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BCM-2000 > 1.4 régulation de la traduction > Flashcards

1.4 régulation de la traduction Flashcards

1
Q

Le contrôle de la traduction s’exerce à quelle étape de la traduction?

A

Initiation

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Q

Vrai ou faux

La plupart des gènes sont contrôlés au niveau de la transcritpion

A

Vrai

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3
Q

Quels sont les deux mécanismes régulant la traduction chez les bactérie?

A
  1. La fixation de protéines près du site de liaison du ribosome (RBS)
  2. Un ARNm forme des appariement de bases avec lui-même masquant ainsi un ou plusieurs RBS
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4
Q

Quelle étape de l’initiation est empêchée par les mécanismes de régulation de la traduction bactérien?

A

Empèche l’ARNr 16S d’accéder au RBS

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5
Q

Par quoi est souvent régulé le mécanisme ou l’ARNm forme des appariements de bases?

A

Par la traduction d’autres gènes du même opéron

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6
Q

La synthèse de chaque protéine r doit être ______ avec la quantité __________ dans la cellule

A

Coordonnée, D’ARNr libre

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7
Q

La vitesse de synthèse protéique et le nombre de ribosomes requis sont liés à …

A

La vitesse de croissance de la cellule

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8
Q

Vrai ou faux

a) Les protéines r agissent comme répresseur de leur propre synthèse
b) Les génes codant pour les protéines r sont sont regroupés sous forme d’opérons
c) pour chaque opéron, un groupe de protéine r se lie au site de l’ARNm ou fini la traduction du premier gène de l’opéron

A

a) Vrai
b) vrai
c) faux, 1 ou un complexe de 2 et lie ou débute la traduction

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9
Q

Vrai ou faux

Les protéines r ont plus d’affinité avec l’ARNm que pour l’ARNr 16S

A

Faux, contraire

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10
Q

Vrai ou faux, la protéine r régulatrice se fixe à un site de forte affinité sur l’ARNm de manière préférentielle

A

Faux, ARNr

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11
Q

Vrai ou faux

Une protéine r peut fonctionner à la fois comme composante du ribosome et comme régulateur de sa propre synthèse

A

Vrai

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12
Q

Comment la protéine S8 peut-elle reconnaître des séquences à la fois sur l’ARNr et sur l’ARNm?

A

Certains sites de liaisons de l’ARNr et l’ARNm ont des séquences primaires et des structures secondaires très similaires

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13
Q

Qu est ce qui peut expliquer que la liaison d’un excès de S8 sur l’ARNm inhibe l’initiation de la traduction?

A

Le site de liaison sur l’ARNm inclut le codon d’initiation AUG

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14
Q

Vrai ou faux

La traduction est réprimée seulement lorsque la cellule a satisfait ses besoins en protéines pour l’assemblage des ribosomes

A

Vrai

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15
Q

Quels sont les autres exemple d’inhibition de la traduction chez les bactéries?

A

aminoacyl-ARNt synthétases régulent leur expression en se fixant sur leur propre ARNm

Il existe aussi des cas où l’ARNm forme différentes structures
favorisant ou inhibant la traduction en fonction des conditions
de température ou des concentrations de certains
métabolites

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16
Q

Vrai ou faux

Les ribocummulateur empêchent la régulation de l’initiation

A

Faux, Ils la régulent en changeant l’appariement tige-boucle

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17
Q

Qu est ce qui influence la vitesse de traduction des ARNm bactériens?

A

La vitesse d’initiation peut varier selon la séquence de Shine-Dalgarno
La vitesse d’élongation dépend de la fréquence des cocdons préférés et donc de l’abondance des ARNt correspondants

Certains plus efficace = + rapide

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18
Q

Vrai ou faux

Chez les eucaryotes la traduction est uniquement régulé au niveau d’ARNm spécifique

A

Faux, Global ou spécifique

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19
Q

Quels facteurs régulent la traduction au niveau global chez les eucaryotes?

A

Carence en aa, infection virale, température élevée

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20
Q

À quelle(s) étape(s) est régulée la traduction au niveau global chez les eucaryotes?
Quel est le mécanisme d’inhibition?

A

Reconnaissance de l’ARNm

Liaison de l’ARNt initiateur à la sous-unité 40S

Contrôlé par la phosphorylation

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21
Q

Quelle est la logique de la phosphorylation de la sous-unité a de eIF2?

A

Inhibe l’activité d’un facteur d’échage du GTP agissant sur eIF2 (eIF2B), ce qui abaisse le niveau de eIF2 lié au GTP

Niveau réduit de eIF2-GTP = faible initiation de la traduction

Protéines kinases de la sous-unité a de eIF2 sont activés dans différentes conditions

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22
Q

Quelles sont les 4 kinases phosphorylant eIF2 sur le résidu Ser-51? quelles sont leurs principales caractéristiques?

A
  1. HRI (Heme-Regulated Inhibition) est activée dans les réticulocytes
    lorsque l’hème est en quantité insuffisante et dans d’autres types de
    cellules suite à un stress oxydatif ou de hautes températures
  2. PKR est activée par un ARN double-brin > 30 pb. Normalement, de
    tels ARN sont produits durant une infection virale
  3. GCN2 (General Control Non-derepressible 2) est activée par la liaison
    avec des ARNt non chargés (dans les cellules en carence d’acides
    aminés) Tous les vertébrés, un peu partout dans le corps
  4. PEK (Pancreatic eIF2 Kinase) est activée lorsque le réticulum
    endoplasmique contient un excès de protéines non repliées à cause de
    stress divers (e.g., hautes températures et concentrations
    anormalement élevées en sucres). Un diabète insulino-dépendant de
    type I (syndrome de Wolcott-Rallison) est associé à des mutations
    dans le domaine catalytique de la PEK
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23
Q

Quelle protéine est inhibée par le mécanisme empêchant la liaison à la coiffe 5’?

A

eIF4E

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24
Q

Quelle protéine entre en compétition avec eIF4G pour la liaison à eIF4E et agissent comme inhibiteurs généraux?

A

4E-BP

25
Q

Vrai ou faux

La liaison des 4E-BP est la seule qui n’est pas régulée par la phosphorylation

A

Faux, régulée par la phosphorylation

26
Q

Quelle protéine kinase phosphoryle les 4E-BP?

A

mTor

27
Q

Vrai ou faux

Les 4E-BP interfèrent avec la traduction lorsqu’ils sont phosphorylés

A

Faux, Contraire

28
Q

Qu est ce qui active mTor?

A

Facteurs de croissance, hormones et facteurs stimulant les divisions cellulaires

29
Q

Vrai ou faux

Les inhibiteur de mTor sont des agents de chimiothérapie efficaces

A

Vrai

30
Q

La liaison à quel facteur est utilisée pour la régulation de la traduction d’arnm spécifique chez les eucaryotes?

A

eIF4E

31
Q

de quelles protéines dépend l’inhibition de l’ARNm Oskar?

A

Bruno qui se lie dans la région 3’ non traduite et Cup (4E-BP) qui se lie à bruno

32
Q

Vrai ou faux

a) la liaiison à eIF4E est impliquée dans la localisation précise de plsuieurs protéines
b) la traduction restreinte à des zones cellulaires particulières explique la localisation de ses protéines
c) La traduction des ARNm Oskar doit être inhibé avant leur transport du pôle antérieur vers la région postérieure

A

a) vrai
b) vrai
c) faux, durant

33
Q

Quelle est la protéine liant eIF4E inhibe la traduction de plusieirs ARNm durant le développement de l’ovocyte chez les vertébrés?

A

Maskin

34
Q

L’oeuf non fécondé contient de grandes quantités
d’ARNm dont la traduction est réprimée
spécifiquement par la _____, une protéine
possédant un domaine _____

A

Maskin, 4E-BP

35
Q

La protéine _____ se lie spécifiquement à des
séquences dans la région ___ non traduite de
plusieurs ARNm, puis recrute la Maskin, inhibant
ainsi la traduction

A

CPEB, 3’

36
Q

Décrire le rôle de la Maskin dans l’inhibition de la traduction

A

a) Plusieurs ARNm maternels ont de courtes queues de poly(A) et ne peuvent
former le complexe d’initiation de la traduction dû à la liaison de la Maskine à
eIF4E.

b) La stimulation des ovocytes par la progestérone active une kinase qui
phosphoryle CPEB, ce qui augmente l’affinité de cette protéine pour CPSF qui va
alors se fixer sur la séquence AAUAAA. CPSF recrute ensuite PAP qui rallonge la
queue de poly(A). Plusieurs copies de PABP se fixent à cette queue et
interagissent avec eIF4G, laquelle déplace la Maskin de eIF4e et permet ainsi la
formation du complexe d’initiation et donc de la traduction de l’ARNm

37
Q

Vrai ou faux

Il n’existe aucun mécanisme permettant d’éliminer un ARNm ou un produit protéique ayant subit une mutation ponctuelle ne modifiant qu’un aa

A

Vrai

38
Q

Quel processus est utilisé pour détecter et éliminé les ARNm défectueux et leur produit protéique?

A

La traduction

39
Q

Quelle est l’utilité de l’ARN SsrA?

A

S’assurer que les ARNm bloqués (sans codon stop) ne reste pas dans le ribosome

40
Q

à quoi se lie et par quoi est chargé SsrA?

A

Chargé par l’alanine et se lie à EF-Tu-GTP

41
Q

Comment SsrA débloque le ribosome?

A

Lorsqu’un ribosome est bloqué à l’extrémité 3’ d’un ARNm, le
complexe SsrA Ala-EF-Tu•GTP se lie au site A et participe à la
réaction de peptidyl-transférase

42
Q

Qu’arrive-t-il au produit de l’ARNm bloqué après sa libération?

A

Étiquette de 10 aa à l’extrémité C-terminale reconnue par des protéase qui la dégradent

43
Q

Quels sont les mécanismes servant à vérifier l’intégrité des ARNm en cours de traduction?

A
  1. Le processus de dégradation de l’ARNm induite par un codon non-sens (codon stop prématuré)
  2. Le processus de dégradation de l’ARNm induite par l’absence d’un codon stop
44
Q

Vrai ou faux

En l’absence de traduction les ARNm endommagés présentent une stabilité normale

A

Vrai

45
Q

Vrai ou faux

a) Chez les mamifères, la traduction d’un ARNm normal déplace seulement une parties des jonctions des exons
b) La traduction d’un ARNm possédant un codon stop prématuré ne déplace pas les complexes d’une ou plusieurs jonctions d’exons.
c) b entraîne le recrutement des protéines Upf1, Upf2 et Upf3 sur le ribosome
d) Les protéines Upf activent une enzymes liant la coiffe de l’ARNm
e) l’ARNm sans coiffe est rapidement dégradé par les exonucléases 5’-3’

A

a) Faux, tous les complexes des jonctions des exons
b) vrai
c) vrai
d) faux, l’hydrolyse
e) vrai

46
Q

Décrire le mécanisme de dégradation de l’ARNm induite par l’absence de codon stop

A

• En l’absence d’un codon stop, la queue poly(A) de l’ARNm est
traduite, ce qui entraîne l’addition d’une suite de lysines à la
fin de la protéine (la rendant instable) et le blocage du
ribosome

• Un complexe, appelé exosome, incluant Ski7 et une
exonucléase 3’-5’, se lie à tout ribosome bloqué à l’extrémité
3’ de la queue poly(A)
• Ski7, qui est apparentée au facteur de terminaison de classe
II eRF3, stimule la dissociation du ribosome, alors que
l’activité exonucléase de l’exosome dégrade l’ARNm

• La protéine contenant la suite de lysines est dégradée

47
Q

Que contrôle la protéine liant l’ARN et régulée par le fer

A

La traduction de l’ARNm de la ferritine

48
Q

Pourquoi est-il important de réguler correctement les niveaux de fer?

A

Parce que le fer joue un rôle important dans le transport de l’oxygène et la production d’énergie chez l’homme

49
Q

Quel est le principal régulateur des niveaux de fer che l’homme

A

La ferritine (protéine liant le fer)

50
Q

Les niveaux de ferritine doivent donc s’adapter aux niveaux de _______ dans le corps

A

Fer libre

51
Q

Par quoi est régulée la synthèse de la ferritine?

A

Par l’IRP, une protéine liant le fer et l’ARNm de la ferritine

52
Q

Quel est le nom et la structure reconnu pas l’IRP?

Ou se trouve-t-elle?

A

Structure tige-boucle, IRE, Région 5’ non traduite de son propre ARNm

53
Q

Par quoi est contrôlée la traduction de l’activateur transcriptionnel Gcn4 chez la levure?

A

De courts ORF en amont et l’abondance d’un complexe ternaire

54
Q

Gcn4 réguler l’expression de quoi?

A

Des enzymes impliquées dans la synthèse des acides aminés

55
Q

L’ARNm de Gcn4 est traduit ou ou non lorsque les concentrations en acides aminés sont élevés?

A

non

56
Q

Combien d’ORF contient Gcn4? ou sont-ils?

A

4, en 5’ de la séquence codant Gcn4

57
Q

Qu’arrive-t-il lorsque les acides aminés sont abondant chez la levure?

A

le complexe eIF2-GTP-Met-ARNtmet (CT) se lie rapidement à la sous-unité 40S permettant la reconnaissance d’un des trois ORF. Le ribosome se dissocie complètement suite à la traduction de ce deuxième ORF

58
Q

QU’arrive-t-il lors d’une faible quantité en acides aminés chez la levure?

A

Lors d’un manque d’aa, la phosphorylation de eIF2 par la protéine kinase Gcn2
amène une réduction des niveaux de eIF2-GTP et par conséquent, une baisse
de la vitesse de fixation de CT à la sous-unité 40S. Cela augmente la
probabilité que le ribosome dépasse les uORF2-4 durant le scanning,
favorisant ainsi la traduction de la séquence codant Gcn4

59
Q

Avantage de contrôler l’expression génétique (régulation) au niveau de la traduction par rapport à la transcription?

A

Rapidité d’action → ARNm prêt lors de la traduction donc production rapide d’une protéine.

Si régulation au niveau de la transcription, délai car on doit produire ARNm et +

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