4 paskaita

Question 1

Kas pasižymi hisotnų acetiltransferazės aktyvumu

Answer 1

Gcn5p, mielių transkripcijos aktyviklis

Question 2

kas pasižymi histonų deacetilazės aktyvumu

Answer 2

Rpd3p, transkripcijos slopiklis

Question 3

kaip veikia potransliacijnės histonų baltymų modifikacijos

Answer 3

hisotnai po transliacijos yra modifikuojami prijungiant prie jų aminorūgščių liekanų įvairias chemines grupes, baltymus

Question 4

kam histonų modifikacijos daro įtaką

Answer 4

• histonų sąveikai su DNR nukleosomoje
• sąveikai tarp nukleosomų
• histonų sąveikai su kitais baltymais, kurie valdo chromatino veiklą

Question 5

kokios yra modifikacijų pasekmės

Answer 5

• suardoma sąveika tarp nukleosomų, chromatinas tampa lengviau prieinamas
• modifikacijas atpažįsta nehistoniniai baltymai

Question 6

kas yra modifikuojami ląstelėje

Answer 6

• šerdiniai histonai
• šerdinių histonų variantai
• jungties histonai

Question 7

kas dažniausiai acetilinama histonuose

Answer 7

lizino e-amino grupė

Question 8

ką liudija chromatino imunoišsodinimo eksperimentai

Answer 8

kad acetilinti histonai yra aktyviai transkribuojamuose chromatino regionuose

Question 9

kas acetilina histonų lizino aminorūgščių liekanas

Answer 9

histonų acetiltransferazės, HAT

Question 10

kas deacetilina aminorūgščių liekanas

Answer 10

histonų deacetilazės, HDAC

Question 11

kur acetilinamas H3

Answer 11

H3 lizinas 14

Question 12

kur acetilinamas H4

Answer 12

H4 lizinas 8 ir 16

Question 13

kokių a.r. liekanos metilinamos histonuose

Answer 13

lizino ir arginino

Question 14

kas metilina histonus

Answer 14

histonų metiltransferazės, HMT

Question 15

kaip metiltransferazės metilina histonus

Answer 15

perneša metilgrupę nuo S-adenozilmetionino ant aminorūgšties

Question 16

kokie fermentai demetilina histonus

Answer 16

demetilazės

Question 17

kokios a.r. yra fosforilinamos

Answer 17

serino, tirozino, treonino
(jų hidroksi grupė)

Question 18

kas fosforilina histonus

Answer 18

kinazės

Question 19

kas panaikina fosforilinimą

Answer 19

fosfatazės

Question 20

kas yra krotonilinama

Answer 20

jungties histonų lizinai

Question 21

ką žymi “kcr”

Answer 21

aktyvius promotorius ir stipriklius

Question 22

kokiu ryšiu ubikvitinas prijungiamas prie histonų lizino

Answer 22

izopeptidiniu ryšiu

Question 23

kuomet vyksta poliubikvitilinimas

Answer 23

kai prijungiamos kelios ubikvitino molekulės

Question 24

ką daro Rad6

Answer 24

jungia ubikvitiną prie H2B K123. Ši modifikacija skatina histono H3 metilinimą K4 ir K79 padėtyse

Question 25

kas dažniausiai ribozilinama

Answer 25

aspartato ir glutamato y karboksigrupės

Question 26

kas vykdo ADP ribozilinimą

Answer 26

- MART -- mono ADP riboziltransferazės - PARP -- poli (ADP) polimerazės

Question 27

kas yra ADP ribozės donoras

Answer 27

NAD+

Question 28

histonų kodo hipotezė

Answer 28

tam tikra modifikacija tam tikrame histone gali daryti įtaką tos pačios aminorūgšties arba kitso aminorūgšties modifikacijai tame pačiame ar kitame histone

Question 29

kas atpažįsta histonų modifikacijų kombinacijas

Answer 29

baltymų kompleksai, kurie turi įvairių atpažinimo domenų

Question 30

kokie yra histonų modifikacijas atpažįstančių baltymų domenai ir su kuo jie sąveikauja

Answer 30

- bromodomenas, sąveikauja su acetilinta Lys liekana - chromodomenas, sąveikauja su metilinta Lys liekana

Question 31

kas atpažįsta metilintus lizinus

Answer 31

baltymai, turintys chromodomeną

Question 32

kas užtikrina nukleosomų dinamiškumą

Answer 32

chromatiną pertvarkantys baltymų kompleksai

Question 33

kas yra chromatiną pertvarkantys kompleksai

Answer 33

nuo ATP priklausomos DNR translokazės, prisijungiančios prie tam tikros vietos histonų oktamere ir keičiančios DNR padėtį jo atžvilgiu

Question 34

kokiais būdais pertvarkomas chromatinas

Answer 34

- histonų oktameras gali slysti išilgai DNR - gali kisti atstumas tarp histonų oktamerų - hisotnų oktameras gali būti išstumtas iš nukleosomos

Question 35

kaip veikia INO80

Answer 35

nukleosomų redagavimas pakeičiant H2A-H2B ir H2A.Z-H2B dimerus

Question 36

ką daro ISWI ur CDH

Answer 36

nukleosomų brendimas ir susirinkimas

Question 37

Ką daro SWI/SNF

Answer 37

nukleosomų išsidėstymas - lemia prieinamumą, nukleosomų išmetimas ir dimerų atskyrimas

Question 38

kaip SWI/SNF lemia nukleosomų pašalinimą

Answer 38

- DNR paslenkama nukleosoma arba dėl susidariusios įtampos pašalinama - DNR nukleosomos susiduria ir viena iš jų pašalinama

Question 39

ką daro ISWI

Answer 39

vykdo chromatino reguliaciją, kuri lemia DNR translokaciją ir tikslią nukleosomų padėtį

Question 40

ką daro SWR1C

Answer 40

pakeičia kanoninius histonus nekanoniniais

Question 41

ką daro INO80

Answer 41

pakeičia struktūrą arba įtraukia/pašalina alternatyvius histonus