VL 8 - Bacterial regulatory RNAs

Question 1

Wie wird in Bakterien die Transkription reguliert?

Answer 1

• Über: Transkriptionsfaktoren, regulatorische RNAs
• an: Transcription start site

beeinflusst: Menge an Transkript vom Gen

Question 2

Wie wird in Bakterien die Translation reguliert?

Answer 2

• Über: RNA Bindeproteine, regulatorische RNAs

• an: Ribosom binding site, UTRs
⇒ Blockade

beeinflusst: Stabilität der RNA u. Menge an Protein von RNA

Question 3

Was sind Riboswitches?

Answer 3

• Teil (5’UTR) einer mRNA mit Regulatorischer Funktion

• Strukturänderung d. RNA in Anwesenheit von viel Metabolit
⇒ Ribosom erkennt mRNA nicht mehr

Question 4

Was ist ein RNA Thermometer?

Answer 4

• Teil (5’UTR-als Hairpin) einer mRNA mit Regulatorischer Funktion
• Strukturänderung d. RNA bei definierter Temp. ⇒ Ribosom erkennt mRNA nicht mehr

wichtig für pathogene Bakterien

Question 5

Wie welche Arten von ncRNA Regulation gibt es in Bakterien?

Answer 5

• in cis: Gegenstrang zu mRNA ist perfekter antisense Strang zur regulation
• in trans: ncRNA von anderer Stelle im Genom reguliert (Hfq hilft, ncRNA zur richtigen mRNA zu bringen)
• bei Bakterien immer mehrere Gene gleichzeitig transkribiert ⇒ ein Tranksript selektiv deaktiviert (dsRNA ist Signal für Abbau)

Question 6

Über welche RNA können Bakterien die RNA Polymerase regulieren?

Answer 6

über 6S RNA

• imitiert promotor DNA u. bindet an RNA Polymerase ⇒ blockiert (unter schlechten Bedingungen)
• Bei guten Bedingungen transkribiert sich 6S RNA aus d. Polymerase raus (hohe Nukleotidkonzentration)

Question 7

Warum Regulation über RNA statt Protein?

Answer 7

• schneller und billiger (Transkription vs Translation)
• direkt (RNA erkennt Moleküle ⇒ keine Signalisierung erforderlich)
• Spezifität einfach ⇒ über Basenpaarung (Bsp.: Riboswitch ist spezifisch für eigene mRNA)