8. Diversité Du Monde Procaryote Flashcards
Les archées ont une évolution divergente des eubactéries (ancêtre commun). Nommez quelques caractéristiques qui les différencient.(5)
- Grande diversité morphologique et physiologique.
- Pas de matériel génétique entouré d’une membrane.
- Reproduction par fission binaire, bourgeonnement ou fragmentation.
- Environnements aquatiques et terrestres extrêmes (température ou sel, ressemble aux conditions de création de la Terre).
- Parois dépourvues de peptidoglycane
Explique en quoi la paroi cellulaire des archées est différente de celle des eubactéries, même si les fonctions et la structure sont similaires. (3)
- Voies métaboliques différentes.
- Pseudomuréine au lieu de peptidoglycane
- Présence d’autres polysaccharides ou de protéines, différences importantes des lipides membranaires.
Décrit ce que la coloration de Gram démontre chez les archaea.
- Les GRAM + : composition biochimique retient le violet de cristal, paroi épaisse et uniforme.
- GRAM - : composition biochimique ne retient pas le violet de cristal, couche S en grande quantité attachées à la membrane cytoplasmique, couche de protéines/lipoprotéines. MEMBRANE EXTERNE (exception chez certains).
Décrit la membrane cytoplasmique des archaea. (4)
- Fonctions similaires aux eubactéries.
- Lipides différents, alcools.
- Monocouche (augmente la rigidité)
- Centre hydrophobe empêche la diffusion de molécules hydrophiles (demande la présence de transporteurs spécifiques).
Nommez un exemple de lipide différent/exclusif dans la membrane d’un archaea qui a permis d’identifier que cette espèce était un archée (lipides servent d’indicateurs de présence des archées).
Le thaumarchéol, indicateur de “thaumarchaeota” dans le picoplancton océanique.
Quelle est la particularité des lipides retrouvés dans la membrane chez les archées?
2 extrémités hydrophiles et un centre hydrophobe.
Que sait-on de la génétique des archées, malgré le peu d’informations disponibles? (5)
- Chromosome unique et circulaire.
- Taille génome est plus petit que celui des eubactéries.
- Fonctions des gènes inconnues, mais spécialisation.
- Quelques plasmides.
- Mécanismes d’échange d’ADN → transformation?
Que sait-on de la biologie moléculaire des archaea?
- Ribosomes : 70S (50 + 30), comme les eubactéries.
- Traduction fonctionne comme chez les eucaryotes.
- Transcription et réplication : ressemble +/- aux eucaryotes.
- Pour le site de réception des antibiotiques (ABIO s), ressemble un peu aux eucaryotes.
À titre d’exemple, les archées sont sensibles à l’antibiotique _______, mais sont résistants aux antibiotiques ________ et ________.
- Anisomycine.
- Kanamycine et chloramphénicol.
Nomme les trois phylums de la taxonomie des archées et ce qu’ils signifient.
- Crenarchaeota : crene = source. (ancêtre)
- Thaumarchaeota : thauma = merveille (environnement marin/sols, phylum récent).
- Euryarchaeota : eurus = large (environnements et métabolismes variés).
Nomme les caractéristiques générales des Crenarchaeota.
- Anaérobies stricts
- Présent dans les sources sulfureuses et solfatares (volcans), ils sont souvent les seuls organismes vivants dans ces endroits.
- Soufre = source d’énergie
Nommez deux exemples de Crenarchaeota et leurs lieux de croissance.
- “Pyrodictium” : fosses abyssales (105-110 degré C)
- “Geogemma” : 120 degrés C, température de croissance optimale la plus élevée connue.
Pourquoi est-il impossible de retrouver des organismes utilisant de l’ATP au-dessus de 150 degrés C?
Car à cette température, l’ATP n’est pas stable → donc ne peut pas faire fonctionner un organisme.
Nomme les caractéristiques générales des Thaumarchaeota. (5)
- Mésophiles (oxydation de l’ammoniaque : cycles N2 et C)
- Psychrophiles/mésophiles (picoplancton en suspension en profondeur, 20% de la biomasse totale du picoplancton)
- Symbiose avec des éponges et des concombres de mer.
- Leur nombre est presque égal au nombre d’eubactéries.
- Présence de thaumarchéol (lipides) dans la membrane cytoplasmique.
VRAI OU FAUX : les archées retrouvés dans un environnement malade ont nécessairement causés la maladie (ex : intestins des mammifères).
FAUX : les archées ne provoquent pas nécessairement la maladie, ils profitent parfois de l’environnement. Par contre, implication dans certaines pathologies (ex : colites ulcéreuses).
Nomme les caractéristiques générales des Euryarchaeota méthanogènes. (2)
- Anaérobies strictes, produisent du méthane.
- Très présents chez les vaches (rumen), intestins d’animaux et dans les milieux riches en matière organique.
Le méthane a _____ fois plus d’impact que le CO2 sur l’effet de serre et sur le changement climatique.
20x.
Explique l’impact de la fonte du pergélisol en Arctique sur le changement climatique.
Beaucoup de méthane sous les couches de glace. Fonte → libération du méthane dans l’atmosphère (très nocif).
Nomme un exemple d’Euryarchaeota méthanogène présent dans le microbiote intestinal humain.
“Methanobrevibacter”.
Nomme les caractéristiques générales des Euryarchaeota halophiles.
- Demandes nutritionnelles complexes en culture.
- Concentration minimale de NaCl : 1.5M, concentration maximum de NaCl : 6.3M (saturation), concentration optimale de NaCl : 3-4M
Qu’arrive-t-il si la concentration de NaCl, en culture, est plus petite que 1.5M?
Désintégration de l’archée.
Où se tiennent les Euryarchaeota halophiles? Que peuvent-ils former pour la photoprotection (se protéger du soleil)? Donne un exemple.
- Dans les mers salées et les marais salants.
- Former des caroténoïdes (pigmentation). Ex : lac rose en Australie.
Nomme un exemple d’Euryarchaeota halophiles faisant de la photosynthèse sans chlorophylle (ou bactériochlorophylle). Quel phénomène unique compense? Explique.
- “Halobacterium”.
- Phénomène : Archaeorhodopsine → évènement dans lequel l’archée possède une structure particulière lui permettant de capturer l’énergie lumineuse et de la transformer en énergie biochimique (approche différente) → biopuces.
Nomme les caractéristiques générales des Euryarchaeota thermoplastes.
- Thermo-acidophiles (55-65 degré C, pH 1-2)
- Absence de paroi
- Membrane cytoplasmique rigide
- Dans les rejets de mines de charbon.
