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UE1 Biochimie > Biomol > Flashcards

Biomol Flashcards

1
Q

Dans un brin d’ADN le pentose des nucléotides est un beta -D-ribose.

A

! 2 ! beta DEXOSY d ribose

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2
Q

TFIID est également capable de provoquer l’ouverture et le déroulement de la double hélice d’ADN.

A

c’est TFIIH

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3
Q

L’ARN est synthétisé dans le sens 3’ vers 5’

A

lu ds 3’ 5; MAIS synthetise ds sens 5’3’

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4
Q

Lors de l’excision-epissage , il y a formation d’une liaison phosphoester entre le phosphate en 5’ site du accepteur AG et la fonction alcool porté par le carbone 3’ du site donneur GU.

A

vrai

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5
Q

ADN et ARN : memes bases qzotees

A

non

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6
Q

cofactuer eIF4 asso a ATP permet la fixation d’un ARNm sur la sous unite 40S du ribosome

A

yes

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7
Q

GCCACCCAGTGA(=stop) : cb d’hydrolyse de l riches en E ?

A
  1. on a donc 3 aa donc 3x4 = 12 l riches en E
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8
Q

gunaylyl transferae peut hydrolyser un ATP en AMP

A

non GTP en GMP

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9
Q

ADN dexoy polymerase sigma peut hydrlilser un ATP en AMP

A

non un desoxy ATP en desoxy AMP

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10
Q

exon 1 - exon 2 - eon 3 - GU A AG - exon 4 - exon 5 : ou commence epissage aletnr

A

A PARTIR du donneur donc on aura exon1-2-3 puis exons 4-5-6 possible

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11
Q

seq codante dun gene comprise entre ATG et vodon stop

A

yes

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12
Q

motif proteique de l a ADN : helice coude helice

A

non helice BOUCLE helice

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13
Q

trypto = UGG : ACC = anticodon

A

non CCA anticodon

3’UGG5’

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14
Q

peptide signal riche en aa hydrophyiles oun hydrophobes

A

hydrophobes : eviter interaction ac eau

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15
Q

synthese du brin nouveau ADN ne peut pas se faire qd ADN polymerase sigma atteint extr 3’ faute de place pour ue amorce complementai

A

oui

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16
Q

ADN polymerase sigma intervient ds synthese des amorces Okasaki

A

non

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17
Q

la telomerase n’allonge qu’un seul des 2 brins ADN a lextre de chorom

A

yes

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18
Q

quelles enz necessite PAS matrice

A

que polyA polymerase ttes le autres y compris la telomerase utilise une matrice A=d’ARN ou ADN

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19
Q

telomeres empechent degradation enzymatique des chromosone spar les deoxyribonucleaes

A

yes

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20
Q

une ribonuclease peut hydrolyser l phospho esther d’aDN

A

non DESOXYribonuclease
ribo= ARN
nucelase = tout le monde

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21
Q

ADN polymerase sigma peut hydrolyser l phospho esther

A

yes

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22
Q

ct terminaison de la traduction : q enz

A

cofacteur eRF (eucaritye Relargage factor) : hydrolyse l esther actviee entre artn 3’ et COOH de aa

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23
Q

aa et arnt liee par N ter ou C ter

A

N ter pour aa et 3’ pour ARNt

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24
Q

4 consequences de action de eRF

A

lib de chaine pepti, de ARnm, de artn et disso des 2 soous unites du ribosomes

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25
Q

Bilan energetique de la trduction pdt elongation

A

4 - charge aa sur artn (ATP_AMP_ - Arnt charge sur site A(eEF1 GTP –> GDP) - translocation peptidyl anrtt de A a P (eEf2 GTP–> GDP)

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26
Q

synthese de prot avec peptide sigal a int de RE ?

A

oui

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27
Q

taille signal peptide 4/5

A

15-20 aa hydrophobes

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28
Q

qui reconnait signap pep 5/5

A

particule SRP = particule ribonucelique 7S

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29
Q

qui a peptide signal 5/5

A

prot excetrices = secretee

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30
Q

prot excretices vers ou 5/5

A

membrane ou organites

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31
Q

ou chainon de 15-20 aa ou nucelotide = signal pep 4/5

A

15-20 ACIDES AMINES donc ds partie codante en N ter

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32
Q

bilan energetique de elongation inclue charge aa ur anrt

A

yes

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33
Q

def origine de repli

A

region de adn reconnues par des prot d’initaion de la repli

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34
Q

prot inition de repli permetttent recrutement des 2 cx

A

yes

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35
Q

30 origines de repli par chroo

A

non des centaines

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36
Q

2 brins synthetise sumultanemen : m mecanisme

A

non

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37
Q

toposiomerase retablit pas de ADN

A

yes = 10 paires de nucleotides

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38
Q

diff primase et topoisomerSE

A

primase : ARN polymerase vs topoisomera retablit pas de adn apres helicase

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39
Q

repi: prot stabilisant double brin 5/5

A

SIMPLE car on fait brin par brin

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40
Q

cb de nucleotides synthetisent la primase 5/5

A

10 RIBOnucleotides

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41
Q

primase abeosin d’une amorce 5/5

A

non

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42
Q

ct polymease fonctionne gal

A

ont leur matrice

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43
Q

adn polyemrase alpha ajoute cb de ribonucelotides

A

20 DESOXYRIBO a partir de son extr 3’ OH libre

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44
Q

adn sigma est un monoere 5/5

A

non 2 sous unites

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45
Q

ADN polymerase utlise de ATP, GTP 5/5

A

non desoxyATP dexosyGTP

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46
Q

ADN polymerase lit ds qu sens et synthetie ds m sens 5/5

A

non lit en 3’5’ et syn en 5’3’

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47
Q

quelle polymerase a une acti exonucleasique 5/5c

A

ADN polymerase

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48
Q

ct corection des mesappariemtn pdt repli

A

ADN poly sigma peut hydroliser l esther entre phospate du dernier nucleotide et le carbone 3’ de avt denrier nucleotide ==

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49
Q

produit de hydroliser l esther entre phospate du dernier nucleotide et le carbone 3’ de avt denrier nucleotide = nucleotide ribo monophosphate 5/5

A

non desooxyribo

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50
Q

pq 2 sous unites de ADN poly sigma

A

car 1 unite pour brni continu et 1 unite pour brin de okazaki

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51
Q

ADN ligase = polymerase

A

non ELLE NE RAJOUTE PAS DES NUCLETODES

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52
Q

ADN : cb de l riches en E conso

A

2: ATP–> AMP ==> intermediaire 5’ diphosphate activee ==> formaiton possible de l phosoph esther entre extr3’OH du fragment 1 et 5’p de frag 2 puis lib AMP

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53
Q

role de ATP ds ADN ligase

A

forme un intermediaire 5’diphosphate active qui permettra l phosph esther entre frag 1 et2

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54
Q

intermediaire 3’diphosphate

A

non 5’diphospaht eactie

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55
Q

taille amorce 5/5

A

30n : 10 + 20

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56
Q

synthese du brin adn en pls fragments (= brins okazaki) ?

A

yes

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57
Q

replication des 2 brins contnue 5/5

A

non pas de okazaki

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58
Q

def nucelase 5/5

A

enz qui hydrolyse l phospho esther

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59
Q

destruciton de toutes les amocres

A

non que amoreces ARN par donc les RIBOnueclaes

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60
Q

telomere : extr 3’ ou 5’ sailllante

A

3’ saillante = boucle car bcpde gunine

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61
Q

formule seq de telomeres 5/5

A

TTAGGG

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62
Q

seq complementaire du telo

A

CCUAA

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63
Q

qui est amorce de la telemoerase 5/5

A

etxr 3’ OH libre du brin ADN

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64
Q

telomerase a besoin d’une amorce

A

yes

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65
Q

telomerase agit sur les 2 brins

A

non que sur UN brin –> brin compl synthe grace amorce(primase adn poly alpha puis adn poly sigma puis ligase)

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66
Q

seq de telomere = hexamerique

A

yes TT A GGG

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67
Q

sens de lecture ARNm 5/5

A

5’3’

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68
Q

lecture du arnm par 40s surotut

A

non RIBOSOMES COMPLET

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69
Q

trad: lec par unite nucleotique

A

non par codon

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70
Q

code genetique assure cores entre aa et codon 5/5?

A

yes

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71
Q

code genetique est normal

A

non degenere

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72
Q

cb de codons

A

64 codons mais 61 codant pour des aa

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73
Q

pq un aa peut etre ode par pls codons

A

car derniere ase libre donc mesappariement avec premier base de anticodon

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74
Q

code G : AUCGou ATCG

A

yes

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75
Q

esp entre des ribosomes

A

100n

76
Q

trad: appariemnt cdon et anticodon //

A

non anti //

77
Q

trad: arnt gros arn

A

petis

78
Q

quelles l faibles maintiennet forme de L

A

hydrogene

79
Q

trad: artn bases aty

A

yes thymine hypoxanthine

80
Q

qui assure charge aa sur artn

A

amino acyl anrt SYNthetases

81
Q

trad: meca de charge aa sur artn

A

intermediaire active amino acyol donc on rjoute AMP(ATP–> AMP cofacteurmg2+

82
Q

type de l artnt et aa

A

esther activve entre 3’ et COOH de aaa

83
Q

intermaediare active aa ou artne t type de l

A

aa : l anhydre MIXTE riche en E entre phosphate alpha et AMP

84
Q

cb de l riches en E conso par aa chargee

A

2 –> intermaa0acyl donc AMP

85
Q

eIF2 peut amener qrnt acc nmmpore quel aa

A

non methiionine

86
Q

qui est seul eIf ou eEf assoi a ATP

A

eIF4 –> amener ARNm a 40s

87
Q

qui amene 60s

A

eIF5 )necessite E)

88
Q

qui amene ARNt-methio au site P

A

eIF2 (GTP dpt) –> GDP

89
Q

qui reconnait coiffe de ARNm mature : ribosome entier

A

non 40s

90
Q

nom du codon initeur

A

AUG

91
Q

nom d el’anticodon de la methi

A

= anti AUG –> 3’ UAC –> 5’ CAU

92
Q

qui deter cadre de lecture

A

liason ARNt methi (via anticodon CAU) et et ARNm (via codon AUG)

93
Q

quel cofacteur fixe ARNm a 40s

A

EiF4 (ATP)

94
Q

qui recurte nouvel arnt

A

eEF1 (GTP)

95
Q

qui permet transfert de chaine pep, artnt, arnm du site P vers A

A

eEF2 (GTP)

96
Q

qui creent l peptide entre C tern du dernier aa et N ter du nouveau

A

il faut E –>hydrolyse l esther riche en E ARNt et son aa

97
Q

trnsfert chaine pepti de A a P

A

non d’abord transfert chain epeti de P vers A (l dernier aa de la chaine C term et N term du aa tjs relies a son artn)

98
Q

brin transcrit = brin sens sou antisens

A

antisens

99
Q

gene : % adn chromo

A

10%

100
Q

def gene (5/5)

A

seq de nucelo desoxyribo codant pour une prot OU un acide RIBOnucleique

101
Q

gene code que pour des prot

A

non aussi des acides RIBOnucleiqes

102
Q

genes codent pour des acides nuceliques

A

juste RIBO pas DESOXYribo

103
Q

le brin sens de sert jamais de matrice a ARN polymerase 2

A

yes

104
Q

brin sens le m pour tous les chromo

A

non dpd des chromo mais id pour un m gene

105
Q

qd regulation

A

transcirp - matureation - traudction – activation de la prot par des modifs posttraducitonne (par phopshorulation glycolisaiton

106
Q

def transcrip

A

lecture d’un gene par ARN polyemras 2 pour donner un trascrit primaire

107
Q

cis regu que ds le promoteur

A

non aussi en amont ou dans les introns

108
Q

cis regu peut etre ds les exonsn

A

non car pas cdant

109
Q

taille du promoetur (***)

A

1000n

110
Q

boite CAAT et TATA = elements cis

A

yes

111
Q

boite TATA ou CAAT reconnue par TF2D

A

TATA

112
Q

ou boite CAAT et TATA

A

80n vs 20-30n avt debut de transciop

113
Q

boite TATA et CAAT symetriques sur les 2 brins

A

TATA yes mais CAAT no bc elle permet orienter transc (sens : en amont de TATA - antisens : en aval de TATA)

114
Q

elements cis propres a chque genes dpd de quoi

A

des tissus et d enevi

115
Q

1 seul type de facteur trans

A

non trans activatuert ou trans inhibiteyr

116
Q

facteurs trans se fixe sur le petit sillon

A

non grand sillon

117
Q

ct fixation des facteurs trans sur factuers cis de adn

A

domaines de liaison

118
Q

q type de l ct fixation des facteurs trans sur factuers cis de adn

A

faibles (hydrophones electro hydrogenes)

119
Q

3 domaines proteiques de liaison a ADN

A

helice BOUCLE (pas coude) heclie - fermeturre a leucine - doigt de zinc

120
Q

cb de nucleotide cx initiaion de transc

A

100n

121
Q

si TF2D transcitipn okay

A

non il faut que les autres TF, qui sont indispemsables se fixent

122
Q

TF2D se fixe ds grand sillon de ADN

A

non petit

123
Q

role des facteurs trans activateurs

A

faciliter fixation de TF2D a TATA

124
Q

TFIID cofacteur de ARN polymerase 2

A

yes

125
Q

transcirp: cb de l riches en E par nucleotide incorpore

A

2 –> hydrolyce ATP/GTP en AMP/GMP …

126
Q

transcirp: ajout de nucelotide en 5’

A

non 3’

127
Q

premier nucletoide du transcit primaire est un monophosp

A

non triphops

128
Q

qui astruc en epingles a cheveux et q q extr

A

trascnrit priamire en 5’

129
Q

transcrit primaire commence et se termine par un exon

A

yes

130
Q

def transcir primaire 5/5

A

seq ADN entre site initiation et fin de transc

131
Q

tout le gene est codant 5/5

A

non seq entre ATG-AUG et STOP

132
Q

complexe multiexymatique qui rajoute coiffe

A

7 methyl guanosine tri phosphate

133
Q

3 etapes ajout de coiffe en 5’

A
  1. hydrolyser P(sigma)-P(beta) de nucleotide 1
  2. hydrolyse GTP en GMP –> l phospho esther entre P(beta) du preimer n et P(alpha) du GMP
  3. ajout de CH3 sur N numero 7 du guanylate
134
Q

role de la coiffe que proteger adn

A

non aussi reconnaisance par les ribosomes- sortie du noyau par les pores

135
Q

m roles endonucelase coiffe et queue polyA

A

yes

136
Q

ct ajouter queue poly A en 3;

A
  1. endonucelase

2. poly A polymerase

137
Q

ou coupe endonucelase

A

10- 20n apres boite de polyadenylation (boite polyA : AAUAAA)

138
Q

polyA polymerase agit avec une matrice

A

non sasn matrice juste a partir de ATP (3’OH libre du trascnrit primaire est son amorce

139
Q

origine ARNr du noyau trascnrit par ARN plolymerase 1

A

m trascnrit primaire : 45S puis epissage alterna

140
Q

a partir d’un gene on peut avoir des prot COMPLETEMENT diff

A

yes epissage altern –> m trasncrit primaire –> ARnm diff –> prot diff

141
Q

ou se trouve adenylate de branchement

A

40n avant site accepetur

142
Q

epissage: seq donneur

A

GU en 5’

143
Q

epissage: seq accp

A

AG en 3’

144
Q

qui fait epissagq

A

SNRP (dont des ARNsn)

145
Q

etapes epissage

A
  1. hydrolyse OH-P(du G donneur)
  2. l OH(G donneur)-esther (P de A de branchemnt
  3. hydrolyse OH(G accapt)-P(1er nuceloitide du 2e exons)
  4. L P(1er nucelotide exon 2 - OH(dernier nuceltoide exon 1)
146
Q

intron lib sous forme de lasso

A

yes

147
Q

hydrolyse d’une l riche en E lib cb

A

36kj/mol >

148
Q

cb de l anhydres par nuceltides triphosp

A

2 liaisons anhydres

149
Q

ADN = D dexosy betaribose

A

non 2-D- desoxyribose beta

150
Q

pq ose de serie D

A

place du OH du carbone reducetue numero 2 a droite

151
Q

carbone 1 lie a quoi

A

base

152
Q

pq beta

A

position anomerique : OH au ddessus du plan

153
Q

qui a 2 cycle : pyrimides ou puriques

A

puriques

154
Q

qui purique qui pyrimdiien

A

AG pur - TCU pyr

155
Q

qui a 3 l hydrogene entre bases complementaier

A

laisons C -G

156
Q

qui a 2 l hydrogene entre bases complementaier

A

liasons TAU

157
Q

unite nucelotique cb de phosp

A

1

158
Q

qui est le carbone reducteur des bases aoztees

A

C numero 1 car lie a la base

159
Q

qui lie C1 de ose a N numero 9

A

pur

160
Q

qui lie C1 de ose a N numero 1

A

pyri

161
Q

nucleoside a phosp

A

non que 1 base et 1 sucre

162
Q

extr 5’ et 3’ libre estheri

A

non libres donc non estherif

163
Q

MG2+ cofacteur de qui

A

de tous les nuceltoties triiphosphate

164
Q

def pont phosoesther

A

une liaison phospho esther de chaque cote

165
Q

4 diff ARN et ADN

A

bases - formule - plus court plus instbale - struc secodare (simple brin et epingles acheuvex ==> proteger ARN

166
Q

quels ARN&raquo_space; et quel %

A

ARNr (80%)

167
Q

ARNt - 5 ou 15%

A

15%

168
Q

tous les ARNr syntheises par la m ARN polymerase

A

non ARNr5s syntheisee par ARN polymerase II

169
Q

tous les ARN ds le noyau

A

non ARNsn in noyau

170
Q

ARNsn font partie des particules ribonucleotprot

A

yes

171
Q

qui est riche en uracils ARNsn ou ARN7s

A

ARN sn

172
Q

qui forme les ribonucleotprot

A

ARN7s

173
Q

ADN : formeinstavle

A

non stable

174
Q

thymine = thymidiine

A

non thymidine = nucleoside vs thymine = base azotee

175
Q

TCU nb de cycles

A

1

176
Q

T a un CH3 ou NH2

A

Ch3 (#1 C before N) - 1 before 2 donc 1 cycle puis 2 , 1 before 9 donc

177
Q

T q azote

A

1

178
Q

si mol est un nucleoside T a un phopshate alors son nom est thymine monophospahte

A

non DEOXY thymiDINE monophosphate

179
Q

pentoses scyclises en quoi

A

ribofuranose

180
Q

coiffe: phophatase hydrolyse l esther entre p sigma et beta

A

non l anhydre

181
Q

coiffe : jout d’un GMP sur le phosphate alpha

A

non phosphate beta`

182
Q

1 gene a 2 promoteur ==> ura un m site d’initiation de trasn

A

non 2 sites diff de debut de transcirpion car 2 boites TATA

183
Q

qd base flottante

A

qd aa code par pls codons ==> que 3e base diff

184
Q

base flottante - q numero debase de anticodon

A

1e base de naticondon car base flottante est la 3e base du codon

185
Q

pdt formation liason pep, hydrolyse de la esther endtre dermier aa et arnt est realisee par arnr28s

A

yes

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