analisis de acidos nucleicos Flashcards

1
Q

primer paso para los estudios de biologia molecular y para las tecnicas de DNA recombinante, secuenciacion, mutagenesis

A

extraccion de DNA

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2
Q

la eleccion del metodo para extraccion del DNA va a depende de:

A
  • tipo de ac nucleico que se va a extraer
  • organismo origen del acido nucleico
  • fuente del acido nucleico
  • tecnica en que se utalizara el acido nucleico extraido
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3
Q

la extraccion del ADN se aplica en ciencias como:

A

medicina forense, bioinformatica, nanotecnologia de DNA e historia y antropologia

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4
Q

pasos para sacar el DNA

A
  • lisis de la celula
  • separacion
  • purificacion
  • precipitacion
  • lavado
  • disolucion
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5
Q

pasos para extraccion de DNA por la tecnica fenol-cloroformo

A
  • lisis de las celulas y liberacion de DNA
  • extraccion de proteinas y lipidos con solventes organicos
  • precipitacion de DNA
  • lavado de DNA
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6
Q

el metodo de columnas es parecido al metodo de:

A

metodo de perlas

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7
Q

en qué consiste el metodo de columnas?

A
  • rompen la celula
  • ponen un filtro que atrae al DNA y quita las proteinas
  • se quita el filtro
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8
Q

para llevar a cabo la cuantificacion del DNA se utilizan las tecnicas:

A
  • espectrofotometria

- fluorometria

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9
Q

en qué consiste la tecnica de espectrofotometria?

A

pasa un haz de luz a traves del DNA y mientras mas luz absorba, mayor concentracion de DNA hay

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10
Q

metodo mas comun para la cuantificacion de DNA

A

espectrofotometria

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11
Q

en que consiste la tecnica de fluorometria?

A

union de colorantes fluorescentes al acido nucleico, absorbe la luz a una determinada longitud de onda y emite una longitud de onda superior

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12
Q

la PCR fue creada por _ en _

A

Mullis en 1986

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13
Q

para realizar una PCR se necesitan:

A
  • secuencia de DNA
  • enzima DNA pol
  • desoxirribonucleotidos
  • primers
  • cofactores para la enzima
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14
Q

DNA pol comercial usada en PCR

A

Taq polimerasa obtenida de una bacteria

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15
Q

desoxirribonucleotidos utilizados en PCR

A

dATP
dCTP
dGTP
dTTP

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16
Q

pH adecuado para la ADN polimerasa

A

8.4

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17
Q

cofactor de la Taq polimerasa

A

cloruro de magnesio

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18
Q

caracteristicas de los iniciadores de la PCR

A
  • se diseñan para cada gen
  • ricos en G y C
  • proporcionan un extremo 3’ para la pol
  • pueden ser forward (5’-3’) o reverse (3’-5’)
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19
Q

fases de la PCR

A
  • desnaturalizacion
  • hibridacion
  • extension
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20
Q

qué sucede en la fase de desnaturalizacion de la PCR?

A

se separan las cadenas de DNA

21
Q

qué sucede en la fase de hibridacion de la PCR?

A

se alinean los primers al extremo 3’

22
Q

qué sucede en la fase de extension de la PCR?

A

la Taq pol actua sobre el complejo templado de primers y agrega dNTPs complementarios para crear cadenas completas

23
Q

temperatura de cada fase de la PCR

A
  • desnaturalizacion: 95º
  • hibridacion: 50-60º (Tm)
  • extension: 72º
24
Q

tipos de PCR

A
  • PCR estandar o punto final
  • PCR multiplex
  • PCR-RFLP
  • RT-PCR (transcriptasa reversa)
  • qPCR o tiempo real
25
PCR mas comun
PCR estandar o punto final
26
PCR utilizada para COVID
RT-qPCR o RT-PCR tiempo real
27
siempre que hacemos un PCR punto final hacemos una _ despues
electroforesis
28
PCR donde solo se amplifica una parte del gen y nos dice si esta o no el gen
PCR estandar o punto final
29
PCR utilzada para encontrar 2 o mas segmentos de DNA, nos dice si esta o no esta el gen
PCR multiplex
30
PCR que se hace con enzimas de restriccion que corta el DNA e identifica varios segmentos, no solo uno
PCR-RFLP
31
PCR que toma un RNA y hace su copia de DNA y ya despues se hace la PCR
RT-PCR o transcriptasa reversa
32
la PCR punto final es _ y la PCR tiempo real es _
cualitativa | cuantitativa
33
tecnica mediante la cual se separan las moleculas en disolucion cuando se ven sometidas a un campo electrico
electroforesis
34
elementos necesarios para una electroforesis
- camara de electroforesis - gel de agarosa - marcador de peso molecular - transiluminadores ultravioleta
35
polisacarido extraido de algas marinas que separa fragmentos de DNA
gel de agarosa
36
los segmentos _ de DNA se quedan hasta arriba y los _ se quedan hasta abajo
los grandes arriba | los chiquitos abajo
37
la concentracion de agarosa es _ proporcional al tamaño del poro obtenido
inversamente
38
son una mezcla de moleculas de DNA o de proteinas de tamaño conocido que permiten determinar por comparacion el tamaño de las moleclulas contenidos en las muestras sometidas a electroforesis
marcador de peso molecular
39
mediante esta PCR es posible cuantificar la cantidad de DNA en la muestra
PCR tiempo real
40
para el COVID se utilizan _ ciclos de PCR tiempo real
45 ciclos
41
elementos necesarios para la PCR tiempo real
- templado o DNA - Taq pol - desoxirribonucleotidos - primers - magnesio - Buffer - agua - colorantes
42
los sistema reportero fluorescencia o colorantes pueden ser:
- especificos | - no especificos
43
colorante no especifico mas comun
SYBER green
44
colorantes que son sondas fluorescentes de oligonucleotidos con un reportero fluorescente
especificos
45
colorantes que son moleculas intercalantes que tienen afinidad por el dsDNA y generan una señal fluorescente
no especificos
46
tipos de cuantificacion del DNA
- absoluta | - relativa
47
cuantificacion que permite conocer el numero exacto de copias amplificadas del blanco, mide la concentracion precisa de ac nucleicos en una muestra y mide la carga viral o bacteriana de un tejido
absoluta
48
cuantificacion que evalua los cambios en la expresion de genes en distintos estados fisiologicos
relativa
49
tecnica que determina la presencia de un gen en una mezcla de acidos nucleicos extraidos con anterioridad
tecnica de Southern Blot