2.5 La réparation de l'ADN Flashcards
Par quoi peuvent être causées les mutations?
Des facteurs environnementaux (radiations et agents mutagènes)
Le métabolisme oxydatif qui génère des espèces d’oxygène réactivs
Des réactions spontanées via l’action de l’eau
Erreur de réplication
Vrai ou faux
Les erreurs de réplication constituent une source de mutation
Vrai
Quelles genre de mutation peut être causée par une erreur de réplication?
Mésappariement ou insertion/délétion
Quelles régions sont particulièrement affectées par les mutations d’insertion/délétion?
Pourquoi?
Régions contenant de courtes séquences répétées (microsatellites)
La machinerie de réplication a de la difficulté à répliquer ces segments répétés; elle glisse sur ces régions, ce qui augmente ou diminue le nombre de séquences répétées
Qu’est ce que le phénomène «replication slippage»?
La machinerie de réplication a de la difficulté à répliquer ces segments répétés; elle glisse sur ces régions, ce qui augmente ou diminue le nombre de séquences répétées
Chez l’homme le «replication slippage est responsable de plusieurs ________ qui se caractérisent par l’expansion d’une répétition de _____
Maladies neurodégénératives, trinucléotides
Qu’est ce qui peut provoquer la formation d’un dimère de pyrimidines?
Quelle est la conséquences de la création de ce dimère?
Les rayons UV
Le dimère déforme la double hélice qui ne peut plus servir de matrice pour la réplication et la transcription
Vrai ou faux
La formation d’un dimère de pyrimidine affecte seulement la réplication
Faux, transcription aussi
Quels sont les 2 types de produit générer par les rayons UV?
Dimère de pyrimidine ( Liaisons C6-C6 et C5-C5)
Liaison C6-C4 ,«photoproduct»
Que causent les radiations ionisantes?
Des cassures double-brins dans l’ADN
Comment les radiations ionisantes affectent-elles l’ADN?
Provoque des cassures en s’attaquant au désoxyribose ou en générant des espèces d’oxygène réactives qui réagissent avec les désoxyriboses
Qu’arrive-t-il si les extrémités associées aux cassures double-brin ne sont pas réliés correctement?
Des réarrangement chromosomiques et des translocations
Pourquoi est-il possible d’utiliser les radiations ionisantes pour traiter le cancer?
Est-ce que d’autres procédés utilisant le même principe existe?
Parce que les cellules ont besoin de chromosomes intacts
pour répliquer leur ADN, on utilise les radiations ionisantes
pour tuer rapidement les cellules cancéreuses
Oui, agents chimiothérapeutiques comme la bléomycine
Quel nucléotide peut être oxydée suite à l’attaque par des espèces d’oxygène réactives?
Guanine
Quelle est la conséquence de la formation d’une guanine oxydée
(oxoG)?
Cette base peut s’apparier avec A et C
Tranversion G-C -> T-A
Quelle mutation en rapport avec oxoG est l’une des plus communes chez les cancers humains?
Tranversion G-C -> T-A
Quelle effet l’alkylation d’une base a sur l’hélice d’ADN et la réplication de celle-ci?
Provoque une distortion de l’hélice, inhibe la réplication
Quelles réactions d’hydrolyse spontanées peut endommager l’ADN?
a) La désamination de la cytosine génère l’uracile b) La dépurination via l’hydrolyse du lien Nglycosidique produit un site abasique (i.e. un désoxyribose sans base) c) La désamination de la 5-méthylcytosine génère une base naturelle, la thymine
Quel effet a la dépurination sur la réplication?
Comment une dépurination peut être corrigée?
Bloque la réplication
Par insertion
Vrai ou faux
La plupart des cellules ne possèdent que 3 types différents de système de réparation
Faux, au moins 4
Quel est le fonctionnement des systèmes de réparation par excision de nucléotides?
Excisent un segment d’ADN contenant les ou les bases altérées et synthétisent un nouveau segment
Quels sont le 4 systèmes de réparation les plus courants?
-système de réparation directe
- Système de réparation par excision
- NER
- BER
- Système de réparation de bases mésappariées
- Système de réparation par recombinaison (cassure bicaténaires)
Vrai ou faux
Les eucaryotes et E.coli utilisent des ADN polymérases distinctes pour répliquer les sites d’ADN endommagé
Vrai
Vrai ou faux
La machinerie de réplication normale est utilisée pour répliquer l’ADN endomagé
Faux
Par quel mécanisme sont réparés les cassures double-brin chez les eucaryotes et certains procaryotes?
NHEJ
Vrai ou faux
le génome humain ne possède par de gènes de réparation
Faux, possède de nombreux gènes de réparation
Donner la cause du dommage et les principaux enzymes de réparation pour le système de réparation des mésappariements.
Erreur de réplication
MutS, MutL et MutH -> E. coli
MSH, MLH, PMS -> humains
Donner la cause du dommage et les principaux enzymes de réparation pour le système de réparation par photoreactivation
Dimères de pyrimidine
ADN photolyase
Donner la cause du dommage et les principaux enzymes de réparation pour le système de réparation par excision de base
Base endommagé
ADN glycosylase
Donner la cause du dommage et les principaux enzymes de réparation pour le système de réparation par excision de nucléotides
Dimère de pyrimidine
«bulky adduct on base»
UvrA, UvrB, UvrC, UvrD -> E. coli
XPC, XPA, XPD, ERCCI-XPF, XPG -> humains
Donner la cause du dommage et les principaux enzymes de réparation pour le système de réparation de cassure double-brin
Cassure double brin
RecA, RecBCD -> E. coli
Donner la cause du dommage et les principaux enzymes de réparation pour le système de réparation translésion de la synthèse d’ADN
Dimère de pyrimidine ou un site apurinique
ADN pol de famille Y comme UmuC chez E. coli
Sur quoi agissent les systèmes de réparation directe?
Nucléotides endommagés par l’irridiation UV ou les agents alkylants
Combien d’enzyme(s) utilisent les systèmes de réparation directe?
1
Combien de types de systèmes de réparation directe existent-ils?
3
Vrai ou faux
La réparation de l’ADN dépendante de la lumière est présente chez l’homme
Faux
Vrai ou faux
a) La réparation de l’ADN dépendante de la lumière est présente chex des organismes unicellulaire et pluricellulaire
b) On appelle aussi ce système photoactivation
c) La lumière est comprise entre 500-700nm
d) Elle permet d’éliminé les dimères de pyrimidines
e) elle est absente chez les mammifères à placenta
a) vrai
b) Faux, photoréactivation
c) Faux, 300-500
d) vrai
e) vrai
à quelle étape de la photoréactivation l’énergie lumineuse est-elle utile?
Est-elle nécessaire pour la reconnaissance du dimère?
Le clivage
Non
L’homme a-t-il une protéine similaire à la photolyase?
À quoi sert-elle?
oui, régule le rythme circardien
Quel est le rôle des alkyltransférases?
Elles désalkylent les nucléotides alkylés
Quels sont les sites d’attaques les plus fréquents des agents alkylants sur l’ADN?
les groupements phosphate N7 de la guanine et N3 de l’adénine
Vrai ou faux
Les conséquences de l’alkylation sont les mêmes peu importe le site touché
Faux
Pour quoi est utilisé le EMS?
créer des mutants
Que cause le dérivé O6-éthylguanine causé par un agent alkylant?
Une transition G-C -> A-T
Par quoi sont réparées les lésions de l’ADN sous forme de O6-alkylguanine?
Par une O6-méthylguanine-ADN méthyltransférase
Comment fonctionne la protéine O6-méthylguanine-ADN méthyltransférase?
• Cette protéine transfère directement le groupement alkyle
sur l’un de ses résidus Cys, causant ainsi son inactivation
irréversible
Pourquoi la protéine réparant les lésions de l’ADN sous forme O6-alkyguanine n’est pas considérée comme une enzyme?
Parce qu’elle ne peut pas être regénérée
Quelle type de protéine est la protéine Ada de E. coli?
O6-méthylguanine-ADN méthyltransférase
Vrai ou faux
Les systèmes de réparation directe représentent une composante majeure des mécanismes de réparation de la cellule
Faux, mineure
Combien de gènes dans le génome humain spécifient une protéine participant à la réparation directe?
1
Quel(s) est/sont la/les protéine(s) participant à la réparation directe chez l’homme?
MGMT
Que permet le système NER?
éliminer les dimères de pyrimidines et les lésions dues à l’addition d’un groupement volumineux sur une base
Quel système le NER remplace-t-il chez certains organismes
Photoréactivation
Quel sont les deux sentiers NER?
sentier agissant sur le génome global (GGR)
Sentier agissant sur les gènes transcrits (TCR)
Quel protéines la voie NER fait intervenir chez E. coli?
UvrA, B, C, D
Le système NER coupe l’ADN à quelles positions chez E. coli?
de chaque coté de la lésion aux positions -8 et +4 ou 5
Combien de pb contient l’oligonucléotide couper par le système NER chez E. coli
12 ou 13
Par quoi est comblée la brèche obtenue après la coupure par le système NER chez E. coli?
Pol I et l’ADN ligase
À quoi est due la maladie XP?
à une NER génétiquement défectueuse
De quoi dépendent les symptômes liés à la maladie XP?
Du gène muté ainsi que du type de mutation
Pourquoi la maladie XP peut apporter des problèmes neurologiques?
À cause d’une accumulation de lésions
Vrai ou faux
Maldie XP
a) les gens touchés sont moins sensible aux rayons du soleil
b) 2000x plus de chance d’avoir un cancer de la peau
a) faux plus
b) vrai
Quels sont les principaux symptômes de XP?
hypersensibilité aux rayons
solaires. L’incidence des cancers de la peau est 2000 fois
supérieure à la normale
Les fibroblastes des personnes atteintes de XP mis en
culture sont défectifs en _____ des
dimères de pyrimidines
Les fibroblastes des personnes atteintes de XP mis en
culture sont défectifs en système de réparation NER des
dimères de pyrimidines
Combien de produits de gènes différents sont impliqués dans la voie de réparation des rayons UV?
Comment ce résultat a-t-il été trouvé?
au moins 7
Les expériences de fusions cellulaires entre cellules
provenant de différents patients XP ont montré qu’il y a 7
groupes de complémentation
Quels sont les 7 produits de gènes différents dans la voie de réparation des lésions UV?
Lesquels sont des sous-unités de TFIIH?
XPA à XPG (XPV)
XPB et XPD
Vrai ou faux
Le système NER des eucaryotes est le même que celui des bactéries
Faux
Vrai ou faux
le mécanisme NER des eucaryote ressemble beaucoup à celui des bactéries
Vrai
Vrai ou faux
La machinerie du système NER des procaryote est plus complexe que celle des eucaryotes
Faux, contraire
Quel type d’évolution le système NER bactériens et eucaryotique démontre-t-il?
Évolution convergente
Quel est l’équivalent des protéines XPB et XPD chez les bactérie?
Quel activité possède ces protéines?
UvrB, Hélicase
Le segment d’ADN libéré comprend combien de pb chez les eucaryotes dans le mécanisme NER?
24-32
Vrai ou faux
Une endonucléase est responsable d’introduire les coupures simple-brin dans le mécanisme NER des eucaryotes
Faux, deux endonucléases distinctes
Quelle étude à montrer que le système de réparation NER est couplé à la ______?
transcription
L’étude du syndrome de cockayne (SC)
Que sont les symptômes de SC?
croissance retardée, dysfonctionnements
neurologiques dus à la démyélisation des neurones, et
hypersensibilité aux UV; mais incidence normale des cancers de la
peau
Quelle est la mutation des personnes atteintes du syndrome de cockayne?
Défctives en un type de réparation NER qui est couplé à la transcription
Vrai ou faux
Chez les personnes normales, les dimères de pyrimidine sont plus efficacement excisés des gènes transcrits que des séquences non-exprimés
Vrai
Que font les protéines CSA et CSB?
participent à la reconnaissance des lésions dans les gènes
transcrits. Elles reconnaissent une ARN polymérase qui s’est arrêtée
de transcrire un gène dû à la présence de nucléotides endommagés
sur le brin d’ADN matrice
Quels gènes sont associés à SC
gènes codant pour CSA et CSB
Qu’arrive-t-il lorsqu’une ARN polymérase rencontre une lésion dans l’ADN?
LA transcription s’arrête
Quelle protéine liant l’ADN chez E. coli reconnait l’ARN polymérase en détresse?
Mdf
Quelles protéines analogue à Mdf chez les eucaryotes reconnaissent l’ARN pol en détresse?
À quelle famille des enzymes de remodelage du nucléosome appartiennent-ils?
Rad26 (levure)
CSB (homme)
SWI/SNF
Quel est le rôle des protéines reconnaissant l’ARN pol en détresse?
Aident à recruter les protéines de réparation du système NER au site de la liaison et à dissocier l’ARN pol de la lésion
Vrai ou faux
L’ADN endommagé est plus rapidement réparé dans les régions activement transcrites
Vrai
Que fait le système de réparation BER?
enlève les bases anormales ou chimiquemement modifiées et répare les sites abasiques
Vrai ou faux
Le système BER enlève aussi des bases normale
Explique
Vrai
Ce système peut aussi enlever une base normale dans
certaines paires de bases mésappriées (T•G ou A•oxoG) afin
de prévenir l’apparition de mutations (système de sécurité ou
système « fail-safe »)
Quel composé est responsable d’enlever les bases altérées?
Les ADN glycosylase
Comment les ADN glycosylases agissent-elles?
Elles clivent le lien glycosidique entre la base altérée et son sucre, créant ainsi un site apurinique ou apyrimidique (AP)
Comment peut être formé un site AP?
Par l’action de l’ADN glycosylase ou dans les conditions physiologiques normales par l’hydrolyse spontanée d’une liaison glycosidique
Vrai ou faux
Il existe 2 différentes ADN glycosylases
Faux, Au moins 11 chez l’homme
Lequel ou lesquels de ces énoncés sur les ADN glycosylase sont/est vrai :
a) les cellules possède plusieurs ADN glycosylase qui reconnaissent les mêmes bases endommagées
b) Une ADN glycosylase peut reconnaitre plus d’une base
c) Chaque glycosylase peut initier la voie BER
d) Chaque base endommagée est spécifique à une ADN glycosylase
b, c
Quelles sont les étapes du système BER?
- Désamination de la cytosine
- Liaison de l’uracile ADN glycosylase
Étape 3. La glycosylase excise la base altérée
Étape 4. Le résidu désoxyribose au site AP est
coupé du côté 5’ par une endonucléase AP
et une ADN phosphodiestérase enlève le
désoxyribose phosphate au site AP
Étape 5. L’ADN polymérase (Pol I chez E. coli et
Pol b chez les mammifères) remplace le
nucléotide manquant sur le brin
complémentaire
Étape 6. L’ADN ligase soude la cassure simple-brin
Comment les ADN glycosylase agissent-elles sur les bases?
Elles font pivoter la base altérée vers l’extérieur de la double hélice pour la placer dans leur site actif
Comme quel autre composante de système de réparation agit l’ADN glycosylase?
ADN photolyase
quelles sont les 2 fonctions de l’endonucléase III; une enzyme monomérique de ___aa?
211,
- ADN glycosylase reconnaissant les pyrimidines oxydées
Endonucléase AP
Quelles est la fonction de l’uracile N-glycosylase?
Excise le U présents dans l’ADN sous forme de paires U-G
Élimine les U qui se retrouve dans l’ADN nouvellement synthétisé
Qu’arriverait-il si l’uracile faisait parti de l’ADN?
Pourquoi?
la désamination de C serait fortement mutagène
Car la paire de base mésappariées G-U n’indiquerait pas si la paire de bases originelle était G-C ou A-U
Comment la cellule reconnait-elle les bases incorrectes?
Le système glycosylase assume qu’un T dans la paire T-G provient de la désamination de la 5-méthyl-cytosine et enlève sélectivement le T qui est alors remplacé par un C
Vrai ou faux
La réparation des mésappariement augmente de 10 à 20 fois la fidélité
Faux, 100 à 1000x
Pourquoi, à l’exception de G-T, les paires de bases mésappariées ne peuvent pas être éliminées par les systèmes NER et BER?
Parce que les bases qu’elles contiennent sont normales
Que fait le système de réparation des mésappariement?
détecter l’absence d’appariement entre la chaîne
parentale et la chaîne-fille ; ensuite il excise une
partie de la chaîne-fille et comble le trou résultant
Qu’est ce qui permet de distinguer la chaine parentale de la chaine fille chez E” coli?
le profil de méthylation
Comment le système de réparation des mésappariements reconsit-il la chaîne-fille?
Durant un certain temps après la réplication
(l’intervalle durant lequel la chaîne parentale est
méthylée et la chaîne nouvellement synthétisée
ne l’est pas), le système de réparation recherche
les bases mésappariées et fait les corrections
nécessaires dans la chaîne-fille qui est
non-méthylée
• Les corrections sont faites en utilisant la chaîne
parentale comme matrice d’ADN
vrai ou faux
La réparation des mésappariement peut se dérouler à gauche ou à droite dela séquence GATC
Vrai
Quels enzymes/protéines de E. coli participent à la réparation des mésappariements?
MutH, MutL et MutS
La séquence GATC se retrouve à toutes les ____ en moyenne sur le génome de E. coli
250 pb
Quel rôle MutS joue dans la réparation des mésappariements?
Reconnaît la base mésappariée et recrute MutL
Qu’est ce que MutH?
À quoi se lie-t-elle spécifiquement?
Endonucléase latente se liant spécifiquement aux séquences GATC hémiméthylées
Comment est activée la fonction endonucléase de MutH
Quand le complexe formé de MutL et MutS s’associe avec une protéine MutH voisine
Ou MutH coupe-t-il la chaine-fille?
Dans la séquence GATC
MutH coupe en 5’ ou en 3’
peut être un ou l’autre
Vrai ou faux le site d’incision doit être à moins de 250 nt de la séquence GATC
Faux, Peut être à 1000nt ou plus
remplir sur la correction de mésappariement
Un segment de la chaine-fille situé… est excisé et remplacé…
entre la coupure et le mésappariement
Quelle composante est utilisée pour enlever l’ADN simple-brin compris entre la coupure et le mésappariement?
Une exonucléase
Dans quelle situation une exonucléase 3’->5’ est utilisée pour enlever l’ADN simple-brin dans le système de réparation des mésappariements?
Quand MutS est à gauche (5’) du brin couper
3’——————–5’
5’——–MutS—- —3’
Qu’arrive-t-il au phénotype des mutants MutS, MutH, MutL et dam de E. coli
Le taux de mutations spontanées est plus élevé
Vrai ou faux
Le système de réparation des mésappariements chez E. coli est similaire à celui des eucaryotes
Vrai
Des gènes homologues à quelles protéines du système de réparation des mésappariements chez E. coli n’ont pas été trouvés chez les eucaryotes?
mutH et système de méthylation
Comment les eucaryotes différencient le brin nouvellement synthétisé du brin parental?
Grâce aux fragments d’Okasaki du brin retardé ou l’extrémité 3’ du brin non retardé
Quels sont les homologues de MutS et MutL chez les eucaryotes?
MSH (MutS)
MLH et PMS (MutL)
Que peut entraîner des défauts dans les gènes codant pour les protéines MSH et MLH chez les eucaryotes?
Un plus fort taux de mutations spontanées, augmentant ainsi la prédisposition à plusieurs types de cancer
Quel est l’avantage pour les eucaryotes d’avoir plusieurs homologues de MutS et MutLL?
Former des hétérodimère leur permettant d’intervenir de manière spécifique
Quel système de réparation est utilisé pour les cassures bicaténaires?
Par quoi sont causés ces cassures?
Réparation par recombinaison homologue
Des agents exogènes ou par des fourches de réplication bloquées par une lésion d’ADN
Dans quelle circonstance le système de réparation par recombinaison homologue peut être utilisé?
lorsqu’une copie homologue à la région de l’ADN endommagé peut être récupérée sur un chromosome nouvellement synthétisé ou en cours de synthèse (S ou G2)
Vrai ou faux les cassures et les lésions sont éliminés par recombinaison homoologue
Faux, seuelement les cassures
Énumérer les principales différences entre la recombinaison homologue et la voie de réparation des cassures bicaténaire par recombinaison homologue
Recombinaison homologue :
- Seuelement pendant la méiose
- Échange réciproque
- Segments échangés très long
- Diversité génétique plus élevé
Vrai ou faux
Les lésions de l’ADN peuvent conduire à la formation de cassures bicaténaires lors de la réplication
Vrai
Quelle protéine est utilisé dans la voie de réparation par recombinaison homologue chez E. coli?
Quelle est l’analogue chez les eucaryotes?
RecA
Rad51
Que fait Rec A chez E. coli?
Capable de provoquer l’échange de brins frères de même polarité entres segments d’ADN homologues
Lequel de la voie de réparation des cassures et de la recombinaison homologue est apparue en premier au cours de l’évolution?
Reombinaison homologue
Vrai ou faux
Les mutants d’E. coli sont seulement déficients pour la réparation par recombinaison homologue
Faux, Homologue et génétique
Quel est le rôle du complexe MRN?
Quel est son site de liaison?
Senseur
Se lie avec l’ADN de chaque coté de la cassure
Que contient le complexe MRN?
Quel rôle joue chaque composante?
e. Il contient MRE11, lequel se lie et peut cliver l’ADN, et RAD50,
qui est une protéine qui peut également se lier aux extrémités d’ADN
cassé, de même que NBS1 (chez les mammifères) et Xrs2 (chez la
levure)
Quel rôle joue la kinase ATM?
Par quoi est-elle recrutée?
Déclenche une cascade de phosphorylation et d’autres modifications de protéines qui conduisent à la synthèse et au recrutement de gros complexes de protéines de réparation au site de cassure
MRN
Quelle est l’une des prmière protéine de réparation recrutée?
BRCA1
Quelle protéine de réparation interagit avec RAD51 et probablement recrute celle-ci?
BRCA2
Que fait RAD51?
S’associe aux extrémités d’ADN sb pour former des filaments de nucléoprotéines
Des mutations dans quels gènes sont associés à plusieurs maladies héréditaires et cancers?
dans des gènes essentiels pour la réparation par recombinaison
Avec une mutation dans quels gènes est associée la susceptibilité héréditaire au cancer du sein chez les femmes?
BRCA-1 et BRCA-2
Dans quelle condition la voie de réparation NHEJ intervient-elle?
Lorsqu’un chromosome non répliqué subit une cassure, car il n’y a pas de de chromosome frère pouvant servir de matrice pour la voie de réparation par recombinaison hoomologue
La voie NHEJ est particulièrement importante pour quel type de cellule eucaryote?
Cellule en phase G1 ou cellules qui ne se divisent pas
Vrai ou faux
La voie NHEJ est mutagène parce que ce ne sont pas les bonnes extrémités d’ADN reliés ensemble
Faux, mutagène car plusieurs nt souvent perdus
Vrai ou faux
La voie NHEJ est ubiquitaire chez les eucaryotes
Vrai
Vrai ou faux
C’est la voie NHEJ qui a permis d’inventer le processus de l’immunité adaptative chez les mammifères
Vrai
Vrai ou faux
Cette voie n’est pas beaucoup utilisé chez les bactéries
Faux, utilisé chez la plupart des bactéries
comment fonctionne la voie NHEJ chez les eucaryotes?
• L’hétérodimère Ku, formé de Ku70 et Ku80, se lie à chaque
extrémité de l’ADN cassé et recrute DNA-PKcs, une protéine
kinase qui à son tour forme un complexe avec Artemis
• Artemis est à la fois une exonucléase 5’®3’ et une
endonucléase latente activée par sa phosphorylation par
DNA-PKcs. Ces activités permettent de digérer les
extrémités cassées et de les préparer pour la ligature
• Un complexe, composé de l’ADN ligase IV, XRCC4 et
Cernunnos-XLF ligature les extrémités cassées
Dans quelles circonstances la réponse SOS est induite chez E. coli?
Lorsque le génome de la bactérie souffre de lésions trop nombreuses pour que les sytèmes de réparation constitutufs puissent les corriger
Vrai ou faux
Lors de la réponse SOS plusieurs région de l’ADN sont alors sous forme sb dû au bloquage des fourches de réplication
Vrai
Suite à quels facteurs survient la réponse SOS chez E. coli?
Exposition aux rayons UV ou à des produits chimiques mutagènes ou à l’inhibition de la réplication de l’ADN
Combien de temps prend la réponse SOS pour être activé chez E. coli?
environ 50 minutes
Quel avantage procure la réponse SOS à la cellule?
• La réponse SOS fournit les polymérases translésionnelles
(Pol IV et PolV) qui permettront à la cellule de répliquer son
ADN même si les brins matrice contiennent des sites AP,
des dimères de pyrimidines ou des bases portant un
groupement volumineux qui normalement bloqueraient ou
du moins retarderaient le complexe de réplication
• Suite à la réponse SOS, E. coli cesse de se diviser et les
protéines codées par près 45 gènes font leur apparition ou
sont synthétisées en plus grande quantité. La plupart sont
des protéines de réparation des lésions d’ADN.
Quel est l’avantage d’utilisé Pol IV et Pol V lors de la réponse SOS?
Leurs sites actifs sont plus ouverts et plus flexibles que ceux des réplicases
Quels sont les protéines majeures de réparation synthétisées lors de la réponse SOS?
RecA, UvrA/B, UmuC/D et Pol IV
Quels protéine forment Pol V?
UmuC et 2x UmuD’
Quelle particularité a Pol V?
Capable de répliquer l’ADN en face d’un dimère de pyrimidines ou d’une base avec un groupement volumineux
Quel est le rôle de RecA? en quoi consiste ce rôle?
Rôle de senseur
Première protéine qui se lie aux régions simple-brin, déclenchant la réponse SOS
Clive UmuD pour former UmuD’
Quelle est la conséquence de la réplication d’un brin d’ADN endommagé par Pol V?
des bases incorrectes sont insérées dans l’ADN
1000x plus d’erreurs que les réplicases
Complète
Lorsque Pol III rencontre une
lésion sur la matrice au cours de
la réplication…
Lorsque Pol III rencontre une lésion sur la matrice au cours de la réplication, elle se dissocie de l’ADN et est remplacée par une ADN polymérase translésionnelle.
Comment est-il possible pour Pol IV et V d’ajouter seulement quelques nt avant d’être remplacer ppar Pol III?
Ils ont une faible processivité
Comment pourrait être recruter la polymérase translésionnelle?
Anneau B pourrait jouer un rôle
Que permet la voie SOS?
Permet à la cellule d’éviter la mort
Quel est le prix à payer de la réponse SOS?
Taux de mutation accru
Vrai ou faux
Les mutations induites par la réponse SOS sont par la suite corriger
Faux
Les bactéries ne possédant pas la réponse SOS on une augmentation ou une diminution de mutations induites par les rayons UV?
Que cela suggère-t-il?
diminution
Mutations produites en traitant les bactéries aux UV ou produits chimiques sont causées par le système de réparation SOS
Quelle est la principale cible de la co-protéase RecA?
LexA
Quel est le rôle de la protéine LexA?
un répresseur de 43 gènes impliqués dans la réparation et le contrôle de la division cellulaire
Comment est activée la synthèse des protéines SOS?
L’activité co-protéase de RecA stimule l’autoprotéolyse de LexA, ce qui provoque la synthèse des protéines SOS
Combien d’ADN Pol trnaslésionnelles sont synthétisées chez l’homme?
5
Quelle polymérase ajoute des nucléotides en face des dimères de pyrimidines?
Quels sont habitellement ces nucléotides?
n (êta)
2 A
Quelles autres polymérases fonctionnent de concert avec êta pour répliquer des matrices contenant des sites AP ou des dimères de pyrimidines?
i (iota) et s (dzêta)
Que requiert la réponse à l’ADN endommagé (DDR) chez les eucaryotes?
un senseur, un régulateur, un médiateur et des effecteurs
Comment fonctionne la réponse à l’ADN endommagé chez les eucaryotes?
• Les régions d’ADN simple brin et les cassures double brin
indiquent la présence d’ADN endommagé
• La réponse DDR est stimulée par la liaison de protéines
“senseur” (RPA ou MRN) à ces sites
• Au lieu d’agir directement sur la régulation transcriptionnelle
des gènes de réparation, les protéines senseurs des
eucaryotes recrutent des protéines kinases régulatrices (ATM
ou ATR) qui coordonnent une réponse plus complexe
• Les kinases régulatrices phosphorylent et activent les
médiateurs, qui lorsque phosphorylés, recrutent des
effecteurs, c’est-à-dire des protéines qui réparent l’ADN
endommagé , contrôlent le cycle cellulaire, ou entraînent
l’apoptose (dans le cas des eucaryotes multicellulaires si les
lésions ne sont pas réparées)
Vrai ou faux
Les senseurs RPA et MRN recrutent deux kinases homologues
Faux, 2 kinases régulatrices distinctes
Vrai ou faux
Les agents mutagènes sont généralement cancérigènes
Vrai
Vrai ou faux
Les tests standardisés sur les animaux sont idéaux
Faux, très couteux, peu sensibles et laborieux
Qu’est ce que le test de Ames?
un test rapide et efficace sur les bactéries, permettant de prévoir l’effet cancérigène
Quels sont les caractères portant par les dsouches de S. thyphimurium lors des tests de Ames?
– différents types de mutations (transitions, transversions et
mutations de cadre de lecture) dans les gènes requis pour la
biosynthèse de l’histidine (mutants his-
)
– une mutation rendant les parois des cellules perméables à de
nombreuses substances
– une mutation inactivant le système de réparation par excision
Comment est évalué l’effet mutagène lors du test de Ames?
Par la fréquence de réversion cers le phénotype his+
Quelle est la méthodologie du test de Ames?
• On étale environ 109 bactéries sur deux boîtes de gélose ne contenant que des traces d’histidine • Un disque de papier contenant le produit à tester est placé sur le milieu d’une des boîtes et les deux boîtes sont incubées durant 2 jrs • La mutagénicité est évaluée en comparant le nombre de colonies sur les deux boîtes
Avec quoi le produit à tester est-il préalablement incuber?
Pourquoi?
Un homogénat de foie
Plusieurs produits doivent être métabolisés dans le foie ou dans d’autres tissus pour devenir cancérigènes
À quoi sert l’homogénat de foie dans le test de Ames?
reproduire certains effets du métabolisme chez les mammifères
