AMBOSS: Aufbau von DNA und RNA Flashcards
Wie ist ein Nukleotid aufgebaut? Welche Bindungen enthält es?
- Purin- oder Pyrimidinbase
- 5-fach-Zucker (Pentose)
- Phosphatrest
Base und Zucker gehen eine N-glykosidische Bindung ein (= Nukleosid).
Zwischen dem Phosphatrest und dem 3’- bzw. 5’-C-Atom des Zuckers des Nukleosids kommt es zu einer Esterbindung.
Wie heißen die Basen von DNA bzw. RNA? Welche Basen paaren sich?
a) Guanin - Cytosin (3 HBB)
b) DNA: Adenin - Thymin (2 HBB)
b) RNA: Adenin - Uracil (2 HBB)
Welche weiteren wichtigen Basen kennst du? Wie heißen ihre Nukleoside?
Die Purinbasen Hypoxanthin und Xanthin sind Zwischenprodukte des Purinstoffwechsels.
Sie werden nicht in die DNA eingebaut.
Das Nukleosid von Hypoxanthin ist Inosin,
das von Xanthin Xanthosin.
Wie erfolgt die Nomenklatur der Zucker in DNA bzw. RNA?
Die Zucker (DNA: Desoxyribose; RNA: Ribose) in Nukleinsäuren liegen als Fünferring vor.
Die Nummerierung der Kohlenstoffatome der Zucker erfolgt mit einem Strich,
damit sie von den C-Atomen der Basen, die ohne Strich geschrieben werden, unterschieden werden können.
Wie ist das Signalmolekül cAMP aufgebaut?
Die Ribose-Einheit des cAMP
geht sowohl am C3’- als auch am C5’-Atom eine Esterbindung mit demselben Phosphatrest ein (Phosphodiester) – es kommt zum Ringschluss.
Das C1’-Atom der Ribose ist N-glykosidisch mit dem N9-Atom der Base verbunden.
Welchen Zucker enthält ATP?
Enthält Ribose und besitzt damit eine 2’-OH-Gruppe.
Wie liegt DNA normalerweise in der Zelle vor?
DNA liegt meist als Doppelstrang vor und bildet eine Doppelhelix aus, deren Stränge komplementär sind und antiparallel zueinander verlaufen. Die Basen bilden über Wasserstoffbrücken spezifische Basenpaare aus.
Wie viele Basenpaare finden sich in B-DNA normalerweise pro Helixwindung?
In der rechtsgängigen Doppelhelix der in vivo hauptsächlich vorkommenden B-DNA finden sich etwa 10 Basenpaare pro Helixwindung.
Erkläre den Begriff Palindrom!
In der Molekularbiologie wird der Begriff Palindrom für sog. „inverted repeats“ benutzt.
Auf den beiden komplementären Strängen eines DNA-Doppelstrangs ist die Basenreihenfolge über einen bestimmten Sequenzabschnitt die gleiche (immer in 5’→3’-Richtung gelesen!).
Palindrome dienen manchen Proteinen als Erkennungssequenzen zur Bindung der DNA.
Beschreibe wichtige Strukturmerkmale der tRNA!
Die tRNA (transfer RNA) bildet mit ihren Basenpaaren eine charakteristische Kleeblattform aus.
Es gibt zwei wichtige Strukturmerkmale:
1. eine Anticodonschleife, die die Bindestelle aus drei Basen (Anticodon) für die Erkennung der komplementären mRNA (Codon) enthält;
- ein 3’-OH-Ende mit CCA-Sequenz, an die die zum Anticodon passende Aminosäure bindet.
tRNA enthält außerdem viele ungewöhnliche Basen wie Pseudouridin,
die nach der Synthese der tRNA aus Uracil gebildet werden.
Welche Aufgabe übernimmt rRNA?
Ribosomale RNA (rRNA) fungiert als Katalysator der Translation der Proteinbiosynthese.
Der 28S-Bestandteil katalysiert z.B. die Bildung einer Peptidbindung und wird deshalb auch als Ribozym bezeichnet.
Welche RNA ist Bestandteil des Spleißosoms?
snRNA (small nuclear RNA) ist am Spleißen der Prä-mRNA beteiligt und damit Bestandteil des Spleißosoms.
Welche Funktion übernehmen mikroRNA?
MikroRNAs (miRNAs) gehören zu den nicht-kodierenden RNAs.
Sie regulieren die Genexpression, indem sie überwiegend komplementäre mRNAs binden, für deren Abbau sorgen und damit deren Translation verhindern.
Was versteht man unter RNA-Interferenz und welche Mechanismen nutzt sie?
Bezeichnet das gezielte Ausschalten spezifischer Ziel-RNAs.
Dies kann geschehen durch
1. Inhibition der Translation
2. Destabilisierung der mRNAs mittels Deadenylierung oder Decapping
3. Abbau der mRNAs
Welche Aufgabe übernehmen snoRNAs hauptsächlich?
Small nucleolar RNAs (snoRNAs) sind nicht-kodierende RNAs im Nukleolus im Zellkern
und v.a. an der Modifikation von RNA-Molekülen beteiligt.
