9- Contrôle post-transcriptionnel et traduction Flashcards
contrôle post transcriptionnels
- lors de la maturation, exportation et/ou dans le cytosol
- ces contrôles ont moins d’influence que les contrôles transcriptionnels
maturation du pré arnm
- Pré ARNm en ARNm fonctionnel
a) coiffe en 5’ (protection et exportation)
b) Queue poly-A de 100-250 bases (poly-A polymérase)
c) Épissage alternatif
d) Édition (rare)
a) Modifications des extrémités du transcrit: coiffe en 5’
- Retrait du P gamma du nucléotide en 5’ du pré-ARNm
- addition du GMP sur l’extrémité du pré-ARNm diphosphate
- Méthylation de N7 de la guanine et en 2’ des premiers riboses en 5’ du transcrit
- enzyme qui ajoute coiffe s’associe au domaine DCT P de arn pol 2
- prévient dégradation par exonucléases
- facilite sortie de ARNm du noyau
- Intervient dans déclenchement de la traduction
Coiffe en 5’
- marqueur moléculaire qui indique le début du messager
- va finir par être dégradé
- outil de protection
- structure qui retarde dégradation
b) Modifications des extrémités du transcrit: queue poly-A
- facteur de spécificité pour le clivage et la polyadénylation (CPSF) s’associe au site AUUAAA en amont du site de polyadénylation
- Clivage au site poly-A et élongation par la PAP
b) Modifications des extrémités du transcrit: queue poly-A en 3’
- Élongation
- Empêche dégradation prématurée de ARNm
c) Épissage: excision des introns et liaisons exons
- Séquence consensus en 5’ et en 3’ de l’intron
- Conservation de poly-A et de la coiffe après l’épissage
- L’intron excisé est dégradé dans noyau
c) Épissage: implications des petits arn nucléaires (ARNsn)
- ARNsn U1 et U2 ont un rôle fondamental dans l’épissage
c) Épissage: formation du spliceosome
- ARNsn U1 et U2 ont un rôle fondamental dans épissage
- trimère U4, U5 et U6 rejoint U1 et U2
c) Épissage: changement de conformation
Départ de U1 et U4, U6 interagit avec U2
c) Épissage: U6 catalyse première transestérification
- ARNsm U6 catalyse la rct. Il était maintenu inactif par U4
- Première transestérification permet de faire le premier clivage en 3’ de l’exon 1
c) Épissage: la deuxième transestérification permet de relier les deux exons
- exon 1 est maintenu en place par U5
- Intron en lasso est dégradé
c) Épissage: production de plusieurs sortes de polypeptides à partir d’un même gène
- dans des cellules différentes ou en réponse à des signaux distincts
d) édition
séquence de ARNm mature est différente de celle des exons qui la code dans l’ADN
Pore nucléaire
- structure octogonale formée d’environ 100 protéines différentes; les nucléoporines
- enchâssé dans les 2 bicouches de phospholipides
3 ARN impliqués dans traduction
- ARNm
- ARNt
- ARNr
Cadre de lecture
séquence de codons entre le codons initiateur et le codon terminateur
Pour que la traduction soit exacte:
- doit être précédée d’une association adéquate entre ARNt et un acide aminé
- ARNt (anticodon) doit s’apparier avec le codon correspondant de l’ARNm (complémentaire)
Maturation du pré-ARNt
Une séquence en 5’ est retirée lors de la maturation et des bases sont modifiées (3’):
- CCA pour attacher aminoacyl
- bases modifiés sont impliquées dans reconnaissance
- 45 différentes
- 3’ est le site de liaison de acide aminé (aminoacyl-ARNt)
Aminoacyl-ARNt synthétase
- 20 enzymes
- catalyse liaison covalente entre acide aminé et son ARNt
Traduction
- 45 ARNt pour 61 possibilités
- reconnaissance élargie par un appariement non standard
Inosine
- désamination de l’adénine
- capable de reconnaître 3 codons différents
Flottement traduction
en position 1 de l’anticodon ou en position 3 du codon. Ainsi, le même ARNt peut reconnaître 2 codons différents
3 étapes traduction
- Initiation
- Élongation
- Terminaison
Toutes les étapes traduction sur PP
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Mécanismes cytoplasmiques de contrôle
- Petit ARN interférent (ARNsi)
- Micro-ARN (ARNmi)
- Dicer et le complexe RISC
Petit ARN interférent (ARNsi)
- structure bicaténaire
- coupure par endonucléase Dicer
- séparer brins
- association à RISC
- ARNsi complémentaire à une séquence de l’ARNm s’y unit
- Coupure de l’ARNm par une sous unité de RISC
- Bloque réplication des virus et supprime transposition
Micro-ARN (ARNmi)
- transcrits non codants fabriqués par ARN pol2 avec queue poly A et coiffe
- ARN monocaténaire se replie
- Coupure par Drosha puis Dicer
- Séparation des brins, association à RISCmi
- Liaison complémentaire avec ARNm et inhibition traduction
Protéasome
- noyau et cytoplasme
- 4 anneaux polypeptidiques empilés et coiffés
- sous unités B dégradent, alpha forment ouverture
- protéines de régulation, mal repliées ou endommagées
- reconnaissance de ces protéines repose sur signaux de dégradation
- liaison de plusieurs ubiquitines permet association à la coiffe