2.5 La réparation de l'ADN Flashcards
Par quoi peuvent être causées les mutations?
Des facteurs environnementaux (radiations et agents mutagènes)
Le métabolisme oxydatif qui génère des espèces d’oxygène réactivs
Des réactions spontanées via l’action de l’eau
Erreur de réplication
Vrai ou faux
Les erreurs de réplication constituent une source de mutation
Vrai
Quelles genre de mutation peut être causée par une erreur de réplication?
Mésappariement ou insertion/délétion
Quelles régions sont particulièrement affectées par les mutations d’insertion/délétion?
Pourquoi?
Régions contenant de courtes séquences répétées (microsatellites)
La machinerie de réplication a de la difficulté à répliquer ces segments répétés; elle glisse sur ces régions, ce qui augmente ou diminue le nombre de séquences répétées
Qu’est ce que le phénomène «replication slippage»?
La machinerie de réplication a de la difficulté à répliquer ces segments répétés; elle glisse sur ces régions, ce qui augmente ou diminue le nombre de séquences répétées
Chez l’homme le «replication slippage est responsable de plusieurs ________ qui se caractérisent par l’expansion d’une répétition de _____
Maladies neurodégénératives, trinucléotides
Qu’est ce qui peut provoquer la formation d’un dimère de pyrimidines?
Quelle est la conséquences de la création de ce dimère?
Les rayons UV
Le dimère déforme la double hélice qui ne peut plus servir de matrice pour la réplication et la transcription
Vrai ou faux
La formation d’un dimère de pyrimidine affecte seulement la réplication
Faux, transcription aussi
Quels sont les 2 types de produit générer par les rayons UV?
Dimère de pyrimidine ( Liaisons C6-C6 et C5-C5)
Liaison C6-C4 ,«photoproduct»
Que causent les radiations ionisantes?
Des cassures double-brins dans l’ADN
Comment les radiations ionisantes affectent-elles l’ADN?
Provoque des cassures en s’attaquant au désoxyribose ou en générant des espèces d’oxygène réactives qui réagissent avec les désoxyriboses
Qu’arrive-t-il si les extrémités associées aux cassures double-brin ne sont pas réliés correctement?
Des réarrangement chromosomiques et des translocations
Pourquoi est-il possible d’utiliser les radiations ionisantes pour traiter le cancer?
Est-ce que d’autres procédés utilisant le même principe existe?
Parce que les cellules ont besoin de chromosomes intacts
pour répliquer leur ADN, on utilise les radiations ionisantes
pour tuer rapidement les cellules cancéreuses
Oui, agents chimiothérapeutiques comme la bléomycine
Quel nucléotide peut être oxydée suite à l’attaque par des espèces d’oxygène réactives?
Guanine
Quelle est la conséquence de la formation d’une guanine oxydée
(oxoG)?
Cette base peut s’apparier avec A et C
Tranversion G-C -> T-A
Quelle mutation en rapport avec oxoG est l’une des plus communes chez les cancers humains?
Tranversion G-C -> T-A
Quelle effet l’alkylation d’une base a sur l’hélice d’ADN et la réplication de celle-ci?
Provoque une distortion de l’hélice, inhibe la réplication
Quelles réactions d’hydrolyse spontanées peut endommager l’ADN?
a) La désamination de la cytosine génère l’uracile b) La dépurination via l’hydrolyse du lien Nglycosidique produit un site abasique (i.e. un désoxyribose sans base) c) La désamination de la 5-méthylcytosine génère une base naturelle, la thymine
Quel effet a la dépurination sur la réplication?
Comment une dépurination peut être corrigée?
Bloque la réplication
Par insertion
Vrai ou faux
La plupart des cellules ne possèdent que 3 types différents de système de réparation
Faux, au moins 4
Quel est le fonctionnement des systèmes de réparation par excision de nucléotides?
Excisent un segment d’ADN contenant les ou les bases altérées et synthétisent un nouveau segment
Quels sont le 4 systèmes de réparation les plus courants?
-système de réparation directe
- Système de réparation par excision
- NER
- BER
- Système de réparation de bases mésappariées
- Système de réparation par recombinaison (cassure bicaténaires)
Vrai ou faux
Les eucaryotes et E.coli utilisent des ADN polymérases distinctes pour répliquer les sites d’ADN endommagé
Vrai
Vrai ou faux
La machinerie de réplication normale est utilisée pour répliquer l’ADN endomagé
Faux
Par quel mécanisme sont réparés les cassures double-brin chez les eucaryotes et certains procaryotes?
NHEJ
Vrai ou faux
le génome humain ne possède par de gènes de réparation
Faux, possède de nombreux gènes de réparation
Donner la cause du dommage et les principaux enzymes de réparation pour le système de réparation des mésappariements.
Erreur de réplication
MutS, MutL et MutH -> E. coli
MSH, MLH, PMS -> humains
Donner la cause du dommage et les principaux enzymes de réparation pour le système de réparation par photoreactivation
Dimères de pyrimidine
ADN photolyase
Donner la cause du dommage et les principaux enzymes de réparation pour le système de réparation par excision de base
Base endommagé
ADN glycosylase
Donner la cause du dommage et les principaux enzymes de réparation pour le système de réparation par excision de nucléotides
Dimère de pyrimidine
«bulky adduct on base»
UvrA, UvrB, UvrC, UvrD -> E. coli
XPC, XPA, XPD, ERCCI-XPF, XPG -> humains
Donner la cause du dommage et les principaux enzymes de réparation pour le système de réparation de cassure double-brin
Cassure double brin
RecA, RecBCD -> E. coli
Donner la cause du dommage et les principaux enzymes de réparation pour le système de réparation translésion de la synthèse d’ADN
Dimère de pyrimidine ou un site apurinique
ADN pol de famille Y comme UmuC chez E. coli
Sur quoi agissent les systèmes de réparation directe?
Nucléotides endommagés par l’irridiation UV ou les agents alkylants
Combien d’enzyme(s) utilisent les systèmes de réparation directe?
1
Combien de types de systèmes de réparation directe existent-ils?
3
Vrai ou faux
La réparation de l’ADN dépendante de la lumière est présente chez l’homme
Faux
Vrai ou faux
a) La réparation de l’ADN dépendante de la lumière est présente chex des organismes unicellulaire et pluricellulaire
b) On appelle aussi ce système photoactivation
c) La lumière est comprise entre 500-700nm
d) Elle permet d’éliminé les dimères de pyrimidines
e) elle est absente chez les mammifères à placenta
a) vrai
b) Faux, photoréactivation
c) Faux, 300-500
d) vrai
e) vrai
à quelle étape de la photoréactivation l’énergie lumineuse est-elle utile?
Est-elle nécessaire pour la reconnaissance du dimère?
Le clivage
Non
L’homme a-t-il une protéine similaire à la photolyase?
À quoi sert-elle?
oui, régule le rythme circardien
Quel est le rôle des alkyltransférases?
Elles désalkylent les nucléotides alkylés
Quels sont les sites d’attaques les plus fréquents des agents alkylants sur l’ADN?
les groupements phosphate N7 de la guanine et N3 de l’adénine
Vrai ou faux
Les conséquences de l’alkylation sont les mêmes peu importe le site touché
Faux
Pour quoi est utilisé le EMS?
créer des mutants
Que cause le dérivé O6-éthylguanine causé par un agent alkylant?
Une transition G-C -> A-T
Par quoi sont réparées les lésions de l’ADN sous forme de O6-alkylguanine?
Par une O6-méthylguanine-ADN méthyltransférase
Comment fonctionne la protéine O6-méthylguanine-ADN méthyltransférase?
• Cette protéine transfère directement le groupement alkyle
sur l’un de ses résidus Cys, causant ainsi son inactivation
irréversible
Pourquoi la protéine réparant les lésions de l’ADN sous forme O6-alkyguanine n’est pas considérée comme une enzyme?
Parce qu’elle ne peut pas être regénérée
Quelle type de protéine est la protéine Ada de E. coli?
O6-méthylguanine-ADN méthyltransférase
Vrai ou faux
Les systèmes de réparation directe représentent une composante majeure des mécanismes de réparation de la cellule
Faux, mineure
Combien de gènes dans le génome humain spécifient une protéine participant à la réparation directe?
1
Quel(s) est/sont la/les protéine(s) participant à la réparation directe chez l’homme?
MGMT
Que permet le système NER?
éliminer les dimères de pyrimidines et les lésions dues à l’addition d’un groupement volumineux sur une base
Quel système le NER remplace-t-il chez certains organismes
Photoréactivation
Quel sont les deux sentiers NER?
sentier agissant sur le génome global (GGR)
Sentier agissant sur les gènes transcrits (TCR)
Quel protéines la voie NER fait intervenir chez E. coli?
UvrA, B, C, D
Le système NER coupe l’ADN à quelles positions chez E. coli?
de chaque coté de la lésion aux positions -8 et +4 ou 5
Combien de pb contient l’oligonucléotide couper par le système NER chez E. coli
12 ou 13
Par quoi est comblée la brèche obtenue après la coupure par le système NER chez E. coli?
Pol I et l’ADN ligase
À quoi est due la maladie XP?
à une NER génétiquement défectueuse
De quoi dépendent les symptômes liés à la maladie XP?
Du gène muté ainsi que du type de mutation
Pourquoi la maladie XP peut apporter des problèmes neurologiques?
À cause d’une accumulation de lésions
Vrai ou faux
Maldie XP
a) les gens touchés sont moins sensible aux rayons du soleil
b) 2000x plus de chance d’avoir un cancer de la peau
a) faux plus
b) vrai
Quels sont les principaux symptômes de XP?
hypersensibilité aux rayons
solaires. L’incidence des cancers de la peau est 2000 fois
supérieure à la normale
Les fibroblastes des personnes atteintes de XP mis en
culture sont défectifs en _____ des
dimères de pyrimidines
Les fibroblastes des personnes atteintes de XP mis en
culture sont défectifs en système de réparation NER des
dimères de pyrimidines
Combien de produits de gènes différents sont impliqués dans la voie de réparation des rayons UV?
Comment ce résultat a-t-il été trouvé?
au moins 7
Les expériences de fusions cellulaires entre cellules
provenant de différents patients XP ont montré qu’il y a 7
groupes de complémentation
Quels sont les 7 produits de gènes différents dans la voie de réparation des lésions UV?
Lesquels sont des sous-unités de TFIIH?
XPA à XPG (XPV)
XPB et XPD
Vrai ou faux
Le système NER des eucaryotes est le même que celui des bactéries
Faux
Vrai ou faux
le mécanisme NER des eucaryote ressemble beaucoup à celui des bactéries
Vrai
Vrai ou faux
La machinerie du système NER des procaryote est plus complexe que celle des eucaryotes
Faux, contraire
Quel type d’évolution le système NER bactériens et eucaryotique démontre-t-il?
Évolution convergente
Quel est l’équivalent des protéines XPB et XPD chez les bactérie?
Quel activité possède ces protéines?
UvrB, Hélicase
Le segment d’ADN libéré comprend combien de pb chez les eucaryotes dans le mécanisme NER?
24-32