Virus Flashcards
5 särdrag för virus?
- Viruspartikeln är transportbehållare för överförligt av det virala genomet till en ny värdcell
- Har en antigen av DNA eller RNA
- Saknar maskineri för egen energiproduktion och proteincyntes
- Utnjutjar cellulära system för produktion av sina komponenter
- Nytt virus bildas genom sammansättning av nysyntetiserade komponenter i den infekterade cellen.
- Kan infektera nästan alla typer av celler, till och med bakterier (bakteriofager)
3 huvud struktuer för ett virus
(bara namn)
hölje, kapsid och nukleinsyra
vad är virusets höje?
- Många virus har ett yttersa hölje som kallas envelope.
- Är tvålagrigt av fosfolipider ifrån värdcellens membran.
- Är skydd emot vatten och enxymer
- Är känsligt emot introkning och värme
- Därför lätt att inaktivera
- Inlagt i höljet finns Glykoprpteiner med virusreceptores bindningsställe, liganden
- Finns även strukturer som gör att de kan sammansmälta med andra strukturer
- Vissa komplicerade kan ha jonknaler som hjälper att reglerar dess pH till lokal miljö
- T.ex. ortomyxovirus
vad är ett virusets kapside
(ej de två olika)
- Nukleinsyran skyddas från omgivningen genom ett skal av veckade proteiner som kallas kapsiden.
- Mycket resistent emot variationer i
- pH
- Temperatur
- Kemiska sammanstättningar
- Nukleinsyran och kapsiden = nukleokapsiden
- Kan ha olika strukturer
skillnad på helikal och isokedral?
Helikal
- Kopiser av samma protiern som klär nukleinsyran i en sprial.
- Ger en flexibel struktur
- Ofast enkelsträngar RNA som är negativt (ss minusRNA)
Ikoshedral symmetri
- Bästa för att få maximal volym. En tringel struktur som bildar en sfärisk form
- De olika triangel delarna kallas för Kapsomer
vad finns att säga om virus nukleinsyra?
- Består antingen av DNA eller RNA
- Har särdrag så som:
- Små, kompakta, minimerar sin volymen
- Utnuttjar överlappande lääsramar
- Transkription i båda riktingar
- Introner saknas ofta
- RNA
- mRNA definieras som positiv då dess information direkt kan translateras till protein
- Negativ RNA måste däremot kopieras till en posetiv innan den kan göra så
- DNA
- Negativt DNA är mall för mRNA
vilken är uppdelning vid klassifikation av virus?
För att avgöra vilket virus det är ställer man följande frågor:
- DNA eller RNA?
- Kapsidsymmetri
- Ikosahedreal eller Helikal
- Hölje
- Om det har eller inte har det. Alla helikal har hölje
- Vilket genom de har
- Om det är dubbel eller enkelsträngat. Posetivt eller negativt. Linjärt eller cirkulärt
- Efter de delas de in i baltimorekalss, vilket vi inte ska kunna
- Sedan efter diameter och genomstorlek
skilnad mellan replikation för DNA och RNA?
Replikationen skiljer gör de virus med RNA och de med DNA. Största skillnaden är:
- DNA sker i kärnan
- Kan dra nytta av cellens maskineri för DNA-replikation och transkription
- Gör också att det nya DNA korturläs och där med undviks mutationer
- RNA replikation sker i cytoplasman
- Måste själva ha sitt RNA-polymeras vilket cellen inte bär
- Leder ofta till mutautoner för att det inte korrekturläses
vilka är de 8 stegen för virusreplikation?
bara namn
- adsorption
- penetration
- avklädning
- transkription
- translation
- proliferation av arvsmassa
- assembly
- frisättning (egress)
hur binder virus in till värdcell?
- Virus finner målcell igenom diffusion där slumpen avgör – därför är smittdosen viktig.
- Fäster först ospecifikt igenom aminosyror och socker
- Sedan specifikt med ligander till receptorer
- De finns en stor variation av ligander och receptorer
hur sker penetrationen av ett virus?
När viruset går in i cellen efter ha fäst på receptor. Är olika om det är en höljeformade eller icke-höljeformad.
- Hölje kan sammansmälta, fusera, med cellmembranet eller med endosomens membran.
- Icke höljebärande kan tas upp i en endosom som kan fusera med andra membraner.
hur sker virus avklädning och transport till kärnan?
Många virus genom måste transporteras till cellens kärna innan transkripton och replikation kan påbörjas. I avkapslingen bryts virusets proteinkapsel ner och virusets arvsmassa släpps fri. Det är förmodligen värdcellens egna proteaser som är ansvariga för denna nedbrytning, och förekommer endast hos de som kommer in i cellen som hela virioner, det vill säga växtvirus samt de flesta animala virus.
- Avklädning kan sker direkt efter cellmembranet
- Vandra på mikrotubulin till kärnan där avklädning sker inann den går in i kärnan
- Att den går in som lendosome som vandrar på mikrotubilin – men sedan lämnar
- Att den går in i endosome som sedan lysis och vi tar oss till kärnan där avklädning sker innan vi går in
när DNA kommer till kärnan - vad sker då?
DNA
Kan använda sig av cellens och kärnas maskineri för att göra replikation
- För dubbelsträngat DNA produseras mRNA på vanligt viss, sedan bildas ett protein per mRNA
- För enkelsträngat DNA blir dubbelsträngat för att sedan bli mRNA och efter det proteiner
vad sker när RNA virus kommer till kränan?
Alla, utom retrovirus, måste produsera ett RNA-beroende RNA-polymeras för att möjliöra syntes av nya virusgenom (detta kommer in med viruset). Replikation sker i cytoplasman, utom för ortomyxovirus. RNA virus har enxymer som modifierar den så den får 5’ och 3’ ände – så den liknar mRNA.
- ssRNA+ motsvaret ett vanligt mRNA
- ssRNA- måste först kopiera strängen med ett RNA-polymeras så den blir mRNA.
hur sker frisätningen av ett nytt virus?
Frisläppandet av nya viruspartiklar sker på olika sätt beroende på om viruset är naket eller höljeförsett. Nakna virus släpps ut ur värdcellen när den dör (lyserar) då cellmembranet brister, och viruspartiklarna frigörs. När däremot ett virus med hölje ska lämna cellen måste viruspartiklarna kläs i ett membranhölje. Det får viruspartikeln när den knoppas av cellmembranet genom exocytos.
skillnad på lytic och lysogenic?
En cell som blir infekterad av virus kan antigen gå igenom den Lytic cykel eller den lysogenic.
- Lytic
- Virus infekterar è gör virusprotein som bildar nya viruspartiklar
- Cellen lyserar och dör è nya partiklarna åker ut och kan infektera ny cell
- Lysogenic
- Viruset går in i kärnan men gör inget mRNA för nya protiner. Den ligger bara där och väntar – latent.
- Denna cell kan dela sig och föra över viruset till nya celler
- Den kan också aktiveras då värdcellens miljö eller hälsa ändras – den påbörjar då lytic cykel.
hur är ett influensa virus uppbyggt?
Består av enkelsträngade minus-polariserade segmenterade, helikala, höljebärande RNA virus (-ssRNA). Strukturen skiljer A och B där A har 8 RNA segmentoch B har 7. Dessa segment har egna kapsider och polymeraskomplex. De ligger som RNP som är omgivna av ett lipidhölje. Har även 3 proteiner i höljet
- Hemagglutinin (H)
- Receptor bindande
- Nueraminidas (N)
- Receptor förstörare
- Jonkanalen (M2)
hur sker replikation av inflensa?
- Viruset H binder till sialinsyra på cellens yta
- Recepornedbrantade effekt hos N gör så inte muciner bindrar virus att nå målcellen
- Viruset tas upp i endocytosblåsa
- Är ända RNA-viruset som replikeras i cellkärna.
- De viralaRNA(-) åker in. RNA-polymeras hos viruset gör om det till mRNA.
- Translation sker och vi går nya virus
- Vid frigöring så fuserar de med väggen och bildar ett höje
hur går herpesreplikation till?
- Omedelbara
- Först så fäster viruset på receptor och går in och släpper ut sitt DNA i kärnan.
- mRNA görs och åker ut och bildar alfa-proteiner
- Tidiga
- A-protinerna åker in i kärnan och transkrption sker
- Ut kommer mRNA som de bildas Beta-proteiner ifrån
- Sena
- Beta-protinerna går in och binder till konkatemert DNA (långt DNA med kopier av samma DNA)
- Kan nu bilda viruset som går ut i ER och sedan via golgi ut ur cellen
vad är kopplingen mellan latent och herpes?
Viruset tas upp i epitelceller vid slemhinnan och munnen De åker med axonen (utan hölje) till perifera never och till ryggmärgen. När vårt immunförsvar är nedsatt så blossar de upp och åker tillbaka ut till epitelet
