ARN Rég (Cours 6)

Question 1

Qu’est-ce que l’expression génique?

Answer 1

Processus par lequel une info contenue dans un gène est lue et produit une molécule effectrice.

Question 2

Que peuvent être ces molécules effectrices?

Answer 2

ARN ou protéines.

Question 3

Combien y a-t-il d’étapes pour lire et faire un gène non codant et un gène codant?

Answer 3

• Gène non codant : que transcription
• Gène codant : transcription + traduction.

Question 4

Pourquoi faut-il adapter l’expression génique?

Answer 4

• S’adapter aux signaux externes/internes
• Cellules spécialisées (différence de forme et fonction)
• Développement organisme multicellulaire.

Question 5

Quels sont les différents points de contrôle de l’expression génique?

Answer 5

1) Synthèse de l’ARNm
2) Maturation (coiffe, épissage, queue)
3) Transport
4) Stabilité
5) Synthèse de la protéine
6) Activité/stabilité de la protéine.

Question 6

Quel est le point de contrôle principal?

Answer 6

Synthèse de l’ARNm.

Question 7

Où se font ces différents contrôles?

Answer 7

• Synthèse + maturation + transport => noyau
• Stabilité + synthèse protéine + activité protéine => cytoplasme.

Question 8

Laquelle de ces étapes se fait en même temps (ou juste après) la transcription?

Answer 8

Maturation (co-transcriptionnelle).

Question 9

Lesquels se font après la transcription (avec ARNm)?

Answer 9

Transport + stabilité ARN + synthèse protéine.

Question 10

Quels sont les 3 profils d’expression génique?

Answer 10

• Gènes de ménage: fonctions essentielles pour toutes les cellules en permanence
• Gènes spécifiques: uniquement dans certaines cellules à un certain stade de développement
• Gènes modulés: exprimés différemment en réponse à des signaux extracellulaires ou intracellulaires.

Question 11

Qu’entend-on par gène exprimé?

Answer 11

Gène transcrit en ARN et souvent traduit en protéine.

Question 12

Qu’est-ce que le transcriptome?

Answer 12

Ensemble de tous les ARN présents à un moment donné.

Question 13

Qu’est-ce que le séquençage d’ARN?

Answer 13

Technique biologique qui identifie les ARN dans un échantillon et quantifie les ARN pour chaque gène.

Question 14

Que permet le séquençage de l’ARN?

Answer 14

Comparaison des profils d’expression génique (entre cellules ou tissus dans différentes conditions et stades de développement).

Question 15

Qu’est-ce qu’un enhancer?

Answer 15

Amplificateur –> région ADN qui fixe des protéines pour stimuler la transcription d’un gène.

Question 16

Quels sont les 2 types de signaux sur l’ADN qui permettent la régulation?

Answer 16

• Éléments régulateurs: plusieurs pour un gène, gèrent accessibilité et niveau d’expression
• Promoteurs: déterminent position et sens de déplacement.

Question 17

Où se situent ces types de signaux?

Answer 17

• Promoteurs juste avant le gène
• Éléments régulateurs avant ou après.

Question 18

Décrire le promoteur.

Answer 18

Séquence sur ADN qui débute souvent par TATA et finit par INR (site d’initiation riche en pyrimidines).

Question 19

L’ARN pol II se lie-t-il directement au promoteur?

Answer 19

Non –> facteurs généraux guident l’ARN pol II.

Question 20

Comment le facteur général de transcription connaît-il le sens d’élongation?

Answer 20

Les facteurs généraux sont asymétriques => reconnaissent la séquence promotrice, le site TBP se lie avec TATA et le site TFIID à l’INR.

Question 21

Qu’est-ce que la phosphorylation?

Answer 21

Groupe phosphate ajouté à une protéine ou molécule.

Question 22

Pourquoi la phosphorylation est-elle essentielle?

Answer 22

• Initiation transcription
• Transition vers élongation
• Recrutement de facteurs de maturation.

Question 23

Comment peut-on réguler l’expression génique au niveau du complexe d’initiation?

Answer 23

• Variation dans la composition selon les gènes et le type cellulaire
• Interaction avec facteurs régulateurs de la transcription.

Question 24

Que sont les éléments régulateurs?

Answer 24

• Courts éléments d’ADN
• Différents d’un gène à l’autre
• Très souvent palindromiques
• Composés de 2 sous-unités.

Question 25

Que vont faire les éléments régulateurs?

Answer 25

Protéines s’y attachent soit pour activer soit pour réprimer la transcription des gènes.

Question 26

Quels sont les 3 domaines d’un activateur ou inhibiteur?

Answer 26

Domaine d’activation, domaine de dimérisation, domaine de liaison à l’ADN.

Question 27

À quoi sert le domaine de dimérisation?

Answer 27

Augmente la force de liaison à l’ADN.

Question 28

Pourquoi les éléments régulateurs sont-ils en palindrome?

Answer 28

2 sous-unités en symétrie => palindrome.

Question 29

Comment se lie le domaine de liaison à l’ADN?

Answer 29

Spécifique à une séquence (domaine rouge va dans séquence rouge) avec une série de contacts via des ponts hydrogènes, interactions hydrophobes et ioniques.

Question 30

À quoi sert le domaine d’activation?

Answer 30

• Transport
• Dimérisation
• Activité grâce à des signaux (hormones ou kinases viennent se fixer dessus).

Question 31

Où se lient les activateurs?

Answer 31

Grand sillon (le plus souvent) et petit sillon (TBP).

Question 32

Pourquoi les activateurs se lient-ils davantage au grand sillon?

Answer 32

+ d’espace
+ de possibilités d’interaction -> 4 pour grand sillon (donneur ou 2 accepteurs de liaisons hydrogènes et méthyle) contre 2 liaisons hydrogène accepteur pour petit sillon => moins de chance de se tromper dans grand sillon.