ביוכימיה- שיעור 5 Flashcards
effector protein
חלבון המטרה שמשתנה בצורה כזו או אחרת בתגובה להפעלת האותות בתא.
התמיינות למצב סופי
דורשת קומבינציה שונה של סיגנלי הישרדות והתמיינות שחייבים לעקוף כל סינגל של חלוקה.
סיגנל תלוי מגע
(ג’וקסטה-קרין
סיגנל של מגע בין תא אחד לתא שני.
למשל תאים שגדלים בתרבית גדלים בשכבה אחת, וברגע שיש צפיפות הם יפסיקו את גדילתם.
לסיגנל זה יש חשיבות רבה במהלך ההתפתחות העוברית.
בתאים סרטניים יש פגיעה בסגינל זה, לכן יווצרו שכבות נוספות של תאים בתרבית ללא צורך במגע בין התאים.
סיגנל פארא קריני
סיגנל שעובר בין תא לבין התאים השכנים שלו- מדובר בסיגנל מקומי.
סיגנל אנדוקריני
סיגנל שעובר דרך זרם הדם.
משמע יכול לעבור מרחק רב.
לרוב מדובר בהורמונים.
סיגנל נוירונלי
סיגנל בין תאי נוירון דרך הסינפסה ומשם לתא המטרה.
סיגנל אוטו-קריני
סיגנל שתא מפריש ובעצם משפיע על עצמו.
תאים סרטניים רבים לדוגמא מפרישים מולק’ סיגנל חוץ תאיות אשר מגרות את ההישרדות והחלוקה שלהם עצמם.
קולטן ממברנלי חוץ תאי
מרבית הלגינדים הם הידרופיליים, ועל כן אינם יכולים לחדור אל תוך התא ולכן משפיעים עליו מבחוץ (המצב הנפוץ).
קולטן תוך תאי
נמצא בציטוזול או ברגעין התא.
ליגדנים אלו יהיו הידרופוביים, ועל כן יוכלו לחדור את ממברנת התא בדיפוזיה (לדוגמא הורמוניים סטרואידיים).
אצטיל כולין בתאי קוצב לב
מוריד את קצב הפ”פ.
רצפטור זהה לתאי רוק.
אצטיל כולין בתאי רוק
מזרז את היצירה של רוק בתאי בלוטת רוק.
רצפטור זהה לתאי קוצב לב
אצטיל כולין בשריר
גורם לתאים להתכווץ.
רצפטור שונה מתאי קוצב לב ורוק.
תגובה מהירה
על ידי מודיפיקציה של חלבונים קיימים בתא- ע”י זירחון, מתילציה, יוביקוויטינציה וכו’.
מעבר האותות אורך שניות עד דק וזה מבוביל לתגובה מהירה של התא.
הפעולה המהירה היא היא בעצם שינוי פעילות של חלבון קיים.
תגובה איטית
בכך שהיא תדרוש סינתזה של חלבונים חדשים- דרך שעתוק ותירגום.
חלבונים אלו יגמרו לשינויים מגוונים.
למשל, סיגנל מיטוגני שיגרום להפעלת מיטוזה ובטווח האיטי מייצר ציקלינים.
דה- סנסטיזציה
מצב בו למרות קיום הסיגנל לא תיהיה פעילות.
יכול לקרות בגלל ירידה בכמות הרצפטורים, או בגלל עיכוב של הרצפטורים.
מתרחש כאשר יש עלייה ברמת הסיגנל באופן ממושך על מנת למנוע תגובה ממושכת.
למעשה הרצפטורים מגיבים לשינוי ברמת מולק הסיגנל ולא לכמות האבסולוטית שלה.
אגוניסט
מול’ שמחקה את הלינגד הטבעי.
נקשרת לרצפטור ומעוררת את אותה תגובה תאית (מפעילה אותו).
אנטגוניסט
נקשר לרצפטור אבל לא מעורר תגובה בתא. חוסם את הרצפטור (משבית אותו).
שליח ראשוני
ליגנד חוץ תאי שנקשר לרצפטור על גביי ממברנת התא ומאתחל מסלול אותות בתוך התא.
לדומ’ הורמונים פפטידים.
שליח שניוני
המול’ שריכוזה בתא משתנה (עולה או יורד) בתגובה לקישור של הליגנד (השליח הראשוני) לרצפטור.
לדוגמא: cAMP, cGMP, DAG, IP3 וסידן.
מתגים מולקולריים
כאשר מתקבל סינגל, החלבונים עוברים ממצב לא פעיל למצב פעיל עד שתהליך אחר יגרום לכיבוי שלהם.
זרחון (פוספורילציה)
המחלקה הגדולה ביותר של מתגים מולקולריים מורכבת מחלבונים המופעלים או נכבים ע”י זירחון.
המעבר בין שני המצבים נעשה ע”י קינאז ופוספטאז.
כ-30%-50% מהחלבונים ההומנים מכילים פוספט המחובר אליהם קוולנטית.
הגנום האנושים מקודד לכ-520 קינאזות ו-150 פוספטאזות.
serine/threonine kinases
tyrosine kinases
בצמחים גם היסטידין קינאז.
חלבונים תוך תאיים רבים המבוקרים ע”י זרחון הם קינאזות בעצמן ופעמים רבות מואורגנים בתוך מה שנקרא:
kinase cascades, כמו במסלול ה- MAPK.
חלבונים קושרי GTP
מורכבת מחלבוני G.
מצב “On”- בו קשורה מולק’ GTP.
מצב “Off” בו קשורה מולק’ GDP.
במצב ה-On יש למרבית חלבוני ה-G פעילות GTPase אינטרינזית אשר מאפשרת להם לכבות את עצמם ע”י הידרוליזת ה-GTP ל- GDP.
חלובני ה- G מחולקים לשתי קבוצות:
חלבוני G טרימרים וחלבוני G מונומרים.
המעבר בין המצב הפעיל לכבוי נעשית בעזרת
GAPs- מזרזים הידרוליזת GTP.
GEFs- מזרZים שחרור של GDP כך ש-GTP חדש יוכל להיקשר.
חלבוני Adaptors
חלבונים בעלי דומיין אינטאקציה אחד או שניים והם מקשרים בין שני חלבונים או יותר במסלול הסינגל.\
דומייני האינטראקציה נקשרים למוטיפים מבניים ספציפיים בחלבונים או ללפידים.
מוטיף Motif
רצף פפטידי קצר או מודיפיקתיה קוולנטית (כמו חומצת אמינו מזורחנת) בחלבון שאליו נקשר האדפטור.