ביולוגיה מולקולרית- שיעור 1

Question 1

כרומוזומים

Answer 1

מבנים דמוי סיבים בגרעין של תא אאוקריוטי ההופכים לניראים לעין כשהתא מתחיל להתחלק.
בנויים מחומצה דאוקסיריבונוקלאית (DNA וחלבון.

ה-DNA והחלבון נמצאים בכרומוזומים בכמוית שוות.

Question 2

נוקלאוטידים

Answer 2

קיימים ארבעה סוגים של נוקלאוטידים במולק DNA.
מורכבים מסוכר בעל חמישה פחמנים.
לסוכר מוצמדת קבוצת פוספט אחת או יותר ובסיס חנקני.
הנוקלאוטידים ב-DNA מכילים סוכר- דאוקסיריבוז והוא מוצמד לקבוצת פוספט יחידה.

Adenin
Cytosine
Guanine
Thymine

הנוקלאוטידים קשורים קוולנטית זה לזה בשרשרת דרל הסוכרים והפוספטים המהווים עמוד שדרה בעל רצף של סוכרים ופוספטים לסירוגין.

ההבדל בין ארבעת סוגי הנוקלאוטידים הוא רק בבסיס.

Question 3

המרחק בין שני נוקליאוטידים סמוכים

Answer 3

0.34 nm

Question 4

אורך גנום אנושי הפלואידי

Answer 4

3.1 * 10^9

Question 5

גנום אנושי דיפלואידי

Answer 5

כולל את 23 זוגות הכרומוזומים + הגנום המיטיכונדריאלי

Question 6

מספר הגנים המקודדים לחלבונים בבני אדם

Answer 6

20,000

Question 7

מספר הגנים המקודדים לNon coding RNA

Answer 7

5000

Question 8

אורך גן ממוצע

Answer 8

27,000 נוקלואוטידים
(מידע ליצירת חלבון ממוצע- 1300 בסיסים בערך)

Question 9

מספר הפסאודו גנים

Answer 9

מעל 20,000
פסאודו גנים- רצף דנא הדומה לגן פונקציונלי אך עבר מוטציות שמנעו ממנו להיות פעיל.
הרוב נובע מאירוע שיכפול גנים ולאחר מכן הצטברות מוטציות מזיקות בעותק.

Question 10

אחוז הרצפים החומרניים בגנום

Answer 10

50%

Question 11

אחוז הרצפים השמורים היטב בגנום

Answer 11

3.5%

Question 12

מה הוא פירמידין?

Answer 12

בסיס חנקני בעל טבעת יחידה
הבסיסים הפירמידינים הם תימין T, ציטוזין C ואורציל U

Question 13

מה הוא פורין?

Answer 13

בסיס חנקני בעל שתי טבעות, אלו הם אדנין A וגואנין G

Question 14

מה הרוחב בין הגדילים בDNA?

Answer 14

שני ננומטר

Question 15

כמה זוגות נוקלאוטידים יש בסיבוב אחד של גדיל הDNA?

Answer 15

10.4 זוגות

Question 16

מה המרחק מרכז למרכז בין שני נוקלאוטידים שכנים? על אותו גדיל

Answer 16

0.34 ננומטר

Question 17

בצביעת קריוטיפ, כמה זוגות נצבעים?

Answer 17

יש 23 זוגות כרומוזומים מוכפלים

Question 18

מה הוא אורך הDNA (כולל את 23 הזוגות + גנום מיטוכונדיראלי)

Answer 18

3.1×10⁹
צמדי נוקלאוטידים עבור גנום הפלואידי, כפול לגנום דיפלואידי כלומר
6.2×10^9

Question 19

כמה גנים מקודדים לחלבון יש?

Answer 19

בערך 20,000

Question 20

מה הוא הגן הגדול ביותר לחלבון?

Answer 20

2.4×10⁶ נוקלאוטידים

Question 21

מה הגודל הממוצע לגן מקודד חלבון?

Answer 21

27,000 נוקלאוטידים

Question 22

מה מספר האקסונים הקטן ביותר שקיים בגן?

Answer 22

1

Question 23

מה מספר האקסונים הגדול ביותר בגן?

Answer 23

178

Question 24

מהו המספר הממוצע של אקסונים בגן?

Answer 24

10.4

Question 25

מהו אורך האקסון הארוך ביותר בגנום?

Answer 25

17,106 נוקלאוטידים

Question 26

מה האורך הממוצע של אקסון?

Answer 26

145 נוקלאוטידים

Question 27

מהו המספר של non coding RNA genes?

Answer 27

בערך 5000

Question 28

כמה פסאודודנים יש?

Answer 28

יותר מ20,000

Question 29

מהו פסואדוגן?

Answer 29

זהו רצף DNA שדומה מאוד לגן פונקציונאלי אבל עבר מוטציה/שינוים רבים שמנעו ממנו להיות פעיל. הרוב נובעים מאירוע שכפול גנים ולאחר מכן הצטברות של מוטציות מזיקות בעותק

Question 30

מה הוא אחוז רצף הDNA שנמצא באקסון? כלומר מקודד לחלבון

Answer 30

1.5%

Question 31

מהו אחוז הDNA שהרצפים שמורים היטב מלבד גנים כולל רצפי בקרה?

Answer 31

3.5%

Question 32

מה הוא אחוז רצף הDNA שמורכב מאלמנטים של רצפים חוזרניים?

Answer 32

בערך 50%

Question 33

מה היא הדחיסה הראשונית והבסיסית ביותר של כרומוזום וממה היא מורכבת?

Answer 33

נוקלאוזום, מורכבת מרצף DNA עם היסטונים

Question 34

כמה היסטונים נמצאים בנוקלאוזום ומה הסוגים?

Answer 34

יש שמונה היסטונים בכל נוקלאוזום, שניים מכל סוג: H4, H3, H2B, H2A

Question 35

כמה זוגות נוקלאוטידים נמצאים בנוקלאוזום אחד?

Answer 35

147 זוגות

Question 36

מבחינה טכנית, מה המושג נוקלאוזם מתייחס?

Answer 36

חלקיק ליבת הנוקלאוזום עם שמונה היסטונים ו147 זוגות נוקלאוטידים פלוס אחד מאיזורי הDNA המקשר לצמוד שלו, נע בין כמה נוקלאוטידים עד 80, ממוצע 50. אז בממוצע נוקלאוזומים מופיעים במרווחים של 200 זוגות נוקלאוטידים

Question 37

כמה נוקלאוזומים יש בכל הDNA?

Answer 37

בערך 30 מיליון

Question 38

היברידיזציית DNA

Answer 38

שיטת צביעה שמבחינה בקלות בין הכרומוזומים האנושיים. גדיל קצר של חומצת גרעין מתוייג על ידי צבע פלאורוסנטי משמש כפרוב probe. הוא נקשר לרצף משלים ומאיר את הכרומוזום המטרה. הצביעה הזו מתרחשת רק בשלב המיטוזה

Question 39

הקריוטיפ האנושי

Answer 39

תצוגת 46 הכרומוזומים האנושיים בזמן מיטוזה

Question 40

מה תהיה ההשפעה של הוספת אצטיל לשייר ליזין בזנב N טרמינלי בנוקלאוזום?

Answer 40

תרפה את מבנה הכרומטין וזה מעודד שעתוק של האזור.
יש הרפיה כי ההוספה של אצטיל לליזין מבטלת את המטען החיובי וכך מפחיתה את האפיניות של הזנבות לנוקלאוזומים שכנים

Question 41

מה עושה מתילציה משולשת לליזין מסוים אחד על זנב היסטון H3?

Answer 41

מגייס את החלבון הספציפי להטרוכרומטין HP1 שתורם לביסוס והפצה של הטרוכרומטין

Question 42

לאיזה סוג היסטון ליבה לא ידועים וריאנטים?

Answer 42

H4

Question 43

מתי מיוצרים ההיסטונים המרכזיים ומתי מיוצרים הוריאנטי היסטונים?

Answer 43

היסטונים מרכזיים נוצרים בשלב הS מורכבים לתוך נוקלאוזומים לסליל הכפול ממש מאחורי מזלג השכפול, הוריאנטים נוצרים לאורך כל שלב האינטרפאזה

Question 44

מה מיוחד לכרומטין בצנטרומר?

Answer 44

הכרומטין הצנטרומרי מתקיים לאורך כל שלב האינטרפאזה, הוא מכיל וריאנט של H3 שנקרא CENP A שיחד עם חלבונים נוספים אורז את הנוקלאוזומים לצורך ארגון דחוס במיוחד. החלבונים מייצרים את הקינטוכור גם.

Question 45

מה הוא רצף HS4?

Answer 45

רצף המפריד בין כרומטין פעיל שמכיל את האתר לבטא גלובין אנושי בתאי דם אדומים לבין אזור כרומטין דחוס.

Question 46

האם alpha satellites נמצאים רק בצנטרומר?

Answer 46

לא, הם נמצאים באזורים אחרים בכרומוזום

Question 47

האם alpha Satellites הם המכווינים ליצירת צנטרומר חדש?

Answer 47

לא. יכולים להיווצר צנטרומרים חדשים שנקראים נאונצטרומרים בכרומוזומים שבורים והם לא מכילים את הרצפים החוזרניים, לכן כנראה מוגדרים על ידי אסיפות חלבונים

Question 48

Fractal globule

Answer 48

סידור נטול קשרים המאפשר אריזה דחוסה מקסימלית שמאפשרת לסיבי כרומטין לעבור פרימה ודחיסה מחודשת

Question 49

טרנספוזונים

Answer 49

רצפי DNA פרזיטיים שיכולים להתפשט בתוך הגנום בו נמצאים, ההתפשטות יכולה להפריע לתפקוד או לשנות את הבקרה על גנים קיימים. הם גורמים לעיתים ליצירת גנים חדשים בעזרת איחוי רצפי טרנספוזונים ומקטעים של גנים קיימים.

Question 50

קודון נרדף או סינונימיים synonymous, מה הם?

Answer 50

קודונים בעלי עמדה שלישית שונה אבל שמקודדים לאותה חומצת אמינו

Question 51

סלקציה מטהרת, מה ההגדרה?

Answer 51

סלקציה המסלקת פרטים הנושאים מוטציות המפריעות לתפקודים גנטיים חשובים

Question 52

מה הם איזורים של סינטניה regions of synteny?

Answer 52

מקטעי DNA גדולים בהם סדר הגנים בכרומוזומים זהה בין מינים רחוקים מאוד.