Virus Flashcards
vrai ou faux? les virus sont des parasites intracellulaires obligatoires. Et qu’est-ce que ça veut dire?
vrai, ça veut dire qu’il doit absolument être dans une cellule vivante pour se multiplier: à l’extérieur, il est inerte.
la coque protéique des virus peut posséder de l’ADN et de L’ARN
Faux ADN ou ARN
(un des deux, pas les deux)
Comment se nomme la forme d’un virus qui est extracellulaire donc métaboliquement inerte et potentiellement infectieux?
le virion
avec quel microscope on observe les virus?
électronique
d’ou le virus tire-t-il les élements necessaire à sa multiplication?
d’une cellule vivante
voir p.28 pour schéma de la structure d’un virus
le génome d’un virus est monocaténaire ou bicaténaire et linéaire ou circulaire
vrai
Entre la réplication du génome ARN ou ADN laquelle est la moins fidèle? Et qu’est-ce que ‘‘moins fidèle’’ veut dire?
ARN, car il ne contient pas le gène de contrôle pour supprimer les mauvaises copies.
Ca veut dire qu’ils y a plus d’erreur de multiplication donc plus de mutations et plus d’apparition de souches
quelle enzyme permettent aux bactériophages de faire l’hydrolyse (décomposition) du peptidoglycane pour attaquer les bactéries.
Quels deux autres enzymes peuvent être présentes chez les virus
lyzozymes
transcriptase incerse
ADN polymérase
comment les virus ARN peuvent entrer dans des cellules ADN?
avec la transcriptase inverse qui change l’ARN en ADN
la capside est de nature___ et quel est son rôle
nature protéique
rôle: protection autour de l’acide nucléique (ADN ou ARN)
acide nucléique + capside=
nucléocapside
sous unités protéiques de la capside s’appellent:
capsomères
a)2 types de structures de capsides
b)3ème chez les bactériophages
a-hélicoidale et polyédrique (ou icosaédrique)
b-structure complexe
les virus respiratoires (grippe, rage, oreillons, rougeole, mosaique du tabac) ont une capside de quelle forme?
hélicoidale
un exemple de virus icosaédrique
poliovirus
l’enveloppe entour quelle partie du virus
nucléocapside
les enveloppe sont complètement faite par le virus avec ses éléments. Vrai ou Faux
Faux, ils proviennent de la membrane de la cellule hôte. Les glucides et lipides viennent de l’hôte, mais les glycoprotéines des spicules sont codées par le virus
les spicules (péplomères) servent à quoi?
permettent la fixation du virus à la cellule hôte. On peut identifier les virus grâce à leur spicule. (spicules=clés)
les influenzavirus s’attachent aux cellules sanguines érythrocyte (hématie) et forment des ponts entre eux. Comment se nomme ce phénomène?
l’hémagglutination
Pour les virus de la famille des Herpesviridae, l’assemblage de la capside et du génome se fait dans le noyau et le virus sort de la cellule par exocytose. Comment on nomme cela?
bourgeonnement au niveau de la membrane cellulaire
Vrai ou Faux? les virus nus sont plus résistants que ceux enveloppés. Explique la réponse
Vrai
les virus enveloppés sont plus fragile car la membrane dont ils dérivent l’est. Il sont plus facilement dégradés dans le tube digestif et le milieu extérieur (on les retrouvent pas dans les selles, eaux usées). Les virus nus résistent à l’acidité, aux enzymes digestives, à la dessiccation et température
Vrai ou Faux? La capsule est faite de protéines donc elle est plus résistance: moins de risques de perdent ses spicules
vrai, et au contraire, pour les virus enveloppés, puisque l’enveloppe est fragile, plus susceptible de perdre les spicules (clés)
Quels virus peuvent se retrouver dans les selles et favoriser contamination fécales-orales
virus nus
Qu’est-ce qui inactive les virus enveloppés dans le milieu extérieur
la température et la dessication
le virus de la grippe est enveloppé ou nu?
enveloppé, on le retrouve pas dans les selles
Qu’est-ce qui favorise la survie du virus de la grippe dans l’air? comment se transmet-il?
l’humidité
se transmet par goutellettes de salives ou par objets contaminés.
endroit clos, confiné avec bcp de gens favorise la transmission
comment se fait la transmission de la polyomyélite et des entérovirus?
contact direct interhumain, mais surtout par voie fécale-orale par les selles contenant le virus, mains sales ou aliments/eau contaminés
selon quels facteurs sont regroupés en famille les virus?(4)
-nature de l’Acide nucléique(ARN ou ADN simple ou double)
-mode de réplication
-morphologie-type de capside (cubique, hélicodale, complexe)
-parfois l’absence ou présence d’enveloppe
les membres d’une même familles ont quels éléments en commun
1-morphologie (type de capside)
2-structure du génome
3- (et/ou) stratégie de réplication
nom de famille se terminent par ___ et le genre par ___
-viridae
-virus
Différence entre ARN- et ARN +
ARN- : doit être transcrit en ARN messager avant d’être traduit
ARN +: peut faire protéines direct sans ARN messager
voir p.33 pour comment classer les virus
Vrai ou Faux? on peut quantifier les virus en mesurant les effets sur les cellules de l’hôte
Vrai
Vrai ou faux? on peut compter directement les virus ou dénombrer les unités infectieuse
Vrai
comment on effectue la culture des bacétriophages?
on réalise une culture bactérienne, puis on dépose les phages. Si une plage de lyse est présente, le virus a fait un infection.
Vrai ou Faux? Chaque plage de lyse vient de la réplication d’un seul virus
Vrai, chacune correspond a un virus de la suspension initiale
Le nombre d’UFP nous donne de l’info sur quoi?
sur le nombre de virus présents dans l’échantillon initial
Vrai ou Faux? On ne doit pas faire de dilution quand il s’agit de trouver le nombre de virus dans un échantillon.
Faux on doit faire un dilution pour obtenir des plages de lyse espacées
Vrai ou Faux? les virus d’une même plage de lyse sont pas nécessairement génétiquement identiques
Faux, les virus d’une même plage de lyse sont génétiquement identiques.
comment on peut obtenir des lignées virales pures
en prélevant des virus d’une même plage de lyse et en les inoculant dans une culture bactérienne fraiche
Vrai ou Faux ? la culture de certains virus animaux sur les cellules n’est pas efficace et il faut alors utiliser des animaux vivants
vrai
quel type de culture est utilisée pour produire des vaccins
culture sur oeuf embryonné (on injecte une suspension virale dedans)
Quelle méthode de culture est plus pratique que celle sur oeuf embryonné
culture dans les cellules, on les multiplie et on les manipule comme des cultures bactériennes
quelles sont les étapes de la culture de virus dans les cellules?
-tissu traité avec enzymes qui séparent les cellules
-cellules misent en suspension dans un milieu de culture
-cellules normales au fond, cellules transformées forment un amas et peuvent être maintenus pour conserver les virus (car elles se multiplient indéfinimment)
quelles sont les trois méthodes d’identification et de diagnostic de virus ?
ELISA
sérologie
PCR
en quoi consiste la méthode ELISA?
méthode qui révèle la présence d’anticorps en utilisant des enzymes.
les anticorps reconnaissent des antigènes spécifiques du virus pour les bloquer. donc par exemple, si on trouve l’anticorps contre l’antigène du VIH, on sait que la personne a le VIH.
Quels sont les étapes de la méthode ELISA? Qu’est ce qu’on fait entre chaque étape?
1-fixation de l’Antigène
2-rajoute le sérum du patient (liaison de l’anticorps spécifique à l’antigène du patient)
3-ajout d’anticorps secondaires avec enzyme qui se lient à l’anticorps spécifique du patient
4-ajout d’un substrat pour l’enzyme qui produit un changement de couleur
***un lavage entre chaque étape
quel est le principe de la sérologie et quel est le facteur limitant de cette méthode?
on mesure le taux d’anticorps (protéines) dans le sang
il faut attendre que l’organisme atteint ai fabriqué des anticorps, ce qui peut prendre des semaines
en quoi consiste la méthode PCR?
a amplifier l’ADN, par exemple d’un virus, pour le détecter (si on a un virus ARN, on utilise la transcriptase inverse pour le transformer en ADN d’abord)
Les étapes du cycle de multiplication des virus
1-phase d’adsorption (reconnaissance, puis fixation) et de pénétration
2-synthèse (duplication du génome et des protéines virales)
3-maturation (assemblage de nouveau virions, les protéines de la capside entourent) et libération
nomme les 2 types de bactériophages
phages tempérés (modérés) avec cycle lysogénique (lambda) et phages virulents avec cycle lytique
les phages de type T on un cycle…
lytique
Qu’est-ce que l’adsorption pour les bactériophages
l’attachement du virus à la bactérie grâce a des protéines externes qui interagissent avec les recepeteurs spécifiques de l’hôte. Pour Type T: utilisent fibres à l’extrêmité de leur queue
explique la pénétration pour le cycle lytique
le lysozyme détruit et perce la paroi bactérienne (peptidoglycane). le génome viral est injecté et la capside reste à l’extérieur. Le génome se cyclise et détruit le génome bactérien
explique la synthèse pour le cycle lytique
L’ADN génomique sert de matrice pour la synthèse des ARNm pour ensuite faire des protéines virales (de structure, d’assemblage et de lyse et libération)
explique la maturation et libération pour le cycle lytique
rappel: bactérie=procaryote donc pas de noyau
maturation: L’ADN et la capside sont assemblés: tête et queue montés séparémment et L’ADN ensuite inséré dans
tête
libération: les nouveaux phages sont libérés par lyse bactérienne (grâce à lysozymes) par les virus dans l’hôte. la bactérie hôte meurt
diff entre cycle lysogénique et lytique
lysogénique n’entraine pas la mort de la bactérie. L’ADN phagique s’intègre dans le chromosome bactérien et reste latent.
Qu’est-ce qu’un prophage
l’ADN d’un phage intégré dans l’ADN bactérien qui reste latent
vrai ou faux? un prophage peut éventuellement produire de nouveaux phages
vrai
Vrai ou Faux? une bactérie avec un prophage ne transmet pas l’ADN du virus aux bactéries filles
Faux, le prophage se multiplie avec la cellule hôte.
comment se fait le passage du prophage d’un état latent à un état actif
par stimulation ou induction.
L’ADN du phage s’excise et amorce un cycle lytique
un bactériophage lambda peut seulement avoir un cycle lysogénique. Vrai ou Faux?
Faux, lysogénique ou lytique (si le prophage devient actif)
que désigne le terme lysogénie?
l’état d’une bactérie qui porte un prophage
Les conséquences de la lysogénisation?
-la cellule hôte est immunisée contre un infection du même phage
-elle peut devenir plus virulente (on peut trouver des gènes de production de toxines qui viennent du virus)
-possibilité de transduction locale(transfert de certains gènes d’une bactérie à une autre par l’intermédiaire de virus bactériophage)
diff entre la pénétration d’un bactériophage et d’un virus animal
bactériophage:
-fait un trou dans la paroi bactérienne pour injecter sin génome
virus animal: par endocytose ou fusion (virus pénètre au complet)
ou se fait l’adsorption pour les virus animaux
sur un site de reconnaissance (spicule=clé et recepteurs=serrure)
vrai ou faux?Pour pénétrer dans une cellule, les virus enveloppés peuvent faire la fusion et l’endocytose alors que les nus peuvent juste faire l’endocytose
vrai
Vrai ou Faux? Dans la pénétration par fusion (juste pour les virus enveloppés), l’enveloppe reste attachée à la membrane et c’est la nucléocapside qui est libérée dans le cytoplasme
Vrai
Qu’est-ce que la décapsidation?
La capside est dégradée dans le cytoplasme par des lysozymes synthétisés dans la cellule hôte. libération de l’ADN viral et sa migration vers le noyau de l’hôte.
explique la réplication du génome (synthèse) des virus Animaux ADN:
ou a lieu la réplication de l’ADN virale, comment sont faites les enzymes de réplication, ou se fait la synthèse de la capside et autres protéines, ou se fait l’assemblage?
Quelle est la différence avec virus animaux ARN?
-réplication de l’ADN dans le noyau en se servant d’enzymes virales
-pour faire les enzymes (protéosynthèse), gènes précoces transcrits en ARNm, puis traduits en enzymes de réplication
-capside et autres protéines synthétisés dans le cytoplasme
-assemblage d’ADN et protéines dans le noyau
-lyse et libération des virus après ça
différence: pour l’ARN, la réplication se fait dans le cytoplasme de la cellule hôte
nomme le mode de libération des virus animaux
bourgeonnement
la cellule hôte meurt-t-elle après que des virus soient libérés par bourgeonnement (virus enveloppés)?
non, elle continue à se multiplier en libérant des virus
comment se fait la libération des virus animaux nus?
lyse donc entraine la mort de la cellule hôte
particularité du virus de l’herpes
assemblage se fait dans le noyau, acquiert une membrane dérivée de la lamelle interne du noyau. virus passe dans réticulum et une vésicule le transporte jusqu’à surface ou il est libéré par lyse
Que sont les retrovirus et donne un exemple
des virus avec ARN + monocaténiare qui possèdent la polymérase transcriptase inverse. ex: VIH
comment se fait l’assemblage et la libération chez les rétrovirus?
1-spicules s’attachent à récepteurs spécifiques
2-pénétration PAR FUSION
3-décapsidation libère ARN et protéines dans cytoplasme
4-double brin d’ADN viral synthétisé dans cytoplasme avec la transcriptase inverse
5-intégrase incorpore l’ADN viral à l’ADN cellulaire
6-ADN viral ne s’excise jamais du chromosome s’appel provirus
7-reste latent et se réplique en mm temps que ADN ou entame un nvx processus de synthèse(transcription de l’ADN en ARNm, puis synthèse enzymes et protéines)
-libération par bourgeonnement
Qu’est-ce qu’un provirus
ADN viral qui ne s’excise jamais du chromosome, chez rétrovirus
voir schéma pour le VIH p. 42
nomme 4 mécanisme d’action des médicaments contre les virus
1) inhibiteur de fusion:
empêchent l’entrée des virus dans les cellules cibles (étant les lymphocytes pr VIH)
2) inhibiteur de la transcriptase inverse: empêche la transcription de l’ARN en ADN donc l’intégration du génome viral à celui de la cellule hôte
3) antiprotéase:
empêche les traduction donc altère la fabrication des protéines du virus
4) interleukine: n’agissent PAS sur le cycle de réplication du virus, mais améliorent la réponse du patient
nomme les virus respiratoire et s’il sont ADN ou ARN.
influenza virus
Coronavirus (SRAS, MERS)
virus respiratoire syncitial
entérovirus (système digestif)
rhinovirus
***ils sont tous ARN
ou se fixent les virus respiratoires en général?
sur les cellules épithéliales des voies respiratoires
que cause le virus de la covid-19? ou se fixe-il?
-une réaction inflammatoire excessive (tempête de cytokines, médiateurs chimiques)
-il se fixe sur l’enzyme de conversion de l’angiotensine (nécessaire pour réguler pression artérielle) sur face externe des cellules du système respiratoire, digestif et vasculaire. Peut aussi affecter système nerveux.
Quel virus a la structure suivante: forme ronde à ovale avec halo de péplomères, protéines de surface (spikes)
coronavirus
quelles sont les 4 protéines structurales du coronavirus
protéines S (spike) ayant affinité élevée pour ACE2
-Protéines E et M qui font parti de l’enveloppe
-Protéine N qui forme la nucléocapside qui protège l’ARN
le coronavirus est-il nu ou enveloppé?
enveloppé, donc fragile et facile à détruire par le savon
a quoi est du le cancer?
a une multiplication anarchique de cellules dans un organisme multicellulaire.
qu’est-ce que des oncogènes
des gènes ayant subi des modification d’ADN et qui causent le cancer
Qu’est-ce que la métastase?
quand les cellules cancéreuses maligne se répandent dans le corps
comment les virus oncogènes agissent? Les cellules subissent une ___
ils intègrent leur génome dans l’ADN cellulaire de l’hôte, semblablement à un provirus/prophage (lysogénique)
-transformation
le virus d’Epstein-Barr, l’Herpès virus 8, l’Hépatocarcinome et le VPH sont des exemples de virus______
oncogènes (ADN)
Pour les virus ARN quelle est la seule famille qui provoque un cancer? Quel type de cancer ces virus provoquent?
Retrovididae
leucémie (cellules T et cellules chevelues)
les virus peuvent agir par leur…
oncogènes
Quelles sont les protéines que les virus oncogènes bloquent? De quoi chacune est-elle responsable?
TP53 et RB
les deux sont responsables de réguler le cycle cellulaire et de réparer l’ADN
TP53: reponsable de la mort cellulaire programée (apoptose) en cas de lésion de l’ADN
RB: empêche hyperprolifération des cellules
Que se passe-t-il si TP53 et RB sont inactivés?
la cellule accumule les mutations et se transforme en cellule cancéreuse
Quels sont les cinq différents types d’infections virales?
1-infection aigue
2- infection persistante
3-infection latente
4-infection chronique
5-infection transformante
caractéristiques de quelle type d’infection?:
-augmentation du taux de virus est graduelle sur de longues périodes
-infection à virus lent
-habituellement fatale
-VIH/sida
persistante
caractéristiques de quelle type d’infection?:
-persiste chez l’homme, parfois tt sa vie, en étant dans un état de latence
-virus pas éliminé par système immunitaire (virus invisible à ce dernier)
-stimuli peuvent actionner le virus
-faible effet cytopathogène
-latente
caractéristiques de quelle type d’infection?:
-virus est en permanence dans l’organisme et détruit peut à peu ses cibles
-génome viral maintenu chez l’hôte
-réponse immunitaire insufisante ou inadaptée
-production continue de particule virale
infection chronique
caractéristiques de quelle type d’infection?:
-infection aboutit à la formation de tumeurs
infection transformante
Queltype d’infection? virus se déclare rapidement durant un temps court
-virus éliminé par système immunitaire
-symptomatique ou asymptomatique
-infection aigue
Qu’est-ce que les prions?
des protéines qui adoptent une forme nouvelle
Qu’Est-ce que les prions entrainent ?
la spongiose du tissu nerveux: l’encéphalite spongiforme bovine (ESB) et la maladie de Creutzfeldt Jacob.
(ils entrainent la formation d’autres prions (PRPc en PRPSc) qui se réplique à l’intérieur d’un neurone qui éclate, puis scrapie)
Symptomes des maladies humaines a prions
dépression, perte de coordination motrice, démence
les méthodes physiques pour lutter contre les virus
chaleur
filtration
basses températures
haute pression
dessiccation
pression osmotique
rayonnement
Qu’est-ce que la valeur d’inactivation thermique
la température qui détruit tous les microorganismes d’une culture liquide en 10min (constante=temps, variable=bactérie)
Qu’est-ce que le temps d’inactivation thermique?
temps nécessaire, à une température donnée, pour détruire toutes les bactéries d’un milieu. (variable: temps
cst: température)
Qu’est-ce que le temps de réduction décimale?
temps pour réduire bactéries de 90% pour une température donnée
différence entre chaleur humide ou sèche
(voir ndc pour détails) CHALEUR HUMIDE: entraine dénaturation des protéines
-autoclave: vapeur d’eau sous pression
-pasteurisation
rapide à haute température : conservation au froid
ultra haute température: conservation température pièce pendant de longues période
CHALEUR SÈCHE (four bruleur): flambage d’une anse de repiquage, incinération de produits contaminés. chaleur se transmet moins facilement
la basse température peut tuer toutes les bactéries
Faux, elle a un effet bactériostatique et pas sur les psychrotrophes ou psychrophiles
Comment la haute pression est efficace contre les virus?
change structure moléculaire des protéines et des glucides (mais pas efficace contre ensdospores)
Une tumeur est une masse de tissu résultant de ____ (multiplication anormale de nouvelles
cellules).
néoplasie
que se passe-t-il aux microorgansimes s’il n’y a pas d’eau?
ils peuvent pas croitre mias deumeurent viables
Qu’est-ce que la lyophilisation
. La
lyophilisation consiste à déshydrater et congeler les bactéries pour les conserver durant une longue
période
comment controler la pression osmotique?
-ajout de sucre ou de sel
Comment les rayonnements se débarassent des virus
Dommages des acides nucléiques
- Rayonnement non ionisants - UV : les plus utilisés.
- rayonnements ionisants X et γ : les plus efficaces; moyen idéal de stérilisation à froid
Vrai ou Faux? La pluspart des facteurs physiques permettent de diminuer la population bactérienne sans assurer une stérilisation
Faux, c’est vrai pour les facteurs chimiques
Quelles sont les deux méthodes pour évaluer l’efficacité d’un agent antimicrobien?
diffusion sur gélose et dilution en bouillon (pr déterminer CMI)
Quel est le genre de bactéries qui produisent bcp d’antibiotiques naturels
Streptomyce
A quelles structures les agents antimicrobiens s’attaquent-t-ils?
paroi
membrane plasmique
protéines cytoplasmiques
acides nucléiques
ribosomes
nomme les 4 stratégies de résistance aux antibiotiques
1) inactivation des enzymes: pénicilines ou céphalosporines peuvent être détruits par des B lactamases
2) blocage de la pénétration dans la cellule. paroi des G-, peut juste passer par porine a cause membrane externe
3)modification de la cible(serrure), donc l’antibiotique peut plus pénétrer
4) expulsion de la substance antimicrobienne (pour les G-, c’est par pompe membranaires)
