7 paskaita Flashcards
kas yra replikonas
DNr vienetas, kuriame vyksta DNR replikacija ir kuris turi replikacijos valdymo elementus
kas yra cis veiksniai
replikatoriai; DNR replikacijos pradžios sritys
kas yra trans veiksniai
iniciatoriai; baltymai, reikalingi replikacijos inciacijai vykti
bakterijų ori srities funkcijos
- ties ja vyksta replikacijos iniciacija
-valdo replikacijos iniciacijos dažnį
-užtikrina chromosomų padalijimą į dvi dukterines ląsteles
kiek bp sudaro ori sritis E.coli bakterijose
486 bp
kokio ilgio yra minimali ori sritis e.coli, užtikrinanti dvi pirmasias funkcijas
245bp
kas prijungia helikazę
DnaC baltymas - helikazės jungiklis, panašus į DnaA, tik neturi su DNR sąveikaujančio domeno
kas yra eklipsė
tarpsnis, per kurį ties oriC nevyksta nauja repliakcijos iniciacija
Ori metilinimas
- srityje yra 11 kopijų GATC, 8 jų - konservatyvios
- Metilina Dam metilazė
- metilinamos abi grandinės, nes GATC - palindromas
- fermentas metilina nemetilintą arba hemimetilintą DNR
SeqA dimerinis baltymas:
- 181 a.r., du domenai, sujungti lanksčiu domenu
- turi domeną, atpažįstantį GATC
- prisijungia prie hemimetilintų GATC ir paslepia jas nuo DnaA ir pakartotinės reiniciacijos
iniciacijos baltymo kiekio ir aktyvumo reguliavimas
-Susimontavus replisomoms, užkelti žiedai β vėluojančioje grandinėje sudaro laikiną kompleksą su DnaA / ATP ir baltymo Hda / ADP kompleksu;
- RIDA stimuliuoja ATP hidrolizę. DnaA / ADP neaktyvus AT srities atžvilgiu
- ADP disocijuoti nuo DnaA skatina rūgštiniai
fosfolipidai, kurių yramembranoje
DnaA-ATP hidrolizei reikalingas
Hda domeno arginino piršto motyvas
Hda baltymas riša
ADP, bet ne ATP
Mutacijos Hda gene didina ląstelių ATP-DnaA kiekį ir taip sukeliama
per didelė iniciacija, dėl kurios slopinamas ląstelių dalijimasis ir ląstelių augimas.
Ter sritys E. coli genome:
*10 sričių;
*23 b. p. konservatyvi seka;
*Pusė Ter sekų orientuota genome viena kryptimi, kita – priešinga kryptimi
Prie sekų atrankiai prisijungia terminacijos baltymas Tus
Eukariotinėje ląstelėje
- daug ori
- daug replikonų
-replikacija nuo kiekvienos ori vyksta
abiem kryptimis, kol replikacinės
šakutės, startavusios nuo gretimų ori,
susitinka
Kai kuriuose vienaląsčiuose (mielės) ori sritys yra nedidelės ir aiškios struktūros –
turi ??? elementą, kurį sudaro
ARS elementą sudaro :
-11 b.p. tipinė A / T turtinga seka
-kiti elementai
ori aktyvinimo etapai (eukariotuose)
- ori atpažinimas
- pre-RC komplekso sumontavimas
-pre-RC aktyvinimas
kas yra leidimas replikuoti
-tai yra patenkinimas tam tikrų sąlygų, užtikrinančių replikacijos iniciaciją ties ori sritimis
-Pre-replikacinio komplekso – pre-RC susimontavimas.
Ciklinai ir nuo ciklinciklinų priklausomos kinazkinazės:
- G1 ciklinai (ciklinas D ir E);jų kinazikinazių kompleksų taikiniai – baltymai, valdantys replikacijos iniciaciją;
- S ciklinai (ciklinas E , taip pat A); jų kinazių kompleksų taikiniai – baltymai, valdantys DNR replikaciją
- G2 ciklinai (ciklinas A , taip pat B);jų kinazių kompleksų taikiniai – baltymai, valdantys ląstelių dalijimąsi
pre-RC baltymų kompleksas
*ORC baltymai;
*Cdc6 baltymas;
*Cdt1 baltymai;
*MCM 2-7 baltymai.
ką daro ORC baltymų kompleksai
žymi ori sritį
Cdc7-Dbf4 kinazei fosforilinus MCM2-7,pritraukiami baltymai
Cdc45 ir Sld3; GINS
Cdc45 ir GINS aktyvina
MCM2-7 helikazes
