8- Transcription des gènes et contrôle Flashcards
triplets
A.T.G.C
codons
A,U,G,C
sur quoi repose la quantité de protéine
sur l’efficacité de chacune des étapes (régulation de l’expression)
Transcription et traduction simultanée?
Eucaryote: Non, car outils dans cytoplasme et d’autres dans le noyau
Procaryotes: Oui, tous dans le même environnement
3 classes arn
- arnm
- arnt
-arnr
ARNm
- issu de processus de transcription
- ils véhiculent info de l’ADN vers cytosol ou ils seront pris en charge par la machinerie traductionnelle
- liens entre ce qui est codé (noyau) et cytoplasme
ARNt
- indispensable au processus de traduction
- impliqués dans l’incorporation des acides aminés dans la protéine au cœur de la synthèse
ARNr
- nécessaire à la traduction puisqu’ils entrent dans la composition des ribosomes et coordonnent positionnement de ARNm et ARNt
Ribosomes
siège de la synthèse des protéines, liens covalents entre acides aminés
ARN polymérase 1
ARNr
ARN polymérase 2
ARNm
ARN polymérase 3
ARNt
Structure ARN
- certains arn doivent leur fonction à leur structure secondaire et tertiaire
- boucles
- appariement anormal
- nucléotides modifiés
Convention écriture
5’ vers 3’
Convention lecture
3’ vers 5’
Par qui se fait la polymérisation des ribonucléotides dans la transcription d’un gène?
- par les arn polymérase
- à partir d’un polymère en cours de synthèse
Précurseur de la polymérisation (transcription d’un gène)
ribonucléosides triphosphates
V ou F? les ARN polymérases n’ont pas besoin d’amorce
Vrai
3 étapes transcription
- Initiation
- élongation
- terminaison
Initiation
a) fixation de facteurs et de la polymérase sur le promoteur
b) séparation des brins
c) début de la transcription au site de départ (2 rNTPs)
Site promoteur
permet association de la polymérase, détermine le brin matrice et l’endroit ou débute la transcription
Facteurs de transcription
identifier le point de départ
ARN pol 2 (ini transcription)
- facteurs de transcription positionnent ARN pol 2 et aident à la séparation des brins
- Assemblage du complexe de pré amorçage (au promoteur)
l’ARN pol. 2 fait la synthèse de…
ARNm
TATA box protein (TBP)
- monomère en forme de selle
- interaction dans le petit sillon (courbure ADN)
- fixe bonne région et recrute acteurs
TFIIB
monomère dont le C-term s’associe à TBP et à l’ADN et le N-term s’étend vers le site du début de la transcription (union à polymérase)
TFIIF
tétramère associé à arn pol2. ce complexe positionne polymérase au site d’initiation de la transcription qui facilite l’ouverture de la bulle
TFIIE
tétramère qui se fixe au promoteur, sert ancrage pour TFIIH et maintient bulle de transcription ouverte
TFIIH
- protéine multimérique, dernière à s’associer et complète l’assemblage du complexe pré amorçage
- activité kinase, hélicase et atpase
Élongation
- polymérase se déplace en ouvrant les brins devant et en hybridant les brins derrière
- dissociation promoteur + facteur de transcription
- plusieurs poly simultanément
Terminaison
ARN poly termine élongation lorsqu’elle rencontre une séquence spécifique de l’ADN et se détache
Terminateurs procaryotes
- intrinsèques
- dépendants de Rho
Terminateurs eucaryotes
riches en A et T
Contrôle transcriptionnel
- implique multitude de facteurs de transcription qui interagissent avec des séquences de l’ADN
La régulation de l’expression de certains gènes résulte en l’action combinée de?
facteurs de transcription généraux et de facteurs de transcription spécifiques
3 domaines des facteurs de transcription?
- domaine de liaison à l’ADN
- domaine d’interactions ou de dimérisation
- domaine d’activation ou de répression
Doigt de zinc
- Liaison de 9 doigts de zinc de TFIIIA au promoteur du gène de l’ARNr 5S
- classe de motifs la plus vaste
- 2 cystéines, 2 histidines s’enroulent autour du zinc et provoquent un repli en un domaine compact capable de s’insérer dans le grand sillon de adn
glissière à leucine
- hélice alpha ou on a leucine à tous les 7 a.a
- nécessaire à dimérisation du facteur, enserre adn
- résidus basique (+) interagissent avec adn
Domaines d’interaction/dimérisation
augmentation du nb de sites pour activer transcription ou pour réprimer certains facteurs de transcription
avantage dimérisation
- minimiser variété de facteur produit
- baisse complexité
- minimiser coûts énergétiques
Domaine activation
- riches en proline ou glutamine
- recruter autres activateurs dans le but amplifier transcription
domaine de Répression
régulent négativement la transcription de gènes
Les facteurs de transcription interagissent avec adn grâce à …
des séquences de nucléotides précis
Séquences régulatrices
- éléments proches du promoteur
- situées à 200pb max en amont du site de début de transcription
Il y a les ______, proximales au promoteur et des ______ à des kilobases du promoteur
régions régulatrices
amplificateurs longs
3 mécanismes qui module expression des gènes
1- régulation de la concentration des facteurs de transcription
2- interaction d’activateurs avec des coactivateurs (ou répresseurs avec des corépresseurs) qui modifient la structure de la chromatine
3- interaction d’activateurs avec des coactivateurs qui interagissent avec l’équipement de base de la transcription
Régulation de la concentration
- expression gènes pas spontanée
- séquences codantes juxtaposée à séquences régulatrices qui influencent production protéines
- séquences régulatrices liées par des facteurs activés ou synthétisés par les voies de signalisation intracellulaires
- récepteurs nucléaires hormones stéroides ou thyroidienne
acétylases
- recrutées par activateurs
- acétylation neutralise les charges des lysines et annule interactions avec nucléosomes voisins et avec le squelette négatif de adn
- histones acétylées permettent liaison du complexe SWI/SNF
- complexe et cpb permettent assemblage des facteurs impliqués dans initiation de transcription en remodelant chromatine
Les complexes de remodelage de la chromatine induisent :
- glissement octamère histone vers autre site
- chgt conformation nucléosome
- modification composition histones
- déplacement complet histones
sous unité TAF2 250 de TFIID
activité acétylase et permet collaboration avec CPB, modifier nucléosomes voisins
Désacétylases
- recrutées par répresseurs
- interactions des lysines des histones avec nucléosomes voisins et squelette négatif adn
Complexe médiateur
- impliqué dans décondensation de l’ADN et assemblage du complexe pré amorçage
- pont entre activateurs et arn pol 2
- activité acétylase
