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BIO2855_Écologie adaptative > 3 COURS_Phénotype et héritabilité > Flashcards

3 COURS_Phénotype et héritabilité Flashcards

1
Q

donner les 2 niveaux de la sélection

A
  • population

- évolutions

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2
Q

comment fonctionne la sélection au sein d’une population ?

A

mortalité différentielle en fonction du phénotype peu importe son niveau d’héritabilité : joue sur n’importe quel trait phénotypique

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3
Q

qu’implique l’évolution par sélection ?

A

la sélection se maintient / répète d’une génération à l’autre (caractères sélectionnés ont un effet sur la génération suivante

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4
Q

comment expliquer que certains traits sont héritables ?

A

une partie de la variation phénotypique est est due à la variation génotypique donc potentiellement transmissible

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5
Q

définir le phénotype

A

ensemble des caractères qui proviennent du génotype d’un organisme qui peuvent s’exprimer à n’importe quel niveau

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6
Q

définir le phénotype entendu

A

réalisations faites par un organisme avec son environnement (pas les caractéristiques de l’organisme lui-même)
ex : barrages de castor, nids, toile d’araignée…

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7
Q

qui est la cible de la sélection ? définir

A

variation phénotypique : différences dans un phénotype donné

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8
Q

donner la différence de la provenance du phénotype et de la variation phénotypique

A

phénotype : provient toujours de caractères génétiques

variation phénotypique : provient de mutations, épigénétique et environnement (pas que de la génétique)

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9
Q

donner les effets de la génétique sur le phénotype (3)

A
  • mutation dans les nucléotides
  • peut altérer la fonction d’une protéine
  • peut modifier le niveau d’expression des gènes
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10
Q

définir un effet génétique pur

A

variation phénotypique uniquement due à une mutation

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11
Q

donner les effets de l’épigénétique sur le phénotype (3)

A
  • contrôle l’expression des gènes
  • modifie toute molécule avec une séquence (ADN, ARN, protéine)
  • rend l’ADN moins (méthylation) ou plus accessible (acétylation)
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12
Q

donner les 2 façons dont l’épigénétique peut survenir

A
  • par hasard : épimutation, changement non prévisible (ce qui crée la variation phénotypique)
  • par interaction avec l’environnement : plasticité épigénétique, conséquences prévisibles de l’environnement sur l’épigénétique (rôle normal)
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13
Q

définir l’effet épigénétique pur

A

variation déterminée par épimutation (changement imprévu par rapport au développement normal)

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14
Q

donner les effets de l’environnement sur le phénotype

A

variation phénotypique causée par une limitation (moins de ressource, énergie, temps…) : modifie la réalisation prévue du phénotype

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15
Q

définir l’effet environnement pur

A

plasticité passive : le fait d’avoir des contraintes dans l’environnement crée un phénotype différent

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16
Q

quelle relation observe-t-on entre le changement du phénotype et la variable environnementale ?

A

changement du phénotype proportionnel à l’intensité de la variable environnementale

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17
Q

s’il y a absence de plasticité qu’observe-t-on ?

A

phénotype ID peu importe l’environnement

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18
Q

décrire la plasticité phénotypique active (3)

A
  • adaptation
  • variabilité génétique derrière la plasticité
  • effet de l’environnement sur l’épigénétique : un génotype donne des phénotypes différents en fonction de l’environnement
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19
Q

comment sait-on qu’un changement phénotypique observé est dû à la plasticité active ?

A

observe un changement phénotypique abrupte au delà d’une valeur critique de l’environnement

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20
Q

que permet la plasticité active ?

A

permet d’anticiper un changement dans l’environnement : le génotype répond à des signes précurseurs de l’environnement

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21
Q

que permettent les normes de réaction ?

A

permet de déterminer si on observe de la plasticité active ou passive

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22
Q

que fait-on pour observer les normes de réaction ?

A

prend des individus génétiquement ID et les placer dans des environnements différents pour voir la réponse du génotype

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23
Q

quels sont les conclusions qu’on peut déduire face aux résultats ? (3)

A
  • tolérance / absence de plasticité : même phénotype peu importe l’environnement
  • changements graduels : plasticité passive, changements peu importants et continus
  • changements soudains / importants : plasticité active
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24
Q

décrire la génétique mendélienne / qualitative (3)

A
  • caractères qui ont pour base génétique 1 gène
  • reflet direct de la variation génétique (seul facteur confondant : dominance)
  • héritabilité proche de 1
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25
Q

décrire la génétique quantitative (3)

A
  • caractère qui implique plusieurs gènes
  • variation phénotypique n’est pas le reflet de la variation génétique
  • héritabilité entre 0 et 1
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26
Q

décrire les caractères qualitatifs (2)

A
  • nombre limité de phénotypes : correspondent au génotype des individus
  • caractères peuvent être mis en catégories discrètes
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27
Q

décrire les caractères quantitatifs (2)

A
  • caractères dont les variations présentent une graduation plus ou moins continue
  • états peuvent être mesurés en caractères continus ou distincts
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28
Q

décrire un trait quantitatif continu

A

pas de catégories définies : déterminé par un nombre réel, nombre de phénotypes infini entre les 2 extrêmes

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29
Q

décrire un trait quantitatif discret

A

caractère déterminé par un nombre entier : nombre de phénotypes peut être grand mais pas infini

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30
Q

pour un phénotype, de quoi peut dépendre la variabilité génétique ? (2)

A
  • nombre d’allèles pour un gène (qualitatif)

- nombre de gènes pour un phénotype (quantitatif)

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31
Q

donner la formule pour définir combien de génotypes sont possibles pour k allèles

A

k(k+1)/2

32
Q

qu’observe-t-on quand on prend un nombre de gène pour un phénotype ?

A

observe une distribution continue des phénotypes (caractères quantitatifs)

33
Q

donner l’héritabilité en fonction de la source de variation phénotypique (3)

A

variation phénotypique due à :

  • l’environnement : non héritable
  • la génétique : héritable
  • l’épigénétique : rarement héritable
34
Q

comment voir si un trait est héritable ?

A

regarder la variation phénotypique sur plusieurs générations

35
Q

donner la formule permettant d’expliquer la variation phénotypique pour les traits qualitatifs

A

P = A + D
A : effets additifs
D : dominance
s’il n’y a pas d’effet de dominance le trait est héritable

36
Q

donner la formule permettant d’expliquer la variation phénotypique pour les traits qualitatifs

A

P = (A + D + I) + E + EPI + interactions + stochasticité
I : épistasie
E : environnement
EPI : épigénétique
intéractions : GxE ; GxEPI ; ExEPI
==> énorme effet confondant (seul A est héritable)

37
Q

définir les effets génétiques additifs et donner la formule pour déterminer le nombre de phénotypes

A

plus un génotype possède d’allèles plus l’effet des allèles est accumulé pour former le génotype (facile pour un système à 1 allèle)
(2 x (nombre de gènes)) + 1

38
Q

décrire les effets génétiques non-additifs

A

dû à l’épistasie : différents gènes contribuent pour un phénotype

39
Q

à quoi contribue l’épistasie ?

A

à générer la variation génétique mais qui est non transmissible

40
Q

en quoi l’effet de la dominance est-il confondant ?

A

donne le même phénotype à l’hétérozygote plutôt que de voir un phénotype intermédiaire : perd la relation d’additivité

41
Q

en quoi la dominance n’est-elle pas transmissible ?

A

composition dépend de l’interaction des allèles entre eux : interaction pas transmissible (peut y avoir des dominances hiérarchiques)

42
Q

qu’est-ce que la pléiotropie ?

A

un gène qui affecte plusieurs traits (phénomène prévisible)

43
Q

quel est le problème de la pléiotropie ?

A

une mutation sur le gène peut être avantageux pour un trait mais pas un autre

44
Q

qu’est-ce que l’épistasie ?

A

plusieurs gènes impliqués dans un trait (phénomène non prévisible)

45
Q

quel est le problème de l’épistasie ?

A

l’interaction entre gènes peut masquer d’autres gènes ou modifier le phénotype auquel on s’attend

46
Q

comment estimer/quantifier les effets de l’environnement sur le phénotype ?

A

contrôler la génétique et l’environnement pour voir s’ils interagissent en regardant la relation entre jumeaux MZ et DZ

47
Q

qu’observe-t-on lorsqu’un trait a une relation génétique importante ?

A

relations proches entre les MZ mais pas les DZ

48
Q

pour 2 génotypes différents, que se passe-t-il au niveau des phénotypes lorsqu’ils sont 100% sous l’effet génétique ?

A

phénotypes ne changent pas selon l’environnement

49
Q

pour 2 génotypes différents, que se passe-t-il au niveau des phénotypes lorsqu’ils sont sous l’effet génétique et environnemental ?

A

phénotypes réagissent de la même façon au changement d’environnement (changement // des droites)

50
Q

pour 2 génotypes différents, que se passe-t-il au niveau des phénotypes lorsqu’ils sont 100% sous l’effet environnemental ?

A

possèdent le même phénotype qui change de la même manière avec l’environnement

51
Q

pour 2 génotypes différents, que se passe-t-il au niveau des phénotypes lorsqu’ils sont sous l’effet d’interactions entre la génétique et l’environnement ?

A

les phénotypes sont différents dans un environnement et ne réagissent pas de la même manière au changement d’environnement

52
Q

pour déterminer l’héritabilité d’un trait qualitatif on ne peut pas travailler sur la moyenne phénotypique (trop de facteurs confondants), que fait-on alors ?

A

travaille sur la variance : regarde la variation dans la population et les sources de la variation phénotypique
(VP = VA + VD + VI + VE + VEPI)

53
Q

définir la variance

A

intervalle pour un caractère et distribution phénotypique à partir de laquelle on détermine la variance

54
Q

sur quelles variances travaille-t-on ? (2)

A
  • variance génétique

- variance additive

55
Q

qu’est-ce que la variance additive ?

A

travaille dans le temps : XP de sélection car l’additivité est le seul effet génétique qui peut être transmis d’une génération à l’autre (phénotype reflète le génotype)

56
Q

qu’est-ce que a variance génétique totale ?

A

voit la part de l’environnement par rapport à la part de la génétique

57
Q

donner la formule de l’héritabilité au sens large et décrire ce que c’est

A

H^2 = VG/VP
estime l’effet total de la génétique sur le phénotype
héritabilité entre 0 et 1 (héritable)

58
Q

comment fait-on pour estimer l’effet génétique total ?

A

utilise des jumeaux MZ et DZ

59
Q

quelles sont les conditions à respecter pour pouvoir utiliser les paires de jumeaux ? (3)

A
  • similarités des MZ doit être le double de celles DZ
  • effets de l’environnement doivent être les mêmes pour tous
  • pas d’interaction entre le génotype et l’environnement : tous les génotypes doivent répondre de la même façon à l’environnement
60
Q

que regarde-t-on lors des observations avec les paires de jumeaux ? décrire

A

coefficient de corrélation r : plus r est proche de 1 plus le nuage de point est condensé et inversement (effet surtout génétique on doit voir : rMZ = 1 et rDZ = 0.5)

61
Q

donner la formule de l’effet génétique total avec MZ, DZ et r

A

H^2 = (rMZ - rDZ) / (1 - DZ)

62
Q

pourquoi ne pas juste utiliser des jumeaux MZ ?

A

DZ permettent de contrôler l’environnement : si rMZ et rDZ sont proches de 1 alors H^2 est faible donc c’est dû à l’environnement

63
Q

définir l’héritabilité au sens étroit

A

ce qui est transmis d’une génération à une autre qui influence la variation phénotypique (calcule que la partie A de la VG)

64
Q

donner la formule de l’héritabilité au sens étroit

A

h^2 = VA/VP

65
Q

comment estimer h ?

A

regarde un phénotype donné des parents par rapport à la progéniture (regarde la transmission des parents aux descendants)

66
Q

comment créer le graphique permettant d’estimer l’héritabilité au sens étroit ?

A

mesure le phénotype de chaque parents qui ont une descendance et fait la moyenne de chaque couple puis regarde le même caractère chez la descendance

67
Q

qu’observe-t-on une fois toutes les mesures faites ? (héritabilité au sens étroit)

A

droite de régression dont la pente (a) correspond au niveau d’héritabilité au sens étroit

68
Q

comment réagit la pente de la droite de régression plus il y a d’effets confondants ?

A

plus elle devient nulle donc pas de génétique additive

69
Q

comment observer l’effet de l’environnement sur des caractères phénotypiques ?

A

XP d’adoption : si le jeune développe les mêmes caractères que les parents adoptifs alors c’est l’effet de l’environnement

70
Q

définir l’effet maternel, en quoi est-ce différent que l’héritabilité ?

A

tous les effets que la mère laisse à sa progéniture qui ne sont pas dûs au génome transmis (influence du phénotype de la mère sur celui de sa progéniture)

71
Q

décrire l’effet maternel 1 génétique et donner un exemple

A

phénotype de la progéniture dépend uniquement du phénotype de la mère
ex : coquille dextre pour un individu Dd car la mère a une coquille dextre et coquille sénestre pour un individu Dd car la mère a une coquille sénestre (pourtant ils ont le même génotype)

72
Q

par quoi est dû l’effet maternel génétique ?

A

les réserves maternelles entreposées dans l’O

73
Q

décrire l’effet maternel 2 écologique

A

influence du phénotype de la mère et/ou de l’environnement dans lequel elle se trouve sur sa progéniture (ex : taille des O de libellule selon la charge parasitaire, niveau d’hormone de stress selon les soins parentaux…)

74
Q

quelle corrélation observe-t-on entre l’héritabilité (h) et l’effet maternel (m) ?

A

corrélation inverse : les traits avec une grande héritabilité sont peu impactés par l’effet maternel et inversement

75
Q

les effets épigénétiques ne sont pas héritables mais ?

A

ils peuvent être transmis

76
Q

comment est-ce que les effets épigénétiques peuvent-ils être transmis ?

A

les ressentis perçus par une mère enceinte peut être transmis à son enfant

77
Q

pourquoi faut-il attendre au moins 3 générations pour déterminer si un trait est héritable ou transmissible ?

A

l’environnement de la mère enceinte influence la mère, son bébé et les gamètes de son bébé (surtout si F) : effets transgénérationnels sur 2 générations

BIO2855_Écologie adaptative (9 decks)

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