7 paskaita

Question 1

kas yra replikonas

Answer 1

DNr vienetas, kuriame vyksta DNR replikacija ir kuris turi replikacijos valdymo elementus

Question 2

kas yra cis veiksniai

Answer 2

replikatoriai; DNR replikacijos pradžios sritys

Question 3

kas yra trans veiksniai

Answer 3

iniciatoriai; baltymai, reikalingi replikacijos inciacijai vykti

Question 4

bakterijų ori srities funkcijos

Answer 4

• ties ja vyksta replikacijos iniciacija
  -valdo replikacijos iniciacijos dažnį
  -užtikrina chromosomų padalijimą į dvi dukterines ląsteles

Question 5

kiek bp sudaro ori sritis E.coli bakterijose

Answer 5

486 bp

Question 6

kokio ilgio yra minimali ori sritis e.coli, užtikrinanti dvi pirmasias funkcijas

Answer 6

245bp

Question 7

kas prijungia helikazę

Answer 7

DnaC baltymas - helikazės jungiklis, panašus į DnaA, tik neturi su DNR sąveikaujančio domeno

Question 8

kas yra eklipsė

Answer 8

tarpsnis, per kurį ties oriC nevyksta nauja repliakcijos iniciacija

Question 9

Ori metilinimas

Answer 9

• srityje yra 11 kopijų GATC, 8 jų - konservatyvios
• Metilina Dam metilazė
• metilinamos abi grandinės, nes GATC - palindromas
• fermentas metilina nemetilintą arba hemimetilintą DNR

Question 10

SeqA dimerinis baltymas:

Answer 10

• 181 a.r., du domenai, sujungti lanksčiu domenu
• turi domeną, atpažįstantį GATC
• prisijungia prie hemimetilintų GATC ir paslepia jas nuo DnaA ir pakartotinės reiniciacijos

Question 11

iniciacijos baltymo kiekio ir aktyvumo reguliavimas

Answer 11

-Susimontavus replisomoms, užkelti žiedai β vėluojančioje grandinėje sudaro laikiną kompleksą su DnaA / ATP ir baltymo Hda / ADP kompleksu;
- RIDA stimuliuoja ATP hidrolizę. DnaA / ADP neaktyvus AT srities atžvilgiu
- ADP disocijuoti nuo DnaA skatina rūgštiniai
fosfolipidai, kurių yramembranoje

Question 12

DnaA-ATP hidrolizei reikalingas

Answer 12

Hda domeno arginino piršto motyvas

Question 13

Hda baltymas riša

Answer 13

ADP, bet ne ATP

Question 14

Mutacijos Hda gene didina ląstelių ATP-DnaA kiekį ir taip sukeliama

Answer 14

per didelė iniciacija, dėl kurios slopinamas ląstelių dalijimasis ir ląstelių augimas.

Question 15

Ter sritys E. coli genome:

Answer 15

*10 sričių;
*23 b. p. konservatyvi seka;
*Pusė Ter sekų orientuota genome viena kryptimi, kita – priešinga kryptimi
Prie sekų atrankiai prisijungia terminacijos baltymas Tus

Question 16

Eukariotinėje ląstelėje

Answer 16

• daug ori
• daug replikonų
  -replikacija nuo kiekvienos ori vyksta
  abiem kryptimis, kol replikacinės
  šakutės, startavusios nuo gretimų ori,
  susitinka

Question 17

Kai kuriuose vienaląsčiuose (mielės) ori sritys yra nedidelės ir aiškios struktūros –
turi ??? elementą, kurį sudaro

Answer 17

ARS elementą sudaro :
-11 b.p. tipinė A / T turtinga seka
-kiti elementai

Question 18

ori aktyvinimo etapai (eukariotuose)

Answer 18

• ori atpažinimas
• pre-RC komplekso sumontavimas
  -pre-RC aktyvinimas

Question 19

kas yra leidimas replikuoti

Answer 19

-tai yra patenkinimas tam tikrų sąlygų, užtikrinančių replikacijos iniciaciją ties ori sritimis
-Pre-replikacinio komplekso – pre-RC susimontavimas.

Question 20

Ciklinai ir nuo ciklinciklinų priklausomos kinazkinazės:

Answer 20

• G1 ciklinai (ciklinas D ir E);jų kinazikinazių kompleksų taikiniai – baltymai, valdantys replikacijos iniciaciją;
• S ciklinai (ciklinas E , taip pat A); jų kinazių kompleksų taikiniai – baltymai, valdantys DNR replikaciją
• G2 ciklinai (ciklinas A , taip pat B);jų kinazių kompleksų taikiniai – baltymai, valdantys ląstelių dalijimąsi

Question 21

pre-RC baltymų kompleksas

Answer 21

*ORC baltymai;
*Cdc6 baltymas;
*Cdt1 baltymai;
*MCM 2-7 baltymai.

Question 22

ką daro ORC baltymų kompleksai

Answer 22

žymi ori sritį

Question 23

Cdc7-Dbf4 kinazei fosforilinus MCM2-7,pritraukiami baltymai

Answer 23

Cdc45 ir Sld3; GINS

Question 24

Cdc45 ir GINS aktyvina

Answer 24

MCM2-7 helikazes

Question 25

besisukančio rato mechanizmo replikacija

Answer 25

Iniciacijos baltymas (IP) skelia vieną DNR grandinę ir 3‘ OH galas tampa pradmeniu pirmaujančios grandinės sintezei.

Question 26

koks esminis plazmidės replikacijos skirtumas nuo bakteriofago

Answer 26

RepC baltymų dimeras lieka neaktyvus po replikacijos ciklo

Question 27

kas yra interonai

Answer 27

sekos, kuriose gausu A ir T nukleotidų, juose išskiriamos DNR grandinės

Question 28

Replisomą sudaro šeimininko:

Answer 28

• DNR pol III
• DnaB helikaazė ir praimazė