פרק 6 - תרגום פרוקריוטי Flashcards

1
Q

איזו תת יחידה של רנא פולימרז נקשרת לפרומוטור ?

A

תת יחידה סיגמא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

לאן היא נקשרת?

A

היא נקשרת לפרומוטור המצוי בין

מינוס 35

ובין מינוס 10

לפני תחילת השעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

מה הוא הוא מבנה ה

holo-enzyme ?

A

זהו המבנה כאשר תת יחידה סיגמא מתחברת לשאר הפולימרז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מה הם

up-elements?

A

רכיבים הנמצאים אפסטרים לפרומוטור

עוזרים לתחילת השעתוק

נמצאים בערך בין

מינוס ארבעים ומינוס שישים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

מה הוא

open complex

A

הדנא נפתח באזור שבין ה

מינוס 35

ומינוס 10

כאשר מתחברת תת היחידה סיגמא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מה קורה לתת היחידה סיגמא לאחר תחילת השעתוק?

A

תת יחידה סיגמא עוזבת וזה קורה לאחר סנתזה של בערך עשרה נוקלאוטידים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מה הוא השלב שמגביל מהירות בשעתוק?

A

השלב המגביל הוא האינציאציה - זה התהליך הכי איטי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מה מבנה הפקטור סיגמא ?

A

מחולק ל-4 תת יחידות שונות

תת יחידה 1 - בקצה האמיני . תפקידה למנוע מסיגמא להקשר לדנא באופן עצמאי . היא קיימת ,לפי הספר, רק בסיגמא שבעים וסיגמא ארבעים ושלוש

תת יחידה שתיים וארבע - אחראיות על הקישור למינוס עשר ומינוס שלושים וחמש

תת יחידה 3 אחראית על הקישור לדנא וגם על הקישור לשאר התת יחידות של הפולימרז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מה מזהה את ה

up elements

של הפרומוטור

?

A

הזנב הקרבוקסילי של תת היחידה אלפא בפולימרז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מה המבנה הכללי של רנא פולימרז ?

A

מחולק ל5 תת יחידות

סיגמא מתחברת לפרומוטור

אלפא ואלפא תאג אחראיות על אינציאציה

בטא ובטא תאג אחראיות על אלונגציה

אומגה - מין תת יחידה שעוזרת לחבר את כל שאר תת היחידות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

מה תפקיד התת יחידה בטא ?

A

תת יחידה בטא חשובה ליצירת קשרים פוספו-דה-אסטריים

ולכן היא חשובה לאלונגציה

בנוסף היא גם חשובה לאינציאציה ולהתחלת סינתזת גדיל הרנא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

איזו אנטיביוטיקה משפיעה על תת יחידה בטא, ואיך היא עושה זאת?

A

rifampicin

האנטיביוטיקה חוסמת את סינתזת הרנא לאחר בערך שני נוקלאוטידים

לכן ניתן להגיד שהיא מונעת איניציאציה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מה עושה האנטיביוטיקה

streptolydigin

?

A

גם היא נקשרת לתת היחידה בטא

ומונעת אלונגציה של הרנא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

אילו מרכיבים יש באתר הקטליטי של תת יחידה בטא?

A

מגנזיום

חומצה אמינית אספרטט

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

מה תפקיד יון המגנזיום באתר הקטליטי?

A

משמש כזרז לתגובה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

לאיזה כיוון מתקדם השעתוק ?

ואיך קורת התגובה של הוספת הנוקלאוטידים?

A

השעתוק מתקדם מכיוון 5 ל-3

כאשר קבוצת ה

OH

שנמצאת בקצה ה-3 של הנוקלאוטיד מבצעת התקפה נוקלאופילית על פופסט אלפא של נוקלאוטיד בקצה ה5 שלו

אז יוצא פירופוספט אנאורגני

17
Q

אילו פוספטים עוזבים מהקצה החמש?

A

פופסט בטא וגאמא

18
Q

מהי טופולוגית הדנא בזמן השעתוק?

A

יש יצירה של פיתולי על חיוביים עם כיוון השעתוק , לפני הפולימרז

ופיתולי על שליליים מאחורי הפולימרז

19
Q

מהי אטנואציה בזמן השעתוק?

למה התהליך הזה קורה?

A

כאשר הפולימרז עוצר

זה חלק מתהליך פרופ-רידינג של השעתוק

20
Q

מה עושה החלבון

GreA

?

מתי הוא פועל?

A

החלבון הזה חשוב כדי לעשות פרופ-רידינג

והוא גורם לפולימרז ללכת אחורה

זה קורה כשיש טעות בהנכסת נוקלאוטידים

בזמן השעתוק

21
Q

מהו החלבון

GreB

מה הוא עושה?

A

גורם לפעילות של רנאז

שחותך את הרנא שנוצר

זה גם סוג של פרופרידינג -כאשר צריך לעצור את השעתוק

22
Q

מהי טרמינציה שלא תלויה ב

Rho

?

A

זוהי טרמינציה שנובעת מאינברטד ריפיט

רצפים אלו עוברים קומפלימנטציה שיוצרת מבנה ראש-סיכה

23
Q

אילו נוקלאוטידים נמצא במבנה ראש-הסיכה

A

בחלקים שעוברים קומפלמינטציה נצפה למצוא הרבה ג׳י וסי

בחלקים שיוצרים את הראש עצמו - נמצא בעיקר איי ויו (או איי וטי אם מסתכלים על הדנא ולא על הרנא)

בקצה ה-3 של הרנא שנוצר יהיה רצף פולי-יו

24
Q

למה חשוב הרצף פולי יו?

ושואל שוב - באיזה קצה הוא נמצא ?

A

זיווג הבסיסים שנעשה עם הדנא יהיה חלש יותר כאשר הקשרים יהיו בין איי ויו

הוא חלש יותר בגלל שיש פחות קשרי מימן - שני קשרי מימן לעומת שלושה קשרים בין ג׳י וסי

פחות קשרי מימן = חיבור רופף יותר לדנא = הסתברות גבוה יותר שהרנא יתנתק מבועת השעתוק

נמצא בקצה ה-3 של הרנא !

25
Q

שאלה מגעילה - אבל זה מוזכר בספר -

למה למעשה צריך את המבנה הזה?

והאם הוא בפני עצמו חשוב לטרמינציה

A

שהמבנה עצמו כמבנה לא חשוב לסיום השעתוק

המבנה חשוב כי ככה הוא מונע מהרנא לעבור זיווג בסיסים עם בועת השעתוק של הדנא

26
Q

מה עושה החלבון

Rho

?

A

החלבון נתפס לרנא באזור העשיר בנוקלאוטיד סי

ועל ידי שימוש באיי-טי-פי

הוא נע לאורך הרנא עד שהוא פוגש את תת היחידה

בטא , וגורם להפרדה בין הזיווג בסיסים של הרנא והדנא בבועת השעתוק

27
Q

מה המבנה של

Rho

A

הוא הקסמר

28
Q

לאיזה כיוון הוא נע על הרנא?

A

מקצה 5 ל-3

29
Q
A