4. les virus Flashcards
qu’est-ce qu’un virus
agent qui peut être filtré (les filtres sont conçus pour retenir les bactéries)
quel type de micro-organisme est le virus
parasite intracellulaire obligatoire (sa réplication dépend de la machinerie biochimique de la cellule hôte)
vrai ou faux : certains virus peuvent produire de l’énergie ou des protéines indépendamment de la cellule hôte
faux, c’est l’une des caractéristiques des virus
vrai ou faux : les virus peuvent contenir de l’ADN et de l’ARN
faux, un ou l’autre
vrai ou faux : tous les virus sont enveloppés
faux
vrai ou faux : les virus ne sont pas vivants
vrai
comment les virus assurent-ils leur survie en 4 étapes
- infection d’une cellule
- utilise la machinerie cellulaire de l’hôte pour produire ses propres composantes
- encode tous les processus requis qui ne sont pas “fournis” par la cellule hôte
- les composantes virales s’assemblent par elles-mêmes
quelles sont les 3 raisons qui expliquent que tous les virus ne peuvent pas infecter toutes les cellules ou tous les hôtes
- le virus doit pouvoir entrer dans la cellule hôte
- la cellule doit posséder la machinerie cellulaire appropriée pour lui permettre de se répliquer
- le virus doit pouvoir être libérer de la cellule pour transmettre l’infection
quels sont les plus petits et plus gros virus + taille
est-ce que les plus gros virus sont visibles en microscopie optique
plus petits : parvovirus (18 nm)
plus gros : poxvirus (300nm)
presque
vrai ou faux : les plus gros virions ont un aussi gros génome et encodent pour le même nombre de protéines que les petits virions
faux, les plus gros virions ont un plus gros génome et encodent pour plus de protéines, ils sont généralement plus complexes
de quoi est fait le génome et dans quoi est-il contenu
- acides nucléiques
- couche protectrice de protéines : capside
qu’est-ce que le nucléocapside et quelles sont les 3 formes qu’elle peut prendre
- génome d’acide nucléique et la capside
- icosahédrique
- hélicoïdale
- complexe
vrai ou faux : certains virions ont une nucléocapside
faux, tous les virions
quelles sont les composantes obligatoires d’un virion et qu’elle est la différence entre un virus nu et enveloppé
- ADN ou ARN
- protéines structurales
- enzymes et acides nucléiques
- nucléocapside
la couche la plus externe du virus nu est la nucléocapside alors que celle du virus enveloppée est sa membrane et glycoprotéines
caractéristique d’un génome d’ADN chez un virion :
- brin(s)
- forme
- simple ou double brin
- linéaire ou circulaire
caractéristiques d’un génome d’ARN chez un virion :
- brin
- segmentation
- simple brin : polarité positive comme l’ARNm ou négative
- double brin (reovirus) : polarité +/- ou double sens
- segmenté ou non
quels sont les 3 rôles de la capside ou de l’enveloppe
- structure
- protection
- véhicule de transmission
qu’est-ce qui permet l’interaction entre le virus et la cellule hôte
les structures présentes à la surface de la capside ou de l’enveloppe 9ex. protéines d’attachement virale PAV)
qu’arrive-t-il si on détruit la couche la plus externe d’un virus et pourquoi
on inactive le virus car il n’aura plus les structures nécessaires pour interagir avec les cellules hôtes
les anticorps que l’on développe pour prévenir l’infection devraient agir contre les composantes des…
structures de surface
vrai ou faux : la capside est une structure rigide qui peut résister à des conditions environnementales difficiles
vrai
à quoi les virus nus sont-ils résistants (3)
- sécheresse
- acidité (inclue l’acide et la bile du tractus digestif)
- détergents
qu’est-ce qui détermine le mode de transmission des virus nus
à quoi ils sont résistants (ex. acides)
quelles formes peut prendre la capside (3)
symétrique : icosaédrique ou hélicoïdale
asymétrique : complexe
quelles sont les 3 étapes pour former la capside icosahédrique
- sous-unités virales s’unissent en protomères
- 5 protomères s’unissent en capsomères (pentamères ou pentons)
- les capsomères s’assemblent en capside
de combien de capsomères la capside icosahédrique simple est-elle formée et chacun d’entre eux interagissent avec combien d’autres capsomères
- 12
- 5
comment est formée la capside hélicoïdale
les sous-unités protéiques interagissent entre elles et avec l’acide nucléique pour former une structure qui ressemble à un bâtonnet
de quoi est composée l’enveloppe (3)
- lipides
- protéines
- glycoprotéines (spikes)
quelles sont 2 des fonctions des glycoprotéines des enveloppes
- protéines d’attachement virales (PAV) capables de se lier à des cellules cibles
- antigènes majeurs pouvant éliciter une immunité protectrice
vrai ou faux : les virus enveloppés sont eux aussi résistants à la sécheresse, l’acidité, les détergents et les solvants
faux, c’est le contraire en comparaison aux virus nus
est-ce que les virus enveloppés peuvent survivre dans le tractus digestif
la plupart non puisqu’ils ne sont pas résistants à l’acidité
quelle est la seule façon de maintenir la structure de l’enveloppe
solution aqueuse (doit rester mouillée)
par quoi les virus enveloppés sont-ils généralement transportés
les fluides :
- sang
- gouttelettes respiratoires
- tissus
quelles sont les 2 façons de classifier les virus
- la nature de leur génome
- leur structure (morphologie)
quels sont les 3 critères de classification des virus selon leur génome
- simple brin ou double brin (pour les ARN : polarité +/-)
- segmenté ou non segmenté
- linéaire ou circulaire
quels sont les 4 critères pour la classification des virus selon la structure du virion
- symétrie de la nucléocapside (icosahédrique, hélicoïdale, complexe)
- enveloppé ou non
- nombre de capsomères
- autres
donne la hiérarchie taxonomique : -virales
ordre
donne la hiérarchie taxonomique : -viridae
famille
donne la hiérarchie taxonomique : -virinae
sous-famille
donne la hiérarchie taxonomique : -virus
genre
donne la hiérarchie taxonomique : aucun
espèce
quel type de virus est inévitablement enveloppé
virus à ARN simple brin
quelles sont les 8 étapes de la réplication virale
- reconnaissance de la cellule cible
- attachement
- entrée de la cellule à travers la membrane plasmatique
- décapsidation
- synthèse des constituants viraux (multiplication virale)
- assemblage du virus
- bourgeonnement des virus enveloppés
- relâchement du virus hors de la cellule hôte
quelles sont les 4 étapes de la multiplication virale
- transcription du génome en ARNm pour traduction en protéines non-structurables (produits précoce)
- réplication du génome
- transcription du génome en ARNm pour traduction en protéines structurales (produits tardifs)
- modification post-traduction de la protéine
qu’est-ce qui définit le tropisme tissulaire
- les cellules susceptibles ciblées par les PAV ou autres structures à la surface des virus
quel est le tropisme tissulaire du virus de l’hépatite C
hépatotrophe
quel est le tropisme tissulaire du virus EBV
lymphotrope
quel est le tropisme tissulaire des virus de l’influenza, adénovirus, rhinovirus et virus respiratoire syncytial
pneumotrope
quel est le tropisme tissulaire des virus de la variole, rougeole, rubéole, varicelle et zona
dermotrope
quel est le tropisme tissulaire des virus de l’hépatite, la fièvre jaune, gastro-entérite, VIH et mononucléose
viscérotrope
quel est le tropisme tissulaire des virus de la rage, encéphalite et polyomyélite
neurotrope
exemple de PAV et de récepteur de la cellule hôte pour le VIH
- gp120
- CD4 et co-récepteur chemokine sur les lymphocytes T-helpers
exemple de PAV et de récepteur de la cellule hôte pour l’influenza A
- HA gp
- acide sialique des cellules épithéliales
comment les virus non enveloppés entrent-ils dans la cellule
principalement par endocytose médié par un récepteur
comment les virus enveloppés entrent-ils dans la cellule (2)
- fusion des membranes du virus et de la cellule cible (précédée ou non d’endocytose)
- le nucléocapside ou le génome viral est ensuite relâché dans le cytoplasme
quel est le seul type de virus dont le génome d’ADN n’est pas transporté au noyau
poxvirus
quels sont les 2 seuls types de virus dont le génome d’ARN ne reste pas dans le cytoplasme
orthomyxovirus
retrovirus
qu’est-ce que la plupart des virus à ADN utilisent pour synthétiser l’ARNm dans le noyau + exception
- les polymérases de la cellule hôte
- poxvirus
où se répliquent les virus à ARN + exception
dans le cytoplasme
orthomyxovirus
rétrovirus
pourquoi y-a-t-il beaucoup d’erreurs qui sont faites par les ARN polymérases (virales)
parce que les virus à ARN doivent eux-mêmes encoder les enzymes nécessaires à la transcription et à la réplication puisque la cellule hôte n’a pas ce qu’il faut pour répliquer de l’ARN
où sont assemblés les virus à ADN (sauf poxvirus)
noyau
où sont assemblés les virus à ARN et poxvirus
cytoplasme
vrai ou faux : les capsides virales sont toutes assemblées autour du génome
faux, elles peuvent aussi s’assemblées et ensuite être remplies de génome
à quelle étape de réplication virale l’enveloppe est-elle acquise
bourgeonnement du virus
d’où la plupart des virus à ARN bourgeonnent-ils
de la membrane plasmatique (sans tuer la cellule)
quelles sont 2 autres sources d’enveloppes chez les virus
- réticulum endoplasmique
- appareil de Golgi
quelles sont les 3 façons de relâcher les virus de la cellule
- lyse cellulaire
- exocytose
- bourgeonnement à travers la membrane plasmatique
de quelle façon les virus nus sont-ils souvent relâchés
par lyse cellulaire
de quelle façon les virus enveloppés sont-ils souvent relâchés
par bourgeonnement par la membrane plasmatique sans tuer la cellule
quels sont les virus qui seront relâchés par exocytose ou lyse cellulaire
ceux qui bourgeonnent dans le cytoplasme
quels sont les 8 mécanismes de transmission virale
- aérosols
- ingestion de nourriture et eau contaminées (fécale-orale)
- fomites
- contact direct avec les sécrétions (salives, plaies, gouttelettes)
- contact sexuel
- sang contaminé ou transplantation d’organe
- zoonoses (animaux, insectes)
- de la mère à l’enfant : transmission verticale
quel est le principal déterminant structural du mode de transmission virale
la présence ou non d’une enveloppe
par quelle voie les virus non enveloppés sont-ils souvent transmis et quelle est la source fréquente
voie fécale-orale
objets contaminés
par quels mécanismes les virus enveloppés sont-ils souvent transmis (5)
- gouttelettes respiratoires
- mucus
- salive et sperme
- sang
- organe transplanté
quel est l’impact des animaux sur les virus lorsqu’ils sont des réservoirs
ils maintiennent et amplifient le virus dans l’environnement
comment appelons-nous l’infection virale lorsque ce sont les arthropodes qui en sont le vecteur
arbovirose
quelles sont 4 façons de détecter des virus/dx des infections virales
- culture virale sur des cellules dérivées de tissus humains en couche monocellulaire
- détection d’anticorps spécifiques chez l’hôte infecté
- détection du matériel génétique viral (PCR)
- observation en microscopie électronique
que pouvons-nous observer en faisant la culture virale sur des cellules dérivées de tissus humains en couche monocellulaire
l’apparition d’effets cytopathogènes caractéristiques
quelle est la méthode de choix pour détecter des virus/dx des infections virales
détection du matériel génétique viral (PCR)
quelles sont les 3 méthodes principales pour le contrôle des infections virales
- hygiène
- vaccination (prévention)
- tx antiviral (pour certains infections virales seulement)
quelles sont les cibles thérapeutiques des traitements antiviraux
les étapes du cycle de réplication virale
concernant les tx antiviraux : quelles sont les 2 façons d’inhiber l’attachement du virus à la cellule
- anticorps neutralisant
- antagonistes de récepteurs spécifiques (analogues des récepteurs cellulaires ou de la PAV qui bloquent l’interaction entre le virus et la cellule)
concernant les tx antiviraux : quel est le principe de l’inhibition de l’entrée dans la cellule et de la décapsidation
- si ces processus sont bloqués, le génome du virus ne peut pas être relâché dans la cellule pour se répliquer
concernant les tx antiviraux : comment certains antiviraux agissent-ils pour empêcher la fusion ou le bris de la membrane empêchant la décapsidation des virus qui entrent dans les cellules par des vésicules endocytiques
ils vont neutraliser le pH de ces compartiments
pourquoi l’inhibition de l’ARNm n’est-elle pas une bonne cible de tx antiviral
car il est difficile d’inhiber l’ARNm sans inhiber l’ARNm de la cellule hôte
concernant les tx antiviraux : quels antiviraux sont des inhibiteurs de la réplication du génome + mécanisme
des analogues des nucléosides
ils se lient à la polymérase virale et inhibent la réplication virale le plus souvent par l’arrêt de l’élongation de la chaîne d’ADN ou d’ARN
concernant les tx antiviraux : comment fonctionnent les analogues non nucléosidiques de la polymérase
ils se lient de façon non compétitive à l’enzyme à des sites autres que celui du substrat pour inhiber la polymérase
concernant les tx antiviraux : exemple d’inhibiteur qui inhibe l’assemblage du virus dans le VIH
inhibiteur de la protéase qui est une enzyme essentielle à l’assemblage du virus et à la production de virions infectieux
concernant les tx antiviraux : exemple d’inhibiteur de l’influenza A et B qui empêche le relâchement hors de la cellule
inhibiteur de la neuraminidase
quelles sont les 6 cibles des antiviraux
- inhibition de l’attachement du virus à la cellule
- inhibition de l’entrée dans la cellule
- inhibition de la décapsidation
- inhibition de la réplication du génome
- inhibition de l’assemblage du virus
- inhibition du relâchement hors de la cellule
