APE 3 Flashcards
Qu’est-ce qu’un glissement antigénique?
Mutation(s) ponctuelle(s) du génome viral
Qu’est-ce qu’une cassure antigénique?
Processus par lequel des souches virales différentes se combinent pour former un nouveau sous-type viral mélangeant des antigènes de surfaces des souches originales (réassortiment viral)
Quelle est la différence entre une pandémie et une épidémie?
Épidémie: augmentation du nombre de cas par rapport au nombre attendu
Pandémie: Épidémie mondiale
Vrai ou Faux: Influenza type A est une zoonose
Vrai
Type, hôte d’origine, endroit d’origine, numéro de la souche, année, type NA/HA: Influenza type A ou B?
Type A
Ex: A/canard/Alberta/35/76/(H1N1)
Type, géographie, numéro de souche, année: Influenza type A ou B?
Type B
Ex: B/Singapour/3/64 (pas de HA/NA)
Comment se fait la transmission d’influenza?
Par goutetelettes, aérosol, animaux et fèces, inhalation
Saison de l’influenza et pourquoi?
Plus l’hiver, car préférence pour froid et peu d’humidité
Contagiosité et incubation de l’influenza?
Contagiosité: surtout 3-4 jours de la maladie
Incubation: 1-4 jours
L’influenza D est-elle pathogène chez l’humain?
Non, seulement chez les bovins
Symptômes de l’influenza C?
Légers symptômes respiratoires
Facteurs de risques pour l’influenza?
- Moins de 30 ans (Ac naïfs, peu d’exposition)
- Enfants à l’école (jeunes: pneumonie bactérienne secondaire à l’influenza)
- IS (incluant femmes enceintes)
- Personnes âgées (90% des mortalités)
- Personnes avec maladies cardiaques/pulmonaires (incluant fumeurs)
Quelle est l’infection virale la plus significative et prévalente?
L’influenza
Vrai ou faux: Les pandémies influenza type A sont-elles plus dues aux glissements antigéniques.
Faux
Elles sont plus souvent dues aux cassures antigéniques (type A), comme zoonose, coinfection d’une cellule par deux souches différentes
Les épidémies, elles, sont plus dues aux glissements antigéniques (sur 2-3 ans)
Influenza: virus ADN ou ARN? Enveloppé ou non?
ARN enveloppé
Quelle est la polarité du virus influenza?
Négative
Nombre de segments de l’ARN de l’influenza?
8 segments, chaque segment a son rôle
Vrai ou faux: tous les segments codent pour une protéine
Faux
segment 7: protéines M1 (protéine matrice) et M2 (protéine membranaire)
segment 8: protéines NS1 et NS2 (non structurelles)
De quoi est formée la nucléocapside hélicoïdale?
ARN polarité négative + nucléoprotéine (NP) + transcriptase
Quelles sont les deux glycoprotéines de l’enveloppe d’influenza?
- Hémagglutinine (HA)
- Neuraminidase (NA)
Influenza: rôle de HA?
rôle de NA?
HA: protéine d’attachement viral (sur acide sialique, se lie aux récepteurs de la surface des cellules épithéliales) et il y a fusion de l’enveloppe à la membrane, active la neutralisation des anticorps.
NA: clive l’acide sialique des glycolipides et glycoprotéines et promeur relargage du virus, permet le bourgeonnement viral en coupant la liaison HA et acide sialique
Influenza: rôle M1? rôle M2?
M1: assemblage du virion (matrice)
M2: canal de protons membranaire qui promeut relargage viral)
Médicaments qui ciblent NA?
Zanamivir (inhalé, 5 jours, seulement traitement), oseltamivir (pillule, +commun, 5 jours, approuvé pour prophylaxie- prévention), peramivir (intraveineux, 1 dose, très cher, pas pour infection sévère)
Médicaments qui ciblent M2
Amantadine et rimantadine (pas recommandé aux États-Unis, résistance extensive)
Expliquer comment se faire la réplication d’influenza.
- Liaison HA à acide sialique des glycoprotéines de surface de la cell hôte
- Endocytose du virus dans vésicule endosomale et fusion de l’enveloppe viral avec membrane endosomal
- Décapsidation : acidification causé par M2 (canal à proton) mène au relargage du nucléocapside dans le cytoplasme. Le nucléocapside rejoint le nucléus
- Transcription du génome viral en ARNm : transcriptase PA, PB1 et PB2 utilisent ARNm de l’hôte comme un primer pour produire ARNm
- Traduction en protéines : NA et HA passent à travers RE et Golgi, M2 est délivré à membrane cellulaire (prévient acidification du Golgi et des autres vésicules et l’inactivation de HA dans la cellule), NA et HA transporté à la surface cellulaire où HA est activé par le clivage des protéases de l’hôte
- Assemblage : les segments ARN répliqué dans le nucléus s’assemblent avec pour former la nucléocapside
- Libération par bourgeonnement du côté apical de la cellule
Quelle est la durée d’un cycle de réplication d’influenza?
8 heures
Comment l’influenza compromet la défense mucociliaire des voies respiratoires?
- Rentre dans les voies respiratoires supérieures et cible les cellules épithéliales en tuant les cellules sécrétant mucus et les cellules ciliées (défense primaire ↓ : ↓ capacité à expulser les pathogènes)
- Cycle de réplication et diffusion virale cellule-cellule
- Au niveau des voies respiratoires inférieure : desquamation sévère de l’épithélium bronchique et alvéolaire
Quelle est la conséquence du fait qu’influenza promeut l’adhésion bactérienne aux cellules épithéliales respiratoire?
Prédispostion à surinfection bactérienne
Par quoi sont causées les symptômes de l’influenza et ou se concentrent-ils généralement?
Symptômes associés à l’induction des IFN et des cytokines et impliquent généralement les poumons
Vrai ou faux: les anticorps produits contre HA et NA après une infection rendent immune.
Faux
Ils sont spécifiques à une seule souche et il en existe beaucoup.
La plupart du temps, est-il possible de détecter des Ac d’influenza dans le sérum/sécrétions
Non, la réponse innée est très rapide
Quand commence la réparation tissulaire après infection à influenza?
Combien de temps durent habituellement les symptômes?
Combien de temps avant une résolution des symptômes?
Généralement après 3-5 jours après début des symtômes (plus lent pour personnes âgées par exemple)
Résolution après 7-10 jours habituellement
Flu syndrome: 3-8 jours environ
Nommez une cytokine responsable de la réponse antivirale (influenza)
IFN α, λ
Quels sont les symptômes habituels d’une infection à influenza?
Malaises, maux de tête, fièvre intense, élevée, soudaine, frissons, myalgie sévère, perte d’appétit, fatigue, faible, mal de gorge, nez bouché/qui coule, toux
Quels sont les symptômes de l’influenza chez enfants de moins de 3 ans?
Ressemble à infections respiratoires sévères, causant bronchite, otite moyenne, vomissement, douleurs abdo, convulsion fébrile
Nommez des bactéries pouvant causer une pneumonie secondaire
S. pneumoniae, H.influenzae, S.aureus
Note: les pneumonies peuvent être directes ou causées par bactéries.
Nommez des complications possibles de l’influenza
pneumonie virale primaire, pneumonie bactérienne secondaire, myosite et myocardite, syndrome neurologique (S. Guillain-Barré, encéphalopathie, encéphalite, S. de Reye : attention aux enfants sous aspirine plus à risque), insuffisance multiorgane (ex : hépatique), exacerber asthme et déclencher sepsis
Quels sont les moyens de diagnostic de l’influenza?
- Culture de gorge/nez/sécrétions
- TAAN ou rest Ag, moins de 30 minutes, différence type A et B
- RT-PCR: détecte ARN du virus en quelques heures (fait partie de TAAN)
- Culture: effet cytolytique observable après environ 4 jours (limité), ajoute de GR de cochon d’inde pour effet d’hémadsorption (adhésion cellules exprimant HA aux GR), effet d’hémagglutination et hémadsorption (pas spécifiques parainfluenza et autres aussi capables)
TAAN plus avantageux que culture car: + rapide (culture prend jours), plus disponible, culture besoin de technologistes spécialisés, achats de cellules vivantes, moins sensibles, plusieurs virus non cultivable
TAAN meilleur que test antigénique aussi car + sensible et permet d’évaluer plusieurs virus respiratoires en même temps
Quelle est la cible du médicament Baloxavir marboxil
PB2 (qui vole le cap 5’ des ARNm de l’hôte et qui l’utilise comme primer pour la transcription des ARNm viraux)
Quels sont les moyens de prévention contre l’influenza?
-Vaccin en sous-unité (composition annuelle varie, mélange de fragments extraits/purifiés de HA et NA de 3-4 souches trivalents ou quatrivalents) surtout pour personnes 75 ans+, CHSLD, travailleurs santé, femmes enceintes, conditions chroniques cardiaques ou pulmonaires
On développe un vaccin ADN, ARN universel contre type A
Nommez des signes et symptômes qui évoquent un diagnostic de pneumonie bactérienne chez une personne qui a récemment fait une grippe.
Une bronchite qui progresse rapidement et potentiellement vers une pneumonie létale, dommage tissulaires et extensifs des alvéoles mène à hypoxie et pneumonie bilatérale, expectorations purulentes
Quels sont les principaux micro-organismes responsables de la surinfection bactérienne?
Streptococcus pneumoniae (Cocci gram + en paires)
H. influenzae (coccobacilles gram -)
S. aureus (cocci gram + en amas)
Quels virus causent les rhumes?
Quel virus cause la grippe?
Rhumes: rhinovirus, coronavirus, adénovirus, influenza, parainfluenza, RSV) - généralement bénin
Grippe: influenza
Grippe ou rhume?
Fièvre habituelle, début soudain, 38-40 degrés, toux, maux de têtes, douleurs et courbatures, fatigue, mal de gorge, nausée chez enfants
Grippe
Grippe ou rhume?
Peu de fièvre, légère toux, fatigue, éternuements, mal de gorge, rhinite ou congestion nasale
Rhume
Vrai ou faux: La grippe est souvent accompagnée d’éternuements et de congestion nasale.
Faux
C’est rare, c’est plutôt le rhume qui donne ces symptômes.
Quels sont des symptômes qui évoquent une bronchiolite chez un enfants de moins de 1 an?
Toux avec respiration sifflante, respiration rapide ou serrement des côtes, rhume, fièvre légère, cyanose
Qu’est-ce qu’une bronchiolite?
Bronchiolite: infection bénigne des bronchioles souvent causé par VRS (autre: Métapneumovirus, (para-) influenza, rhinovirus, adénovirus)
Vrai ou Faux: Les bronchiolites sont rares chez les enfants.
Faux
C’est la cause principale d’hospitalisation chez les enfant de <1 an, une des maladies les plus répandues chez les enfants de 2 ans, touchant particulièrement bébés de 3-9 mois
Peut-on avoir une réinfection de bronchiolite la même saison?
Oui
Quels sont les principaux virus responsables de la bronchiolite?
Parainfluenza et virus respiratoire syncytial (+métapneumovirus)
Quel est le réservoir de SARS-CoV-2?
Humain et animaux (chauve-souris)
Comment se fait la transmission de SARS-CoV-2?
Par gouttelettes
Contagiosité: 2 jours avant symptômes et 10 jours après (transmission asymptomatique possible), incubation 5-6 jours environ mais possible 1-14 jours
Quelles sont les manifestations cliniques de SARS-CoV-2?
Fièvre, toux, essoufflement, fatigue, perte du goût et de l’odorat, mal de gorge, N+V, moins grave chez enfants
Quelles sont les méthodes de traitement et prévention pour SARS-CoV-2?
Traitement de soutien, oxygénothérapie, assistance ventilatoire, médicaments (corticostéroïdes pour diminuer tempête inflammatoire provoquée par cytokines/antiviraux comme remdesivir)
Prévention: vaccination, quarantaine, mesures
Vrai ou Faux: SARS-CoV-2 est un virus ADN à double brin
Faux
Virus ARN à simple brin positif
Décrire le cycle viral de SARS-CoV-2.
- Inhalation des gouttelettes aériennes dans les voies respiratoires
- Entrée virale médiée par l’attachement de la glycoprotéine Spike avec ACE II (récepteur bronchique sur cellule épithéliale) et facilitée par quelques facteurs (comme TMPRSS2)
- Fusion à la membrane et endocytose
- Décapsidation: génome relargué dans cytoplasme
- Translation et traduction en protéine: phase précoce (nsps et ARN polymérase ARN dépendante) et phase tardive de production de protéines
- Bourgeonnement dans le RE pour assemblage, maturation virale dans le Golgi
- Vésicules contenant virus migrent vers membrane et exocytose
Résumé parainfluenza
Ubiquitaire, se transmet par gouttelettes, surtout infections respiratoires supérieures, pas systémique (pas de virmie), syndromes d’allure grippale, infection cause imminuté de courte durée, mais possibilité de réinfection, pas d’antiviral disponible
Résumé virus respiratoire syncytial
Cause la plus commune d’infection aiguë et fatale du tractus respiratoire, tout le monde est infecté à 2 ans, réinfections possibles, hôte = humain, très contagieux, se transmet par large droplet aerosols, mains et fomites
Résumé métapneumovirus
Ubiquitaire, tous les enfants de 5 ans l’auront eu, culture difficile, symptômes d’allure grippale, bronchiolite, pneumonie, 15% rhumes enfants (surtout ceux avec otites moyennes), 10% sifflement respiratoire, dyspnée, pneumonie
Quels sont les virus causant le rhume le plus souvent l’automne, l’été, n’importe quand?
Automne: rhinovirus, parainfluenza 1,2 (manuel)
Été: entérovirus
N’importe quand dans l’année: parainfluenza (1,2,3), adénovirus, métapneumovirus
Types d’influenza A chez l’humain?
Chez l’animal?
Humain: H1, H2, H3
N1, N2
Animal: H1, H2, H3, …., H18
N1, N2, …, N11
Un adolescent qui travaille dans une ferme a développé une influenza A H5N1, peut-il la transmettre à sa famille?
Non.
Quels sont les avantages d’une culture virale?
Essentiel pour fabrication de vaccin, pour surveillance de la résistance aux antiviraux, permet de faire le sous-typage (H et N), essentiel pour la surveillance d’une souche pandémique
Plusieurs désavantages tho (long, moins disponible)
Quand se fait la vaccination contre l’influenza au Québec?
En novembre
De quoi sont constitués les vaccins contre l’influenza
Au moins deux sous-types de A et un sous-type de B, certains contiennent même deux sous-types de A et deux sous-types de B
Donnez des exemples de coronavirus.
SARS-CoV-2 (pandémie actuelle)
Coronavirus 229E, HKU1, OC43, NL63: 2ième cause la plus fréquente de rhume après rhinovirus
Mers-CoV: sous haute surveillance, moyen-orient
SARS-CoV-2: épidémie en 2002-2004
Quel est le virus qui cause le plus des rhumes?
Les rhinovirus
Nommez une différence entre une pneumonie bactérienne et une pneumonie virale.
Pneumonie virale: bilatérale
Pneumonie bactérienne: unilatéral
