Biochemistry and molecular biology Flashcards
Composición de un nucleótido
Grupo fosfato + pentosa (desoxiribosa) + base nitrogenada
El grupo fosfato se une en el carbón #___ por medio de una unión _______
C5 (afuera) - covalente
Nucleótidos del DNA
Adenina, Timina, Citocina, Guanina
Purinas y pirmidinas
Purinas (2 anillos) > G y A
Pirimidinas (1 anillo) > C y T
Tipo de unión entre bases nitrogenadas
Puentes de hidrógeno
A-T (2 puentes)
C-G (3 puentes)
¿Cómo se unen las histonas y DNA?
Por cargas positivas (histonas) y negativas (grupo fosfato)
Nucleosoma
Es la unidad básica de repetición (2 vueltas de DNA en 8 histonas)
Eucromatina vs heterocromatina
Eucromatina - descondensada (genes activos)
Heterocromatina - compacta (inactiva)
Número de cromosomas en una célula
46 cromosomas
Fases del ciclo celular
Interfase –> G1, S (síntesis), G2
Mitosis
G0
La replicación del DNA se considera ___
Semiconservadora
3 pasos de la replicación
Iniciación, elongación y terminación
Iniciación
Caja TATA (región promotora), división de las hebras por helicasa, topoisomerasa lo desenreda
Elongación
RNA primasa pone primers de RNA, DNA polimerasa pone nucleótidos (de 3’ a 5’)
La hebra complementaria se forma en dirección:
5’ a 3’
Función de DNA ligasa
Unir fragmentos de Okazaki
Nucleótidos en telómeros
TTAGGG
Límite de Flick
Se refiere a la cantidad de divisiones disponibles antes de que se empiecen a perder genes.
Definición de epigenética
Mecanismos que pueden selectivamente activar o silenciar genes sin modificar la secuencia de nucleótidos.
Acetilación y desacetilación
Acetilación –> Favorece transcripción (menos atracción entre histona y DNA)
Desacetilación –> silencia
Metilación
Puede aumentar o disminuir transcripción:
1 grupo metilo –> aumenta
2 o 3 grupos –> disminuye transcripción
Modificaciones directas al DNA
Metilación de citocinas en islas CpG –> silenciamiento
Las modificaciones epigenéticas se pueden heredar (V/F)
Verdadero
Transcripción
DNA a mRNA
Dirección de hebras en DNA
Líder o conductora –> 5’ a 3’
Rezagada –> 3’ a 5’
Enzima encargada de la transcripción
mRNA polimerasa
Modificaciones post traduccionales
Cap de G –> en 5’
Cola de poliA –> en 3’
Exones e intrones
Los exones son los que sí se codifican.
Enzima encargada de cortar intrones.
Spliceosoma
Traducción
mRNA a proteína
Un aminoácido está compuesto por ___ nucleótidos.
3 nucleótidos –> codón
64 combinaciones
El anticodón lo tiene el ___
tRNA
Codón de inicio
AUG (metionina)
Codón de paro
UAA, UAG, UGA
Sitios en el ribosoma
De izquierda a derecha: E (exit), P (peptidil), A (aminoacil).
Los aminoácidos se unen entre sí por medio de _____
Enlaces peptídicos (entre el grupo amino y el carboxilo, por condensación).
De los 20 aa, ¿cuántos son esenciales?
9: His, Ile, Leu, Lys, Met, Phe, Thr, Typ, Val
* 5 son no esenciales (los producimos de novo) y 6 son condicionales.
Estructura de un aa
Grupo amino (NH2+) + ácido (COOH-) Carbón alfa --> donde se une la cadena lateral (R) puede ser: hidrofílica (polar) o hidrofóbica (no polar).
Enantiómeros
Son dos moléculas idénticas, en espejo.
Las proteínas están hechas de aa levógiros.
¿En qué organelo suceden las modificaciones post taduccionales?
Retículo endoplásmico
Estructura de las proteínas
- Primaria: cadena de aa
- Secundaria: alfa hélice o beta plegada, por puentes de H.
- Terciaria: atracción entre secundarias, puentes disufluro, hidrofobicidad, etc.
- Cuaternaria: interacción de 2 o más terciarias (ej. hemoglobina)
Nucleósido vs nucleótido
Nucleósido = desoxiribosa + base nitrogenada Nucleótido = grupo fosfato + desoxirribosa + base
Síntesis de novo de bases nitrogenadas
Ribosa-5-fosfato (viene de la vía de pentosa fosfato) –> se le agregan dos grupos fosfato (de un ATP) por una fosfoquinasa –> PRPP (fosforibosilpirofosfato)
Las pirimidinas (C, T, U) se pueden degradar en:
CO2 y NH3
Las purinas se degradan en:
Ácido úrico (se puede convertir en urato monosódico = gota)
Expresión genética
Se refiere al proceso de decodificación del DNA (transcripción y traducción).
Regulación transcripcional por epigenética
Epigenética: aumenta o disminuye el acceso hacia los promotores (de los factores de transcripción y la RNA polimerasa)
Activadores y represores
Son moléculas que hacen up y down regulation.
Activadores: funcionan como 2dos mensajeros, se unen al enhancer y pueden reclutar acetil transferasas.
Represores: se unen al silenciador, recluta deacetilasas.
Regulación post transcripcional
Splicing alterantivo.
G-cap y cola de poli A para que las exonucleasas no corten el RNA.
Edición del RNA (inserción, deleción y sustitución de nucleótidos) por enzimas (ADAR y CDAR) –> ej. apolipoproteína B se puede hacer Apo B-100 o Apo B-48.
Regulación traduccional
Factores de inciación: se unen a cap o cola. Necesarios para que la subunidad 40s empiece traducción. Se inactivan en inanición o estrés.
