1-1,2 Teoria Flashcards
Qu’est-ce que l’arbre phylogénétique ?
une représentation des relations de parenté entre les organismes vivants, traduisant leur histoire évolutive; c’est une hypothèse
Que sont les caractères homologues ?
Des structures héritées d’un ancêtre commun
Sous quels états peut exister un caractère ?
- sous un état primitif (pas de changement du caractère par rapport à l’ancêtre précédent)
- sous un état dérivé (innovation, transformation du caractère)
Quelle est la raison de l’utilisation d’un extra-groupe ?
la détermination du sens de transformation, on définit un état ancestral ou dérivé
Les différents niveaux hiérarchiques (du particulier au général)
Règne > Embranchement Classe > Ordre > Famille > Genre > Espèce
3 domaines de la classification
- eucaryotes
- eubactéries
- archées
Constituants des Alvéolobiontes (Eucaryotes)
- dinophytes
- apicomplexés
- ciliés
Constituants des Excavobiontes (Eucaryotes)
- Métamonadine
- Euglénobiontes
Constituants des Ubicontes (Eucaryotes)
- Amoebozoaires
- Opisthocontes:
- Métazoaires
- Choanoflagellés
- Eumycètes
Constituants des Straménopiles (Eucaryotes)
- Ochrophyte
- Oomycètes
Constituants des Plantae/ Lignée verte (Eucaryotes)
- Chlorobiontes
- Rhodobiontes
Eumycètes
Constituants des Ubicontes (Eucaryotes)
Euglénobontes
Constituants des Excavobiontes (Eucaryotes)
Dinophytes
Constituant des Alvéolobiontes (Eucaryotes)
Oomycètes
Constituants des Straménopiles (Eucaryotes)
Comment appelle-t-on un caractère qui est partagé avec le groupe extérieur ? (aussi appelé extra-groupe)
caractère non informatif
Def groupe monophylétique
groupe défini par au moins une synapomorphie, un ancêtre commun hypothétique et l’ensemble de ses descendants
Que représente le nœud dans un arbre phylogénétique ?
reconstitution incomplète d’un ancêtre commun hypothétique
Que sont deux groupes-frères ?
2 groupes monophylétiques qui ensemble forment un groupe monophylétique
Def de caractère
Attributs observables. Structures comparables entre les organismes étudiés, représentant des similitudes sans ê identiques
Postulats de base pour faire un arbre phylogénétique
- Tous les organismes dérivent d’un ancêtre commun qui ne donnent pas des êtres identiques
- sur 3 organismes, 2 sont toujours plus proches
Que dit le principe de parcimonie ?
utiliser le minimum d’évolutions pour construire un arbre phylogénétique
Qu’est-ce que la synapomorphie ?
les caractères dérivés et partagés par un ou plusieurs groupe-frères. Mais tous les descendants peuvent ne pas partager ce caractère, en cas de dérive ultérieure
Comparaison de l’organisation cellulaire entre les Eubactéries, les Eucaryotes et les Archées
- les eubactéries et les archées
- les eucaryotes
les eubactéries et les archées:
- pas de noyau
- pas d’organite
- pas de cytosquelette
les eucaryotes:
- noyau
- organites
- cytosquelette
Comparaison dans l’organisation du génome et du mode de division cellulaire entre les archées, les eubactéries et les eucaryotes
- les eubactéries et les archées
- les eucaryotes
les eubactéries et archées: -chromosome circulaire -division par scissiparité les eucaryotes: -chromosomes linéaires -division par mitose
Comparaison de la nature des lipides membranaires entre les eucaryotes, les archées et les eubactéries
- les eubactéries et les eucaryotes
- les archées
les eubactéries et les eucaryotes:
-chaînes d’acide gras non ramifiées
les archées
-chaînes d’acide gras ramifiées
Quels domaines des trois ont un noyau délimité par une enveloppe ?
les eucaryotes
Quels domaines des trois ont un système endomembranaire ? (Organites avec membranes)
les eucaryotes
Quels domaines des trois ont une réponse inhibé à la streptomycine et au chloramphénicol ? (qui agit sur la synthèse des protéines)
les eubactéries
Quels domaines des trois possèdent des histones ?
les archées et les eucaryotes
Quels domaines des trois où les introns sont présents ?
les eucaryotes, et les archées (où ils sont rares)
Combien d’ARN polymérases possèdent les
3 domaines ?
- les eubactéries : une
- les archées: plusieurs
- les eucaryotes: trois
Quels sont les ARNt initiateurs qu’utilisent les trois domaines ?
-les eubactéries: Formylméthionine
-les archées:
Méthionine
-les eucaryotes:
Méthionine
Quels domaines des trois possèdent des peptidoglycanes (sucres aminés) dans la paroi cellulaire ?
les eubactéries
Quels sont les caractéristiques des lipides membranaires selon les domaines ?
-les eubactéries: Liaison ester établie et les hydrocarbures sont linéaires -les archées: Liaison éther établie et les hydrocarbures sont linéaires -les eucaryotes: Liaison ester et les hydrocarbures sont linéaires
Taille des eubactéries et archées
0,5 à 10 µm
Taille des cellules eucaryotes animales
10 – 30 µm
Taille des cellules eucaryotes photosynthétiques
30 - 100 µm
Morphologie des eubactéries
Unicellulaire solitaire ou formant des colonies sous forme de coque, bacille, spirille ou spirochète
Métabolisme des eubactéries
Diversité de métabolisme:
- Photo-autotrophes; Photo-hétérotrophe
- Chimio-autotrophes; Chimio-hétérotrophes
source d’énergie (la lumière et chimique)
source de carbone (inorganique CO2, organique sucres)
Milieu et impact sur la santé publique des eubactéries
Diversité de milieu: Présentes dans tous les milieux
Impact sur économique, écologique et sur la santé publique des eubactéries
Impact économique: yaourt (Lactobacillus bulgaricus), vinaigre (Acetobacter aceti), vaccins, enzymes, etc
Impact écologique: cycle de l’azote
Impact sur la santé publique: Nombreux pathogènes et toxine(responsable du choléra, du tétanos)
Particularités des cyanobactéries (appartenant aux eubactéries)
- Présentes en milieu terrestres, eaux douces et marins
- Seraient apparues il y a 2,5 Ga
- Verte; présence de chlorophylle a et de photosytèmes
- Sont à l’origine de l’enrichissement de l’atmosphère terrestre en oxygène
Morphologie des archées
Unicellulaire solitaire ou formant des colonies sous forme de coque,
bacille, spirille ou spirochète
Métabolisme des Archées
diversifié comme dans le cas des eubactéries
Milieu des archées
Diversité. Terrestre (les sols, les marais, les lacs, les eaux usées), Marin (colonne d’eau et sédiments au fond de l’océan), milieux « extrêmes » (hautes températures, thermophiles 45-80°C et hyperthermophiles, 80-105°C / hypersalés, halophiles / hyperacides, acidophiles, ph<2)
Impact écologique et sur la santé publique des archées
Impact sur la santé publique: Absence de pathogènes connus
Impact écologique: méthanogènes
Morphologie des eucaryotes
Unicellulaire ou pluricellulaire de forme très variées
Métabolisme des eucaryotes
Photo-autotrophes; Chimio-hétérotrophes
Milieu des eucaryotes
Présente dans tous les milieux
Synapomorphie des eucaryotes
- Présence d’un noyau
- Compartimentation
- Cytoplasme avec un cytosquelette
caractéristiques des Unicontes
-Présence d’un flagelle (avec perte secondaire possible) dans les organismes unicellulaires dans des cellules libres des organismes pluricellulaires
caractéristiques des amoebozoaires
Sont des eucaryotes. Organismes dont les cellules libres sont de type amibe
caractéristiques des eumycètes
Sont des eucaryotes et sont des opisthocontes.
Groupe d’organismes
unicellulaires ou pluricellulaires hétérotrophe.
Représente environ 100 000 espèces mais on estime qu’il en existe jusqu’à environ 1,5 million. Aérobies et hétérotrophes (saprotrophe,
parasite ou symbiotique).
• Cellules entourées d’une paroi contenant de la chitine
• Secrètent des enzymes lytiques à action digestive extracellulaire: exodigestion
• les champignons sont les principaux agents de décomposition de la biosphère
caractéristiques des choanoflagellés
Sont des eucaryotes et sont des opisthocontes.
Petit groupe d’organismes unicellulaires marins
caractéristiques des métazoaires
ou Animaux: Sont des eucaryotes et sont des opisthocontes.
- organismes pluricellulaires hétérotrophes
- Présence de collagène
caractéristiques de la lignée verte ou plantae
Sont des eucaryotes. Possession de cellules avec chloroplastes à deux membranes (descendants directs de l’organimes ayant effectué la 1ère endosymbiose chloroplastique)
caractéristiques des straménopiles
Sont des eucaryotes.
- présence de cellule à structure hétérocontée (1 flagelle lisse et 1 flagelle plumeux)
- Composé de réserve type laminarane (glucane b-1,3)
caractéristiques des oomycetes
Sont des eucaryotes et des straménopiles.
800 – 1000 espèces, saprophytes ou parasites
de vertébrés et de plantes
caractéristiques des Ochrophyta
Sont des eucaryotes et des straménopiles.
• Environ 17 000 espèces (essentiellement
unicellulaires sauf la classe des algues brunes)
• Plastes à 4 membranes (endosymbiose secondaire)
• Pigments : Chl et caroténoïdes
Caractéristiques des alvéolobiontes
Sont des eucaryotes
- Organismes unicellulaires uniquement
- tailles et modes de vie variés; souvent flagellés ou ciliés
- Cellules avec des alvéoles sous la membrane plasmique
Caractéristiques des excavobiontes
Sont des eucaryotes.
unicellulaires hétérotrophes et généralement flagellés présence d’une
zone creusée, le cytostome, permettant l’ingestion de fines particules
alimentaires (Excavés qui signifie creusés)
Groupes de l’arbre du vivant concernés par la pluricellularité
- métazoaires
- eumycètes
- oomycètes
- ochrophytes
- rhodobiontes
- chlorobiontes
Groupes de l’arbre du vivant concernés par la photosynthèse
- rhodobiontes
- chlorobiontes
- ochrophytes
- dinophytes
- euglénobiontes
Def symplésiomorphie
partage d’une plésiomorphie (= partage d’un caractère primitif)
Def plésiomorphie
(= caractère ancestral, primitif) caractère présent chez un ancêtre commun d’espèces différentes
Def apomorphie
(= caractère dérivé) évolution d’un caractère primitif en un nouveau caractère
def taxon
groupe d’êtres vivants
Signification de la racine d’un arbre
branche qui permet d’orienter l’arbre en fonction du temps
Signification d’un nœud
ancêtre commun hypothétique
Def groupe paraphylétique
Un ancêtre commun et une partie de ses descendants
Def groupe polyphylétique
Regroupe les taxons en excluant leur ancêtre commun
