12. REPARACIÓN

Question 1

Generalidades de reparación
Tipos de reparación

Answer 1

• Forma directa
• Escisión del fragmento dañado y resíntesis: BER y NER
• Recombinación homóloga: HR
• Unión de extremo no homólogos: NHEJ

Question 2

¿Qué hace la DNA pol al momento de encontrar una falla?

Answer 2

Realiza escisión específica para las bases mal apareadas
MMR

Question 3

¿Qué hace la DNA polimerasa ante lesiones por reacciones fotoquímicas?

Answer 3

Se generan dímeros de pirimidina
* DNA pol replicativas: Detiene la síntesis dejando huecos que van a ser completados por DNA pol de síntesis sobredelesión (TLS)

Question 4

Reparación directa

Answer 4

Reparación realizada por la acción de una única enzaima
* No se sustituye la base dañada
* La molécula orginal del ADN revierte la lesión
3 mecanismos
1. fotorreactivación
2. alquitranferencias
3. desmetilación oxidativa

Question 5

Fotorreactivación

Answer 5

Daño generada por fotoproductos, genera dimeros de pirimidina
Esto genera:
* inhibición de replicación y transcripción
* aumento de aparición de mutaciones
* detiene el ciclo celular
* provoca muerte celular

Es revertido por FOTOLIASA:
* capta un fotón y ocupar la energía para revertir el dímero
* rompe el enlace entre pirimidinas reparando el daño

Question 6

Alquiltranferencia

Answer 6

Es quitar aductos alquilo en las bases del DNA
Son:
* meitil-metano-sulfonato → MMS
* enzimáticos → metilasas

Question 7

Importancia de la metilación del oxígeno en las guaninas

Answer 7

El proceso ocurre así: METILACIÓN EN O6-METILGUANINA
1. La metilación hace que ocurra una unión con una timina cuando debe de ser citosina
2. Entrecruzamiento G-C
3. Alteración en nueva cadena de DNA
4. Inhibición de replicación y transcripción
5. Muerte celular por apoptosis

Question 8

Enzima que realiza la reparación

Answer 8

Enzima:
O6-alquilguanina-ADN-alquiltransferasa
(hAGT o MGMT)
* transfiere el grupo metilo de la 06-mG a un aa, de su centro activo
* restaura la guanina original
* MGMT se inactiva

Question 9

¿Qué sucede en las mutaciones por metilación oxidativa?

Answer 9

Remueve daños por metilación de DNA, que pueden ser tóxicas y con acción mutagénica
Causada por:
* estrés oxidativo
* inflamación
* peroxidación de lípidos
* infecciones
* procesos metabólicos naturales
* alteración de microbiota intestinal

Question 10

Desmetilación oxidativa

Answer 10

E.coli: AlkB → desmetila las bases lesionada y las revierte, liberando el grupo metilo en formaldehído
HUMANOS los homólogos son:
* ABH1
* ABH2
* ABH3

Question 11

Reparación indirecta

Answer 11

• Interviene sobre el DNA durante la replicación, transcripción o hebras de DNA fragmentados
  Implica:
• corte, empalme de la región dañada
• inserción de nuevas bases
• ligación de cadena
  Hay 3 mecanismos:
  1. reparación por escisión de base (BER)
  2. repación por escisión de nucleótidos (NER)
  3. reapración por apareamiento erróneo (mitsmach repair)

Question 12

Reparación por escisión de bases BER

Answer 12

Lesiones producidas por: hidrólisis, desaminación, radiaciones ionizantes, ROS, agentes alquilantes y ándulos de bases
PROCESO:
1. DNA glucosidasa → remueve las bases modificadas
2. hace un corte del enlace N-glucosídico
3. crean un sitio abásico o una ruptuda de cadena sencilla
4. llega la endonucleara y fosfodiesteresa (“dejan limpio el espacio vacío”)
5. el espacio es llenado por la DNA pol de reparación, DNA pol beta
6. Al final DNA ligasa III o I

Question 13

Diferencia entre la SP-BER y la LP-BER

Answer 13

SP: espacio vacío de sólo UN NUCLEÓTIDO
LP: espacio vacío de DOS O MÁS NUCLEÓTIDOS

Question 14

¿Qué es el reparosoma?

Answer 14

Formado por:
1. UDG
2. APE1
3. DNA pol beta
4. ligasa

Lo que hace es generar lugares abásicos (AP)

Question 15

Reparación por escisión de nucleótidos NER

Answer 15

Importante para el daño provocado por radiación UV
Se subdivide en dos:
1. reparación global del genoma GGR
2. reparación acoplada a transcripción TCR

Question 16

Reparación global del genoma

Answer 16

• proceso al azar
• reconoce el daño
• compuesto de 4 complejos diferentes: XPC, DDB, XPA y RPA

1. XPC HR23B : reconocen el daño y se unen al complejo D (formado por DDB1 y DDB2 (XPE))
2. Se unen los complejos de repación por acción de la helicasa → XPB y XPD (TFIIH)
3. Se hace incisión en la hebra de daño por la endonucelasa (XPG y ERCC1-XPF) en 24-32 nucleótidos
4. El hueco lo rellena DNA pol delta o epsilon junto con PCNA y RFC
5. Todo es sellado por la DNA ligasa III

Question 17

Reparación acoplada a transcripción TCR

Answer 17

• específica y eficiente
  1. RNA pol II enceuntra la lesión y se detiene y se desplaza
  2. Se une dos proteína CSA y CSB
  3. Se une la helicasa XPB y XPD

Síndrome asociados:
* síndrome de Cockayne: alteración en CSA y CSB
* xeroderma pigmentoso: alteración en XPB y XPD

Question 18

Reparación d bases mal apareada MMR

Answer 18

Remueve las bases mal apareadas
* Hace que se mantenga la estabilidad genómica y reduce la mutaciones durante la replicación
* si exsite alguna falla hay mayor riesgo a: tumores, síndromes y cáncer (síndrome de Lynch)

Se reconoce las discontinuidades de cadena
E.coli, 3 proteína específicas:
* MutS: se une al sitio de apareamiento erróneo
* MutL: reconoce la secuencia de ADN hemimetilado, fragmentos de Okasaki, se genera un rompimiento de la cadena debido a su actvidad de endonucleasa
* MutH:
* el segmento lesionado es removido por la helicasa
* lo degrada la exonucleasa
* se hace síntesis y ligación por la DNA pol III y DNA ligasa

Question 19

Reparación por combinación homóloga HR

Answer 19

• Repara las rupturas de doble cadena ocasionadas por reacciones bioquímicas, radiaciones ionizantes o ROS (G2)
• En eucariotas puede provocar la inactivación de un gen esencial, lo que puede causar apoptosis de la células

Question 20

¿Cuáles son las dos maneras en la que se reparan las rupturas de doble cadena?

Answer 20

1. recombinación homóloga
2. recombinación de extremos no homólogos