Biomolécules Flashcards
Sous ensemble d’é. chimiques qui formes les systèmes vivants
C(18%), N(3), O(65%), H(10) et un peu de Ca, P, K, S, Cl, Na mg
Organisme vivant a besoin de
Carbone
Famille de bloc de construction moléculaire (les biomolécules)
Acide aminés, glucides, lipides, nucléotides
Nucléotides fonction
Structure de l’ADN/ARN, information génétique, énergie
Polymères
Polypeptide (acide aminées), polysaccharides(glucides), acide nucléiques( nucléotides)
Liquide intracellulaire
Majoritairement de l’eau (solvant)
Propriété macroscopique de l’eau
Solvant, abondant, large présence
Structure de l’eau
Déséquilibre entre l’hydrogène et l’oxygène
Qu’est-ce que sont les interaction ioniques et où se passent-elles dans les AA?
Interaction léectrostatique entre 2 groupements de charge opposées (ions). Interaction entre groupement carboxylate et amino
Ordre des forces de liaisons
Covalente > ioniques > pont hydrogène
Liaisons hydrogènes (Ponts h)
Conséquence des dipôles (polarité). Dipôle négatif sur atome hydrogène interagit avec l’oxygène ou l’inverse. Ça peut être Eau-eau ou Eau-alcool ou Eau amine
Glace???
Orientation tétraédrique des liaisons H autoure de l’O
L-analine et D-analine
Caractéristiques acides aminés hydrophobes
Non-polaires
Interaction faible ou nulle avec l’eau
svt dans la protèines
participent pas directement aux réaction chimique
Alanine, valine, phénylalanine, tryptophane, leucine, isoleucine, méthionine, proline
Acides aminés polaire snon chargées
Sérine, Thréonine, Tyrsoine, cystéine, asparagine, glutamine, histidine, glycine
Histidine***
AA polaires. Groupement imidazole (le cycle avec 2 N) peut gagner ou perdre unn proton en fct du pH.
Permet de moduler l’activité d’une prot en fct du pH
Glycine
Seul AA non chiral
Non-hydrophobe et non chargé, -> aa polaires ou hydrophobe
Acides aminés polaires chargés
Chaine latérale chargée a ph Physiologique (7.0 - 7.4)
POlaire
Ds les prots, les AA pol. forment des contacts avec le solvant
Aspartate Glutamate (-) Lysine arginine (+)
Effet tampon
Variation faible du pH lorsqu’une solution est proche du pKa
Point isoélectrique(Pi (zwitterion)
pH où l’acide aminé est électriquement neutre
pI= (pKa1 + pKa2)/2
si di basique: pI= (pKa2 + pKa3)/2
Valeur du pKa des groupes a-carboxyle, a aminé, et chaine latérale
A carboxyle - 2
a-aminé- 9,5
Chaine latérale:
acide aspertique et glutamique 4
histidine: 6
cystéine: 8,4
lysine et tyrosine: 10.5
arginine: 12
