Viral klassifikation Flashcards
Hvor mange familier af DNA virusser er associeret med menneskelig sygdom?
7
Hvor mange familier af RNA virusser er associeret med menneskelig sygdom?
Mindst 13
Hvad er størrelserne for de mindste og største vira?
18 nm - 300 nm
Beskriv opbygning af en virus partikel
Genomet er pakket ind i en proteinkapsel = nucleokapsid
Der kan være en kappe med glykoproteiner omkring nucleokapsid, eller det kan være ikke-kappebærende
Virussen har viral attachment proteins som hjælper dem med at sætte sig fast til værten
Hvad er virionet modstandsdygtig over for hvis den ikke har en kappe?
Udtørring, detergenter, kogning samt andre hårde miljø bl.a i mavetarmkanalen og kloakvand
Hvad sker der med virus med en kappe hvis de er i et ikke-vandigt miljø?
De udtørres
Hvordan transmitteres ikke-kappebærende virus?
Fækalt-oral
Hvordan transmitteres kappebærende virus?
Via blod, dråber og væv
Hvilke former kan nukleokapsidet have?
Helical
Icosahedral
Beskriv helical-formet nucleokapsid
De helicale opstår som stave der i forlængelse af hinanden forlænger genomet og dækker alt arvemateriale
Beskriv icosahedral-formet nukleokapsid
En kugle der består af symmetriske subunits
Beskriv strukturen af en membrankappe
Består af lipider, proteiner og glykoproteiner
Strukturen minder som en cellemembran, dog sjældent med membranproteiner
De fleste er runde eller pleomorfe
Mange viral glycoproteiner har N-linked (asparagine) kulhydrat som skyder sig gennem kappen og danner et spikeprotein. De kan bruges som VAP til at binde target celler
Har membrankappen membranproteiner?
Nej
Har membrankappen glykoproteiner?
Ja
Består membrankappen af lipider?
Ja
Består membrankappen af proteiner?
Ja
Hvad er asparagine-linked kulhydrat på virus-overfladen?
Spikeprotein
Hvad kaldes viral attachment proteins (VAPs) som binder til erythrocytter?
Hæmagglutininer
Hvad er hæmagglutininer?
VAPs som binder til erythrocytter
Hvilke typer vira har altid en membrankappe?
Negative sense RNA vira
Har negativ sense RNA vira altid en membrankappe?
Ja
Hvad hedder rummet mellem membrankappen og nukleokapsidet?
Tegumentet
Findes tegumentet på alle virioner?
Nej, kun på virioner med en kappe
Hvilke former for genomer kan virioner have?
ssRNA
dsRNA
ssRNA
dsDNA
Hvilke strukturer kan virus genom antage?
Linært
Cirkulært
Segmenteret
Er der extrons i virus-genom?
Ja
Er der introns i virus-genom?
Nej
Hvilket slags genom har herpes virus?
dsDNA
Hvilket slags genom har papilloma virus?
dsDNA
Hvilket slags genom har adeno virus?
dsDNA
Hvilket slags genom har parvo virus?
ssDNA
Hvilket slags genom har hepadna virus?
Reverse transcriptase dsDNA
Hvilket slags genom har corona virus?
+ ssRNA
Hvilket slags genom har picorna virus?
+ ssRNA
Hvilket slags genom har flavi virus?
+ ssRNA
Hvilket slags genom har ortomyxo virus?
- ssRNA
Hvilket slags genom har paramyxo virus?
- ssRNA
Hvad er de overordnede steps i virus livscyklus?
Fasthæftelse Entry mRNA produktion Protein produktion Self-assembly Frigivelse
På hvilke måder kan virus komme ind i cellen?
Ved endocytose eller membran-fusion
Beskriv endocytose for virus
Virion binder til receptor i cellemembranen
Der sker invagination af membranen
Der dannes en endocytotisk vesikel
Virion frigives ind i cellen
Beskriv membran-fusion for virus når den skal ind i cellen
Kappe-bærende virus binder til receptor på cellemembranen
Kappen fusionerer med cellemembranen
Nucleokapsidet kommer ind i cellen
På hvilke måder kan virus kommer ud af værtscellen?
Ved budding, exocytose og lysis
Beskriv budding for virus
Virus-specifkke glykoproteiner produceres og transporteres til værtens cellemembran
Den cytoplasmiske del af glykoproteinet binder til nukleokapsidet
Beskriv exocytose for virus
Virus-glykoproteiner dannes i endosomer fra endoplasmatisk reticulum
Nukleokapsidet fusionerer med endosomet, så der dannes en kapsel omkring virus-genomet. Dette dannes nukleokapsidet, som nu findes i exosomet. Dette transporteres til overfladen og sendes ud af cellen
Beskriv lysis af værtscellen for virus
Virionet inducerer værtscellen til at lysere, således at de mange nyligt-producerede virioner kommer ud af cellen
Nævn 4 typer virus medieret patogenesen
Lysis
Transformering
Cytopatogen effekt
Celle-celle fusion (syncytie)
Beskriv hvordan virus kan give immunmedieret skade på værten
Cytokin og IFN frigivelse giver feber og muskel- og ledsmerter
DAMP frigivelse giver øget inflammation og cytokiner
Cytotoksisk drab giver smerter
Hvilke cytokiner giver feber?
TNF-alfa
IL-6
IL-1-beta
Hvilken slags cytokin giver muskel- og ledsmerter?
IFN
Hvordan manifesterer virus-medieret gastroenteritis?
Ses primært hos mindre børn
Giver opkast, diarré, mavesmerter og feber
Beskriv norovirus: familie, genom, smittevej, hvor det inficerer og forurener, symptomer
Caliciviridae \+ ssRNA Fækal-oral smitte Inficerer epitel i tyndtarm Forurener mad, drikke og overflader 24-48 self-limited Give opkast og vandig diarré
Beskriv rotavirus: familie, genom, hvor det inficerer, symptomer, konsekvenser
Reoviridae
dsDNA segmenteret
Inficerer epitel i tyndtarmen
Give opkast og mild til alvorlig vandig diarré uden blod
Kan medfører alvorlig dehydrering og tab af elektrolytter
Beskriv adenovirus: familie, genom, kappe?, hvor den inficerer
Adenoviridae
dsDNA
Ikke-kappebærende
Inficerer gastrointestinalt eller i luftvejene
Kan give gastroenteritis, forkølelse, konjunktivitis
Kan give pneumoni i immunsvækkede individer
Beskriv patogenesen af virus-medieret gastroenteritis
Virus inficerer epitel i tyndtarm, primært jejunum
Giver histologiske ændringer som forkortning og atrofi af villus, som giver nedsat overfladeareal af tyndtarmen
Fordøjelsesenzymer, som disaccharidaser, der normalt dannes i brush boarder er nedsat
Giver malabsorption så bl.a. sukker ikke absorberes, hvilket giver diarré grundet den hyperosmotiske effekt
Beskriv symptomer ved forkølelse
Ingen eller lav feber Løbende næse Mild hoste Mindre smerte, utilpashed og træthed Øm hals
Beskriv symptomer ved influenza
Høj feber Hoste Smerte og generel utilpashed Træthed (udmattelse) Ofte hovedpine
Beskriv rhinovirus: familie, genom, kappe?, smittevehe
Picornaviridae
+ ssRNA
Ingen kappe
Smitter gennem aerosoler og håndkontakt
Beskriv patogenesen for rhinovirus
Virus invaderer mucosa i luftvejene
Virus replicerer og giver sekret med mange virioner i, så infektionen spredes
Antistoffer og IFN angriber virioner så infektionen slutter og epitelet regenererer
Beskriv human corona virus: familie, genom, kappe?
Coronaviridae
+ ssRNA
Lipidmembran (kappebærende)
Beskriv parainfluenzavirus: familie, genom, kappe, sygdomme
Paramyxoviridae
- ssRNA
Ikke-kappebærende
Kan give bronkiolitis, pneumoni og falsk strubehoste hos børn
Beskriv respiratory synsytial virus (RSV): familie, genom, kappe?, sygdom, patogenese
Paramyxoviridae
- ssRNA
Ikke-kappebærende
Giver mild forkølelseslignende sygdom, bronkiolitis, pneumoni og falsk strubehoste
Danner syncytier i epitelceller og giver immunmedieret celleskade, som giver nekrose og obstruktion i luftvejene
Beskriv SARS-CoV-19: familie, smittevej, sygdom, patogenese
Coronaviridae
Smitter gennem aerosoler og håndkontakt
Give oftest mild forkølelse hos børn og unge, og influenza hos voksne og ældre
Immunmedieret celleskade, som fører til nekrose og obstruktion i luftevejene (cytokin release syndrome)
Beskriv papilomavirus (HPV): familie, hvor den inficerer, sygdom, effekt på celler
Papillomaviridae
Inficerer epitel, hud og slimhinder
Kan give 3 typer vorter: alm. hudvorter, flade og kønsvorter (kondylomer)
Kan føre til transformering af cellerne, som kan give malign sygdom bl.a. livmoderhalskræft
Beskriv hvilke familier Hepatitis A-E tilhører
A: Picornaviridae B: Hepadnaviridae C: Flaviviridae D: Deltaviridae E: Hepeviridae
Hvilke vira kan give encephalitis og meningitis?
Herpesvirus, enterovirus og arbovirus
Beskriv poliovirus: familie, genom, kappe?, hvor den inficerer og patogenese
Picornaviridae \+ ssRNA Ikke-kappebærende Inficerer tarm-epithel Spreder sig til blodet og senere til CNS
Beskriv patogenese af poliovirus
Virus inficerer i mucosa mavetarmkanalen. Herfra kommer den til lymfeknuder og videre til blodet. Her kan den fortsætter til ekstraneuralt-væv eller ligge sig i den motoriske endeplade. Den kan så lige i rygmarven og fortsætter til hjernen
Beskriv rabies: familie, genom, kapsid-form, reservoir, symptomer
Rhabdovirus - ssRNA Spiralformet-kapsid Rovdyr Hovedpine, utilpashed, føle- og synsforstyrrelser, feber, koma
Beskriv patogenese ved rabies
Infektion ved bidstedet, hvorfra virus går i musklen, til PNS, rygmarven (lumbosakral dorsal root ganglion), hjernen og slutteligt til øjne og spytkirtler
Hvilket ganglion ligger rabies infektion sig i?
Det lumbosakrale dorsal root ganglion
