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Question 1

da cosa è formato il complesso del poro?

Answer 1

da recettori e trasportatori che riconoscono sequenze specifiche di proteine

Question 2

quali sono le sequenze specifiche riconosciute d trasportatori?

Answer 2

-NLS (sequenza di entrata): riconosciute da importine, che legano la proteina e la portano nel nucleo
-NES (seq di uscita): riconosciute da esportine, portano le proteine fuori dal nucleo

Question 3

dimmi 4 cose sulla proteina RAN

Answer 3

-g protein monomerica
-collabora con RanGAP nel citosol e RanGEF nel nucleo
-nel citoplasma la RanGAP trasferisce il GDP sulla Ran
-nel nucleo serve energia per staccare il cargo dalla beta-importina quindi la RanGDP
grazie alla GEF perdere affinità con il GDP e lega il GTP

Question 4

come viene regolata l’importazione nucleare?

Answer 4

con cambio conformazionale o modifiche post traduzionali della proteina cargo, che riesce a legare NLS ed è riconosciuta dall’importina

Question 5

da cosa è fatta la cromatina?

Answer 5

da un insieme di nucleosomi, associazioni di dna a proteine istoniche

Question 6

qual è la funzione dell’istone H1?

Answer 6

condensa ulteriormente la cromatina formando la struttura a solenoide

Question 7

cos’è lo scaffold?

Answer 7

struttura ad anse in cui si organizza il solenoide, essa contiene geni specifici regolati con la modifica dell’ansa

Question 8

in che stato si trova la cromatina in G1?

Answer 8

è finemente dispersa, quindi molto attiva

Question 9

quali sono i tipi di eterocromatina?

Answer 9

-costitutiva: non si modifica in interfase (centromero), mai trascritta
-facoltativa: silenziamento genico specifico, per cui a un certo punto non viene più trascritta, inattivata attraverso la proteina SIR

Question 10

cos’è la proteina SIR?

Answer 10

proteina che inattiva la cromatina e la rende eterocromatina facoltativa

Question 11

cosa comporta l’acetilazione degli istoni?

Answer 11

attivazione della cromatina

Question 12

come si attiva/disattiva la cromatina?

Answer 12

-attiva: acetilazione istoni
-disattiva: proteina sir

Question 13

cos’è il gene?

Answer 13

l’unità trascrizionale, parte di dna trascritta

Question 14

quali sono le caratteristiche della trascrizione nei procarioti?

Answer 14

-i geni operoni sono regolati in base ai nutrimenti
-gene legato a promotore, che localizza il punto di trascrizione dove si trova la RNA polimerasi
-l’unità trascrizionale è continua, perchè una sequenza trascritta è sempre tradotta
-gli mRNA sono policistronici perchè codificano per più proteine

Question 15

caratteristiche della trascrizione degli eucarioti

Answer 15

-mRNA monocistronico, codifica per una sola proteina
-unità di trascrizione discontinua (esoni alternati a introni)
-i geni codificanti hanno un promotore core ed elementi prossimali e distali

Question 16

cos’è lo splicing?

Answer 16

fenomeno di taglio delle sequenze non codificanti (introni) presenti nel premRNA eucariotico, cosi nell’mRNA maturo ci sono solo esoni

Question 17

definisci splicing alternativo

Answer 17

una cellula effettua splicing diversi in funzione di una regolazione di fattori specifici

Question 18

qual è il dogma centrale della biologia?

Answer 18

replicazione trascrizione e traduzione avvengono in tutte le cellule?
il verso è prestabilito ma alcune cellule possono effettuare trascrizione inversa

Question 19

quali sono i vari tipi di RNA?

Answer 19

mRNA
tRNA
rRNA
snRNA SMALL NUCLEAR RNA
miRNA MICRORNA
siRNA SILENCING INTERFERENCE RNA

Question 20

cosa sono i snRNA?

Answer 20

piccoli rna che fanno parte della struttura degli spliciosomi, prendono parte alla regolazione/maturazione dell’mRNA

Question 21

definisci spliceosoma

Answer 21

ribonucleoproteine con attività enzimatica
viene attivato per individuare il trascritto primario da tagliare
sintetizzato nel nucleo

Question 22

definisci miRNA

Answer 22

sono sintetizzati dalla RNApolimerasi-2
In forma non matura, attraversano i pori nucleari ed arrivano nel citoplasma (sono gli unici che possono farlo)
Nel citoplasma i miRNA interagiscono per reprimere la traduzione di quel messaggero

Question 23

definisci siRNA

Answer 23

RNA che silenziano i geni e si trovano nelle piante. Hanno funzione simile ai miRNA

Question 24

in che direzione è prodotto l’RNA?

Answer 24

da un filamento stampo di dna, in direzione 5’-3’per il filamento guida e 3’-5’ per il filamento ritardato

Question 25

quali sono le fasi della trascrizione procariotica?

Answer 25

inizio
allungamento
terminazione

Question 26

cos’è il promotore?

Answer 26

il segmento di DNA che precede il sito d’inizio della trascrizione (+1)

Question 27

quali sono le sequenze consenso del promotore procariotico?

Answer 27

-10 (10 nt prima del sito di inizio) e -35(35 nt prima), sono riconosciute dalla RNA polimerasi che si lega al filamento e inizia la denaturazione

Question 28

descrivi l’rna polimerasi nei batteri

Answer 28

solo un tipo, fatta da più subunità alpha e beta, ha un fattore sigma con cui si lega il promotore

Question 29

definisci oleoenzima e core

Answer 29

-oleoenzima: rna polimerasi+fattore sigma, che può legare il promotore
-core: rna polimerasi senza fattore sigma, non lega promotore

Question 30

cos’è e cosa fa il fattore sigma?

Answer 30

proteina che lega rna polimersai per legame con promotore, riconosce le sequenze consenso sul dna (-10 e -35) e individua il promotore
decide il filamento stampo, il verso di trascrizione
poi il fattore sigma si stacca e il core va in posizione +1 per avviare la trascrizione

Question 31

cosa avviene durante la fase di allungamento?

Answer 31

si crea una bolla di trascrizione (regione denaturata di 20 nt ca)
rnapol scorre sul filamento stampo e aggiunge pochi nt alla volta
si forma neo RNA in direzione 5’-3’

Question 32

quali sono i due tipi di terminazione?

Answer 32

-RHO INDIPENDENTE: nella regione di terminazione si crea una forcina di stop a causa di sequenze palindromiche (tante G e C), si crea un loop che destabilizza la rna polimerasi che rilascia il filamento stampo
-RHO DIPENDENTE: enzima Rho raggiunge rna polimerasi in prossimità delle regioni palindromiche e la stacca

Question 33

cos’è il fattore rho?

Answer 33

è un enzima (elicasi) che scorre sul filamento di RNA nascente fino a raggiungere la sequenza di terminazione che si trova subito dopo la forcella di replicazione. interviene a determinare
il distacco tra RNA e filamento stampo

Question 34

cosa sono gli operoni?

Answer 34

geni controllati da un unico promotore, trascritti sullo stesso rna e codificati tutti insieme

Question 35

quali elementi intervengono nella trascrizione eucariotica?

Answer 35

3 tipi di rna polimerasi (1,2,3)
fattori trascrizionali
elementi regolatori prossimali e distali

Question 36

caratteristiche delle rna polimerasi I, II, III

Answer 36

-rna pol I e III: simili a rna pol procariotica, sempre attive, sintesi rrna e trna
-rna pol II: sintesi mrna, attivata solo se necessaria, regolata da fattori trascrizionali tessuto specifici

Question 37

cos’è il promotore core/basale?

Answer 37

promotore legato alla RNA polimerasi II, indica il punto di inizio della trascrizione, deve legarsi a sequenze consenso