פרק 10.1 - מבנה רנא פולימרז Flashcards
באקריוטים - כמה רנא פולימרז קיימים , ומה כל אחד מהם משעתק?
הפירוט לפי הטבלה
על מה משפיע אלפא-אמינטין?
ועל מה לא?
הוא פוגע בפעילות של פולימרז 2 ו-3
כאשר פול2 מאד רגיש (מריכוז של 1 מיקרוגרם למ״ל
ופול3 רגיש פחות (מריכוז של 100 מיקרוגרם למ״ל
פול1 - בכלל לא רגיש
מצורף השקף שמראה את הירידה בפעילות שלהם כתלות בריכוז האלפא אמינטין
כמה תת יחידות קיימות בפול2 ההומני?
מה כל תת יחידה עושה?
הערת המחבר:
הטבלה המצורפת היא טבלת הגיהינום שמפרטת על כל תת יחידה פרטים על הגודל והפונקציה שלה
בהמשך ישאלו שאלות יותר ספציפיות - אז כן, כדאי להכיר אותה
12
אילו שלוש תת יחידות הן בעלות פעילות אנזימתית
ולמי התת יחידות הדומות להן בפרוקריוטים?
Rpb1
דומה לבטא תאג
Rpb2
דומה לבטא
Rpb 3
דומה לאלפא
באי קולי
מה המבנה של זנב ה
CTD
באיזו תת יחידה הוא נמצא?
הוא מורכב מ7 חומצות אמינו
והוא נמצא בקצה הקרבוקסילי של תת היחידה
Rpb1
מה המבנה , האורך וההבדלים בין שמרים ואדם במבנה
CTD
?
בנוסף, מהן הח״א החשובות בזנב?
הזנב מורכב מחזרות של הפטה-פפטיד הכולל 7 חומצות אמינו
החשובות בו הן :
סרין בעמדות חמש ושתיים
וגם בעמדה שבע - רשום שהיא חשובה אבל לא תמיד
שזה הסבר מאד מוזר.
באדם הרצף הזה חוזר 52 פעמים
לעומת זאת בשמרים הוא חוזר 26 פעמים
כלומר 52 חזרות של 7 ח״א או 26 חזרות של 7 ח״א
איזה יון חשוב לפעולת הפול2?
איפה הוא נמצא?
יון מגנזיום
הוא נמצא בשני מקומות -
הוא נמצא פעם אחת באתר הקטליטי של הפולימרז2
מחובר לשלוש אספרטט
תזכורת - הפולימרז מכיל אתר קטליטי עם אספרטט
זה הוזכר בפרק על פרוקריוטים , ולא כל כך מפורט בפרק הזה
יון זה גם מכונה
METAL - A
היון השני בא במגע עם 2 אספרטט וגלוטמט
והוא עוזר לקטלז את הפעילות
לא רשום במדויק היכן הוא נמצא אלא שהוא בקרבת התת יחידות
Rpb1 + 2
הוא מכונה
Metal-B
איזה קשרים מבצע יון זה?
קשרים קואורדנטיבים
מה היא ה
T-loop?
איך היא עובדת בקצרה?
אזור בפולימרז שיודע להפריד בין נוקלאוטידים שהוכנסו נכון ולא נכון
נמצא ב
RPB1
בקצרה - הטי לופ עוזרת להכווין את כניסת הנוקלאוטיד לאתר הפעיל של הפולימרז
