ARN régulateurs Flashcards

Question

À partir de quoi sont formés les ARNi?

Answer 1

à partir de molécules d'ARN longues qui sont clivées par Dicer Dicer: enzyme à activité RNase lll qui reconnaît et clive des ARN longs db ou des structures tige-boucle pour créer des ARni

Answer 2

-ARN guide (donne spécificoté au complexe RISC) -ARN support (dégradé)

Answer 3

il est dirigé sur ses cibles par complémentarité de séquence entre l'ARN guide et l'ARN cible si complémentarité est forte: -ARNm cible est dégradé -> Argonaute (sous-unité de RISC) clive l'ARNm

Answer 4

21-22 nucléotides (doit être très précis)

Answer 5

1. Un long ARN est transcrit en pri-miARN 2. 1ère réaction de clivage catalysée par Drosha qui s'associe à Pasha ou DGCR8 -libère la région de l'ARN structurée en tige-boucle se qui transforme un pri-miARN en pré-miARN 3. 2ème réaction de clivage catalysée par Dicer -la boucle est clivée se qui transforme le pré-miARN en miARN

Answer 6

peut être présent dans des introns ou des exons, qui soit codants ou non

Answer 7

-montre des sites de clivage pour Drosha et pour Dicer -contient une tige-boucle

Answer 8

-clive entre les parties inférieure et supérieure de la tige -génère un pré-miARN -spécifique aux ARNdb et le clive en produisant une extrémité 3′ sb sortant de 2 nucléotides

Answer 9

-65-70 nucléotides -a une extrémité 3′ simple brin plus longue de 2 nucléotides (à cause du clivage par Drosha)

Answer 10

pour la reconnaissance par l'enzyme Dicer

Answer 11

clivage du pri-miARN en pré-miARN: noyau clivage du pré-miARN en miARN: cytoplasme

Answer 12

grâce à la protéine exportin-5

Answer 13

-2 domaines RNase III -1 domaine de liaison à l'ARNdb appelé PAZ

Answer 14

-PAZ situé à la base du manche et forme une poche de liaison pour l'extrémité 3′ de l'ARNdb -manche formé par un domaine intermédiaire contenant une surface de liaison chargée + pour stabiliser l'ARN -la lame contient des domaines RNase qui contiennent un site actif pour cliver l'ARNdb

Answer 15

2 fragments de miARN de longueur de 22 nucléotides, mais ils sont encore double brins

Answer 16

lorsque miARN db se lie à RISC, RISC est activé et par le domaine Argonaute, il déroule l'ARN en ARN guide et ARN support la forme active de miARN est ARN guide dans le complexe RISC (ARN support est dégradé)

Answer 17

permet au complexe RISC d'éteindre l'expression du gène cible

Answer 18

à cliver l'ARN cible

Answer 19

-Argonaute possède un domaine PAZ qui reconnaît spécifiquement l'extrémité 3′ de l'ARN guide -ARN guide est apparié à l'ARN cible -permet à Argonaute de cliver l'ARNcible au milieu de la région d'appariement entre le 10e et le 11e nucléotide

Answer 20

-un ARN guide qui reconnaît l'ARN cible -Argonaute qui peut cliver l'ARN cible

Answer 21

+ l'expression du transgène était forte, + l'expression de la chalcone synthétase diminuait -ARN sens a le même effet que l'ARN antisens -> ce n'est ni ARN sens ou l'ARN antisens qui inhibait l'expression par -1 -> c'est plutôt l'ARN db résultant de l'appariement des deux qui est responsable de la suppression de l'expression d'un gène

Answer 22

-à 7 sites de la région 3′ non traduite de son gène cible lin-14 -sa liaison empêche la traduction de l’ARNm lin-14 en protéine

Answer 23

-chaque centromère possède une région centrale unique flanquée de répétitions qui contribuent à la formation d'hétérochromatine -les histones de l'hétérochromatine portent des marques de répression constituées de faibles niveaux d'acétylation et niveaux élevés de méthylation de lysine 9 et H3, qui contribuent à la condensation de la chromatine -> répression de la transcription

Answer 24

-perte de la méthylation histone H3K9 -la chromatine se déroule -perte de l'extinction transcriptionnelle des centromères

Answer 25

1.production de transcrits complémentaires qui peuvent s'apparier pour former de l'ARNdb 2. ARNdb transformé en siARN par Dicer 3. siARN se dirigent à un complexe RITS contenant Argonaute (semblable à RISC) -> RITS est recruté par complémentarité de séquence entre siARN et et ARN en transcription au centromère 4. Le complexe recrute Clr4 et Swi6 5. Ils modifient localement les nucléosomes en méthylant H3K9 6. La chromatine se condense 7. Chp1 et Swi6 contiennent des bromodomaines qui reconnaissent les groupements méthyles, s'y lient ey stabilise RITS à la chromatine pour maintenir la répression transcriptionnelle

Answer 26

c'est pour éviter que les gènes du chromosome X s'expriment 2 fois chez la femme, un est inactivé

Answer 27

durant le stade embryonnaire à 32 ou 64 cellules

Answer 28

génération de femelles mosaïques (certaines cellules expriment la copie père et d'autres copie mère du chromosome)

Answer 29

le gène du chromosome X peut avoir 2 allèles pour la couleur de la fourrure (orange ou noir) -les zones de différentes couleur dépendent de quel chromosome X a été inactivé

Answer 30

Xist est codé dans le locus essentiel à l'inactivation du chromosome X appelé Xic

Answer 31

il couvre progressivement tout le chromosome X (xi)

Answer 32

il peut inactiver partiellement des gènes de ce chromosome

Answer 33

Région A: -forme des longues tiges-boucles portant chacune 9 séquences répétées Région C: -partie de l'ARN Xist qui interagit avec la chromatine du chromosome Xi

Answer 34

-recrutement de la protéine Suz12 qui appartient au complexe de répression PRC2 et pourrait être impliquée dans le silencing de la chromatine

Answer 35

1. il recrute des facteurs (comme suz12) qui modifient et condensent la chromatine et méthylent l'ADN 2. Les histones du chromosome X sont désacétylées 3. Condensation de l'ADN qui ne peut plus être transcrit 4. Ils transmettent cette inactivation par ces modifications à ces cellules filles

Answer 36

c'est un régulateur négatif de Xist -> il est aussi codé par ke locus Xic, mais sur le brin opposé et chevauche le gène Xist, ce qui inhibe le gène Xist

Answer 37

ce chromosome sera choisi pour l'inactivation -> l'équilibre en Xist et Tsix dans chaque cellule dicte alors le choix du chromosome X à inactiver