12/13 Flashcards
da cosa è formato il complesso del poro?
da recettori e trasportatori che riconoscono sequenze specifiche di proteine
quali sono le sequenze specifiche riconosciute d trasportatori?
-NLS (sequenza di entrata): riconosciute da importine, che legano la proteina e la portano nel nucleo
-NES (seq di uscita): riconosciute da esportine, portano le proteine fuori dal nucleo
dimmi 4 cose sulla proteina RAN
-g protein monomerica
-collabora con RanGAP nel citosol e RanGEF nel nucleo
-nel citoplasma la RanGAP trasferisce il GDP sulla Ran
-nel nucleo serve energia per staccare il cargo dalla beta-importina quindi la RanGDP
grazie alla GEF perdere affinità con il GDP e lega il GTP
come viene regolata l’importazione nucleare?
con cambio conformazionale o modifiche post traduzionali della proteina cargo, che riesce a legare NLS ed è riconosciuta dall’importina
da cosa è fatta la cromatina?
da un insieme di nucleosomi, associazioni di dna a proteine istoniche
qual è la funzione dell’istone H1?
condensa ulteriormente la cromatina formando la struttura a solenoide
cos’è lo scaffold?
struttura ad anse in cui si organizza il solenoide, essa contiene geni specifici regolati con la modifica dell’ansa
in che stato si trova la cromatina in G1?
è finemente dispersa, quindi molto attiva
quali sono i tipi di eterocromatina?
-costitutiva: non si modifica in interfase (centromero), mai trascritta
-facoltativa: silenziamento genico specifico, per cui a un certo punto non viene più trascritta, inattivata attraverso la proteina SIR
cos’è la proteina SIR?
proteina che inattiva la cromatina e la rende eterocromatina facoltativa
cosa comporta l’acetilazione degli istoni?
attivazione della cromatina
come si attiva/disattiva la cromatina?
-attiva: acetilazione istoni
-disattiva: proteina sir
cos’è il gene?
l’unità trascrizionale, parte di dna trascritta
quali sono le caratteristiche della trascrizione nei procarioti?
-i geni operoni sono regolati in base ai nutrimenti
-gene legato a promotore, che localizza il punto di trascrizione dove si trova la RNA polimerasi
-l’unità trascrizionale è continua, perchè una sequenza trascritta è sempre tradotta
-gli mRNA sono policistronici perchè codificano per più proteine
caratteristiche della trascrizione degli eucarioti
-mRNA monocistronico, codifica per una sola proteina
-unità di trascrizione discontinua (esoni alternati a introni)
-i geni codificanti hanno un promotore core ed elementi prossimali e distali
cos’è lo splicing?
fenomeno di taglio delle sequenze non codificanti (introni) presenti nel premRNA eucariotico, cosi nell’mRNA maturo ci sono solo esoni
definisci splicing alternativo
una cellula effettua splicing diversi in funzione di una regolazione di fattori specifici
qual è il dogma centrale della biologia?
replicazione trascrizione e traduzione avvengono in tutte le cellule?
il verso è prestabilito ma alcune cellule possono effettuare trascrizione inversa
quali sono i vari tipi di RNA?
mRNA
tRNA
rRNA
snRNA SMALL NUCLEAR RNA
miRNA MICRORNA
siRNA SILENCING INTERFERENCE RNA
cosa sono i snRNA?
piccoli rna che fanno parte della struttura degli spliciosomi, prendono parte alla regolazione/maturazione dell’mRNA
definisci spliceosoma
ribonucleoproteine con attività enzimatica
viene attivato per individuare il trascritto primario da tagliare
sintetizzato nel nucleo
definisci miRNA
sono sintetizzati dalla RNApolimerasi-2
In forma non matura, attraversano i pori nucleari ed arrivano nel citoplasma (sono gli unici che possono farlo)
Nel citoplasma i miRNA interagiscono per reprimere la traduzione di quel messaggero
definisci siRNA
RNA che silenziano i geni e si trovano nelle piante. Hanno funzione simile ai miRNA
in che direzione è prodotto l’RNA?
da un filamento stampo di dna, in direzione 5’-3’per il filamento guida e 3’-5’ per il filamento ritardato
quali sono le fasi della trascrizione procariotica?
inizio
allungamento
terminazione
cos’è il promotore?
il segmento di DNA che precede il sito d’inizio della trascrizione (+1)
quali sono le sequenze consenso del promotore procariotico?
-10 (10 nt prima del sito di inizio) e -35(35 nt prima), sono riconosciute dalla RNA polimerasi che si lega al filamento e inizia la denaturazione
descrivi l’rna polimerasi nei batteri
solo un tipo, fatta da più subunità alpha e beta, ha un fattore sigma con cui si lega il promotore
definisci oleoenzima e core
-oleoenzima: rna polimerasi+fattore sigma, che può legare il promotore
-core: rna polimerasi senza fattore sigma, non lega promotore
cos’è e cosa fa il fattore sigma?
proteina che lega rna polimersai per legame con promotore, riconosce le sequenze consenso sul dna (-10 e -35) e individua il promotore
decide il filamento stampo, il verso di trascrizione
poi il fattore sigma si stacca e il core va in posizione +1 per avviare la trascrizione
cosa avviene durante la fase di allungamento?
si crea una bolla di trascrizione (regione denaturata di 20 nt ca)
rnapol scorre sul filamento stampo e aggiunge pochi nt alla volta
si forma neo RNA in direzione 5’-3’
quali sono i due tipi di terminazione?
-RHO INDIPENDENTE: nella regione di terminazione si crea una forcina di stop a causa di sequenze palindromiche (tante G e C), si crea un loop che destabilizza la rna polimerasi che rilascia il filamento stampo
-RHO DIPENDENTE: enzima Rho raggiunge rna polimerasi in prossimità delle regioni palindromiche e la stacca
cos’è il fattore rho?
è un enzima (elicasi) che scorre sul filamento di RNA nascente fino a raggiungere la sequenza di terminazione che si trova subito dopo la forcella di replicazione. interviene a determinare
il distacco tra RNA e filamento stampo
cosa sono gli operoni?
geni controllati da un unico promotore, trascritti sullo stesso rna e codificati tutti insieme
quali elementi intervengono nella trascrizione eucariotica?
3 tipi di rna polimerasi (1,2,3)
fattori trascrizionali
elementi regolatori prossimali e distali
caratteristiche delle rna polimerasi I, II, III
-rna pol I e III: simili a rna pol procariotica, sempre attive, sintesi rrna e trna
-rna pol II: sintesi mrna, attivata solo se necessaria, regolata da fattori trascrizionali tessuto specifici
cos’è il promotore core/basale?
promotore legato alla RNA polimerasi II, indica il punto di inizio della trascrizione, deve legarsi a sequenze consenso
