ADN : Structure Flashcards
Avant 1920, on pensait que ces structures, étant plus complexes et diversifiées, étaient les porteuses de l’information génétique, quelles sont-elles? Et qu’est-ce qui leur faisait croire que ça ne pouvait être l’ADN?
Les protéines (alors que l’ADN était simple, régulier et monotone)
L’ADN est un polymère de…
… désoxynucléotides
L’ADN a une structure (1), car elle est formée de (2)
- bicaténaire
2. l’association de deux chaînes de polymères
L’ADN est caractérisée par une structure en…
… double-hélice
Comment se nomme l’expérience de la première démonstration que l’ADN, et non les protéines,
encode de l’information transmissible de façon héréditaire à une descendance?
L’expérience d’Avery, MacLeod et McCarty (1944)
Qu’est ce que l’expérience d’Avery, MacLeod et McCarty (1944) ?
Ils ont séparé des cellules S (phatogènes) en diverses classes de molécules cellulaires pour savoir laquelle porte le matériel génétique, puis ils les ont mélangées avec des molécules R (non-pathogènes).
Les seules molécules R qui se sont transformées en molécules S sont celles qui ont été mélangées avec de l’ADN
Qu’est ce que le principe de transformation de l’expérience de Fred Griffith?
Le transfert du phénotype S des bactéries mortes
et de sa pathogénicité à la souche R
Qu’est ce qu’un phénotype?
Apparence ou comportement
Qu’est ce qu’un génotype?
Information portée par le génome
Qu’est-ce que l’expérience de Fred Griffith (1928)?
La souche S (pathogène) chauffée (bactéries mortes) est mélangée avec la souche R (non pathogène); ce mélange injecté tue la souris. La pathogénicité de la souche S morte est donc transférée à la souche R vivante.
Qu’est ce que la cellule S?
Souche pathogène: S pour “Smooth” (causant la pneumonie), elles ont une couche protectrice (la capsule) qui les protège contre le système immunitaire
Cette cellule, lorsqu’injectée dans les souris, les tue
Qu’est ce que la cellule R?
Souche non-pathogène R pour «Rough » n’ont pas de couche protectrice, alors sont tuées par le système immunitaire
Quelles sont les unités de base des acides nucléiques (ADN et ARN)?
Les nucléotides
De quoi sont formés les nucléotides? (3)
- Une base (G,C,A,T) ou U (au lieu de T avec ARN)
- Un sucre à 5 carbones (ribose ou désoxyribose), qui est
un pentose - Un ou plusieurs groupements phosphates
Comment on nomme une molécule formée d’une base et d’un sucre?
NucléoSide
Comment on nomme une molécule formée d’une base, d’un sucre et d’un phosphate?
NucléoTide
Quel est le nom de la base (et du nucléoside associé) A: G: C: U: T:
- Adenine (adenosine)
- Guanine (guanosine)
- Cytosine (cytidine)
- Uracil (uridine)
- Thymine (thymidine)
Quelles sont les 2 différentes classes de bases azotées et la caractéristique qui les différencie?
- Purine = simple cycle
- Pyrimidine = double cycle
Quelles sont les bases azotées de la classe purine?
A, G
Quelles sont les bases azotées de la classe pyrimidine?
T, C, U
Quelles sont les bases azotées associées à l’ADN?
A,G, T, C
Quelles sont les bases azotées associées à l’ARN?
A, G, U, C
Quel est le sucre (ribose) retrouvé dans l’ARN?
Ribose
Quel est le sucre (ribose) retrouvé dans l’ADN?
Désoxyribose
Quelle est la différence entre un ribose et un désoxyribose?
- Ribose (ARN): au Carbone 2’ il y a un OH
- Désoxyribose (ADN): au Carbone 2’ il y a un H (désoxy)
Quelle est la structure la plus stable entre l’ADN et l’ARN?
L’ADN est plus stable, car pas de OH sur le carbone 2’ de son ribose. L’ARN est moins stable que ADN, car il possède un OH sur le carbone 2’ de son désoxyribose (il se dégrade rapidement)
Vrai ou faux: l’ADN peut durer des miliers d’années?
Vrai
Si on prend l’adénine A comme base, quelles sont les type de molécule avec phosphate qu’on peut avoir?
Adénosine Mono-Phosphate (1 Po)
Adénosine Di-Phosphate (2 Po)
Adénosine Tri-Phosphate (3 Po)
Quel est le lien fondamental/de base de l’ADN/ARN?
Le lien phosphodiester
Dans _ et _ les nucléotides sont liés par des liens _ entre les carbones _ des _
- L’ADN
- L’ARN
- Phosphodiester
- 5’ et 3’
- Riboses/désoxyriboses
Comment se fait la formation du lien phosphodiester entre les carbones 5’ et 3’ des sucres?
La synthèse se fait de 5’ à 3’, coupant ainsi les phosphates supplémentaires (si le nucléotide est di-phosphate ou tri-phosphate) pour qu’il n’en reste qu’un
Qu’est ce qui est unis par des lien phosphodiester?
Les nucléotides
Lors de la synthèse d’ADN, on a deux brins, soit…
- le brin matrice
- le brin amorce
Qu’est ce que le brin matrice?
Brin sur lequel se fait la synthèse (brin que l’on va copier, un nucléotide à la fois)
Quelles sont les 3 caractéristiques de la structure hélicoïdale de l’ADN?
1- La structure de l’ADN est une double hélice
2- Les brins l‘ADN ont une polarité 5’ -> 3’
3- Les brins sont antiparallèles et complémentaires
De quoi est composé le squelette d’ADN? (2)
Sucres + phosphates (donc simplement pas les bases)
La chaîne d’ADN est orientée…
… 5’ vers 3’
L’ADN est l’appariement de deux…
… chaînes antiparallèles
Quels sont les appariement des bases dans l’ADN (couples)?
A-T et G-C
Quels sont les appariement des bases dans l’ARN (couples)?
A-U et G-C
Quelle paire d’appariement de bases est plus forte (dans l’ADN)&
G-C
Pourquoi la paire G-C est plus forte la paire AT?
Car elle a 3 ponts hydrogène plutôt que 2 (A-T)
Combien A-T a de ponts H?
A-T = 2 ponts hydrogène
Combien G-C a de ponts H?
G-C = 3 ponts hydrogène
Quelle est la position des bases, des sucres et des phosphates dans la double hélice?
À l’intérieur de l’hélice: bases
À l’extérieur de l’hélice: sucres et phosphates
Qu’est ce que le sillon mineur vs le sillon majeur dans la double hélice?
Voir image page 21
Qu’est ce qui porte l’info dans L’ADN?
Les bases
Comment les protéines se lient-elles à l’ADN?
Tant à l’intérieur pour la reconnaissance d’une séquence (via des protubérances qui vont rentrer dans la double hélice) qu’à l’extérieur, là où il y a la charge négative (différents domaines sur les protéines se lient à différents endroits)
Le génome haploïde humain a combien de paires de bases et cela équivaut à combien de mètres?
3 x 10^9 paires de bases = 1-3 mètres
Dans un noyau de 10 µM
Les protéines qui se lient à l’ADN sont basiques (charge positive) ou bien acides (charge négative)?
Elles sont basiques (+), car l’ADN est chargé négativement par le phosphate
Combien y a t-il de paires de nucléotides par tour d’hélice?
10
À quoi le phosphate se lie-t-il sur les acides nucléiques?
ADN: Carbone 5’ du désoxyribose
ARN: Carbone 5’ du ribose
Que confère le phosphate à un nucléotide?
Une charge négative
Comment appelle-ton les espaces entre 2 “étages” d’hélice?
Les sillons majeurs ou mineurs