7 paskaita Flashcards
kas yra replikonas
DNr vienetas, kuriame vyksta DNR replikacija ir kuris turi replikacijos valdymo elementus
kas yra cis veiksniai
replikatoriai; DNR replikacijos pradžios sritys
kas yra trans veiksniai
iniciatoriai; baltymai, reikalingi replikacijos inciacijai vykti
bakterijų ori srities funkcijos
- ties ja vyksta replikacijos iniciacija
-valdo replikacijos iniciacijos dažnį
-užtikrina chromosomų padalijimą į dvi dukterines ląsteles
kiek bp sudaro ori sritis E.coli bakterijose
486 bp
kokio ilgio yra minimali ori sritis e.coli, užtikrinanti dvi pirmasias funkcijas
245bp
kas prijungia helikazę
DnaC baltymas - helikazės jungiklis, panašus į DnaA, tik neturi su DNR sąveikaujančio domeno
kas yra eklipsė
tarpsnis, per kurį ties oriC nevyksta nauja repliakcijos iniciacija
Ori metilinimas
- srityje yra 11 kopijų GATC, 8 jų - konservatyvios
- Metilina Dam metilazė
- metilinamos abi grandinės, nes GATC - palindromas
- fermentas metilina nemetilintą arba hemimetilintą DNR
SeqA dimerinis baltymas:
- 181 a.r., du domenai, sujungti lanksčiu domenu
- turi domeną, atpažįstantį GATC
- prisijungia prie hemimetilintų GATC ir paslepia jas nuo DnaA ir pakartotinės reiniciacijos
iniciacijos baltymo kiekio ir aktyvumo reguliavimas
-Susimontavus replisomoms, užkelti žiedai β vėluojančioje grandinėje sudaro laikiną kompleksą su DnaA / ATP ir baltymo Hda / ADP kompleksu;
- RIDA stimuliuoja ATP hidrolizę. DnaA / ADP neaktyvus AT srities atžvilgiu
- ADP disocijuoti nuo DnaA skatina rūgštiniai
fosfolipidai, kurių yramembranoje
DnaA-ATP hidrolizei reikalingas
Hda domeno arginino piršto motyvas
Hda baltymas riša
ADP, bet ne ATP
Mutacijos Hda gene didina ląstelių ATP-DnaA kiekį ir taip sukeliama
per didelė iniciacija, dėl kurios slopinamas ląstelių dalijimasis ir ląstelių augimas.
Ter sritys E. coli genome:
*10 sričių;
*23 b. p. konservatyvi seka;
*Pusė Ter sekų orientuota genome viena kryptimi, kita – priešinga kryptimi
Prie sekų atrankiai prisijungia terminacijos baltymas Tus
Eukariotinėje ląstelėje
- daug ori
- daug replikonų
-replikacija nuo kiekvienos ori vyksta
abiem kryptimis, kol replikacinės
šakutės, startavusios nuo gretimų ori,
susitinka
Kai kuriuose vienaląsčiuose (mielės) ori sritys yra nedidelės ir aiškios struktūros –
turi ??? elementą, kurį sudaro
ARS elementą sudaro :
-11 b.p. tipinė A / T turtinga seka
-kiti elementai
ori aktyvinimo etapai (eukariotuose)
- ori atpažinimas
- pre-RC komplekso sumontavimas
-pre-RC aktyvinimas
kas yra leidimas replikuoti
-tai yra patenkinimas tam tikrų sąlygų, užtikrinančių replikacijos iniciaciją ties ori sritimis
-Pre-replikacinio komplekso – pre-RC susimontavimas.
Ciklinai ir nuo ciklinciklinų priklausomos kinazkinazės:
- G1 ciklinai (ciklinas D ir E);jų kinazikinazių kompleksų taikiniai – baltymai, valdantys replikacijos iniciaciją;
- S ciklinai (ciklinas E , taip pat A); jų kinazių kompleksų taikiniai – baltymai, valdantys DNR replikaciją
- G2 ciklinai (ciklinas A , taip pat B);jų kinazių kompleksų taikiniai – baltymai, valdantys ląstelių dalijimąsi
pre-RC baltymų kompleksas
*ORC baltymai;
*Cdc6 baltymas;
*Cdt1 baltymai;
*MCM 2-7 baltymai.
ką daro ORC baltymų kompleksai
žymi ori sritį
Cdc7-Dbf4 kinazei fosforilinus MCM2-7,pritraukiami baltymai
Cdc45 ir Sld3; GINS
Cdc45 ir GINS aktyvina
MCM2-7 helikazes
besisukančio rato mechanizmo replikacija
Iniciacijos baltymas (IP) skelia vieną DNR grandinę ir 3‘ OH galas tampa pradmeniu pirmaujančios grandinės sintezei.
koks esminis plazmidės replikacijos skirtumas nuo bakteriofago
RepC baltymų dimeras lieka neaktyvus po replikacijos ciklo
kas yra interonai
sekos, kuriose gausu A ir T nukleotidų, juose išskiriamos DNR grandinės
Replisomą sudaro šeimininko:
- DNR pol III
- DnaB helikaazė ir praimazė
