VL3 Topologie

Question 1

Grundeiinheiten der DNA: Aufbau, Nomenklatur

Answer 1

DNA-Einzelstrang:
-ist polar 
-innen positiv, außen negativ
-besitzt ein 5'-Phospatende
-besitzt ein 3'-OH-Ende
Base - Nucleosid - Nucleotid

Question 2

Struktur der Basenpaare

Answer 2

zeichne! NTP, dNTP, ddNTP

Question 3

Wie schmilzt DNA?

Answer 3

durch erhitzen oder unter alkalischen Bedingungen

• Auflösen der H-Brücken
• Darstellung: Auftragung der relativen A260 gegen T
• relative A260 erhöht sich so lange, bis DNA einzelsträngig vorliegt
• ist umkehrbar

Question 4

Aufbau der Doppelhelix

Answer 4

-rechtsgängig
Anlagerung eines komplementären Stranges in antiparalleler Orientierung mit Paarung der Basen durch H-Brücken
- zwischen den übereinander gestappelten bp bestehen vdW-WW und hydrophobe-WW
-> Alle Bindungen tragen zur Stabilität bei

Question 5

Helixtypen

Answer 5

–> Die Konformation des Zuckers bedingt die Struktur der Helix
B-DNA
-unter physiologischen Bedingung
-zwei Furchen (groß und klein) wechseln sich ab
A-DNA
-entsteht durch Wasserentzug
Z-DNA
-entsteht in Lösungen mitnhohen Salzgehalt und GC-Gehalt
-linksläufig

Question 6

Was ist Tm?

Answer 6

Schmelzpunkt Tm: liegt bei der halbmaximalen Absorption der Einzelstrang-DNA
-steigt mit zunehmenden GC-Gehalt
>GC-Gehalt stapelt besser und hat mehr H-Brücken
-Mensch DNA: Tm = 86°C
-Pneumococcus DNA: Tm = 85°C
-Serratia DNA: Tm = 94°C