1.4. Estructura secundaria Flashcards
¿Qué es la estructura secundaria?
Elementos estructurales locales que se encuentran en muchas proteínas debido a las interacciones no covalentes entre los aminoácidos cercanos de una proteína.
Tipos de hélices (3):
Alfa
3(10)
Pi
¿Qué aminoácidos son más frecuentes en las hélices alfa? (5)
MALEK (metionina, alanina, leucina, glutámico, lisina)
Las alfa helices tienen enlaces de hidrógeno cada ___ residuos; las 3(10) cada ___ residuos; las pi cada ___ residuos.
4
3
5
¿Qué es una lámina beta?
Estructura que se forma cuando un polipéptido establece puentes de hidrógeno con otro paralelo a él
Tipos de láminas beta (3)
Paralelas
Antiparalelas
Mixtas
¿Qué es un bulto B?
Interrupción localizada del enlace de hidrógeno regular mediante la inserción de residuos adicionales en la lámina beta. Hace que la lámina gire
Grandes tipos de elementos de unión entre estructuras secundarias (3):
Turn/giro
Loop/bucle
Coil/ovillo
¿Qué es un giro?
sitio donde la cadena polipeptídica invierte su dirección general para conectar hélices y láminas
Tipos de giro (6):
Horquillas
Giro alfa
Giro beta
Giro gamma
Giro delta
Giro pi
¿Qué es un bucle?
Es igual a un giro, pero más grande
¿Qué es un ovillo?
Zona amplia de aminoácidos que une zonas de estructura secundaria definida, pero que no tiene estructura secundaria definida
Métodos experimentales para la determinación de la estructura secundaria (2)
Diacronismo circular
Resonancia magnética nuclear
Métodos no experimentales para la determinación de la estructura secundaria (3)
Frecuencia de aminoácidos
Cálculos energéticos
Alineamientos múltiples
¿Qué es el diacronismo circular?
Medir la absorbancia de luz polarizada que interacciona con los elementos de estructura
