UA2 - Notions De Base En Biologie Clinique Flashcards
Facteurs de variations lié à l’aspect pré-analytique : avant le prélèvement (3)
- Variables prévisibles (cycles)
- Variables imprévisibles (aléatoires)
- Variables reliées au patient
Déf. Cycle ultradien et exemple
Sécrétion épisodique, des petits creux et petits pics
Ex. : hormone de croissance
Déf. Cycle circadien
Sur un jour
Ex. : hormone de croissance
Déf. Cycle infradien
Sur >3 jours
Ex. : cycle menstruel
Déf. Cycle circannuelle (et ex.
Sur 1 ans +- 2 mois
Ex. : production de vitamine D (création de réserve pour l’hiber pour prévenir carence)
Alanine aminotransferase
Bilirubine total
Fer
Thryotropin (TSH)
TRiglycérides
Ecq bcp variations intraindividuelles?
Oui
Calcium, total
Chloride
Osmolalité
Protéine total
Sodium
Bcp variaté intra-ind?
Non (ions!!)
Augmentation de quels trucs ++ après un repas (2)
- TRiglycérides (aug 70%)
- GLucose (aug 15%)
Comment posture affecte le corps ? (Couché vs actif)
Couché = moins de pression hydrostatique, donc petites mol passent moins facilement à travers les capillaires
Effet de l’exercice sur biologie clinique
Marqueurs d’activité physique activ!!! (Ex. Troponine)
Facteurs de variabilité pré-analytiques (pendant le prélèvement) (3)
- Types d’échantillon
- Contenants et additifs
- Techniques de prélèvement
Trois types d’échantillons snaguines et carac.
Plasma vs sérum
- Sang total : avec anticoagulant
- Plasma : sang total + anticoag + centrifugation
- Sérum : sang total déjà coagulé + centrifugation
Plasma : on a encore toutes les protéines de la cascade de coagulation
Sérum : les prot de cascades sont prises ds le caillot
pq mettre un préservatif ds le sang
Inh de glycolyse : une fois le sang est dans un tube, les cellules sanguines restent vivantes. Ils continuent de métaboliser le glucose. Il faut arrêter pour prévenir la variation de certains paramètres
Étapes d’un prélèvement sanguin (8)
- Mettre gants
- Choisir veine (gros calibre)
- Appliquer garrot et serrer un peu pour voir veine (aussi serrer poing) : risque d’hémolyse/hyperkaliémie
- Désinfecter endroit où seringue ira
- Piquer
- Deserre garrot RAPIDEMENT (hémolyse)
- Remplir tube au complet
- Identifier tubes immédiatement
Pourquoi remplir tube adéquatement ds prélèvement sanguin ?
Plupart des tubes renferment additifs avec concentrations prédéterminés pour un vol de sang donné . On ne veut pas changer ce ratio.
Quelle erreur est à la source de la moitié des erreurs lol
Identification du tube
pourquoi hyperkaliémie qd serrer poing?
Destruction des GR marquée par aug potassium, comme contenu des GR relaché
Facteur de variabilité pré-analytique (après le prélèvement) (3)
- Transport
- Prétraitement
- Entreposage
Que faire pour maintenir t˚?
Quelles conditions de transport en quelles circonstances ?
Mettre ds glacière
Biochimie : réfrigération, car on veut arrêter métabolisme le plus possible
Hématologie : comme on travaille avec les cellules, on veut pas les réfrigérer, donc garder à T˚ pièce (20-22˚C)
Qu’est-ce qui change av les délais pour sample?
Glucose
Gaz sanguins (doncpH, pO2 et pCO2)
Conditions de centrifugation pour urine vs. Sérum (vitesse, temps, avec ou sans frein?) (comparer)
Vitesse : Sérum > urine
Temps : Sérum > urine
Frein : avec vs sans
Entreposage : court terme
Temp ambiante : 20-24˚C
Entreposage : moyen terme
Réfrigération : 2-8˚C
Entreposage : Long terme
Congélation : -20, -30 ou -80 ˚C
Déf. Erreur anaylituqe . Vs faute brute ?
L’erreur du à la mesure en tant que telle, donc due à la précision de l’appareil et son calibrage
Faute brute = non respect des étapes de la procédure
Inexactitude déf.
La différence entre valeur expérimentale et vraie
Imprécision déf.
Écart type/coefficient de variation calculé
Basically ecq les résultats sont reproductibles ou ecq ils s’en vont partout
Situation où résultats imprécis et exactes ?
Qd les résultats individuels ne sont pas proches de la vraie valeur, mais que la moyenne serait proche (donc l’écart entre valeurs exp. Et vraie valeure est similaire)
Erreur analytique = (équation genre)
Inexactitude + imprécision
Déf. : interférence analytique in vivo
qd interférence survient à l’int du patient
Déf. :interférence analytique in vitro
qd interférence survient au moment des étapes analytiques en labo
Expliquer spectrophotométrie et donner exemple d’interférence via ça
Déf. : On mesure la longueur d’onde de la lumière qui passe à travers une substance pour dét. Sa concentration
Ex. : si on veut mesurer sérum mais hémolyse, la couleur change de jaune à rougeâtre. Ce n’est pas la mm longueur d’onde qui est capté de l’autre bord donc la lecture est mauvaise .
Expliquer turbidimétrie et donner ex interférence
Mesurer concentration d’une substance en suspension selon l’intensité de la lumière transmise de l’autre côté de la substance
Ex. : si prise de sérum directement après repas, beaucoup de lipide. Rend + opaque et affcete intensité lumière
Expliquer immunoessais et donner ex d’inrerférence
Def : la liaison d’AC marqués sur un AG permet de mesure la concentration de l’AG
Interférence : des AC non reliés bloque la liason des deux AC sur l’AG .
Idéal vs réalité des valeurs de référence
Idéal : une concentration malade totalement diff de la concentration santé
Réalité : il y a tjrs un chevauchement
Comment établir valeurs de réf. : Hard wa y
Sélectionner 120 ind en santé pour établir intervalle de référence
Comment établir des valeurs de référence : Soft way
UTilisation de bases de donnée, à l’hôpital par exemple
Comment établir des valeurs de référence : no way (et ex.?)
Pour certains paremètres, pas de valeur de réf.
IL faut juste utiliser les seuils consensus établis par société savantes
Ex. : glycémie pour diabète
Quels facteurs sont en jeu ds le transport des prélèvements de sang (2)
- Délais
- Température
Deux types de caractéristiques d’une analyse et ex (2-2)
- Caractéristiques du test lui-même (intrinsèques)
- Caractéristiques du test et de la population à c’est appliqué (donc la prévalence de la maladie ds la population est considérée)
Ex. :
1. Sensibilité et spécificité
2. Valeur prédictive postitive et nég (VPP et VPN)
Déf. Prévalence et équation
Nbre de cas (malades) recensé ds une population donnée à un moment spéc.
P = (VP+FN)/N
Déf. : Efficacité et éq
Déf. : Pourcentage des classements (N ou P) qui ont été bien fait
E = (VP+VN)/N
Déf. : sensibilité et éq
Déf. : proportion de vrais positifs chez les malades
Se = VP/(VP+FN)
Déf. : spécificité et éq.
Déf. : proporition de vrais négatifs chez les malades
Éq. : Sp = VN/(VN+FP)
Déf.: valeur prédictive positive (VPP) et éq.
Déf. : probabilité que le sujet soit réellement malade, sachant que son test est positif
VPP = VP/(VP+FP) = Se*prévalence de la maladie/prévalence d’un résultat postiif
Déf. : Valeur prédictive négative et éq
Déf. : Probabilité que le sujet soit réellement santé si son test est négatif
VPN = VN/(VN+FP) = Sp*(1-prévalence maladie)/(1-prévalence test positif)
Déf. : likelihood ratio/rapport de vraisemblance (plus comme une éq)
Rapport de
- probabilité d’être malade sur
- probabilité de ne pas l’être en connaissant résultat du test (selon s’il est positif ou négatif)
Sig. rapport de vraisemblance positif
accroissement de la probabilité qu’une personne soit malade après test positif
Sig. test de vraisemblance négatif
Accroissement de probabilité qu’une personne ne soit pas atteinte de la maladie après un test négatif
Rapport de vraisemblance positif : éq
L+ = Se/(1-Sp)
Rapport de vraisemblance positif : Idéal et tendance
Idéal : L+ = infini
Tendnace : si élevé, permet de confirmer la maladie encore plus
Rapport de vraisemblance négatif : Éq
L- = (1-Se)/Sp
Rapport de vraisemblance : Idéal et tendance, maximum
Idéal : L- = 0
Plus il est petit, plus il nous permet d’exclure la maladie
Max = 1
OR est toujours…
≥ 0
Sig : OR proche ou égal à 1
maladie est indépendante du groupe (car prob = ds les 2 groupes)
Sig. : sup à 1
maladie plus fréq. Ds groupe A vs B
éq. : odds ratio
P/(1-p)/
q/(1-q)
Sig OR : bien sup. À 1
Maladie ++++ A vs. B
Sig. OR : inf 1
B>A
Sig. OR proche 0
B»»>A
Quelle analyse diagnostique choisir ?
Dépistage vs diagnostic
Dépistage : Se
Diagno : Sp
Utilisation courbe ROC ds domaine médical (variables…)
Illustrer relation existante entre Se et Sp d’un test pour toutes les valeurs seuils possibles
Déterminer une valeur seuil pour malade vs. Santé
Variables : Se /1-Sp, donc taux des VP/taux des FP
Courbe ROC : valeurs d’un test inutile
50% Se et 50% sp
Comment obtenir valeur seuil optimal à partir courbe ROC
Valeur la plus éloignée de la diagonale milieu (celle qui représente un test nul)
Utilitié AUROC (2)
- Évaluer si test est bon pour diagnostic
- Comparer performance diagnostique de plusieurs tests
Comment déterminer si une différenec significative (cliniquement) existe entre 2 résultats consécutifs (3)
- Jugement/exp des prof
- RCV (reference change value)
- SCL = Significant Change Limit
RCV : éq., sig des variables
RCV (%) = 2,77*racine(CVa^2+CVb^2)
CVa : imprécision de la méthode au laboratoire
CVb : variation dans la biologie des individus pour ce paramètre
SCL : éq. Et sig variables
SCL = 3 ETu
ETu : Et analytique usuel des 3-6 derniers mois
Diff scl et RCV
SCL : utilise imprécision au labo slmt
RCV : prend en compte imprécision au niv de l’ind aussi