Apoptos/cellcykeln Flashcards
Viktigaste skillnaden mellan Apoptos och Nekros?
Apoptos kräver ATP
Nekros är en simpel process. Vad händer?
Cellen sväller och spricker då jonkanalerna inte kan hålla uppe en osmotisk gradient
Vad leder nekros till i sitt område?
Inflammatorisk respons
Två saker som får celler att gå in i apoptos?
Direkt dödssignaler eller avsaknad av trofiska faktorer
Vad gör trofiska faktorer?
stimulerar cellevnad
Vad AVGÖR om en cell går in i apoptos eller inte?
Kampen mellan pro- och antiapoptotiska signaler
Exempel på trofiska faktorer?
I nervsystemets utveckling är receptorerna Trk A och Trk C avgörande
Vad syftar apoptotiska signalvägar till att aktivera?
Kaspas 3
Ge exempel på extracellulär receptor apoptos signalering
Ligand till receptor Fas
Vad rekryterar Fas-receptorn
Fas-associated protein with death domain (FADD)
FADDs signalväg?
rekryterar pro-kaspas 8 som autoproteolyserar till kaspas 8. Kaspas 8 proteolyserar pro-kaspas 3 till kaspas 3 som orsakar apoptos
Exempel på annan signalväg än extracellulär för apoptos?
Mitokondriell signalering
Vad i mitokondriens membran signalerar för apoptos?
cytokrom C
Vad leder till att cytokrom C passerar membranet och ge exempel?
Lägre membranpotential, störningar i jonbalans Dna-skador O2-brist Förgiftning ER-stress Heat shock cell-cell kontakt störs Celladhesion Trofiska faktorer
Vad gör Cyt C i cytoplasman
reagerar med och hydrolyserar APAF-1 så att den aktiveras
Hur många Cyt C reagerar med APAF1 och vad bildar detta?
Sju st skapar en apoptosom
Vad gör apoptosomen och hur går detta vidare i singlaringen?
Proteolyserar sju st pro-kaspas 9 till kaspas 9 som proteolyserar prokaspa 3 till kaspas 3
Vad kan inhibera apoptosomen?
Inhibitor of Apoptosis Protein (IAP)
I cellen finns pro-apoptotiska och anti-apoptotiska proteiner. Hur många? Rita en lista med dessa
Pro-apoptotiska
Utförande
Bax
Bac
Inducerande
Bad
Bim
Bid
anti-apoptotiska
Bcl2
Bcl alfa
Hur agerar anti/pro apoptotiska proteiner
Genom att antingen höja eller sänka membranpotentialen hos mitokondrien
Hur verkar Bcl2
Binder till Bax och stoppar därmed den från att sänka membranpotentialen
Förklara Bad/Bcl2 relationen
De balanserar mot varandra då Bad vill binda till Bcl2 och på så sätt inaktivera den. Bads pro-apoptotiska förmåga kan hämmas genom större produktion av Bcl2 eller fosforylering av Bad
Cellens DNA är otroligt viktigt, och får inte replikeras om det är skadat. Vilken gen sköter detta och på vilket sätt?
Dna-skador ökar aktiviten hos P53-genen som ger upphov till transkriptionsfaktorer som ökar pro-aptotiska gener (ex Bim, Bax) och minskar anti-apoptotiska gener (Bcl2)
Vad behöver cellen mer än frånvaro av apoptiska signaler för att leva?
Trofiska signaler
Ge exempel på apoptoshämmare
PI3kinas
Vilken väg aktiverar den och vad är slutresultatet?
Akt-vägen. Akt fosforylerar NF-kB och Bad så att Bad ej hämmar Bcl2
Hur definieras stamceller?
Cell som kan dela och differentiera sig under hela vår livslängd, dock med ett lågt uttryck
Ge exempel på stamceller
totipotenta - befruktat ägg
pluripotenta - embryonala
multipotenta - hematopoietiska
unipotenta - epitel
Vilka typer av stamcellsdelningar finns?
Symmetrisk (två stamceller) och asymmetrisk (en stamcell och en progenitor)
Vad måste finnas för att stamceller ska fungera korrekt?
Deras nisch - miljö för att upprätthålla tillväxt och odifferentierat tillstånd. • Extracellulärt matrix (basalmembran) • Kemisk miljö (ex CaPi) • Faktorer (BMP, FGF, Wnt) • Cell-cell kontakter (ex notch-delta)
Vilka fem faser består en cells livscykel av?
G0 G1 S G2 M
Vilka fem moment består M-fasen av?
Profas Metafas Anafas Telofas Cytokinesi
Beskriv den tidiga profasen
DNA-molekylerna kondenseras till 23 kromosomer. Kinetokormikrotubilli börjar bildas från centrosomer
Vad händer i den sena profasen?
Kärnmembranet börjar lösas upp
Beskriv spolkroppens uppbyggnad
1 Centrosom bestående av två centrioler i en MTOC på var sida med kinetokormikrotubili som binder till kinetokor på kromosomerna, aster ut mot plasmembranet och polär mikrotubili på kanterna
Vad händer i metafasen?
Ekvatorialplatta bildas, Aster spänns mot cellväggen av Dynein
Anafasen?
Centromeren upplöses så kromatiderna dras isär. Kinetokoren går längs mikrotubilin
Vad behövs för att kinetokoren ska gå längs mikrotubilin?
NCD80
Telofasen?
Kärnmembranen bildas åter, kromosomerna löser upp sig
Hur går cytokinesi till?
Aktinringen dras åt så att cellen delas i två
Tyrosinkinas har fyra reaktionsvägar i early response, vilka?
PI3K-Akt. Grb2, Src och PKC aktiverar alla MAPK
Cytokinasreceptorn aktiverar i early-response?
JAK-STAT
G-protein i earlyresponse?
PLC som gör PIP2 till DAG och IP3 –> PKC
Vad behövs för aktivering av CDK
Cykliner
Vad för något inhiberar Cyklin?
CKI
Vad reglerar Cyklin förutom CKI?
Wee1 negativt, CAK positivt
Förklara aktivt cyklin/cdks positiva feedback
1) inhiberar Wee1 2) Stimulerar CDC25 att ta bort fosfatgruppen från Wee1
Vad gör G1-cyklin/CDK som svar på delayed response? Vad blir effekten och vad behövs mer än G1-cyklin/CDK
Fosforylerar pRb och Cdh-1 (som blir inaktivt då). Det stimulerar övergång till S-fasen vilket också kräver feel good signaler.
Hur verkar pRB?
Det inhiberar vanligen E2F, men lossnar när den fosforyleras. E2F är en aktivator viktig för S-fasen
Vad gör E2F?
Ökar transkription av Myk, S-fasrelevanta gener och G1/S-cyklin samt S-cyklin
Förklara restriction point
Fosforylering av pRb aktiverar E2F som ökar transkription av G1/S-cyklin vilket stimulerar fosforylering av pRb. När maximal E2F är frigjort har vi så mycket G1/S-cyklin och S-cyklin att vi ej kan reversera övergången
Förklara S-cki
Det inhiberar S-cyklin. Fosforyleras av G1-Cyklin/CDK och G1/S-cyklin/CDK och ubiqvitineras sen av SCF för nedbrytning
Vilka tre sätt förbereder delayed response cellen för S-fasen?
- Bygga upp prereplikationskomplexet i origin of replication
2 Öka proteinsyntes med S6kinas och bilda organeller
3 Cykliner och CDK
Vad gör S-cyklin/CDK i S-fasen?
Fosforylerar ORC, cdc6, cdt1 och MCM som utgör prereplikationskomplexet
Var sätter sig prereplikationskomplex och vad binder de där?
Origin of replication, två DNA-polymeraser
Vad leder fosforyleringen av pre-RK till?
Att replikationen kan börja
Det är viktigt att replikationen endast sker en gång per cykel hur säkerställs detta?
Geminin binder till cdt1, cdc6 degraderas och ORC hålls fosforylerad
Vad gör APC?
Defosforylerar ORC
Hur kontrolleras att allt DNA är replikerat innan man går in i M-fasen?
Proteinera ATM och ATR inhiberar cdc25 som alltså inte kan ta bort fosfatgruppen från cyklin som wee1 satt dit ifall det finns oreplikerat eller skadat DNA. I G2-fasen finns alltså hög halt M-cyklin men den är inhiberad av Wee1
Hur sker M-cyklin/CDKs självreglering ut?
Stimulerar CAK och cdc25 samt inhiberar Wee1
Kronologisk ordning på G2-fasen?
- Wee1 dominerar, ATR/ATM inhiberar cdc25 så M-cyklin/cdk inaktivt
- ATR och ATM minskar sin aktivitet under replikationen cdc25 defosforylerar M-cyklin/cdk
- M-cyklin/cdk stimulerar CAK oc inhiberar Wee1 och ökar sin aktivitet
- Fosforyleringen av CAK stimulerar cdc25 så wee1 är väldigt oaktivt och M-cyklin/cdk väldigt aktivt
Kronologisk ordning på M-fasen?
- Laminer bryts ned
- Nukleoporiner dissasocierar från kärnmembranet
- Kromosomer kondenseras
- Två MTOC bildas
Vad håller fast systerkromatiderna i varandra?
kohesinringar
Vad kontrollerar så att kinetokorerna spänns åt olika håll för systerkromatiderna?
Aurorakinas
Vad behövs för att man ska gå in i anafasen?
Att kohesinringarna bryts
Vad är spindle assembly checkpoint?
Mad2 slutar inhibera cdc20 först när alla systerkromatider är bundna, astern färdig och de polära mikrotubilierna avslutade
Vad gör aktivt cdc20?
Binder med APC = cdc20/APCkomplexet som ubiqutinerar sekurin. Det möjliggör för separas att fosforylera kohesinringarna.
Vad depolymeriserar mikrotubili under anafasen?
Kinesin 13
Vad gör Kinesin 5?
Trycker de positiva ändarna av polära mikrotubili mot varandra vilket ger cellen en oval form
Hur inaktiveras M-proteinerna?
CDH1 binder till APC som ubikvitinerar M-cyklas och geminin. ORC och CDT1 i prereplikationskomplexet defosforyleras
Definiton Stamcell?
Självförnyande
Differentieringsförmåga
SKillnad på progenitor?
De saknar självförnyelseförmåga men delar sig mycket snabbare