2.4 Repetidos Comunes Flashcards
Regiones del DNA que tienen secuencias repetidas
Repetidos comunes
¿Cómo son los repetidos comunes’?
Dispersos y están en distintas regiones
Tipos de repetidos comunes
-transposones (45%)
-regiones intergenicas
-repeticiones largas
-repeticiones cortas
-pseudogenes
-repeticiones en tándem
Elementos móviles del genoma que se pueden replicar e insertar en cualquier sitio (genes saltarines)
Transposones
Tipos de transposones
Clase I
Clase II
Clase I de transposones
Retrotransposones
Retrotransposones
En los procesos de reacomodación o desplazamiento, primero deben transcribirse a RNA y luego saltan
Tipos de retrotransposones
Repeticiones terminales largas (LTR)
Repeticiones terminales no largas (nLTR)
Repeticiones terminales largas
100pb-5k
En el extremo de los cromosomas
Repeticiones terminales no largas (nLTR)
-LINEs (elementos intercalados largos):20% del genoma
-SINEs (elementos intercalados cortos): 13% del genoma
Clase II transposones
DNA transposones
Saltan directamente (no hay transcripción)
¿Dónde podemos ver los LINEs?
Regiones eucromaticas de bandas G(giemsa +)
Ricas en A T
Característica especial de los LINEs
Son automóviles, pueden hacer su transcriptasa reversa para la transposición
Familia de los LINEs
LINE 1
LINE 2
LINE 3
Regiones específicas que van a iniciar una marca de lectura
ORF
Características de SINEs
-no es autónomo y no produce su propia transcriptasa reversa ni endonucleasa
-100 a 400 Pb
¿Quién es responsable de la transposición de SINEs?
La maquinaria de LINE
Familias de SINEs
-elementos ALU
-MIR
-MIR3
Forma más abundante de SINEs con 280 Pb
Elementos ALU
Elementos ALU
2 regiones en tándem con 120 Pb C/u
Seguidas de una región rica en An/Tn