4-Enzymes Flashcards
Qu’est-ce qu’un cofacteur?
composante non-protéique nécessaire à l’activité enzymatique.
Apoenzyme: cofacteur non présent
holoenzyme: Cofacteur présent
Qu,est-ce qu’une isoenzyme?
Enzymes qui catalysent la meme réaction, mais n’ont pas la meme structure primaire.
En quoi les enzymes ont une spécificité?
- Type de réaction: par les a.a du site actif (donne un produit précis)
- Substrat: par la structure, la chargem la polarité et l’hydrophobicité du site de liaison.
Que contient le site actif?
Centre catalytique + site de liaison du substrat
C,est quoi l’ajustement induit?
Liaison du substrat au site actif entraine une légère modification structurale pour que l’enzyme épouse la forme.
Décris l’énergie libre d’Activation.
Quantité d’É requise pour convertir 1 mole de substrat de son état initial à son état de transition.
De quoi dépendent les enzymes?
pH
Température
Pression
Salinité
En quoi les enzymes ont une sensitivité?
Due à la présence de charges ioniques sur les a.a qui la compose. Si ces valeurs varient trop, il peut y avoir modification de structure secondaire ou tertiaire = ne peut plus accueillir son substrat = dénaturée.
Changements de T peut ralentir la fonction, mais pas toujours la dénaturer.
Dans quelles conditions est définie l’activité enzymatique.
Mesurée à des conditions définies de
- Température
- pH
- Substrat
- [coenzymes]
- Tampons
Comment en obtenue l’activité enzymatique?
En déterminant la vitesse d’une réaction catalysée par une enzyme.
E+S ES –> E+P
Comment est régulée l’activité enzymatique?
- demande métabolique ou changements dans ¢
- activées ou inactivées par enzymes du pancréas
- modifications covalentes (Phosphorylation)
- Dégradation des enzymes par lysosomes ou protéasomes
- Régulation allostérique
La vitesse de réaction est influencée par quoi?
Augmentation [substrat] Augmentation enzymes Changement de Température Changement de pH. Inhibiteurs
Quelles sont les 6 classes d’enzyme et sur rôle.
Oxydoréductase (transfert e- entre un agent réducteur et oxydant)
Transférase (ex: Hexokinase)
Hydrolase (hydrolyse + H2O)
Lyase (addtion ou repart d’un gr. NH3, H20 ou CO2 en brisant ou formant un lien double.
Isomérase (réarrangement)
Ligase (avec hydrolyse ATP)
Quelle enzyme métabolise l,éthanol et le méthanol et décris leur affinité.
Alcool DH
Affinité ++ pour éthanol.
Donc intoxication au méthanol, on donne de l’alcool! = inhibition compétitive
Décris le métabolisme du méthanol.
1-Déshydrogénation par Alcool DH
2- Oxydation par aldéhyde DH
Ordre 0
Décris Ki.
Constante de dissociation de l’inhibiteur
Ki bas = inhibition enzymatique +++
Décris Km.
Décris l’Affinité
représente la [substrat] à laquelle la vélocité = 50% de la Vmax.
Dans l’équation d’Eadie-Hofstee, à quoi correspondent Km et Vmax?
Km = pente Vmac = o.o
Décris inhibiteur compétitif.
liaison à Enzyme Augmente Km (diminue affinité) Vmax inchangé
Décris inhibiteur non-compétitif.
Liaison E + S
Km inchangé
Vmax diminue.
Quelle est la différence entre effet homo et hétérotropique?
Homo: Substrat agit en tant que molécule allostérique
Hétéro: Effecteur allostérique différent du substrat
Qu’est-ce que l’effet coopératif négatif?
par un inhibiteur allostérique qui stabilise la forme inactive de l’enzyme.
Stabilise la forme T
Décris les conformations des transitions allostériques.
Conformation T: inactif (faible affinité au substrat)
Conformaiton R: Actif
Décris le model concerté et séquentiel.
Concerté: Transition T–> R se font dans toutes les s-u de l’enzyme simultanément
Séquentiel: Changement de forme indépendemment des autres.
DOnne un exemple d’enzyme allostérique.
Pyruvate DH
inhibée par augmentation du produit: Acétyl-CoA
Décris le métabolisme de l’éthanol.
Absorbé dans l’estomac
90% métabolisé par 1er passage
reste excrété par air + urine
Saturation rapide (ordre 0), donc [étahnol] dans le foie augmente, la quantité d’éthanol métabolisée diminue (va dans la circulation systémique)
NAD+ limite l’oxydation de l’éthanol
Quels sont les métabolites de l’éthanol?
Ethanol + NAD+ –> Acétaldéhyde (par alcool DH)
Acétaldéhyde + NAD+ + H2O –> Acide acétique (par aldéhyde DH)
Oxydation par le foie.
Acétaldéhyde: composé réactif et toxique
Acide acétique: bien métabolisé par l’organisme, donc peu toxique. ne cause pas de trou anionique. Entre dans le cycle de krebs donc ne crée pas d’acidose.
Éthanol : se rend au cerveau = confusion.
Quels sont les métabolites du méthanol?
Methanol + NAD+ –> Formaldéhyde (Alcool DH)
Formaldéhyde + NAD+ + H2O–> Acide formique ( Aldéhyde DH)
Acide formique –> Formate + H+
Ajout de bicarbonate produit formate + Eau + CO2
H+ = diminue pH
Bicarbonayte s’épuise = Acidose + trou anionique
Produits toxiques: Formaldéhyde + Formate = causent l’acidité
Formaldéhyde: Réactif (inactive le cycle de krebs), dans la rétine peut rendre aveugle.
Acide formique: acidose sévère.
Quels sont les tx d’une surdose de méthanol?
Éthanol (retarde le métabolisme du méthanol)
Fomepizole: Compétition pour le site de l’alcool DH, moins d’E2 que l’éthanol.
Hémodialyse: retire méthanol + métabolites toxiques
Décris le métabolisme de l’éthylène glycol.
Lave-vitre, prestone
ADH, ALDH
dans le foie
Cinétique ordre 1
Quels sont les métabolites de l’éthylène glycol?
EG + NAD+ –> Glycoaldéhyde (ADH)
Oxyadation: Glycoaldéhyde –> glycolate (ALDH)
Glycolate –> Glyoxylate
GLyoxylate –> Oxalate (ADN)
Glycolate: dommage aux ¢ des tubules
Glyoxylate: ‘’ + acidose métabolique
Oxalate: Cristaux d’oxalate = bloquent tubules + acidose
Glyoxylate + Oxalate = lésions rénales
Quels sont les tx pour unr surdose d’éthylène glycol?
Éthanol
Fomepizole
les 2 par compétition
CAUSE DE SUICIDE FRÉQUENTE
Oxalate lie le Ca2+ = hypocalcémie = pu de contraction musculaire et de transmission d’influx.
Décris le métabolisme de l’isopropanol.
Oxydé en Acétone , qui ne CRÉE PAS DE TROU ANIONIQUE, car ne crée pas d’acidose. Mais a un TROU OSMOTIQUE.
Qu’est-ce qui permet le maintien de l’équilibre acido-basique?
Poumons (expiration du CO2, contrôle le H+)
Érythrocytes
Reins (contrôle bicarbonate du plasma + excrétion H+)
Quel est le tampon de l’organisme? Décris la réaction.
pH ACIDE
Bicarbonate (se lie aux ions H+) régule pH sanguin
Bicarbonate + H+ –> acide carbonique (H2CO3) –> eau + CO2
CO2 = augmente expiration. (car >pCO2)
PH BASIQUE
OH + acide carbonique –> Eau + HCO3-
si manque de H2CO3, on pousse la réaction vers la droite
CO2 + H2O –> H2CO3
Si manque de HCO3-, réabsorption par les reins.
Quelle enzyme permet la formation de bicarbonate, et où se trouve-t-elle?
Anhydrase carboxylique dans les reins et les érythrocytes
CO2+ H2O H2CO3 HCO3- + H+
HÉMOGLOBINE SERT DE TAMPON AUX H+ FORMÉS
Pourquoi l’acidose est associée à une hyperkaliémie?
Car le [H+] extra¢ pousse les ions H+ à entrer dans les ¢, et donc à sortir le K+ des ¢.
l’inverse est aussi vrai.
Quel est le rôle des tampons Phosphate?
Peu important en extra ¢, moins efficace que bicarbonate
TRÈS IMPORTANT en intra¢ + tubules rénaux.
Quel est le rôle des tampons des protéines intra¢?
Est en intra¢ et Réduit les changements de pH extra¢ car diffusion des éléments du tampon HCO3-.
Qu’est-ce que l’effet Haldane?
pO2 élevée facilite la dissociation du CO2 de l’hémoglobine.
Décris la régulation acido-basique par les reins.
Sang trop basique = excrétion HCO3-
Sang trop acide = excrétion H+ + Réabsorption HCO3-
Sécrétion H+ pour former HCO3- –> H2CO3 qui sera réabsorbé.
Contient anhydrase carboxylique
3 modes de régulation de [H+]:
1: Réabsorption HCO3- filtré (tubule proximal) (combiné avec H+ pour faire H2CO3)
2: Sécrétion de H+ (lumière du tubule) si yen a trop, effet tampon des ions phosphate = excrétés dans urine.
3: Production de nouveaux HCO3- (tubule distal) gain net de HCO3-, perte de H+
Décris les classes de désordres de l’équilibre a-b.
ACIDOSE RESPIRATOIRE: + pCO2 (obstruction des poumons, diminution irrigation, accompagne Hypoxie)
compensation par production HCO3- par les reins & + HCO3- plasmatique
ALCALOSE RESPIRATOIRE: -pCO2 (trop expiré)
diminue production HCO3- reins
diminue HCO3- plasma
ACIDOSE MÉTABOLIQUE: - HCO3- plasma diminue pCO2 (hyperventilation)
ALCALOSE MÉTABOLIQUE: + HCO3- plasma augmente pCO2 (hypoventilation)
ACIDOSE DIABÉTIQUE: Cétoacides s’accumulent dans le plasma
Décris l’acidose causée par lactate ou formate.
[H+] augmente
réagit avec HCO3- pour former H2CO3 dissocie en CO2+H2O
pCO2 augmente , HCO3- diminue = acidose
Décris la forme prédominante selon l’équation d’handerson-hasselbach.
[base conjuguée]/[acide] < 1 FORME NON-IONISÉE
[A-]/[HA] > FORME IONISÉE
Quels ions sont pris en considération dans le trou anionique? Quelle est l’équation? Quelle est la valeur normale?
Na+
Cl-
HCO3-
[NA+] - ([Cl-] + [HCO3-])
Valeur normale: 7+/- 4 MEq/L
Limite supérieure normale : 15 mEq/L
Élevé: > 20 mEq/L
Dans quelles conditions le trou anionique augmente?
Si [anions] non-mesurée (albumine, phosphate, sulfate) augmente
OU
si [cations] non-mesurée (Ca2+, Mg2+, K+) diminue.
Trou anionique: dans le cas d’une acidose métabolique, HCO3- se lie aux H+ pour former du H2CO3 puis du CO2 + eau. Si HCO3- diminue, le Cl- doit augmenté pour compenser la diminution de HCO3-. Si Cl- n’augmente pas, un autre ion qui n’est pas dans l’équation le fera. C,est ce qui causera le trou anionique.
SI CL- Augmente, on appelle ça une acidose métabolique hyperchlorémique
Cl- PRINCIPAL RESPONSABLE DE LA VARIATION car haute concentration.
Si en acidose métabolique on forme du HCl, y a t-il un trou anionique?
Si en acidose métabolique on forme du HNO3-, y a-t-il un trou?
non car Cl- augmente.
Oui, car NO3 pas dans formule, alors Cl- diminue.
Que permet le trou anionique?
Dx d’une acidose métabolique.
ex; acidose lactique, acidocétose, déficience rénale, intoxication par salicylate, méthanol, éthylène glycol.
La diminution du trou anionique peut être causée par?
diminution des protéines plasmatiques.
Hyponatrémie
une acidose avec trou anionique normal peut être causé par ?
Diarrhée.
Quels solutés sont comptabilisés dans le trou osmotique? Quelle est la formule? sa valeur normale?
Na+
Glucose
Urée
Trou = osmolarité mesurée - Osmolarité calculée
O. mesurée = Connue par abaissement du point de congélation (plus grande si trou osmotique car tient compte des autres substances)
O. calculée (mmol/L) = 2xNa + Glucose + Urée
Si autre soluté est présent, L’osmolarité calculée sera plus basse que la normale par rapport à l’o. mesurée. Hausse du trou osmotique.
Valeur normale: < 10 mosm/Kg
Que fait l’alcool sur le trou osmotique et le trou anionique?
Alcool augmente point de congélation (augmente O. mesurée = augmente trou osmotique)
- surtout méthanol et éthylène glycol
- trou osmotique diminue au fur et à mesure que l’alcool est métabolisé.
Alcool = métabolites acides = diminue HCO3- = Augmente trou anionique.
Décris la déficience en G6PDH .
G6P DH =
protège les GR contre stress oxydatifs
Regénère NADPH (avec gluthatione = antioxydant)
si G6P DH diminue = Hémolyse = protection contre la malaria.
Transmission: Lié à l’X récessif.
160 mutations différentes.
Clinique: Jaunisse néonatale+Anémie hémolytique (gourganes = vicine + covinine = détruisent GR)
Décris le Favisme.
Sorte d’anémie chez personnes ayant déficience en G6P DH.
Asymptomatique, sauf quand le corps est exposé à une provocation oxydative (Rx, gourganes, infection)
Décris l’intolérance au lactose.
Enzyme lactose peut présente
Mutation gène LCT
Transmission: Autosomique récessive
Peut se développer par atteintes de la muqueuse intestinale.
Décris la phénylcétonurie.
Empêche métabolisme de phénylalanine. = toxique pour le cerveau en développement de l’enfant.
Phénylcétones retrouvés dans les urines.
Hyperphénylalaninémie à la naissance.
Transmission: Autosomique récessive.
Gène PAH anormal, chromosome 12 (moins d’enzyme)
Enzyme PAH+ cofacteur BH4 = synthèse de tyrolien
3 formes de maladie:
- typique; > 20 mg/dl
- Atypique: 10-20 mg/dl
- hyperphénylalaninémie modérée permanente (HMP): < 10 mg/dl
Définit le mot hémo-globine.
Globine: protéine
Hème: protéine qui participe à la protection des dommages radicaux en transportant l’O2. Ion ferreux au centre
Décris structure Hb.
protéine tétramérique
2 chaines a + 2 chaines B (adulte)
2 a + 2 g (foetus)
a : gène sur chromosome 16 (2 gènes identiques (a1 et a2))
B: gène sur chromosome 11
Décris les conformations de Hb.
HHb = tendue (T) (faible affinité pour O2)
Hb+O2 = Relaxe (haute affinité pour O2)
Hb + CO2 = plus facile quand pas de O2
Quelles molécules ont une influence sur l’affinité de l’O2, et pourquoi?
Hb = protéine allostérique (avec un site allostérique!)
- H+ (effet Bohr) = hétérotrope
- O2 = homotrope
- CO2 = hétéro
- 2-3 BPG = hétéro
Décris l’effet Bohr.
Effet du pH
CO2 enter dans les GR = H2Co3 = HCO3- + H+
H+ fixe Hb = diminue affinité. (protonation)
