1.1 Le code génétique Flashcards by Antoine Desmeules

Quelle est la définition de la traduction?

La biosynthèse des polypeptides dirigée par l’ARNm

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À quoi sert le code génétique?

Établir la correspondance entre les groupes de bases (codons) dans les acides nucléiques et les a.a dans les polypeptides.

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Quelles sont les arrangements possibles des codons s’ils sont composés de trois bases? Quel de ces arrangement est le bon?

Codons contigus ( Le bon)
Codons chevauchants
Codons séparés par une ou plusieurs bases

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Quelles sont les principales caractéristiques du code génétique? Expliquer brievement chaque caractéristique.

Code à triplets : Chaque codon = groupe de 3 bases
Code dégénéré : Plus d’un codon peut spécifier un a.a
Code non-chevauchant et sans virgule : aucune base ne sépare deux codon successifs

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Quelles expériences ont permis de décrypter le code génétique?

Mutagénèse chimique
Les codons sont des triplets
Décryptage du code
Analyse de la structure du code

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Quelles sont les deux types de mutations?

Mutations ponctuelles

- Mutations par insertion/délétion d’une ou plusieurs pb

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Donner les deux types de mutations ponctuelles

Laquelle est la plus facile à obtenir? Pourquoi?

Transitions (Substitution d’une seule pb donc plus facile à obtenir)
Transversions (plus complexe, car changement majeur au niveau des bases)

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En quoi consiste une transition?

Purine (R) R –·> R ou Y –> Y (pyrimidine)

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En quoi consiste une transversion

R –> Y

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Comment peut-on obtenir une mutation ponctuelle?

Suite à un traitement par des analogues de bases

- Suite à un traitement par des agents modifiant chimiquement certaines bases

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Donner deux analogues de bases et leur fonctionnement.

5BU (5-Bromouracile) Forme énol 5BU (analogue de T, s’apparie avec G (au lieu de A)
2AP (2-aminopurine) analogue A peut s’apparier avec C (au lieu de T)

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Les agents alkylants provoquent un transition ou une transversion?

Transversion

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Quels sont les agents alkylants les plus utilisés?

Le diméthyl sulfate et l’éthylnitrosurée

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Par quoi sont causées les mutations par insertion/délétion?

Quel est le résultat d’une mutation de ce type?

Des agents intercalants

Déphasage du cadre de lecture

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Quelle avancée dans le domaine a résulter d’une mutation par insertion/délétion?

Démontrer que les codons sont des triplets

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Qu’arrive-t-il lors d’un déphasage dans le cadre de lecture?

Des protéines non-sens

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Pourquoi les agents intercalants sont planaire?

Parce qu’ils sont fortement aromatique

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VRAI ou VAUX

a. Les mutations paires sont différentes des mutations impaires
b. Les mutations paires représente une délétion et les mutation impaires un ajout
c. Un changement de séquence n’affecte pas les protéines

a. Vrai
b. Faux, contraire
c. Faux protéines non-fonctionnelles

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Décrire l’expérience de Crick et Brenner.

Isolement des mutants (p.12)
Analyse de la séries de mutants → construire et analyser des recombinants portant différentes combinaisons de mutations dans le but de récupérer le phénotype original.

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Comment a-t-il été démontré que les codons sont des triplets?

Crick et Brenner ont fait l’analyse génétique de mutants (révertants) induits dans le gène rIIB du phage T4 (E. coli) suite à un traitement à la proflavine.
Phénotype mutant original (FCO) → croissance sur E. coli B mais pas sur E. coli K12, phénotype souche sauvage → croissance sur les 2

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Décrit le fonctionnement des agents intercalants.

Ce sont des molécules fortement aromatiques qui ont une structure planaire. Ces molécules peuvent s’intégrer dans l’ADN (entre les bases) et étirer la structure normale de celle-ci. Il y a ensuit ajout ou délétion d’une base lors de la réplication de l’ADN

Définir le terme supresseur intragénique

Une mutation à un site voisin de la mutation originale permettant de rétablir le cadre de lecture original

Quel est le résultat le plus important obtenu lors de l’expérience de crick et brenner? Que confirme ce résultat?

Les recombinants avec +/- 3 mutations ont tous le phénotype sauvage

Chaque codon contient 3 bases
Le code génétique n’a pas de virgule
Presque tous les 64 triplets codent pour un aa

À quoi se lient spécifiquement les ARNm lors de la traduction? Que porte-t-il?

ARNt porteurs d’un aa correspondant

Quelle partie assure la formation des liens peptidique lors de la traduction?

Le ribosome

Vrai ou Faux L'ARNt se lie au ribosome et chaque codon se lie à sont ARNm chargé

Faux, contraire

Que stimule l'addition de poly(U) à un système protéique?

la synthèse de poly(Phe)

Que spécifie AAA et CCC?

AAA=Lys et CCC=Pro

Vrai ou faux. Expliquer. Poly(G) ne put être utilisé comme ARNm.

vrai, les ribosome ne peuvent lire des quatuore de G

Que permis de déterminer la traduction in vitro d'ARNm synthétiques contenant 2 ou 3 nucléotide dans un ordre aléatoire et dans des proportion différentes?

- Les compositions en bases, mais pas les séquences, de plusieurs codons - Le code génétique est dégénéré

Vrai ou faux a. L'incorporation d'aa dirigée par des copolymères de A et de C ne permettent pas des résultats concluant? b. Le code génétique a été élucidé par des mesures de liaison de triplets et par l'utilisation de polyribonucléotides de séquences connues

a. Faux | b. vrai

Qu'arrive-t-il quand il n'y a pas de codons d'initiation?

La traduction peut partir entre la première et la 3e base du premier codon.

Quels sont les codons d'arrets? Quel est le plus fréquent?

UAG, UAA et UGA | UAA = plus fréquent

Quels sont les autres noms des codons d'arrets?

Codons non-sens ``` UAG = codon ambre UAA = codon ocre UGA = codon opale ```

Quels sont les codons d'initiation de la chaine? Quel est le plus fréquent?

AUG et GUG | AUG = plus fréquent

Les codons d'initiation peuvent également être présent à l'intérieur des régions codantes. Quel est leur rôle? sont-ils reconnus par les mêmes ARNt?

Ils spécifient Met (AUG) et Val (GUG) Non

Quels acides aminés sont spécifier par un seul codon?

Met et Trp

Qu est ce qu'un codon synonyme?

Codons spécifiannt un même aa

Quels acides aminés sont spécifiés par 6 codons?

Arg, Leu, Ser

Vrai ou faux a) La plupart des codons synonymes ne diffère que par leur deuxième nucléotide. b) Les codons différant à la première position tendent à spécifier des aa semblables. c) Les codons avec Y en 2e position codent essentiellement pour des aa polaires d) les codons avec R en 2e position codent pour des aa hydrophobe.

a) faux, 3e b) vrai c) faux hydrophobe d) faux) polaire

Chez quel organisme une même séquence d'ADN peut coder 2 ou même 3 polypeptides différent?

Chez les phages à petit génome

Vrai ou faux Le code génétique standard est universel.

Faux, Très répandu mais pas universel.

Choisir le ou les énoncé(s) faux. 1. Une mutations à la première position d'un codon donne souvent un aa similaire 2. Les transitions à la seconde position d'un codon donne un codon non-sens 3. Une mutation à la troisième position d'un codon donne rarement un acide aminé différent. 4. Si les deux première position d'un codon sont occupés par C ou G l'acide aminé spécifié dépend du nucléotide à la 3e position 5. Si les deux première position d'un codon sont occupés par A ou U l'acide aminé spécifié dépend du nucléotide à la 3e position

2, 4.

Par quoi sont lus les codons d'arrets?

Par des protéines spécifiques : RF1, RF2, eRF1

Comment fonctionne les RF?

Ils entrent par le site A du ribosome ou ils déclenche l'hydrolyse du peptide-ARNt qui occupe le site P. Le résultat étant le relachement d'une protéine nouvellement synthétisé

Quel réactif la polynucléotide phosphorylase à t-elle besoin pour former des molécules d'ARN?

Concentrations élevés de nucléoside diphosphate.

Quel réactif permet l'initiation de la chaine sans facteurs d'initiation et fMet-ARNt?

Concentration élevée de Mg

Qu'arrive t-il dans le cas de copolymère répétés?

Le ribosome initie la synthèse de protéine au hasard le long du copolymère en incorporant des aa spécifique.

Comment on appelle un altération changeant un codon spécifique pour un aa pour un autre?

missense

Qu'arrive t-il au ARNm contenant un stop prématurer dans les cellules eucaryotes?

Elle sont rapidement dégradé

Combien d'ARNt différent sont présent dans les mitochondries des mammiféres?