Variação patogénica Flashcards
Variações patogénicas
É difícil saber se uma variação é patogénica:
- maioria não é
- outras funcionam em combinação
- outras ainda só causam susceptibilidade
- algumas precisam do ambiente certo
Mutações pontuais: Mudança de uma base no DNA
Point Mutations:
- silenciosa — não tem efeito na sequencia da proteína
- missense — resulta na substituição de um aminoácido
- nonsense — substituição um aminoácido por um codão stop
Anemia Falciforme — Causada por mutação missense
Indivíduos homozigóticos para a mutação têm moléculas de hemoglobina formam aglomerados, distorcendo os eritrócitos e dificultando o seu funcionamento normal.
Mutação A → T no gene β-globina (HBB) e anemia falciforme
Síndrome de Waardenburg — Mutação nonsense
- 3 dos 64 codões no código genético são codões stop
O codão TGG que codifica para um Triptofano na posição 274 da proteína, é substituído por um codão STOP TGA.
Mutação G → A no exão 6 do gene PAX3
Nonsense mediated decay (NMD)
- À medida que os ribossomas se movem ao longo do mRNA durante a tradução vão removendo as proteínas do complexo de splicing
- Se por acaso encontram um codão de STOP prematuro (PTC, premature termination codon):
> os ribossomas separam-se do mRNA antes de retirar todas as proteínas do complexo de splicing
> o mRNA é direcionado para degradação (NMD)
> codões STOP que ocorrem no último exão ou a menos de 50 nucleótidos antes (upstream) da última splice juntion não despoletam NMD
STR (Short Tandem Repeat)
- Repetições curtas em tandem, ou seja, um codão repetido várias vezes seguidas.
- Acima de um certo tamanho se tornam patogénicos
- Podem ser codificantes ou afetar UTRs e splicing
- A unidade de repetição pode apresentar diferentes tamanhos, diferentes graus de expansão, diferentes localizações em relação ao gene afetado e diferentes mecanismos patogénicos
STR e Mutações Dinâmicas
- Grandes expansões normalmente fora de regiões codificantes
- Impedem expressão gene
- Patologia deriva da falta de função do gene
- Expansões modestas podem ser encontradas em regiões codificantes
Expansões codificantes — Doença de Huntington
Forma agregados intercelulares que são tóxicos para as células, especialmente neurónios
↓
Doença degenerativa progressiva e de começo tardio
Variabilidade na dose do gene pode ser patogénica?
- Trissomias causam fenótipos severos
> Trissomia 21 — Síndrome de Down
> Trissomia 18 — Síndrome de Edwards
> Trissomia 13 — Síndrome de Patau - Uma minoria dos genes são sensíveis a gene dosage
> genes que causam doenças recessivas não são
> variação no número de cópias (CNV) de determinado gene é comum na população
> grandes deleções ou monossomias de um cromossoma inteiro são menos tolerados que as duplicações ou trissomias no desenvolvimento humano
Síndromes de Genes Contíguos
- Homens com deleções no cromossoma X
- Síndromes de genes contíguos em autossomas são menos comuns porque o outro cromossoma compensa
- Apresentam um combinação de diferentes doenças resultando da deleção de vários genes
- Ex: Distrofia Muscular de Duchenne, Retinite Pigmentosa e Doença Crónica Granulomatosa
Síndromes de Aneuploidia Segmentária
- Tipo especial de Síndromes de Genes Contíguos
- Afetam clusters de genes
- Síndromes com características bem definidas
- Ex: Síndromes de Prader-Willi (expressão deficiente de vários genes no cromossoma paterno) e Angelman (perda de gene UB3A no cromossoma materno)