ביולוגיה מולקולרית- שיעור 1 Flashcards

1
Q

כרומוזומים

A

מבנים דמוי סיבים בגרעין של תא אאוקריוטי ההופכים לניראים לעין כשהתא מתחיל להתחלק.
בנויים מחומצה דאוקסיריבונוקלאית (DNA וחלבון.

ה-DNA והחלבון נמצאים בכרומוזומים בכמוית שוות.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

נוקלאוטידים

A

קיימים ארבעה סוגים של נוקלאוטידים במולק DNA.
מורכבים מסוכר בעל חמישה פחמנים.
לסוכר מוצמדת קבוצת פוספט אחת או יותר ובסיס חנקני.
הנוקלאוטידים ב-DNA מכילים סוכר- דאוקסיריבוז והוא מוצמד לקבוצת פוספט יחידה.

Adenin
Cytosine
Guanine
Thymine

הנוקלאוטידים קשורים קוולנטית זה לזה בשרשרת דרל הסוכרים והפוספטים המהווים עמוד שדרה בעל רצף של סוכרים ופוספטים לסירוגין.

ההבדל בין ארבעת סוגי הנוקלאוטידים הוא רק בבסיס.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

המרחק בין שני נוקליאוטידים סמוכים

A

0.34 nm

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

אורך גנום אנושי הפלואידי

A

3.1 * 10^9

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

גנום אנושי דיפלואידי

A

כולל את 23 זוגות הכרומוזומים + הגנום המיטיכונדריאלי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מספר הגנים המקודדים לחלבונים בבני אדם

A

20,000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מספר הגנים המקודדים לNon coding RNA

A

5000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

אורך גן ממוצע

A

27,000 נוקלואוטידים
(מידע ליצירת חלבון ממוצע- 1300 בסיסים בערך)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מספר הפסאודו גנים

A

מעל 20,000
פסאודו גנים- רצף דנא הדומה לגן פונקציונלי אך עבר מוטציות שמנעו ממנו להיות פעיל.
הרוב נובע מאירוע שיכפול גנים ולאחר מכן הצטברות מוטציות מזיקות בעותק.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

אחוז הרצפים החומרניים בגנום

A

50%

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

אחוז הרצפים השמורים היטב בגנום

A

3.5%

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

מה הוא פירמידין?

A

בסיס חנקני בעל טבעת יחידה
הבסיסים הפירמידינים הם תימין T, ציטוזין C ואורציל U

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מה הוא פורין?

A

בסיס חנקני בעל שתי טבעות, אלו הם אדנין A וגואנין G

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מה הרוחב בין הגדילים בDNA?

A

שני ננומטר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

כמה זוגות נוקלאוטידים יש בסיבוב אחד של גדיל הDNA?

A

10.4 זוגות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

מה המרחק מרכז למרכז בין שני נוקלאוטידים שכנים? על אותו גדיל

A

0.34 ננומטר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

בצביעת קריוטיפ, כמה זוגות נצבעים?

A

יש 23 זוגות כרומוזומים מוכפלים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

מה הוא אורך הDNA (כולל את 23 הזוגות + גנום מיטוכונדיראלי)

A

3.1×10⁹
צמדי נוקלאוטידים עבור גנום הפלואידי, כפול לגנום דיפלואידי כלומר
6.2×10^9

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

כמה גנים מקודדים לחלבון יש?

A

בערך 20,000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

מה הוא הגן הגדול ביותר לחלבון?

A

2.4×10⁶ נוקלאוטידים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

מה הגודל הממוצע לגן מקודד חלבון?

A

27,000 נוקלאוטידים

22
Q

מה מספר האקסונים הקטן ביותר שקיים בגן?

A

1

23
Q

מה מספר האקסונים הגדול ביותר בגן?

A

178

24
Q

מהו המספר הממוצע של אקסונים בגן?

A

10.4

25
Q

מהו אורך האקסון הארוך ביותר בגנום?

A

17,106 נוקלאוטידים

26
Q

מה האורך הממוצע של אקסון?

A

145 נוקלאוטידים

27
Q

מהו המספר של non coding RNA genes?

A

בערך 5000

28
Q

כמה פסאודודנים יש?

A

יותר מ20,000

29
Q

מהו פסואדוגן?

A

זהו רצף DNA שדומה מאוד לגן פונקציונאלי אבל עבר מוטציה/שינוים רבים שמנעו ממנו להיות פעיל. הרוב נובעים מאירוע שכפול גנים ולאחר מכן הצטברות של מוטציות מזיקות בעותק

30
Q

מה הוא אחוז רצף הDNA שנמצא באקסון? כלומר מקודד לחלבון

A

1.5%

31
Q

מהו אחוז הDNA שהרצפים שמורים היטב מלבד גנים כולל רצפי בקרה?

A

3.5%

32
Q

מה הוא אחוז רצף הDNA שמורכב מאלמנטים של רצפים חוזרניים?

A

בערך 50%

33
Q

מה היא הדחיסה הראשונית והבסיסית ביותר של כרומוזום וממה היא מורכבת?

A

נוקלאוזום, מורכבת מרצף DNA עם היסטונים

34
Q

כמה היסטונים נמצאים בנוקלאוזום ומה הסוגים?

A

יש שמונה היסטונים בכל נוקלאוזום, שניים מכל סוג: H4, H3, H2B, H2A

35
Q

כמה זוגות נוקלאוטידים נמצאים בנוקלאוזום אחד?

A

147 זוגות

36
Q

מבחינה טכנית, מה המושג נוקלאוזם מתייחס?

A

חלקיק ליבת הנוקלאוזום עם שמונה היסטונים ו147 זוגות נוקלאוטידים פלוס אחד מאיזורי הDNA המקשר לצמוד שלו, נע בין כמה נוקלאוטידים עד 80, ממוצע 50. אז בממוצע נוקלאוזומים מופיעים במרווחים של 200 זוגות נוקלאוטידים

37
Q

כמה נוקלאוזומים יש בכל הDNA?

A

בערך 30 מיליון

38
Q

היברידיזציית DNA

A

שיטת צביעה שמבחינה בקלות בין הכרומוזומים האנושיים. גדיל קצר של חומצת גרעין מתוייג על ידי צבע פלאורוסנטי משמש כפרוב probe. הוא נקשר לרצף משלים ומאיר את הכרומוזום המטרה. הצביעה הזו מתרחשת רק בשלב המיטוזה

39
Q

הקריוטיפ האנושי

A

תצוגת 46 הכרומוזומים האנושיים בזמן מיטוזה

40
Q

מה תהיה ההשפעה של הוספת אצטיל לשייר ליזין בזנב N טרמינלי בנוקלאוזום?

A

תרפה את מבנה הכרומטין וזה מעודד שעתוק של האזור.
יש הרפיה כי ההוספה של אצטיל לליזין מבטלת את המטען החיובי וכך מפחיתה את האפיניות של הזנבות לנוקלאוזומים שכנים

41
Q

מה עושה מתילציה משולשת לליזין מסוים אחד על זנב היסטון H3?

A

מגייס את החלבון הספציפי להטרוכרומטין HP1 שתורם לביסוס והפצה של הטרוכרומטין

42
Q

לאיזה סוג היסטון ליבה לא ידועים וריאנטים?

A

H4

43
Q

מתי מיוצרים ההיסטונים המרכזיים ומתי מיוצרים הוריאנטי היסטונים?

A

היסטונים מרכזיים נוצרים בשלב הS מורכבים לתוך נוקלאוזומים לסליל הכפול ממש מאחורי מזלג השכפול, הוריאנטים נוצרים לאורך כל שלב האינטרפאזה

44
Q

מה מיוחד לכרומטין בצנטרומר?

A

הכרומטין הצנטרומרי מתקיים לאורך כל שלב האינטרפאזה, הוא מכיל וריאנט של H3 שנקרא CENP A שיחד עם חלבונים נוספים אורז את הנוקלאוזומים לצורך ארגון דחוס במיוחד. החלבונים מייצרים את הקינטוכור גם.

45
Q

מה הוא רצף HS4?

A

רצף המפריד בין כרומטין פעיל שמכיל את האתר לבטא גלובין אנושי בתאי דם אדומים לבין אזור כרומטין דחוס.

46
Q

האם alpha satellites נמצאים רק בצנטרומר?

A

לא, הם נמצאים באזורים אחרים בכרומוזום

47
Q

האם alpha Satellites הם המכווינים ליצירת צנטרומר חדש?

A

לא. יכולים להיווצר צנטרומרים חדשים שנקראים נאונצטרומרים בכרומוזומים שבורים והם לא מכילים את הרצפים החוזרניים, לכן כנראה מוגדרים על ידי אסיפות חלבונים

48
Q

Fractal globule

A

סידור נטול קשרים המאפשר אריזה דחוסה מקסימלית שמאפשרת לסיבי כרומטין לעבור פרימה ודחיסה מחודשת

49
Q

טרנספוזונים

A

רצפי DNA פרזיטיים שיכולים להתפשט בתוך הגנום בו נמצאים, ההתפשטות יכולה להפריע לתפקוד או לשנות את הבקרה על גנים קיימים. הם גורמים לעיתים ליצירת גנים חדשים בעזרת איחוי רצפי טרנספוזונים ומקטעים של גנים קיימים.

50
Q

קודון נרדף או סינונימיים synonymous, מה הם?

A

קודונים בעלי עמדה שלישית שונה אבל שמקודדים לאותה חומצת אמינו

51
Q

סלקציה מטהרת, מה ההגדרה?

A

סלקציה המסלקת פרטים הנושאים מוטציות המפריעות לתפקודים גנטיים חשובים

52
Q

מה הם איזורים של סינטניה regions of synteny?

A

מקטעי DNA גדולים בהם סדר הגנים בכרומוזומים זהה בין מינים רחוקים מאוד.