Autophagie Partie 2

Question 1

Quelles sont les familles de LC3?

Answer 1

LC3A, B et C et GABARAP 1, 2 et 3

Question 2

Vrai ou faux: les différentes familles d’adapteur autophagique ont une spécificité aux cargos dégradés

Answer 2

Vrai

Question 3

Via quel domaine les cargos peuvent t’ils interagir avec LC3/GABARAP afin d’être dégradés?

Answer 3

Domaine LIR (WxxL) souvent sur les ATG

Question 4

Nomme un récepteur autophagique important et ses différents domaines.

Answer 4

P62: Domaine LIR (LC3-interacting region), Zinc finger, UBD, PB1-domain pour faire des oligomères

Question 5

À quoi sert P62?

Answer 5

À la liaison de l’autophagosome au cargo (via ubiquitination du cargo)

Question 6

Explique le processus de LLPS et à quoi il sert

Answer 6

La phase separation liquid-liquid qui forme un aggregat de protéines/cargos ubiquitinés. C’est la seule facon que l’autophagosome peut se former, s’il y a un condensé de cargos déjà formé

Question 7

Quel est l’événement essentiel pour la maturation de l’autophagosome et nomme les acteurs impliqués?

Answer 7

Un changement d’identité. Perte de ULK1 et ATG12, trime les lipides, perte de LC3, recrutement de syntaxin 17

Question 8

Quels sont les 2 structures intermédiaires entre l’autophagosome et le lysosome?

Answer 8

Amphisome (autophagosome et MVB) et autolysosome (autophagosome et lysosome)

Question 9

Quels sont les 2 complexes qui permettent la fusion de l’autophagosome?

Answer 9

Stx17 et SNAP29 de l’autophagosome avec VMAP8 du lysosome
OU/ET
SNAP29 et YKT6 de l’autophagosome avec Stx7 du lysosome

Question 10

Quels acteurs sont nécessaires pour le recyclage de l’autophagosome?

Answer 10

SNX4, 5 et 17 recyclent le complex
STG9 et Stx17 sont recyclés

Question 11

Combien de temps est requis pour générer l’autophago, maturation, fusion au lysosome et dégradation?

Answer 11

15 min

Question 12

Que se passe-t-il si nous augmentons TFEB? (par mTOR)

Answer 12

Augmentation de l’autophagie

Question 13

Comment TFEB augmente l’autophagie?

Answer 13

Se lie à l’ADN et médie l’Expression des gènes lysosomaux pour générer plus de cargos (augmente la fonction des lysosomes) et uprégule les gènes responsables pour les phagosomes.

Question 14

Qu’est-ce que la mitophagie et comment elle est induite?

Answer 14

Autophagie des mitochondries, induite par le stress.

Question 15

Qu’est-ce que la pexophagie et comment elle est induite?

Answer 15

autophagie des peroxisomes, induite par l’ubiquitination de l’adaptateur du peroxisome

Question 16

Vrai ou faux: une diminution de l’autophagie est associée à une hausse de longévité

Answer 16

Faux, une augmentation (carence de nutriments, jeune intermitent)

Question 17

Vrai ou faux: Les mutaitons dans les régulateurs autophagiques sont néonataux léthaux?

Answer 17

Vrai (nécessaire pour la vie)

Question 18

Vrai ou faux: l’autophagie diminue avec le vieillissement? Pourquoi?

Answer 18

Vrai, associé à une moins bonne immunité qui vient avec le vieillissement

Question 19

Qu’est-ce que la Sortin?

Answer 19

Récepteur qui permet le tri des hydrolases et donc permet de lier des séquences spécifiques et permet le transport du golgi aux endosomes et aux lysosomes (permet le tri de la cathepsine)

Question 20

Qu’est-ce que la Limp2?

Answer 20

Permet le tri de Gcase

Question 21

À quoi sert le Manose6Phosphate (M6P)

Answer 21

Il marque les enzymes lysosomales lors de leur synthèses pour qu’elles se rendent aux lysosomes

Question 22

Pourquoi M6P est important?

Answer 22

Pour protéger les protéases, les glycosyler

Question 23

Qu’est-ce qui permet aux ensymes d’être relâchées aux lysosomes?

Answer 23

Golgi/ER ph7 donc liaison de enzyme et M6P au golgi et pH de 5 au lysosome = relâche des enzymes

Question 24

Quelle thérapie peut-on donner en remplacement pour maladies lysosomales (faible concentration de M6P = lysosome dépourvu d’enzymes et donc accumulation de métabolites)

Answer 24

Donner des enzymes lysosomales au patient

Question 25

Qu’est-ce qu’un UPR?

Answer 25

Unfolded Protein Response: Stress réticulum endoplasmique

Question 26

Qu’elles sont les 2 destins de la cellule après un UPR?

Answer 26

Résoudre le stress et retour à la normale ou initiation de l’apoptose

Question 27

Décris la Branche 1 de UPR

Answer 27

BIP (chaperone) se lie aux misfolded proteins, ce qui libère ATF6. Complexe incorporé dans des vésicules COPII transportées au Golgi où il va être cleavé par 2 protéases S1P et S2P. ATF6 est cleavé et transloque au noyau -> ISR

Question 28

Décris la branche 2 de UPR

Answer 28

BIP (chaperone) se lie aux misfolded proteins, ce qui libère PERK qui phosphoryle EIF2a
- inhibition de la traduction par les ribosomes en général (transcrits mis dans des stress granules)
- ATF4 est déphosphorylé et transloque au noyau -> ISR

Question 29

Décris la branche 3 de UPR

Answer 29

Bip (chaperone) se lie aux misfolded proteins, ce qui libère IRE1, une RNAse qui va cleaver XBP1 mRNA qui va transloquer au noyau -> ISR

Question 30

Quels sont les 3 sentiers que IRE1 régule?

Answer 30

IRE1 régule RIDD (regulated IRE1-dependent decay), active JNK et splice XBP1

Question 31

En labo, comment on pourrait faire pour regarder que IRE1 est actif?

Answer 31

Western de XBP1 ou PRC qui check le splicing

Question 32

Si l’UPR est activé trop longtemps, que se passe-t-il dans la cellule?

Answer 32

Le processus d’apoptose est enclenché

Question 33

Qu’est-ce qui module l’apoptose en cas d’UPR constant?

Answer 33

ASK1 et l’activation des caspases

Question 34

Vrai ou faux: bloquer l’UPR a un bon effet thérapeutique dans le contexte du cancer?

Answer 34

Vrai.

Question 35

Quelle type de maladies sont associés aux UPR?

Answer 35

Maladies neurodégénérative, parce que la balance entre UPR et apoptose est inadéquate, donc on a la mort des neurones (UPR trop long = apoptose)

Question 36

Quelle action on pourrait faire comme thérapie pour les cancers avec une activation moyenne d’UPR?

Answer 36

Induire l’UPR de manière prolongée pour cibler les cellules cancéreuses