Translationsinitiering/elongering/terminering Flashcards
Steg 1 i initieringen
eIF4F och 43s-komplexen bildas
Steg 2 i initieringen
Del av eIF4F komplexet binder till 5’-cappen och PABP möjliggör ringslutning
Ringslutning är skapad och eIF4F har bundit in, nästa steg?
En del av eIF4F-komplexet och en del av 43S interagerar –> komplexen går ihop
eIF4F och 43S är nu bundna, vad händer?
43S rör sig i 5’ - 3’. mRNAt lindas upp av helikas från eIF-komplexet
Initieringskomplexet rör sig i 5’-3’ riktning tills…?
Startkodon AUG binder in
Startkodon är hittat, vad händer och varför?
eIF4F släpper med capbindande proteiner för att starta ny translation.
43S är lämnat ensam kvar med mRNA, vad händer?
eIF5 hydrolyserar eIF2. F1, eIF2-GDP och eiF3 disassoicerar. Initiator tRNAmet sitter bundet
40s är skapat av disassociering av F1, F2-GTP och F3. Hur ska nu stora subenheten komma dit?
eIF5B-GTP binder in till subenheten och rekryterar stora subenheten.
5B-GTP har rekryterat stora subenheten vad gör den nu?
5B-GTP hydrolyseras till 5B-GDP –> den disossierar samtidigt sker en konformationsändring vilket gör att stora och lilla subenheterna kan ta rätt plats
Ett sista steg för att initieringen enkelt ska kunna ske igen med eIF2?
eIF2 laddas upp med GTP av eIF2B. Det finns alltid mer eIF2 än eIF2B
Vad krävs för att elongering ska starta?
80s är bunden till mRNAt med initiator tRNA på P plats
Första steget i elongering?
EF1-GTP-tRNA(AA) binder till A plats
EF1-GTP är bundet till A-platsen, vad händer nu?
EF1-GTP hydrolyseras till EF1-GDP och släpper. Leder till omkonformation, aminosyror nära varandra.
Hydrolysen av eF1 har lett till att aminosyrorna är nära varandra, vad mer?
Peptidbindning mellan aminosyror och den stora subenheten rör sig ett kodon i 3’-riktning.
Tomt A-site i stora subenheten för att hydrolysen av EF1-GTP skett. Vad binder in?
EF2-GTP
Vad gör EF2-GTP när den bundit in i den tomma A-siten?
Hydrolyseras vilket leder till att den lilla subenheten omkomformeras fram ett steg och initator-tRNA släpper från E-platsen
Vad har hänt under elongeringen?
EF1 hydrolyserats, peptidbindnignen mellan aminosyror och stora subenheten flyttar fram. EF2 hydrolyserats och stora subenheten flyttar fram samt initator-tRNA lämnar. Polypeptiden har vuxit en aminosyra och är i P-site.
Vad initerar translationsterminering och var befinner sig polypeptidkedjan?
Stoppkodon, i P-site.
Vilka molekyler befinner sig fria i cytosolen för att starta terminering, samt vad är första steget?
eRF3 binder in med eRF1-GTP
eRF3 samt eRF1-GTP har bundit in, vad händer?
eRF1 hydrolyseras vilket skapar komformationsändring i stora subenheten. Detta leder till hydrolys av bindningen mellan tRNA och polypeptidkedjan som disassocierar.
eRF1 har hydrolyserats vilket flyttat på stora subenheten, now what?
Ribosomen faller isär och disassocierar
Vad möjliggör för ribosomen att lätt binda till 5’-cappen och starta ny translation?
Ringslutning
Vad har antibiotika med translation att göra?
Många hämmar bakteriell translation
När sker proteinveckning?
Både translationellt och posttransionellt
Vilket chaperon veckar under translationen?
HSP70
VIlket chaperon veckar posttranslationellt?
HSP60
Vad krävs för proteinveckning och hur fungerar det?
Chaperoner kräver ATP och känner av hydrofoba ytor
Var bryts proteiner ned nånstans?
Proteasomen efter ubiquitinering?
Bryts alla protein ned?
Förr eller senare måste alla brytas ned
