11 Flashcards
definisci trascrittoma
diversi rna nella cellula
da cosa è composta l’espressione genica?
trascrizione e traduzione
definisci proteoma
proteine espresse
5 caratteristiche del dna
-acido
-se denaturato può essere rinaturato
-assorbe a 260 nm
-studiato con elettroforesi
-circolare o lineare
descrivi l’elettroforesi a gel di agarosio
usata per misurare la grandezza del dna
-formata da una camera di elettroforesi, che contiene soluzione tampone in cui vi sono elettrodo positivo e negativo
-i frammenti di dna sono posti fra i due elettrodi e verranno attratti dal polo positivo
-i frammenti più piccoli (paia di basi) saranno più veloci ad attraversare il gel
come si divide il dna?
-dna non ripetuto (codifica geni): definisce complessità genomica
-dna moderatamente ripetuto
-dna altamente ripetuto
come si divide il dna altamente ripetuto in base alla grandezza dei frammenti e alla quantità di ripetizioni?
-dna satellite: (centromero), formato da eterocromatina costitutiva [170 nt]
-dna minisatellite (telomeri) [25 nt]
-dna microsatellite (polimorfismi) [5 nt]
qual è la velocità di rinaturazione dei diversi tipi di dna?
-Il 15% si rinatura velocemente poichè costituito da DNA altamente ripetitivo;
- il 30% con velocità intermedia poichè è moderatamente ripetitivo;
- Il 55% che invece presenta dna non ripetuto e si
rinatura più lentamente.
cosa sono i trasposoni/retrotrasposoni?
-sequenze disperse trasponibili di dna(trasposoni) e rna(retrotrasposoni)
-legate al dna moderatamente ripetuto
-i retrotrasposoni possono avere diversa grandezza LINE, SINE LTR
da cosa dipende la complessità genomica?
dalla porzione di dna non ripetuto
da cosa è formato il dna eucariotico?
-dna ripetuto
-dna ripetuto in tandem: codifica per trna e rrna
-geni in singola copia (codificano per proteine) e pseudogeni
come è organizzato il dna nei batteri?
dna associato a proteine HU e poliammine, si trova nel nucleoide
dove si trova il dna eucariotico?
nel nucleo
dimmi 3 componenti dell nucleo
-involucro nucleare: fatto da una doppia membrana
-pori nucleari: nell’involucro, selezionano selettivamente le sostanze di passaggio, punti in cui le due membrane si fondono
-lamina nucleare: formata da filamenti intermedi (lamine) che formano tetrameri che interagiscono con membrana nucleare
quali sono le funzioni del nucleo?
-separa dna da regioni di stress ossidativo
-regola trascrizione (regola accessibilità a cromatina)
-blocca traduzione se trascritto non è maturo