פרק 11 - פקטורי שעתוק כלליים Flashcards
שאלת פתיחה לחימום -
מה הסדר של הגעת פקטורי השעתוק הכלליים ?
TFIID
TFIIB
TFIIF
TFIIE
TFIIH

מהו ה
TBP
ועם איזה פקטור שעתוק הוא בא במגע?
TBP
הוא פקטור שנקשר לרצף ה
TATA
לאיזו תעלה נקשר
TBP
?
נקשר לתעלה הקטנה
איך ה
TBP
משפיע על מבנה הדנא?
הוא יודע לעקם את הדנא בזווית של 80 מעלות
וככה חושף אותו לקשירה של חלבונים - כמו הפקטור
TFIID
על אילו רצפים חלבון ה
TBP
פועל?
על רצפי
TATA
מה המבנה של
TBP
?
ובעזרת איזה אלמנט מבני בחלבון הוא נקשר לדנא?
הוא בעל מבנה סימטרי !
לא דימרי !
הוא נקשר בעזרת מבנה בטא לתעלה הקטנה
איך יקשר הפקטור
TFIID
כאשר יש לנו רצף
DPE
?
זה מתקשר קצת לשאלה קודמת -
רצפי
DPE
מופיעים לרוב כשאין
TATA
ולכן הפקטור
TFIID
יקשר בעזרת תיווך של
TAF1

איך יקשרו פקטורי השעתוק כאשר הפרומוטור הוא חסר
TATA
ומכיל
GC box
בעזרת תיווך של חלבון הנקרא
SP1
ובעזרת
TAF 4/1/2

מה מיוחד ב-
TAF1
?
ידוע כבעל פעילות אנזימתית.
יודע לחבר קבוצות אצטיל לליזין בהיסטונים
ובעזרת זה הוא מקדם שעתוק..
מה הוא החלבון
TRF1?
הוא חלבון הומולוגי ל
TBP
והוא יכול להחליף את פעילותו בגנים מסוימים
האם חלבוני
TAF
תמיד דרושים כדי להתחיל שעתוק?
לא
האם
TBP
תמיד נחוץ להתחלת שעתוק?
לא.
למרות החשיבות שלו והופעתו כמעט בכל קומפלקס אינציאציה
הוא לא תמיד נחוץ - לפעמים יש שימוש ב
TRF1
אילו תפקידים עיקריים יש ל
TFIIH
?
הוא מזרחן את זנב ה
CTD
וגם יש לו פעילות כהליקז
שניהם יחד חשובים לתחילת השעתוק, והאלונגציה של הרנא
באילו מקומות מזורחן זנב ה
CTD
של הפולימרז?
ואיך משפיע כל זרחון על פעילותו ועל השעתוק?
סרין מספר 2 - זרחון בעמדה זו חשוב למעבר מאינציאציה לאלונגציה
סרין מספר 5- זרחונו חשוב לאינציאציה של השעתוק
מהי הדרך הנוספת בה זנב ה
CTD
יכול להיות מזורחן?
הוא יכול להיות מזורחן בעזרת קינזים כמו
CTDK
אשר מזרחנים את סרין 2 בזנב
למה גורמת פעילות ההליקז של
TFIIH
?
היא חשובה לפתיחת בועת השעתוק
על מה אחראי הפקטור
TFIIF
?
למה הוא דומה בפולימרז הפקרוקריוטי?
אחראי על יצוב האינטרקציות בין הפקטורים השונים, והבאת הפולימרז
מזכיר את תת יחידה סיגמא ברנא פולימרז הפרוקריוטי
איך מתחיל השעתוק בפרומוטורים של פולימרז-1?
הכל מתחיל בגיוס של החלבון
UBF
אל רצף בפרומוטור הקרוי
UCE - upstream control element
חלבון זה מגייס את
SL1
שהוא קומפלקס חלבוני המורכב מ
TBP
ועוד שלושה חלבוני
TAF
ואז מצטרפים פקטורי השעתוק הכלליים, ומגויס הפולימרז

איך מגויס רנא פולימרז 3?
TFIIIC
מגייס את הפקטור
TFIIIB
שמכיל בתוכו את
TBP
ויחדיו מגייסים את הפולימרז
