Translationsinitiering/elongering/terminering

Question 1

Steg 1 i initieringen

Answer 1

eIF4F och 43s-komplexen bildas

Question 2

Steg 2 i initieringen

Answer 2

Del av eIF4F komplexet binder till 5’-cappen och PABP möjliggör ringslutning

Question 3

Ringslutning är skapad och eIF4F har bundit in, nästa steg?

Answer 3

En del av eIF4F-komplexet och en del av 43S interagerar –> komplexen går ihop

Question 4

eIF4F och 43S är nu bundna, vad händer?

Answer 4

43S rör sig i 5’ - 3’. mRNAt lindas upp av helikas från eIF-komplexet

Question 5

Initieringskomplexet rör sig i 5’-3’ riktning tills…?

Answer 5

Startkodon AUG binder in

Question 6

Startkodon är hittat, vad händer och varför?

Answer 6

eIF4F släpper med capbindande proteiner för att starta ny translation.

Question 7

43S är lämnat ensam kvar med mRNA, vad händer?

Answer 7

eIF5 hydrolyserar eIF2. F1, eIF2-GDP och eiF3 disassoicerar. Initiator tRNAmet sitter bundet

Question 8

40s är skapat av disassociering av F1, F2-GTP och F3. Hur ska nu stora subenheten komma dit?

Answer 8

eIF5B-GTP binder in till subenheten och rekryterar stora subenheten.

Question 9

5B-GTP har rekryterat stora subenheten vad gör den nu?

Answer 9

5B-GTP hydrolyseras till 5B-GDP –> den disossierar samtidigt sker en konformationsändring vilket gör att stora och lilla subenheterna kan ta rätt plats

Question 10

Ett sista steg för att initieringen enkelt ska kunna ske igen med eIF2?

Answer 10

eIF2 laddas upp med GTP av eIF2B. Det finns alltid mer eIF2 än eIF2B

Question 11

Vad krävs för att elongering ska starta?

Answer 11

80s är bunden till mRNAt med initiator tRNA på P plats

Question 12

Första steget i elongering?

Answer 12

EF1-GTP-tRNA(AA) binder till A plats

Question 13

EF1-GTP är bundet till A-platsen, vad händer nu?

Answer 13

EF1-GTP hydrolyseras till EF1-GDP och släpper. Leder till omkonformation, aminosyror nära varandra.

Question 14

Hydrolysen av eF1 har lett till att aminosyrorna är nära varandra, vad mer?

Answer 14

Peptidbindning mellan aminosyror och den stora subenheten rör sig ett kodon i 3’-riktning.

Question 15

Tomt A-site i stora subenheten för att hydrolysen av EF1-GTP skett. Vad binder in?

Answer 15

EF2-GTP

Question 16

Vad gör EF2-GTP när den bundit in i den tomma A-siten?

Answer 16

Hydrolyseras vilket leder till att den lilla subenheten omkomformeras fram ett steg och initator-tRNA släpper från E-platsen

Question 17

Vad har hänt under elongeringen?

Answer 17

EF1 hydrolyserats, peptidbindnignen mellan aminosyror och stora subenheten flyttar fram. EF2 hydrolyserats och stora subenheten flyttar fram samt initator-tRNA lämnar. Polypeptiden har vuxit en aminosyra och är i P-site.

Question 18

Vad initerar translationsterminering och var befinner sig polypeptidkedjan?

Answer 18

Stoppkodon, i P-site.

Question 19

Vilka molekyler befinner sig fria i cytosolen för att starta terminering, samt vad är första steget?

Answer 19

eRF3 binder in med eRF1-GTP

Question 20

eRF3 samt eRF1-GTP har bundit in, vad händer?

Answer 20

eRF1 hydrolyseras vilket skapar komformationsändring i stora subenheten. Detta leder till hydrolys av bindningen mellan tRNA och polypeptidkedjan som disassocierar.

Question 21

eRF1 har hydrolyserats vilket flyttat på stora subenheten, now what?

Answer 21

Ribosomen faller isär och disassocierar

Question 22

Vad möjliggör för ribosomen att lätt binda till 5’-cappen och starta ny translation?

Answer 22

Ringslutning

Question 23

Vad har antibiotika med translation att göra?

Answer 23

Många hämmar bakteriell translation

Question 24

När sker proteinveckning?

Answer 24

Både translationellt och posttransionellt

Question 25

Vilket chaperon veckar under translationen?

Answer 25

HSP70

Question 26

VIlket chaperon veckar posttranslationellt?

Answer 26

HSP60

Question 27

Vad krävs för proteinveckning och hur fungerar det?

Answer 27

Chaperoner kräver ATP och känner av hydrofoba ytor

Question 28

Var bryts proteiner ned nånstans?

Answer 28

Proteasomen efter ubiquitinering?

Question 29

Bryts alla protein ned?

Answer 29

Förr eller senare måste alla brytas ned