Επίπεδα οργάνωσης των πρωτεϊνών (σελ. 160-161)

Question 1

Τα ανώτερα επίπεδα οργάνωσης μιας πρωτεΐνης σχετίζονται το ένα με το άλλο;

Answer 1

• Δεν είναι ανεξάρτητα
• Αποτελούν προέκταση το ένα του άλλου => πλήρη καθορισμό της 3D δομής του

Question 2

Τι ορίζεται ως πρωτοταγής δομή;

Answer 2

Η αλληλουχία των αμινοξέων μιας πρωτεΐνης

Question 3

Τι ορίζεται ως δευτεροταγής δομή;

Answer 3

Τμήματα πολυπεπτιδικής αλυσίδας που σχηματίζουν α-έλικες και β-πτυχωτά φύλλα

Question 4

Τι ορίζεται ως τριτοταγής δομή;

Answer 4

Η πλήρης 3D διαμόρφωση που σχηματίζεται από ολόκληρη την πολυπεπτιδική αλυσίδα:
- α-έλικες
- β-πτυχωτά φύλλα
- σπειράματα
όποιες πτυχές σχηματίζονται μεταξύ Ν-τελικό & C-τελικό αύριο

Question 5

Τι ορίζεται ως τεταρτοταγής δομή;

Answer 5

Όταν μια πρωτεΐνη σχηματίζεται ως σύμπλοκο 2 ή περισσότερα πολυπεπτίδια => πλήρης δομή

Question 6

Τι ορίζεται ως πρωτεϊνική περιοχή;

Answer 6

Σχηματίζεται από κάθε τμήμα μιας πολυπεπτιδικής αλυσίδας που μπορεί να διπλωθεί ανεξάρτητα σε μια σταθερή & συμπαγή δομή

Question 7

Πόσα αμινοξέα περιλαμβάνει συνήθως μια πρωτεϊνική περιοχή;

Answer 7

40-350

Question 8

Τι αποτελεί η πρωτεϊνική μονάδα;

Answer 8

Μονάδα από την οποία δομούνται πολλές πρωτεΐνες

Question 9

Με τι σχετίζονται οι διαφορετικές περιοχές μιας πρωτεΐνης;

Answer 9

Διαφορετικές λειτουργίες

Question 10

Από ποιους οργανισμούς χρησιμοποιείται η πρωτεΐνη CAP;

Answer 10

Βακτήρια

Question 11

Ποιος είναι ο ρόλος της πρωτεΐνη CAP;

Answer 11

Ενεργοποίηση & Απενεργοποίηση διαφόρων γονιδίων

Question 12

Ποια δομή έχει η πρωτεΐνη CAP και τι ρόλο έχει κάθε μέρος της;

Answer 12

• Μικρή Περιοχή => Σύνδεση με DNA
• Μεγάλη Περιοχή => Σύνδεση με κυκλικό AMP

Question 13

Τι ορίζεται ως κυκλικό AMP;

Answer 13

Ενδοκυτταρικό σηματοδοτικό μόριο

Question 14

Τι συμβαίνει όταν η μεγάλη περιοχή της CAP συνδεθεί με το κυκλικό AMP;

Answer 14

• Μεταβολή στην διαμόρφωση της CAP =>
• Επιτρέπει στην μικρή περιοχή - συνδεθεί με ειδική αλληλουχία DNA =>
• Ενεργοποίηση γειτονικών γονιδίων

Question 15

Πως σχηματίζονται οι περιοχές (domains) μιας πρωτεΐνης;

Answer 15

Δομικά στοιχεία δευτεροταγούς δομής => Συσκευάζονται σφιχτά

Question 16

Πως συγκροτείται μιας συνηθισμένη πρωτεΐνη;

Answer 16

• 1 ή περισσότερες περιοχές
• Ανάμεσα παρεμβάλλονται πολυπεπτιδικά τμήματα => ΔΕΝ έχουν ιδιαίτερα δομικά χαρακτηριστικά

Question 17

Τι λειτουργία έχει το κυτόχρωμα b562;

Answer 17

Εμπλέκεται στην μεταφορά e- στα μιτοχόνδρια

Question 18

Τι μορφή και δομή έχει το κυτόχρωμα b562;

Answer 18

• Σχεδόν αποκλειστικά α-έλικες
• 1 μοναδική περιοχή

Question 19

Η περιοχή σύνδεσης με το NAD του ενζύμου γαλακτική δεϋδρογονάση τι μορφή έχει;

Answer 19

Συνδυασμός α-ελίκων και β-πτυχωτών φύλλων

Question 20

Σε ένα πρωτεϊνικό μοντέλο οι προεξέχουσες βρόχοι τι σχηματίζουν;

Answer 20

Θέσεις Πρόσδεσης για άλλα μόρια