Autophagie Partie 2 Flashcards
Quelles sont les familles de LC3?
LC3A, B et C et GABARAP 1, 2 et 3
Vrai ou faux: les différentes familles d’adapteur autophagique ont une spécificité aux cargos dégradés
Vrai
Via quel domaine les cargos peuvent t’ils interagir avec LC3/GABARAP afin d’être dégradés?
Domaine LIR (WxxL) souvent sur les ATG
Nomme un récepteur autophagique important et ses différents domaines.
P62: Domaine LIR (LC3-interacting region), Zinc finger, UBD, PB1-domain pour faire des oligomères
À quoi sert P62?
À la liaison de l’autophagosome au cargo (via ubiquitination du cargo)
Explique le processus de LLPS et à quoi il sert
La phase separation liquid-liquid qui forme un aggregat de protéines/cargos ubiquitinés. C’est la seule facon que l’autophagosome peut se former, s’il y a un condensé de cargos déjà formé
Quel est l’événement essentiel pour la maturation de l’autophagosome et nomme les acteurs impliqués?
Un changement d’identité. Perte de ULK1 et ATG12, trime les lipides, perte de LC3, recrutement de syntaxin 17
Quels sont les 2 structures intermédiaires entre l’autophagosome et le lysosome?
Amphisome (autophagosome et MVB) et autolysosome (autophagosome et lysosome)
Quels sont les 2 complexes qui permettent la fusion de l’autophagosome?
Stx17 et SNAP29 de l’autophagosome avec VMAP8 du lysosome
OU/ET
SNAP29 et YKT6 de l’autophagosome avec Stx7 du lysosome
Quels acteurs sont nécessaires pour le recyclage de l’autophagosome?
SNX4, 5 et 17 recyclent le complex
STG9 et Stx17 sont recyclés
Combien de temps est requis pour générer l’autophago, maturation, fusion au lysosome et dégradation?
15 min
Que se passe-t-il si nous augmentons TFEB? (par mTOR)
Augmentation de l’autophagie
Comment TFEB augmente l’autophagie?
Se lie à l’ADN et médie l’Expression des gènes lysosomaux pour générer plus de cargos (augmente la fonction des lysosomes) et uprégule les gènes responsables pour les phagosomes.
Qu’est-ce que la mitophagie et comment elle est induite?
Autophagie des mitochondries, induite par le stress.
Qu’est-ce que la pexophagie et comment elle est induite?
autophagie des peroxisomes, induite par l’ubiquitination de l’adaptateur du peroxisome
Vrai ou faux: une diminution de l’autophagie est associée à une hausse de longévité
Faux, une augmentation (carence de nutriments, jeune intermitent)
Vrai ou faux: Les mutaitons dans les régulateurs autophagiques sont néonataux léthaux?
Vrai (nécessaire pour la vie)
Vrai ou faux: l’autophagie diminue avec le vieillissement? Pourquoi?
Vrai, associé à une moins bonne immunité qui vient avec le vieillissement
Qu’est-ce que la Sortin?
Récepteur qui permet le tri des hydrolases et donc permet de lier des séquences spécifiques et permet le transport du golgi aux endosomes et aux lysosomes (permet le tri de la cathepsine)
Qu’est-ce que la Limp2?
Permet le tri de Gcase
À quoi sert le Manose6Phosphate (M6P)
Il marque les enzymes lysosomales lors de leur synthèses pour qu’elles se rendent aux lysosomes
Pourquoi M6P est important?
Pour protéger les protéases, les glycosyler
Qu’est-ce qui permet aux ensymes d’être relâchées aux lysosomes?
Golgi/ER ph7 donc liaison de enzyme et M6P au golgi et pH de 5 au lysosome = relâche des enzymes
Quelle thérapie peut-on donner en remplacement pour maladies lysosomales (faible concentration de M6P = lysosome dépourvu d’enzymes et donc accumulation de métabolites)
Donner des enzymes lysosomales au patient
Qu’est-ce qu’un UPR?
Unfolded Protein Response: Stress réticulum endoplasmique
Qu’elles sont les 2 destins de la cellule après un UPR?
Résoudre le stress et retour à la normale ou initiation de l’apoptose
Décris la Branche 1 de UPR
BIP (chaperone) se lie aux misfolded proteins, ce qui libère ATF6. Complexe incorporé dans des vésicules COPII transportées au Golgi où il va être cleavé par 2 protéases S1P et S2P. ATF6 est cleavé et transloque au noyau -> ISR
Décris la branche 2 de UPR
BIP (chaperone) se lie aux misfolded proteins, ce qui libère PERK qui phosphoryle EIF2a
- inhibition de la traduction par les ribosomes en général (transcrits mis dans des stress granules)
- ATF4 est déphosphorylé et transloque au noyau -> ISR
Décris la branche 3 de UPR
Bip (chaperone) se lie aux misfolded proteins, ce qui libère IRE1, une RNAse qui va cleaver XBP1 mRNA qui va transloquer au noyau -> ISR
Quels sont les 3 sentiers que IRE1 régule?
IRE1 régule RIDD (regulated IRE1-dependent decay), active JNK et splice XBP1
En labo, comment on pourrait faire pour regarder que IRE1 est actif?
Western de XBP1 ou PRC qui check le splicing
Si l’UPR est activé trop longtemps, que se passe-t-il dans la cellule?
Le processus d’apoptose est enclenché
Qu’est-ce qui module l’apoptose en cas d’UPR constant?
ASK1 et l’activation des caspases
Vrai ou faux: bloquer l’UPR a un bon effet thérapeutique dans le contexte du cancer?
Vrai.
Quelle type de maladies sont associés aux UPR?
Maladies neurodégénérative, parce que la balance entre UPR et apoptose est inadéquate, donc on a la mort des neurones (UPR trop long = apoptose)
Quelle action on pourrait faire comme thérapie pour les cancers avec une activation moyenne d’UPR?
Induire l’UPR de manière prolongée pour cibler les cellules cancéreuses
