ortam sıcaklığının artırılması
2-reaksiyona giren madde konsantrasyonunun artırılması
3-ortama katalist eklenmesi

Question 4

katalistler

Answer 4

reaksiyona giren fakat reaksiyon sonucunda değişime uğramadan çıkan maddelerdir
canlı sistemlerde enzimler katalist görevi görür

Question 5

enzimlerin özellikleri

Answer 5

bazı rna yapısındaki enzim benzeri moleküller (ribozimler) hariç bütün enzimler protein yapısındadır.
kimyasal reaksiyonların hızını artırırlar
enzimle katalizlenen reksiyonlar 10^8- 10^12 kat daha hızlı
aktivasyon enerjisini düşürürler
denge sabitini değiştirmezler
enzimin etki ettiği moleküle substrat denir
birincil ikincil üçüncül ve dördüncül yapıları katalitik aktivite için esastır
bir veya birden fazla substrat ile etkileşir fakat tek tip reaksiyon katalizlerler
genelde doğal koşullarda (atmosferik basınç ve fizyolojik sıcaklık) aktivite gösterirler
katalizlenmeden hızlı olan reaksiyonlar bile genelde katalizlenir

Question 6

kimotripsin

Answer 6

en çok çalışılmış ve anlaşılmış enzimlerden

pankreasta üretilip ince barsaklara salgılanır, diyetle alınan proteinlerin sindirimine yardımcı olur

Question 7

aktif merkez

Answer 7

substrat enzimin bu bölgesine bağlanır
aktif merkezdeki belli aminoasitlerin etrafında polipeptitlerin hidrolizi gerçekleşir
*yük taşıyabilir
*hidrofobik ya da hidrofilik olabilir
*flexibl olabilir

Question 8

enzimin çalışabilmesi için temel şart

Answer 8

doğal protein konformasyonunun sağlamlığı

Question 9

katalizlenmeyen reaksiyon yavaşlığı ve enzim hızlandrıma ilişkisi

Answer 9

katalizlenmeyen reaksiyon ne kadar yavaşsa enzim reaksiyon hızını o kadar arttırabilir

Question 10

reaksiyon spesifikliği

Answer 10

enzimler genellikle katalizlediği reaksiyona giren substrat ve reaksiyondan çıkan ürünlere spesifiktir
bu özellik aktif merkezdeki fonksiyonel grupların substratı tanıyabilmesi ve ayırabilmesiyle olur

Question 11

enzim aktivitelerini ne düzenler

Answer 11

organizma

böylece değişen koşullara enzim aktiviteleri aracılığıyla cevap verilir

Question 12

aktivasyon enerjisi

Answer 12

aktivasyon enerjisinin bariyeri nek adar yüksekse reaksiyon o kadar yavaş
enzimler bunu düşürür

Question 13

proenzimler

Answer 13

zimojenler
ilk sentezlendiklerinde inaktiv olup hedef dokularında aktivleşen enzimlere denir
örn: pankreas enzimleri- sindirim enzimleri

Question 14

izoenzimler

Answer 14

izozimler
aynı reaksiyonu katalizleyen ama aminoasit dizimlerindeki farklılıktan dolayı farklı fiziksel özellikleri olan enzimler
farklı sayıda yüklü aminoasit taşıyabilirler
birbirlerinden elektrofezle ayrılabilirler
ör: CK1(BB) CK2(MB) CK(MM)

Question 15

kofaktör

Answer 15

ya fe,mg,mn,zn gibi 1+ inorganik iyon ya da koenzim denen organik veya metalloorganik kompleks moleküldür

Question 16

metal-activated enzim

Answer 16

metal iyonları enzime zayıf bağlanmış veya kolay dissosiye olabilen enzimler

Question 17

metalloenzim

Answer 17

metal iyonlarının enzime sıkı bağlı olduğu ve kopamadığı enzimler

Question 18

koenzim öncül molekülleri genelde

Answer 18

vitaminler

vücutta ufak değişikliklerle koenzimleri meydana getirir

Question 19

holoenzim

Answer 19

enzim koenzimi ile birlikte ve katalitik bakımdan tamamen aktif durumda ise bu haline holoenzim denir

Question 20

prostetik grup

Answer 20

koenzim apoenzime (protein kısım) kovalent bağlı ise buna prostetik grup denir
(non-kovalent de bağlanabilir ama bu prostetik grup
olmaz)

Question 21

fisher’in anahtar kilit modeli

Answer 21

substrat ve enzimin aktif yerinin birbirine uyacak şekilde önceden belirlenmiş olduğu varsayılır
geçerliliğini kaybetse de doğruluk payı var

Question 22

koshland’ın uyum oluşturma modeli

el eldiven modeli

Answer 22

aktif merkez esnek yapıdadır

enzim substratını katalize uygun en doğru biçimde bağlayacak biçimsel bir değişikliğe uğrar

Question 23

katalitik aktivite

Answer 23

tek bir enzim molekülü tarafından birim zamanda (saniye) ürüne dönüştürülen substrat molekülü sayısına enzime ait dönüşüm sayısı veya molar katalitik aktivite denir
sembol: Kcat

Question 24

International Unit (IU)

Answer 24

en çok kullanılan enzim aktivitesi birimi

1 dakikada 1 mikromol substratın ürüne dönüşümünü katalize eden enzim miktarını ifade eder

Question 25

katal

Answer 25

enzim aktivitesinin bir ifade şekli

1 katal enzim aktivitesi: 1 saniyede 1 mol substratın ürüne dönüşümünü kataliz eden enzim miktarını gösterir

Question 26

spesifik aktivite

Answer 26

enzim aktivitesi ifade şekli

mg protein başına düşen enzim aktivitesi

Question 27

mutlak spesifiklik

Answer 27

enzimleri spesifik bir substratı, spesifik bir reaksiyonunu kataliz etmesi özelliğidir
enzimlerin çoğu mutlak spesifiklik gösterir

Question 28

grup spesifikliği

Answer 28

enzimlerin sınırlı sayıda substrata etki etmesi
ör: aminotransferazlar amino grubuna etkili
alkol dehidrojenazlar alkol üzerine etkili

Question 29

bağ spesifikliği

Answer 29

peptid bağı, glikozidik bağ vb.

Question 30

stereospesifiklik

Answer 30

enzimlerin optik izomerlere etkili olması özelliğidir

Question 31

enzimlerin hücre içi dağılımı

Answer 31

metabolik aktiviteler farklı organellerde gerçekleştiği için enzimlerin dağılımı da çeşitlilik gösterir
ör: glikoliz enzimleri sitoplazmada
solunum zincirinde görevli enzimler mitokondride lokalize

Question 32

enzimatik bir tepkimenin hızını etkileyen faktörler

Answer 32

enzim konsantrasyonu
substrat konsantrasyonu
ph
sıcaklık
ışık
ürün konsantrasyonu
kofaktör ve koenzimlerin konsantrasyonu
modülatör ve inhibitörlerin konsantrasyonu

Question 33

enzimlerde geleneksel adlandırma

Answer 33

substrata ya da aktivitelerini tanımlayan kelime/sözcük grubuna -az eki eklenir
substratı tanımlayan: üreaz, amilaz, arjinaz, proteaz, lipaz
tepkimeyi tanımlayan: DNA polimeraz, lakat dehidrojenaz, adenilat siklaz

Question 34

enzimlerin sınıflandırılması 6 alt grup

Answer 34

1-oksidoredüktazlar
2-transferazlar
3-hidrolazlar
4-liyazlar
5-izomerazlar
6-ligazlar

Question 35

oksidoredüktazlar

Answer 35

oksidasyon-redüksiyon (yükseltgenme indirgenme) reaksiyonlarını katalizleyen enzimler

Question 36

transferazlar

Answer 36

fonksiyonel bir grubun (amino açil fosfat karbon glikozil grupları vb) transfer reaksiyonunu katalize eden enzimler

Question 37

hidrolazlar

Answer 37

su katılması bağların parçalandığı hidroliz tepkimelerini katalizleyen enzimler
genelde c-o c-n c-s bağlarının hidrolitik yıkımı
tripsin, kimotripsin, a-amilaz, a-glukozidaz

Question 38

liyazlar

Answer 38

C-C C-O C-N bağlarını hidrolizden ve oksidasyondan farklı bir yolla kıran veya bu atomlar arasına bağ ilave eden enzimler
çift bağlardan grup çıkmasını katalizlerler

Question 39

izomerazlar

Answer 39

bir moleküldeki geometrik ve yapısal değişiklikleri yani izomerizasyon reaksiyonlarını kataliz eden enzimler

Question 40

ligazlar

Answer 40

c-o c-s c-n c-c arasında yeni bağ oluşturan enzimlerdir

gerekli enerji atp vsden sağlanır

Question 41

EC isimlendirme

Answer 41

1961 yılında enzim komisyonu kod numaralı sistem

4 numara var

Question 42

EC isimlendirme 1. numara

Answer 42

a:ana sınıf
6 ana sınıftan biri
tepkimenin tipini ifade eder

Question 43

EC isimlendirme 2. numara

Answer 43

b:subklas

vericinin etkilediği grubu ifade eder

Question 44

EC isimlendirme 3. numara

Answer 44

c:subsubklas

alıcı olarak yararlanılan grubu ifade eder

Question 45

EC isimlendirme 4. numara

Answer 45

d:subsubklas seri no

adlandırılan enzimi belirler

Question 46

enzim konsantrasyonu tepkime hızı ilişkisi

Answer 46

yeterli substrat bulunması halinde optimal şartlarda tepkime hızı enzim kons. ile orantılı artar

Question 47

substrat konsantrasyonu reaksiyon hızı ilişkisi

Answer 47

enzim moleküllerinin hepsinin ES kompleksi oluşturduğu noktada reaksiyon hızı max.
bu noktadan sonra substrat konsantrasyonu hızı artırmaz.
yani bir zamana kadar artar sonra doygunluğa ulaşır
enzim sayısından fazla substrat oluncu doygunluk
yavaşlayarak artan grafik

Question 48

pHın enzim aktivitesi ilişkisini değiştirdiği 2 yol

Answer 48

1- ph enzimin ve substratın yüklü hallerinde değişiklik yaparak enzim aktivitesini değiştirir
2-ph enzimin aktif bölge iyonizasyonuna etki eder

Question 49

enzimler genelde hangi ph aralığında en etkili

Answer 49

5-9

Question 50

sıcaklık enzim aktivitesi ilişkisi

Answer 50

genelde 10c artış %10 daha yüksek enzim aktivitesi sağlar, başlagıç hızının 2 katı?
reaksiyon hızı maxa gelene kadar sıcaklık aktiviteyi artırır
sıcaklık kinetik enerji artırıp aktivasyon enerjisinin çabuk geçilmesini sağlar
yüksek sıcaklık enzimlerin 2.l 3.l yapılarını bozar, denatüre eder, katalitik aktivite bozulur

Question 51

enzim aktivitesinin ölçülmesi

Answer 51

reaksiyon sırasında [S] (substrat) azalırken [P] (ürün) artar. Bu doğrusal şekilde olur.
substrattaki azalma ile ürün artış oranı aynıdır.
reaksiyon hızı: substrat kons. azalma oranı veya ürün kons. artma oranı
oran: zamana oranlanır

Question 52

enzim kinetiği?

Answer 52

Enzim aktivitesinin yeterli olup olmadığını ve bu aktiviteyi düzenlemek için yapılabilecekleri değerlendirmek için öncelikle enzimin aktivitesini ölçmek gerekir
amaç enzim aktivitesini matematiksel ifade etmek
Enzimin hücre içindeki rolünü anlamak ve gerektiği durumlarda enzimin çalışmasını durdurabilmek için aktiviteye etki eden faktörlerin değerlendirilmesi