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Biologie cellulaire (BCL102) > 8- Transcription des gènes et contrôle > Flashcards

8- Transcription des gènes et contrôle Flashcards

1
Q

triplets

A

A.T.G.C

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Q

codons

A

A,U,G,C

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3
Q

sur quoi repose la quantité de protéine

A

sur l’efficacité de chacune des étapes (régulation de l’expression)

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4
Q

Transcription et traduction simultanée?

A

Eucaryote: Non, car outils dans cytoplasme et d’autres dans le noyau
Procaryotes: Oui, tous dans le même environnement

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Q

3 classes arn

A
  • arnm
  • arnt
    -arnr
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6
Q

ARNm

A
  • issu de processus de transcription
  • ils véhiculent info de l’ADN vers cytosol ou ils seront pris en charge par la machinerie traductionnelle
  • liens entre ce qui est codé (noyau) et cytoplasme
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7
Q

ARNt

A
  • indispensable au processus de traduction
  • impliqués dans l’incorporation des acides aminés dans la protéine au cœur de la synthèse
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8
Q

ARNr

A
  • nécessaire à la traduction puisqu’ils entrent dans la composition des ribosomes et coordonnent positionnement de ARNm et ARNt
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9
Q

Ribosomes

A

siège de la synthèse des protéines, liens covalents entre acides aminés

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10
Q

ARN polymérase 1

A

ARNr

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11
Q

ARN polymérase 2

A

ARNm

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12
Q

ARN polymérase 3

A

ARNt

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13
Q

Structure ARN

A
  • certains arn doivent leur fonction à leur structure secondaire et tertiaire
  • boucles
  • appariement anormal
  • nucléotides modifiés
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14
Q

Convention écriture

A

5’ vers 3’

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15
Q

Convention lecture

A

3’ vers 5’

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16
Q

Par qui se fait la polymérisation des ribonucléotides dans la transcription d’un gène?

A
  • par les arn polymérase
  • à partir d’un polymère en cours de synthèse
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17
Q

Précurseur de la polymérisation (transcription d’un gène)

A

ribonucléosides triphosphates

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18
Q

V ou F? les ARN polymérases n’ont pas besoin d’amorce

A

Vrai

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19
Q

3 étapes transcription

A
  • Initiation
  • élongation
  • terminaison
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20
Q

Initiation

A

a) fixation de facteurs et de la polymérase sur le promoteur
b) séparation des brins
c) début de la transcription au site de départ (2 rNTPs)

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21
Q

Site promoteur

A

permet association de la polymérase, détermine le brin matrice et l’endroit ou débute la transcription

22
Q

Facteurs de transcription

A

identifier le point de départ

23
Q

ARN pol 2 (ini transcription)

A
  • facteurs de transcription positionnent ARN pol 2 et aident à la séparation des brins
  • Assemblage du complexe de pré amorçage (au promoteur)
24
Q

l’ARN pol. 2 fait la synthèse de…

A

ARNm

25
Q

TATA box protein (TBP)

A
  • monomère en forme de selle
  • interaction dans le petit sillon (courbure ADN)
  • fixe bonne région et recrute acteurs
26
Q

TFIIB

A

monomère dont le C-term s’associe à TBP et à l’ADN et le N-term s’étend vers le site du début de la transcription (union à polymérase)

27
Q

TFIIF

A

tétramère associé à arn pol2. ce complexe positionne polymérase au site d’initiation de la transcription qui facilite l’ouverture de la bulle

28
Q

TFIIE

A

tétramère qui se fixe au promoteur, sert ancrage pour TFIIH et maintient bulle de transcription ouverte

29
Q

TFIIH

A
  • protéine multimérique, dernière à s’associer et complète l’assemblage du complexe pré amorçage
  • activité kinase, hélicase et atpase
30
Q

Élongation

A
  • polymérase se déplace en ouvrant les brins devant et en hybridant les brins derrière
  • dissociation promoteur + facteur de transcription
  • plusieurs poly simultanément
31
Q

Terminaison

A

ARN poly termine élongation lorsqu’elle rencontre une séquence spécifique de l’ADN et se détache

32
Q

Terminateurs procaryotes

A
  • intrinsèques
  • dépendants de Rho
33
Q

Terminateurs eucaryotes

A

riches en A et T

34
Q

Contrôle transcriptionnel

A
  • implique multitude de facteurs de transcription qui interagissent avec des séquences de l’ADN
35
Q

La régulation de l’expression de certains gènes résulte en l’action combinée de?

A

facteurs de transcription généraux et de facteurs de transcription spécifiques

36
Q

3 domaines des facteurs de transcription?

A
  • domaine de liaison à l’ADN
  • domaine d’interactions ou de dimérisation
  • domaine d’activation ou de répression
37
Q

Doigt de zinc

A
  • Liaison de 9 doigts de zinc de TFIIIA au promoteur du gène de l’ARNr 5S
  • classe de motifs la plus vaste
  • 2 cystéines, 2 histidines s’enroulent autour du zinc et provoquent un repli en un domaine compact capable de s’insérer dans le grand sillon de adn
38
Q

glissière à leucine

A
  • hélice alpha ou on a leucine à tous les 7 a.a
  • nécessaire à dimérisation du facteur, enserre adn
  • résidus basique (+) interagissent avec adn
39
Q

Domaines d’interaction/dimérisation

A

augmentation du nb de sites pour activer transcription ou pour réprimer certains facteurs de transcription

40
Q

avantage dimérisation

A
  • minimiser variété de facteur produit
  • baisse complexité
  • minimiser coûts énergétiques
41
Q

Domaine activation

A
  • riches en proline ou glutamine
  • recruter autres activateurs dans le but amplifier transcription
42
Q

domaine de Répression

A

régulent négativement la transcription de gènes

43
Q

Les facteurs de transcription interagissent avec adn grâce à …

A

des séquences de nucléotides précis

44
Q

Séquences régulatrices

A
  • éléments proches du promoteur
  • situées à 200pb max en amont du site de début de transcription
45
Q

Il y a les ______, proximales au promoteur et des ______ à des kilobases du promoteur

A

régions régulatrices
amplificateurs longs

46
Q

3 mécanismes qui module expression des gènes

A

1- régulation de la concentration des facteurs de transcription
2- interaction d’activateurs avec des coactivateurs (ou répresseurs avec des corépresseurs) qui modifient la structure de la chromatine
3- interaction d’activateurs avec des coactivateurs qui interagissent avec l’équipement de base de la transcription

47
Q

Régulation de la concentration

A
  • expression gènes pas spontanée
  • séquences codantes juxtaposée à séquences régulatrices qui influencent production protéines
  • séquences régulatrices liées par des facteurs activés ou synthétisés par les voies de signalisation intracellulaires
  • récepteurs nucléaires hormones stéroides ou thyroidienne
48
Q

acétylases

A
  • recrutées par activateurs
  • acétylation neutralise les charges des lysines et annule interactions avec nucléosomes voisins et avec le squelette négatif de adn
  • histones acétylées permettent liaison du complexe SWI/SNF
  • complexe et cpb permettent assemblage des facteurs impliqués dans initiation de transcription en remodelant chromatine
49
Q

Les complexes de remodelage de la chromatine induisent :

A
  • glissement octamère histone vers autre site
  • chgt conformation nucléosome
  • modification composition histones
  • déplacement complet histones
50
Q

sous unité TAF2 250 de TFIID

A

activité acétylase et permet collaboration avec CPB, modifier nucléosomes voisins

51
Q

Désacétylases

A
  • recrutées par répresseurs
  • interactions des lysines des histones avec nucléosomes voisins et squelette négatif adn
52
Q

Complexe médiateur

A
  • impliqué dans décondensation de l’ADN et assemblage du complexe pré amorçage
  • pont entre activateurs et arn pol 2
  • activité acétylase

Biologie cellulaire (BCL102) (10 decks)

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