Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Tillväxt Och Degeneration > Vecka 1+5 - Translation och translationell kontroll (27.08.14 och 19.09.14) > Flashcards

Vecka 1+5 - Translation och translationell kontroll (27.08.14 och 19.09.14) Flashcards

1
Q

Vilket RNApol syntetiserar rRNA?

A

RNApol I

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Vad består ribosomens två subenheter av? (2 saker)

A
  • Proteiner
  • rRNA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Ribosomen består av två underenheter. Vilka?

A
  • Stora subenheten 60S
  • Lilla subenheten 40S
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vad är det för något som “shuttlar” de enskilda aminosyrorna till Ribosomen och mRNA?

A

tRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hur dekodas informationen i mRNA av tRNA? Dvs. vad är det som bestämmer vilken aminosyra som skall komma vart? (3 saker)

A
  • mRNA avkodas i tripletter
  • tRNA har ett s.k. antikodon bestående av 3 baser som basparas mot mRNA.
  • Tripletten motsvarar en aminosyra.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vilket kodon (i mRNA) anger translationens start och vilken aminosyra kodar den för?

A

AUG - Metionin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vilka fyra kodon ger stop-kodon?

A
  • UGG
  • UGA
  • UAG
  • UAA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Påv vilket site på ribosomens stora subenhet är det som inkommande tRNA molekyler dockar?

A

A-site (Amino-acid)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Ribosomens stora subenhet har tre olika sites för tRNA. Vad heter de?`

A
  • E - Exit
  • P - Peptide
  • A - Amino acid
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vilken subenhet i ribosomen binder mRNA till?

A

Lilla subenheten 40S

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

När translationen först skall initieras, är det en av ribosomens subenheter som laddas med ett antal faktorer. Vilken?

A

Lilla subenheten 40S laddas med faktorer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Tre “laddningsfaktorer” förs över till ribosomens lilla subenhet. Vad kallas komplexet?

A

Preinitieringskomplexet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Preinitieringskomplexet byggs upp av 3 “laddningsfaktorer” fästa till 40S. Vilka?

A
  • eIF1A
  • eIF2-GTP
  • Met-tRNA

(Eukaryote Initiating Factor)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

I vilket skede binds mRNA till Ribosomen?

A

Strax EFTER att preinitieringskomplexet har bildats och FÖRE stora subenheten ens har bundit till.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

I initieringen av translationen, vad händer efter att mRNA har bundit in till lilla subenheten 40S?

A

Lilla subenheten börjar scanna mRNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vad är det som 40S scannar efter?

A

Start translation-sekvensen AUG.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Vad händer när 40S hittar start-translation sekvensen AUG?

A

Alla initieringsfaktorer lossnar från mRNA och lilla subenheten.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Det, att initeringsfaktorerna lossnar från 40S och det bundna mRNA:t är en förutsättning för…

A

..att stora subenheten 60S skall kunna binda in till 40S.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Rita en bild för hur initieringen av translationen går till!

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Om en cell får en signal för tillväxt via PKB -> mTOR -> S6K, kommer S6K att fosforylera ribosomen. Hur påverkas ribosomen? Vad är konsekvenserna av detta?

A
  1. Fosforyleringen gör att ribosomen blir bättre på att scanna pyrimidinrika 5’-UTR och således hitta start-translation-sekvensen snabbare. Vanligtvis kan den hacka lite.
  2. Detta leder till effektivare proteinsyntes.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Vad innebär det att lilla subenheten 40S “laddas”?

A

Att preinitieringskomplexet bildas på lilla subenheten.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Elongering vid translationen börjar när 40S har scannat fram till start-translation-sekvensen och 60S har bundit in till 40S för att skapa den kompletta ribosomen. Till vilket site i 40S kommer nästa aminosyra i leden att docka först?

A

Till A-site. (Met-tRNA (START) har redan dockat vid P-siten, denna plats har den redan när preinitieringskomplexet bildas.)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Efter att en komplementär tRNA har bundit till ett ledigt A-site händer 2 saker. Vad?

A
  • En peptidbindning bildas mellan de två aminosyrorna.
  • Stora subenheten flyttas i förhållande till lilla subenheten.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Vad är det som katalyserar peptidyltransferasreaktionen?

A

rRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Vad är det som driver ribosom”förflyttningen” längs mRNA i elongeringsfasen?

A

GTP-hydrolys

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

I steg 3 i elongeringen, efter att stora subenheten har flyttats, sker 2 saker. Vilka?

A
  • Lilla subenheten glider 3 nukleotider längs mRNA. (Allt annat är statiskt; Stora subenheten, de bundna tRNA molekylerna och mRNA)
  • Den “använda” tRNA molekylen skickas ut då den nu hamnat på E-siten.
27
Q

I och med att en aminosyra skickas ut från E-siten i elongeringens tredje steg, är vi redo för en ny am.s.-tRNA?

A

Ja!

28
Q

Redogör för och rita upp elongeringsfasen i translationen!

A
29
Q

I proteinsyntesens initieringsfas laddas den lilla subenheten med tre laddningsfaktorer. En av dessa kommer att genomgå GTP-hydrolys då 40S skannar sig fram till start-translation-sekvensen. Vilken laddningsfaktor är det?

A

eIF2-GTP

30
Q

Som känt är eIF2-GTP nödvändigt för initieringskomplexet och således nödvändigt för initiering av proteinsyntesen. eIF2-GTP hydrolyseras till eIF2-GDP när lilla subenheten skannar fram till AUG. Vilken GEF är det som har hand om återbildningen av eIF2-GTP från eIF2-GDP?

A

eIF2B-GTP

31
Q

Vid två särskilda situationer kan nukleotidutbytet eIF2-GDP -> eIF2-GTP förhindras. Vilka?

A
  • Virusinfektion
  • ER-stress
32
Q

Genom vilken mekanism förhindras nukleotidutbytet eIF2-GDP->eIF2-GTP vid ER-stress och virusinfektion?

A

eIF2-GDP fosforyleras. Detta tillåter att nukleotidutbytet börjar, men det kan ej slutföras.

33
Q

Vad är resultaterar av att nukleotidutbytet eIF2-GDP -> eIF2-GTP inte kan ske?

A

Preinitieringskomplexet i translationens initiering kan inte bildas. Således avstannar proteinsyntesen.

34
Q

Vid ER-stress aktiveras PERK. Hur relaterar detta till proteinsyntesen? (Vad gör PERK och vad leder det till?)

A

PERK fosforylerar eIF2-GDP. Detta gör att nukleotidutbytet eIF2 -GDP -> eIF2 - GTP inte kan ske. Av den anledningen kommer preinitieringskomplexet inte kunna bildas och proteinsyntesen avstannar.

35
Q

Cellen kan med hjälp av PKR fosforylera eIF2 - GDP för att stoppa proteinsyntesen vid en virusinfektion. Vad kallas den mekanism som virus använder sig av som tillåter att translation av proteiner fortsätter?

A

Decoy mekanism

36
Q

Hur fungerar virusets decoy mekanism?

A
  • Viruset “tar med sig” eIF2-liknande protein.
  • PKR, som vanligen fosforylerar eIF2-GDP för att förhindra translationen från att fortsätta, kan inte skilja eIF2-liknande proteinet från det riktiga. -> eIF2-liknande protein som finns i cellen kommer också att fosforyleras.
  • När en stor mängd eIF2-liknande protein finns i cellen hinner inte PKR fosforylera alla eIF2-liknande proteiner OCH eIF2-GDP. Detta resulterar i att ofosforylerat eIF2-GDP blir tillgängligt.
  • eIF2-GDP kan sedan genomgå nukleotidutbytet (GTP) och delta i bildandet av preinitieringskomplexet.
37
Q

Vad är ringslutning bra för? (2saker)

A
  • mRNA skyddas mot degradation
  • Ribosomen kan åka “runt, runt” vilket effektiviserar proteinsyntesen
38
Q

I ringslutning klistras mRNA:s 5’-ända till 3’-ändan. Det är INTE själva mRNA molekylen som basparar till sig själv. Vad är det för komponenter som finns i

  1. 5’-ändan
  2. 3’-ändan

och som binder till varandra för att skapa ringslutningen?

A
  1. eIF4E och eIF4G
  2. PABP (PolyA binding protein)
39
Q

Varför termineras elongeringen vid ett stop-kodon?

A

Det finns ingen aminosyra som motsvarar stop-kodonet.

40
Q

Vad har eIF4A och eIF4B för enzymatisk funktion?

A

Helikasaktivitet

41
Q

I vilket sammanhang i proteinsyntesen stöter vi på eIF4A och eIF4b?

A

I uträtningen av ev. mRNA hårnålar.

42
Q

En särskild faktor behövs för att eIF4A och eIF4B skall kunna verka. Vilken?

A

eIF4E

43
Q

Vad binder eIF4E till?

A

Cappen på mRNA

44
Q

Vad har eIF(4E, 4A, 4B) för syfte i anslutning till proteinsyntes?

A

De bryter upp ev. mRNA hårnålar som annars skulle förhindra ribosomen från att avläsa mRNA.

45
Q

Vilka faktorer deltar i uträtningen av ett mRNA? (1 initiator, 2 utförare)

A
  1. eIF4E är “initiator” och rekryterar:
  2. utförarna eIF4A och eIF4B
46
Q

Redogör för uträtningen av mRNA i anslutning till translationen!

A
  • eIF4E binder till cap. Detta är en förutsättning för att 4A och 4B skall kunna funka.
  • eIF4A och eIF4B är helikaser, de bryter upp ev. hårnålar på mRNA
47
Q

När en oocyt befruktas eller stimuleras med hormoner kommer ett proteinkinas att aktiveras som leder till att translationen av “dormant mRNA” kommer igång. Vad är det som fosforyleras?

A

Det är CPEB som fosforyleras.

48
Q

Vilket protein är det som får en kovalent modifikation på sig, som följd av att oocyten befruktas/stimuleras med hormon? Vad är det för kovalent modifikation?

A

CPEB blir fosforylerad

49
Q

Vad sker då CPEB blir fosforylerad som följd av att oocyten blir befruktad?

A

Det Maskin som förhindrat translationsstart och polyadenylering lossnar från CPEB.

50
Q

På vilket sätt förhindrar Maskinet translationsstart hos en “translationally dormant mRNA” i oocyten?

A

Det förhindrar initieringskomplexet från att assembla på 5’ ändan av mRNA.

51
Q

Vid Heat Shock kommer proteinsyntesen att regleras av cellen. Vilka proteiner minskar/ökar? (2 saker)

A
  1. Syntesen av vanliga proteiner stängs av
  2. Syntes av de inducerbara chaperonerna (HSP) ökar
52
Q

Rent mekanistiskt, vad är det som gör att proteinsyntesen avstannar vid Heat Shock?

A
  • Det sker en fosforylering av eIF4E
  • Fosforyleringen förhindrar eIF4E från att binda till 5’ Cappen (eIF4E behövs på cappen då mRNA skall bindas till preinitieringskomplexet)
53
Q

Hur kan syntes av chaperoniner fortgå trots att proteinsyntesen stängts av vid Heat Shock?

A
  • Istället för de olika faktorerna (däribland eIF4E och eIF4G) kommer en s.k. “komplicerad RNA-struktur” att binda till chaperonin mRNA.
  • Den komplicerade RNA-strukturen har förmåga att locka preinitieringskomplexet direkt till AUG på chaperonin mRNA.
54
Q

Vilken initieringsfaktor är det som huvudsakligen styr mRNA till 40S där mRNA sedan binder in?

A

eIF4G

55
Q

Vad är eIF4G för typ av protein?

A

Ett adaptorprotein

56
Q

Vad för proteiner är det som eIF4G binder till då mRNA skall bindas till 40S?

A
  • eIF4E
  • eIF3
57
Q

Redogör för hur syntes av vanliga proteiner (icke-chaperoniner) stängs av vid Heat shock!

A
  • eIF4E fosforyleras
  • När eIF4E fosforyleras kan den inte binda till 5’-cappen på mRNA.
  • eIF4E BEHÖVER binda till 5’-cappen för att mRNA skall kunna bindas in till 40S
  • Detta för att ett adaptorprotein eIF4G binder eIF4E och eIF3 (i preinitieringskomplexet) när mRNA skall fästas vid 40S
58
Q

Vad är IRE-BP?

A

Iron Response Element Binding Protein, en järnsensor. Proteinet har förmågan att binda till specifika hårnålar på Ferritin mRNA och Transferrinreceptor mRNA.

59
Q

Vad aktiveras IRE-BP av?

A

Låg järnhalt

60
Q

Vad har IRE-BP förmågan att göra när det aktiveras?

A

Binda in till mRNA (Ferritin mRNA och Transferrinreceptor mRNA)

61
Q

Vad leder en inbindning av IRE-BP till en specifik hårnål i Ferritin mRNA till? Varför?

A
  • En sänkning av mängden Ferritin och således en ökning av järnkoncentrationen.
  • Detta för att IRE-BP binder till en hårnål framför start-translation-sekvensen i Ferritin mRNA. (Fysisk barriär för ribosomen)
62
Q

Vad leder en inbindning av IRE-BP till specifika hårnålar på Transferrinreceptor mRNA till? Varför?

A
  • Translation av transferrinreceptorer ökar, varpå även järnhalten i cellen ökar.
  • För att IRE-BP inbindningen till TR-mRNA:s 3’ ända stabiliserar mRNA:t och gör det resistent mot degradation.
63
Q

Redogör för hur järnhomeostasen uppehålls genom att reglera proteinsyntesen! (Rita)

A
64
Q
A

Tillväxt Och Degeneration (10 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions