3 paskaita Flashcards
eukariotų chromatiną sudaro
-dnr
-baltymai histonai
-nehistoniniai baltymai
-rnr (genų transkripcijai, nekoduojančios rnr)
nukleosoma
struktūrinis ir funkcinis chromatino vienetas
histonų oktomerą sudaro
po dvi H2A, H2B, H3 ir H4
vinea nukleosoma chromatine yra susijungusi su
viena jungties histono (pvz H1) molekule
hisotnų klostės domeną sudaro
3 alfa-spiralės, tarpusavyje sujungtos kilpomis L1 ir L2
kas yra histonai
nedideli, 10-15 kDa baltymai
kokios a. r. daug yra H1
lizino
kokios a. r. daug yra H3
arginino
kur yra didžiausia histonų genų sankaupa
žmogaus 6 chromosomoje
kanoniniai šerdies histonai
dalyvauja chromatino supakavime ir genų veiklos valdyme
histonų baltymų molekulėse nestruktūrizuoti dažniausiai yra
N galai
ląstelėje oktomeras susirenka iš
(H3-H4)2 tetramero ir dviejų H2A-H2B dimerų
tetramero pagrindas
H3 histonų molekulių keturių alfa spiralių ryšulys
keturių spiralių ryšulys, kurį sudaro H4 ir H2B histonų alfa spiralės,
laiko H2A-H2B dimerą su H3-H4 dimeru
rūgštinį taką nukleosomoje sudaro
6 H2A aminorūgštys ir 2 H2B aminorūgštys
archėjos turi baltymų, panašių į
eukariotų histonų H3 ir H4
histonų variantų savybės:
- koduoja atskiri genai
- sintezė nepriklauso nuo replikacijos
- dalyvauja DNR reparacijoje, mejozinėje rekombinacijoje, chromosmų segregacijoje, transkripcijos inciacijoje ir terminacijoje, lytinių chromosomų kondensacijoje, spermos chromatino supakavime
H3 variantai:
CenH3 (CENP-A/Cse4/Cid)
H2A variantai:
H2A.X
Mažiausiai ir daugiausiai variabilūs histonai
mažiausiai - H4 (neturi variantų), daugiausiai H2A
centromerose yra
-savitos DNR sekos
-nukleosomose - H3 histono variantas - CenH3 (CENP-A)
10 nm siūlas yra
nukleosomų grandinėlė, kurioje nukleosomas skiria tarpai - jungties DNR
30 nm siūlui sudaryti reikia
šerdinių histonų N galų
kur tvirtinasi chromatino kilpos, sudarytos iš 30 nm siūlo
prie branduolio baltymų - pastolių
SMC baltymų yra
- kohezinų kompleksuose
- kondensinų kompleksuose
SMC baltymų N ir C galuose yra
A ir B volkerio motyvai, atsakingi už ATP jungimą
SMC baltymų C gale yra
C motyvas (LSGG(E/Q)(K/R), svarbus ATP hidrolizei
ką daro kohezinų kompleksai
per mitozę laiko dukterines chromatides
nukleoidas
Bakterijų DNR kartu su baltymais ir RNR