Ultracentrifugation Flashcards

1
Q

Quand les macromolécules commencent à sédimenter?

A

Lorsqu’elles sont assujetties à des accélérations énormes.

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2
Q

Qu’est-ce que l’ultracentrifugeuse?

A

C’est un type de centrifugeuse avec lequel il est possible d’atteindre des vitesses de rotations de 80 000 RPM qui donnent lieu à des forces dépassent 600 000X g

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3
Q

Avec la technique d’ultracentrifugation, qu’est-ce qui a pu être démontrer?

A

Que les protéines sont des macromolécules de composition homogène et qu’un grand nombre de protéines sont composées de sous-unités

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4
Q

De quoi dépend la vitesse avec laquelle une particule sédimente dans une ultracentrifugeuse?

A

De sa masse

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5
Q

À quoi correspond la force de sédimentation?

A

À la force centrifuge qui s’exerce sur la particule moins la force due au déplacement de la solution par la particule (ou force de flottaison)

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6
Q

À quoi est opposée le déplacement d’une particule à travers une solution?

A

À une force qui représente la friction entre la particule et la solution

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7
Q

Sous l’influence d’une force centrifuge, une particule va accélérer jusqu’à ce que toutes les forces soient contrebalancée où on atteint la phase stationnaire. À quoi peut servir cette technique?

A

À mesurer la masse de macromolécules

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8
Q

Qu’est-ce que le coefficient de sédimentation S?

A

Le coefficient de sédimentation est analogue au coefficient de mobilité électrophorétique; sa valeur est exprimée en unités de 10^-13 sec qui sont connues sous forme de Svedbergs (S)

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9
Q

Vrai ou faux : Il est possible de déterminer la masse d’une particule, m=M/N, à partir de son coefficient de sédimentation S et de son coefficient de friction f.

A

Vrai

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10
Q

Bien que de nouvelles techniques sont maintenant utilisées pour mesurer la masse des macromolécules (______ et ______), l’analyse des complexes de macromolécules utilise toujours _________.

A

-Chromatographie en gel de filtration
-Électrophorèse SDS-PAGE
-Ultracentrifugation

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11
Q

Comment est exprimée la masse des constituants des complexes des macromolécules?

A

En Svedberg (S)

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12
Q

Pour quoi sont conçues les centrifugations préparatives?

A

Pour la préparation d’échantillons possédant des volumes significatifs

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13
Q

La sédimentation peut être faite dans quoi? Donner 2 exemples

A

La sédimentation peut être faite dans une solution inerte comme le saccharose ou de chlorure de césium (CsCl) dans lesquels la concentration et donc la densité augmente du haut vers le bas du rotor.

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14
Q

L’utilisation de gradients de densité augmente de façon significative le pouvoir de résolution de la centrifugeuse. Comment?

A

Ce type de gradient minimise l’agitation d’une solution par convection (qui peut nuire à la résolution).

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15
Q

Quelles sont les deux applications des gradients de densité?

A

1-Ultracentrifugation zonale ou en zones
2-Ultracentrifugation en gradient de densité à l’équilibre

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16
Q

Que permet l’ultracentrifugation en zones?

A

Cette technique permet la séparation des particules selon leurs coefficients de sédimentation.

17
Q

Dans l’ultracentrifugation en zones, comment est déposée la solution de macromolécules?

A

Sous forme de couche en haut d’un gradient de densité préparé au préalable.

18
Q

Qu’utilise-t-on pour former le gradient en ultracentrifugation en zones? Pourquoi?

A

On utilise le saccharose car il est visqueux et bio chimiquement inerte.

19
Q

Selon quoi l’ultracentrifugation en zones sépare les macromolécules?

A

Elle sépare les macromolécules de forme similaire selon leur masse.

Chaque molécule se déplace à travers le gradient à une vitesse largement déterminée par leur coefficient de sédimentation et donc migre comme une zone.

20
Q

Quel est le deuxième nom de l’ultracentrifugation par densité d’équilibre?

A

Centrifugation isopycnique

21
Q

Selon quoi l’ultracentrifugation par densité d’équilibre sépare les macromolécules?

A

Selon leur densité

22
Q

Pour quoi l’ultracentrifugation par densité d’équilibre est la technique préférée?

A

Pour séparer des macromolécules qui possèdent une gamme de densités.

23
Q

Différence entre la centrifugation de zone et la centrifugation isopycnique.

A

En zones : les particules migrent en fonction de leur nombre S (coefficient de sédimentation, selon leur masse) dans le gradient de densité de saccharose

Isopycnique : les particules se répartissent selon leur densité dans le gradient de densité de CsCl

24
Q

Qu’utilise-t-on pour former le gradient en ultracentrifugation par densité d’équilibre (centrifugation isopycnique)? Pourquoi?

A

Dans les sels CsCl et Cs2 SO4 car ce sont des substance dense qui diffuse relativement vite.

25
Q

Qu’est-il essentiel de faire lorsqu’on utilise des centrifugeuses à grandes vitesses (2)?

A

1-Bien balancer le rotor pour éviter tout débalancement lors de la centrifugation
2-Utiliser le bon rotor (selon les paramètres désirés)