8 - RNA Flashcards
Welche Nukleobasen hat die RNA?
Cytosin
Guanin
Adenin
Uracil
Welche Nucleobasen hat die DNA?
Cytosin
Guanin
Adenin
Thymin
Häufige Methode zur RNA Synthese? Vor und Nachteile?
T7 in vitro Transkription. Vorteile \+bekannter prozess \+leicht \+schnell \+reproduzierbar Nachteile: -Untere Größenbeschränkung -geringere ausbeute und Reinheit
Wie sind die denaturierungs Konditionen von RNA?
- RNA ist ein instabiles Molekül und hat eine sehr kurze Halbwertszeit, sobald sie aus der Zelle oder dem Gewebe extrahiert wurde.
- RNA ist besonders instabil, da RNasen, Enzyme, die im Blut, in allen Geweben und in den meisten Bakterien und Pilzen in der Umwelt vorkommen, allgegenwärtig sind.
Welche Besonderheiten hat die RNase? Folgen?
- RNAse ist hitzestabil und faltet sich nach einer Hitzedenaturierung wieder. Sie sind schwer zu inaktivieren, da sie keine Cofaktoren benötigen.
- Bei der Isolierung intakter RNA werden seit jeher starke Denaturierungsmittel verwendet, um endogene RNAsen zu hemmen.
Was wird für die In-Vitro-Synthese von RNA benötigt?
Für die In-vitro-Synthese werden benötigt:
- gereinigtes DNA-Plasmid,
- gereinigte RNA-Polymerase,
- Metall-Ionen-Enzym-Cofaktoren,
- und Rohmaterial-Nukleotide
Was ist PAGE?
Die Polyacrylamidgel-Elektrophorese (PAGE) ist eine Technik zur Trennung biologischer Makromoleküle entsprechend ihrer elektrophoretischen Beweglichkeit. Die elektrophoretische Beweglichkeit ist eine Funktion der Länge, Form und Ladung des Moleküls
Was kann als Hilfsmittel zu PAGE hinzugegeben werden und wofür?
Die Acrylamidlösung kann mit einem Denaturierungsmittel (meist 8 M Harnstoff, so genannte denaturierende PAGE) versetzt werden, um die migrierende RNA vollständig zu entfalten und die Moleküle ausschließlich nach ihrer Größe zu trennen.
Was wird verwendet um RNA nach Größe und Form zu trennen?
- Polyacrylamidgel-Elektrophorese (PAGE)
- size-exlusion-chomotogrphy (SEC)